MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Serratia sp. ATCC 39006 genome

Total Repeats: 2509

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022268	CGCTG	2	10	1831	1840	0 %	20 %	40 %	40 %	541862393
2	NC_022268	GGTTT	2	10	1917	1926	0 %	60 %	40 %	0 %	541862393
3	NC_022268	GGTGA	2	10	4203	4212	20 %	20 %	60 %	0 %	541862396
4	NC_022268	ACACC	2	10	5064	5073	40 %	0 %	0 %	60 %	541862397
5	NC_022268	GCCAG	2	10	6434	6443	20 %	0 %	40 %	40 %	541862398
6	NC_022268	CAGGA	2	10	8633	8642	40 %	0 %	40 %	20 %	541862398
7	NC_022268	GCCAG	2	10	8684	8693	20 %	0 %	40 %	40 %	541862398
8	NC_022268	GACCA	2	10	9441	9450	40 %	0 %	20 %	40 %	541862399
9	NC_022268	TGAAA	2	10	11801	11810	60 %	20 %	20 %	0 %	541862401
10	NC_022268	CTGGC	2	10	12330	12339	0 %	20 %	40 %	40 %	541862401
11	NC_022268	GGAAA	2	10	13035	13044	60 %	0 %	40 %	0 %	541862403
12	NC_022268	TCATT	2	10	19561	19570	20 %	60 %	0 %	20 %	541862408
13	NC_022268	AATAT	2	10	19904	19913	60 %	40 %	0 %	0 %	541862409
14	NC_022268	TATTT	2	10	20364	20373	20 %	80 %	0 %	0 %	541862409
15	NC_022268	TCGGT	2	10	20782	20791	0 %	40 %	40 %	20 %	541862410
16	NC_022268	CGGTA	2	10	20921	20930	20 %	20 %	40 %	20 %	541862410
17	NC_022268	TCCGT	2	10	21047	21056	0 %	40 %	20 %	40 %	541862410
18	NC_022268	CGGCA	2	10	22648	22657	20 %	0 %	40 %	40 %	541862411
19	NC_022268	GTGGA	2	10	23073	23082	20 %	20 %	60 %	0 %	541862411
20	NC_022268	ATTGG	2	10	23111	23120	20 %	40 %	40 %	0 %	541862411
21	NC_022268	TGGAT	2	10	26067	26076	20 %	40 %	40 %	0 %	541862414
22	NC_022268	GGCCT	2	10	28828	28837	0 %	20 %	40 %	40 %	541862416
23	NC_022268	ACCAC	2	10	30688	30697	40 %	0 %	0 %	60 %	541862417
24	NC_022268	GCAGG	2	10	33947	33956	20 %	0 %	60 %	20 %	541862418
25	NC_022268	TGAAC	2	10	36103	36112	40 %	20 %	20 %	20 %	541862419
26	NC_022268	ACTGC	2	10	38185	38194	20 %	20 %	20 %	40 %	541862421
27	NC_022268	CATAA	2	10	38672	38681	60 %	20 %	0 %	20 %	541862421
28	NC_022268	ACATC	2	10	40495	40504	40 %	20 %	0 %	40 %	541862422
29	NC_022268	TTACT	2	10	47868	47877	20 %	60 %	0 %	20 %	541862423
30	NC_022268	TTCTG	2	10	49328	49337	0 %	60 %	20 %	20 %	541862425
31	NC_022268	CGAGC	2	10	52152	52161	20 %	0 %	40 %	40 %	541862429
32	NC_022268	TGCGC	2	10	54144	54153	0 %	20 %	40 %	40 %	541862431
33	NC_022268	TTTCC	2	10	56843	56852	0 %	60 %	0 %	40 %	541862434
34	NC_022268	AAATG	2	10	57294	57303	60 %	20 %	20 %	0 %	541862435
35	NC_022268	GGATC	2	10	58241	58250	20 %	20 %	40 %	20 %	541862437
36	NC_022268	CCCAA	2	10	59931	59940	40 %	0 %	0 %	60 %	541862439
37	NC_022268	TCGGC	2	10	60605	60614	0 %	20 %	40 %	40 %	541862441
38	NC_022268	GACGG	2	10	64675	64684	20 %	0 %	60 %	20 %	541862449
39	NC_022268	GTCAG	2	10	65233	65242	20 %	20 %	40 %	20 %	541862450
40	NC_022268	TTTTG	2	10	66330	66339	0 %	80 %	20 %	0 %	541862453
41	NC_022268	AACCA	2	10	68067	68076	60 %	0 %	0 %	40 %	541862457
42	NC_022268	ATTCC	2	10	70256	70265	20 %	40 %	0 %	40 %	541862461
