MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Bovismorbificans str. 3114 plasmid pVIRBov complete sequence

Total Repeats: 21

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022248	GCGCTG	2	12	4486	4497	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	538397729
2	NC_022248	CCACCG	2	12	5428	5439	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	538397729
3	NC_022248	CAAAAT	2	12	5474	5485	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	538397729
4	NC_022248	AATCTA	2	12	6404	6415	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	538397730
5	NC_022248	TGCGCC	2	12	9904	9915	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	538397733
6	NC_022248	ACAGGG	2	12	11194	11205	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	538397734
7	NC_022248	CAGGCT	2	12	11735	11746	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	538397735
8	NC_022248	GCTGTC	2	12	14157	14168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397739
9	NC_022248	CACTGT	2	12	14169	14180	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	538397739
10	NC_022248	CGGGGA	2	12	34659	34670	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	538397754
11	NC_022248	GCCGGT	2	12	35468	35479	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	538397755
12	NC_022248	ACCAGC	2	12	41563	41574	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	538397759
13	NC_022248	CATCGT	2	12	42042	42053	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	538397759
14	NC_022248	GCCCCA	2	12	44256	44267	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	538397760
15	NC_022248	CCACAT	2	12	44562	44573	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	538397760
16	NC_022248	ACCGTC	2	12	45083	45094	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	538397760
17	NC_022248	GGCTGT	2	12	48324	48335	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	538397762
18	NC_022248	ACGGTT	2	12	48995	49006	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	538397762
19	NC_022248	ATAAAA	2	12	71605	71616	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	538397772
20	NC_022248	CCAGCG	2	12	87043	87054	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	538397785
21	NC_022248	GGTAAG	2	12	92657	92668	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	538397787

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.