MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Bovismorbificans str. 3114 plasmid pVIRBov complete sequence

Total Repeats: 35

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022248	CCCGT	2	10	693	702	0 %	20 %	20 %	60 %	538397726
2	NC_022248	GTAAA	2	10	1170	1179	60 %	20 %	20 %	0 %	538397726
3	NC_022248	TCAAC	2	10	1686	1695	40 %	20 %	0 %	40 %	538397727
4	NC_022248	TAATA	2	10	5802	5811	60 %	40 %	0 %	0 %	538397729
5	NC_022248	ACTCA	2	10	6093	6102	40 %	20 %	0 %	40 %	538397729
6	NC_022248	ACCAG	2	10	6865	6874	40 %	0 %	20 %	40 %	538397730
7	NC_022248	ACGTC	2	10	12267	12276	20 %	20 %	20 %	40 %	538397736
8	NC_022248	AATCA	2	10	16218	16227	60 %	20 %	0 %	20 %	538397740
9	NC_022248	TGGAG	2	10	17213	17222	20 %	20 %	60 %	0 %	538397741
10	NC_022248	AAAAT	2	10	18252	18261	80 %	20 %	0 %	0 %	538397742
11	NC_022248	GCCAT	2	10	18411	18420	20 %	20 %	20 %	40 %	538397742
12	NC_022248	GTTAC	2	10	18740	18749	20 %	40 %	20 %	20 %	538397742
13	NC_022248	CGCAG	2	10	26192	26201	20 %	0 %	40 %	40 %	538397747
14	NC_022248	TGACC	2	10	26604	26613	20 %	20 %	20 %	40 %	538397748
15	NC_022248	TATTT	2	10	27039	27048	20 %	80 %	0 %	0 %	538397749
16	NC_022248	TGACC	2	10	30505	30514	20 %	20 %	20 %	40 %	538397750
17	NC_022248	GTTCA	2	10	32082	32091	20 %	40 %	20 %	20 %	538397751
18	NC_022248	TACCG	2	10	35182	35191	20 %	20 %	20 %	40 %	538397755
19	NC_022248	TGAAG	2	10	35491	35500	40 %	20 %	40 %	0 %	538397755
20	NC_022248	CGCTG	2	10	44160	44169	0 %	20 %	40 %	40 %	538397760
21	NC_022248	TTTCG	2	10	44377	44386	0 %	60 %	20 %	20 %	538397760
22	NC_022248	TCCGG	2	10	45600	45609	0 %	20 %	40 %	40 %	538397760
23	NC_022248	CGCGC	2	10	45749	45758	0 %	0 %	40 %	60 %	538397760
24	NC_022248	CCCGG	2	10	46249	46258	0 %	0 %	40 %	60 %	538397760
25	NC_022248	CAGGT	2	10	48615	48624	20 %	20 %	40 %	20 %	538397762
26	NC_022248	CCGGA	2	10	68726	68735	20 %	0 %	40 %	40 %	538397771
27	NC_022248	AATGT	2	10	71169	71178	40 %	40 %	20 %	0 %	538397772
28	NC_022248	ATTTA	2	10	73121	73130	40 %	60 %	0 %	0 %	538397775
29	NC_022248	TTATT	2	10	73982	73991	20 %	80 %	0 %	0 %	538397776
30	NC_022248	ATTTT	2	10	75460	75469	20 %	80 %	0 %	0 %	538397778
31	NC_022248	AGTTC	2	10	76404	76413	20 %	40 %	20 %	20 %	538397781
32	NC_022248	GCTTA	2	10	83178	83187	20 %	40 %	20 %	20 %	538397783
33	NC_022248	CGTCC	2	10	85582	85591	0 %	20 %	20 %	60 %	538397784
34	NC_022248	TGTGC	2	10	86884	86893	0 %	40 %	40 %	20 %	538397785
35	NC_022248	AAAAT	2	10	92232	92241	80 %	20 %	0 %	0 %	538397787

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.