43	NC_022268	TACCG	2	10	72346	72355	20 %	20 %	20 %	40 %	541862465
44	NC_022268	ACCAG	2	10	74982	74991	40 %	0 %	20 %	40 %	541862466
45	NC_022268	ATCCA	2	10	75046	75055	40 %	20 %	0 %	40 %	541862466
46	NC_022268	TTAAA	2	10	77107	77116	60 %	40 %	0 %	0 %	541862471
47	NC_022268	TAAAA	2	10	78789	78798	80 %	20 %	0 %	0 %	541862473
48	NC_022268	ATACC	2	10	82271	82280	40 %	20 %	0 %	40 %	541862476
49	NC_022268	CAGAC	2	10	88126	88135	40 %	0 %	20 %	40 %	541862482
50	NC_022268	TGCAC	2	10	89763	89772	20 %	20 %	20 %	40 %	541862484
51	NC_022268	CACTG	2	10	94602	94611	20 %	20 %	20 %	40 %	541862489
52	NC_022268	GATAA	2	10	95799	95808	60 %	20 %	20 %	0 %	541862489
53	NC_022268	GATCC	2	10	98055	98064	20 %	20 %	20 %	40 %	541862491
54	NC_022268	GGAAA	2	10	99148	99157	60 %	0 %	40 %	0 %	541862492
55	NC_022268	GTGCA	2	10	100008	100017	20 %	20 %	40 %	20 %	541862493
56	NC_022268	ACAGA	2	10	101751	101760	60 %	0 %	20 %	20 %	541862496
57	NC_022268	CGGCC	2	10	103247	103256	0 %	0 %	40 %	60 %	541862497
58	NC_022268	CGCGG	2	10	105215	105224	0 %	0 %	60 %	40 %	541862498
59	NC_022268	CCCGT	2	10	106200	106209	0 %	20 %	20 %	60 %	541862499
60	NC_022268	CGGTC	2	10	110201	110210	0 %	20 %	40 %	40 %	541862503
61	NC_022268	GGTGC	2	10	113501	113510	0 %	20 %	60 %	20 %	541862507
62	NC_022268	TCCCA	2	10	118081	118090	20 %	20 %	0 %	60 %	541862511
63	NC_022268	TGATC	2	10	120269	120278	20 %	40 %	20 %	20 %	541862513
64	NC_022268	CATTT	2	10	128324	128333	20 %	60 %	0 %	20 %	541862525
65	NC_022268	GCACC	2	10	129585	129594	20 %	0 %	20 %	60 %	541862527
66	NC_022268	AGCAA	2	10	130498	130507	60 %	0 %	20 %	20 %	541862528
67	NC_022268	TTTTC	2	10	130849	130858	0 %	80 %	0 %	20 %	541862529
68	NC_022268	AACGC	2	10	132695	132704	40 %	0 %	20 %	40 %	541862531
69	NC_022268	AATCG	2	10	145433	145442	40 %	20 %	20 %	20 %	541862542
70	NC_022268	ATCAG	2	10	146543	146552	40 %	20 %	20 %	20 %	541862542
71	NC_022268	CATAT	2	10	148579	148588	40 %	40 %	0 %	20 %	541862543
72	NC_022268	CCAGC	2	10	148992	149001	20 %	0 %	20 %	60 %	541862543
73	NC_022268	GGCAT	2	10	149774	149783	20 %	20 %	40 %	20 %	541862544
74	NC_022268	CAGGC	2	10	149951	149960	20 %	0 %	40 %	40 %	541862544
75	NC_022268	CATTC	2	10	151528	151537	20 %	40 %	0 %	40 %	541862545
76	NC_022268	ACCGC	2	10	151960	151969	20 %	0 %	20 %	60 %	541862545
77	NC_022268	CGCTC	2	10	152610	152619	0 %	20 %	20 %	60 %	541862545
78	NC_022268	AACCC	2	10	153459	153468	40 %	0 %	0 %	60 %	541862546
79	NC_022268	CAGTC	2	10	160868	160877	20 %	20 %	20 %	40 %	541862552
80	NC_022268	AGTTG	2	10	161093	161102	20 %	40 %	40 %	0 %	541862553
81	NC_022268	ATGGG	2	10	163425	163434	20 %	20 %	60 %	0 %	541862554
82	NC_022268	CATCA	2	10	166500	166509	40 %	20 %	0 %	40 %	541862556
83	NC_022268	CAGCA	2	10	169035	169044	40 %	0 %	20 %	40 %	541862558
84	NC_022268	AACAT	2	10	169093	169102	60 %	20 %	0 %	20 %	541862558
85	NC_022268	CAAAC	2	10	169326	169335	60 %	0 %	0 %	40 %	541862558
86	NC_022268	CCCGG	2	10	169981	169990	0 %	0 %	40 %	60 %	541862559
87	NC_022268	GGTCA	2	10	170617	170626	20 %	20 %	40 %	20 %	541862560
88	NC_022268	ACAGT	2	10	173159	173168	40 %	20 %	20 %	20 %	541862562
89	NC_022268	ACCGA	2	10	173522	173531	40 %	0 %	20 %	40 %	541862562
90	NC_022268	CCGGG	2	10	175297	175306	0 %	0 %	60 %	40 %	541862564
91	NC_022268	GACCA	2	10	176851	176860	40 %	0 %	20 %	40 %	541862566
92	NC_022268	CGCAC	2	10	179967	179976	20 %	0 %	20 %	60 %	541862569
93	NC_022268	AGGTT	2	10	180025	180034	20 %	40 %	40 %	0 %	541862569
94	NC_022268	ATGCA	2	10	181050	181059	40 %	20 %	20 %	20 %	541862569
95	NC_022268	TGTGG	2	10	181322	181331	0 %	40 %	60 %	0 %	541862570
96	NC_022268	CAGAC	2	10	181496	181505	40 %	0 %	20 %	40 %	541862570
97	NC_022268	GATCC	2	10	182245	182254	20 %	20 %	20 %	40 %	541862570
98	NC_022268	TGGTG	2	10	185600	185609	0 %	40 %	60 %	0 %	541862573
99	NC_022268	GCCAG	2	10	185848	185857	20 %	0 %	40 %	40 %	541862573
100	NC_022268	CGCTG	2	10	186882	186891	0 %	20 %	40 %	40 %	541862574
101	NC_022268	CATGG	2	10	192246	192255	20 %	20 %	40 %	20 %	541862579
102	NC_022268	TCACT	2	10	199694	199703	20 %	40 %	0 %	40 %	541862585
103	NC_022268	GACAA	2	10	202971	202980	60 %	0 %	20 %	20 %	541862588
104	NC_022268	ACCTT	2	10	203060	203069	20 %	40 %	0 %	40 %	541862588
105	NC_022268	GAATG	2	10	208672	208681	40 %	20 %	40 %	0 %	541862593
106	NC_022268	TCAGG	2	10	209317	209326	20 %	20 %	40 %	20 %	541862593
107	NC_022268	TTTTC	2	10	209901	209910	0 %	80 %	0 %	20 %	541862594
108	NC_022268	AATAC	2	10	211479	211488	60 %	20 %	0 %	20 %	541862596
109	NC_022268	CCCAC	2	10	211611	211620	20 %	0 %	0 %	80 %	541862596
110	NC_022268	GCCAA	2	10	212244	212253	40 %	0 %	20 %	40 %	541862596
111	NC_022268	CCACT	2	10	213559	213568	20 %	20 %	0 %	60 %	541862598
112	NC_022268	ATCCA	2	10	218943	218952	40 %	20 %	0 %	40 %	541862603
113	NC_022268	TTGCA	2	10	221236	221245	20 %	40 %	20 %	20 %	541862604
114	NC_022268	GGGAT	2	10	222702	222711	20 %	20 %	60 %	0 %	541862605
115	NC_022268	GTCAC	2	10	223258	223267	20 %	20 %	20 %	40 %	541862606
116	NC_022268	GCCCC	2	10	227040	227049	0 %	0 %	20 %	80 %	541862611
117	NC_022268	ACCAC	2	10	228881	228890	40 %	0 %	0 %	60 %	541862612
118	NC_022268	TTAAA	2	10	231929	231938	60 %	40 %	0 %	0 %	541862615
119	NC_022268	AAGAT	2	10	233754	233763	60 %	20 %	20 %	0 %	541862617
120	NC_022268	CGCCT	2	10	235530	235539	0 %	20 %	20 %	60 %	541862618
121	NC_022268	CATTA	2	10	236036	236045	40 %	40 %	0 %	20 %	541862619
122	NC_022268	AAATC	2	10	236318	236327	60 %	20 %	0 %	20 %	541862619
123	NC_022268	CTTTT	2	10	238953	238962	0 %	80 %	0 %	20 %	541862622
124	NC_022268	AACAG	2	10	240426	240435	60 %	0 %	20 %	20 %	541862623
125	NC_022268	AACAT	2	10	240700	240709	60 %	20 %	0 %	20 %	541862624
126	NC_022268	AAAGA	2	10	241113	241122	80 %	0 %	20 %	0 %	541862624
127	NC_022268	GTAAG	2	10	242020	242029	40 %	20 %	40 %	0 %	541862625
128	NC_022268	CATAT	2	10	242968	242977	40 %	40 %	0 %	20 %	541862626
129	NC_022268	CAATA	2	10	245623	245632	60 %	20 %	0 %	20 %	541862628
130	NC_022268	CCAGC	2	10	245912	245921	20 %	0 %	20 %	60 %	541862628
131	NC_022268	AAAAT	2	10	247167	247176	80 %	20 %	0 %	0 %	541862629
132	NC_022268	GCCGG	2	10	247882	247891	0 %	0 %	60 %	40 %	541862629
133	NC_022268	CAATC	2	10	248752	248761	40 %	20 %	0 %	40 %	541862630
134	NC_022268	CTTCA	2	10	251432	251441	20 %	40 %	0 %	40 %	541862633
135	NC_022268	TGGTT	2	10	253906	253915	0 %	60 %	40 %	0 %	541862635
136	NC_022268	ACCAC	2	10	257901	257910	40 %	0 %	0 %	60 %	541862638
137	NC_022268	GGCCT	2	10	258467	258476	0 %	20 %	40 %	40 %	541862639
138	NC_022268	CTATC	2	10	258722	258731	20 %	40 %	0 %	40 %	541862639
139	NC_022268	CGTAA	2	10	263734	263743	40 %	20 %	20 %	20 %	541862643
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141	NC_022268	CATGC	2	10	268260	268269	20 %	20 %	20 %	40 %	541862645
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145	NC_022268	ACCGT	2	10	273634	273643	20 %	20 %	20 %	40 %	541862648
146	NC_022268	CAGCA	2	10	276265	276274	40 %	0 %	20 %	40 %	541862650
147	NC_022268	GGCCA	2	10	277987	277996	20 %	0 %	40 %	40 %	541862651
148	NC_022268	TCTGA	2	10	278241	278250	20 %	40 %	20 %	20 %	541862651
149	NC_022268	ATCGC	2	10	279043	279052	20 %	20 %	20 %	40 %	541862652
150	NC_022268	GCAAC	2	10	280732	280741	40 %	0 %	20 %	40 %	541862654
151	NC_022268	CCGGG	2	10	281206	281215	0 %	0 %	60 %	40 %	541862654
152	NC_022268	CCCGG	2	10	281442	281451	0 %	0 %	40 %	60 %	541862654
153	NC_022268	CGCCA	2	10	282924	282933	20 %	0 %	20 %	60 %	541862655
154	NC_022268	TTGCG	2	10	283228	283237	0 %	40 %	40 %	20 %	541862655
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156	NC_022268	GTTCT	2	10	290397	290406	0 %	60 %	20 %	20 %	541862662
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160	NC_022268	AAACC	2	10	301480	301489	60 %	0 %	0 %	40 %	541862665
161	NC_022268	CTTCT	2	10	302060	302069	0 %	60 %	0 %	40 %	541862667
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164	NC_022268	CAAGC	2	10	308580	308589	40 %	0 %	20 %	40 %	541862671
165	NC_022268	GCAAC	2	10	308880	308889	40 %	0 %	20 %	40 %	541862671
166	NC_022268	CACCG	2	10	312311	312320	20 %	0 %	20 %	60 %	541862675
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168	NC_022268	GGCCA	2	10	316535	316544	20 %	0 %	40 %	40 %	541862678
169	NC_022268	GTAAA	2	10	317661	317670	60 %	20 %	20 %	0 %	541862679
170	NC_022268	GCGAT	2	10	318663	318672	20 %	20 %	40 %	20 %	541862680
171	NC_022268	TTGGG	2	10	318915	318924	0 %	40 %	60 %	0 %	541862680
172	NC_022268	TGAAG	2	10	323071	323080	40 %	20 %	40 %	0 %	541862684
173	NC_022268	GCCAG	2	10	325443	325452	20 %	0 %	40 %	40 %	541862687
174	NC_022268	TTTCC	2	10	334847	334856	0 %	60 %	0 %	40 %	541862697
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181	NC_022268	ATAAA	2	10	339857	339866	80 %	20 %	0 %	0 %	541862702
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242	NC_022268	CAGGC	2	10	463138	463147	20 %	0 %	40 %	40 %	541862816
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244	NC_022268	GCCTG	2	10	463840	463849	0 %	20 %	40 %	40 %	541862816
245	NC_022268	CATGC	2	10	465379	465388	20 %	20 %	20 %	40 %	541862818
246	NC_022268	CAACC	2	10	467891	467900	40 %	0 %	0 %	60 %	541862823
247	NC_022268	CTGTC	2	10	467920	467929	0 %	40 %	20 %	40 %	541862823
248	NC_022268	GGCCA	2	10	469418	469427	20 %	0 %	40 %	40 %	541862824
249	NC_022268	AGCGC	2	10	470217	470226	20 %	0 %	40 %	40 %	541862825
250	NC_022268	ATCGG	2	10	470342	470351	20 %	20 %	40 %	20 %	541862825
251	NC_022268	CGGGA	2	10	473760	473769	20 %	0 %	60 %	20 %	541862827
252	NC_022268	TATTG	2	10	474518	474527	20 %	60 %	20 %	0 %	541862828
253	NC_022268	GAAAA	2	10	477372	477381	80 %	0 %	20 %	0 %	541862831
254	NC_022268	GACCA	2	10	477466	477475	40 %	0 %	20 %	40 %	541862831
255	NC_022268	GATGG	2	10	477753	477762	20 %	20 %	60 %	0 %	541862831
256	NC_022268	CTCAT	2	10	479551	479560	20 %	40 %	0 %	40 %	541862832
257	NC_022268	TGTTT	2	10	481899	481908	0 %	80 %	20 %	0 %	541862834
258	NC_022268	CACAA	2	10	483099	483108	60 %	0 %	0 %	40 %	541862835
259	NC_022268	ATTCC	2	10	488810	488819	20 %	40 %	0 %	40 %	541862840
260	NC_022268	ATGGC	2	10	490344	490353	20 %	20 %	40 %	20 %	541862842
261	NC_022268	GCGCT	2	10	491111	491120	0 %	20 %	40 %	40 %	541862843
262	NC_022268	GAGTC	2	10	493007	493016	20 %	20 %	40 %	20 %	541862844
263	NC_022268	CGCGC	2	10	493428	493437	0 %	0 %	40 %	60 %	541862844
264	NC_022268	CCGGT	2	10	493981	493990	0 %	20 %	40 %	40 %	541862844
265	NC_022268	GCCAT	2	10	494928	494937	20 %	20 %	20 %	40 %	541862845
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374	NC_022268	CCATA	2	10	713917	713926	40 %	20 %	0 %	40 %	541863041
375	NC_022268	AGTGT	2	10	715752	715761	20 %	40 %	40 %	0 %	541863043
376	NC_022268	CGTTG	2	10	716711	716720	0 %	40 %	40 %	20 %	541863044
377	NC_022268	TTTTC	2	10	720862	720871	0 %	80 %	0 %	20 %	541863047
378	NC_022268	TTCAT	2	10	722953	722962	20 %	60 %	0 %	20 %	541863049
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381	NC_022268	TATAA	2	10	727831	727840	60 %	40 %	0 %	0 %	541863054
382	NC_022268	CCAGC	2	10	731108	731117	20 %	0 %	20 %	60 %	541863056
383	NC_022268	TGCAG	2	10	731416	731425	20 %	20 %	40 %	20 %	541863056
384	NC_022268	GTGAG	2	10	732209	732218	20 %	20 %	60 %	0 %	541863056
385	NC_022268	GGCCT	2	10	733580	733589	0 %	20 %	40 %	40 %	541863058
386	NC_022268	TGTGC	2	10	734460	734469	0 %	40 %	40 %	20 %	541863059
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388	NC_022268	GAAAT	2	10	739637	739646	60 %	20 %	20 %	0 %	541863063
389	NC_022268	AGGCC	2	10	739657	739666	20 %	0 %	40 %	40 %	541863063
390	NC_022268	GTACG	2	10	739692	739701	20 %	20 %	40 %	20 %	541863063
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