MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Bovismorbificans str. 3114 plasmid pVIRBov complete sequence

Total Repeats: 292

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022248	CGGT	2	8	123	130	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_022248	CCAG	2	8	543	550	25 %	0 %	25 %	50 %	538397726
3	NC_022248	CGCC	2	8	610	617	0 %	0 %	25 %	75 %	538397726
4	NC_022248	TGTA	2	8	618	625	25 %	50 %	25 %	0 %	538397726
5	NC_022248	ATAA	2	8	650	657	75 %	25 %	0 %	0 %	538397726
6	NC_022248	CTGC	2	8	951	958	0 %	25 %	25 %	50 %	538397726
7	NC_022248	CAGC	2	8	1051	1058	25 %	0 %	25 %	50 %	538397726
8	NC_022248	TTCG	2	8	1520	1527	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_022248	ACAA	2	8	2390	2397	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_022248	TTAT	2	8	2477	2484	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022248	TTCT	2	8	2495	2502	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_022248	GAAT	2	8	3114	3121	50 %	25 %	25 %	0 %	538397728
13	NC_022248	ATAA	2	8	3267	3274	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022248	TTAT	2	8	3375	3382	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022248	CCGA	2	8	3963	3970	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_022248	AGTC	2	8	4411	4418	25 %	25 %	25 %	25 %	538397729
17	NC_022248	CGGA	2	8	4622	4629	25 %	0 %	50 %	25 %	538397729
18	NC_022248	TGGG	2	8	4774	4781	0 %	25 %	75 %	0 %	538397729
19	NC_022248	CGCC	2	8	5190	5197	0 %	0 %	25 %	75 %	538397729
20	NC_022248	AGTA	2	8	7107	7114	50 %	25 %	25 %	0 %	538397730
21	NC_022248	ACAT	2	8	7620	7627	50 %	25 %	0 %	25 %	538397732
22	NC_022248	GCGG	2	8	8104	8111	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
23	NC_022248	TCTG	2	8	8164	8171	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_022248	CCAT	2	8	8385	8392	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_022248	CTTA	2	8	8516	8523	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_022248	GTCA	2	8	9103	9110	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_022248	GCTG	2	8	9165	9172	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_022248	TGGC	2	8	9664	9671	0 %	25 %	50 %	25 %	538397733
29	NC_022248	CAGG	2	8	10287	10294	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_022248	TCGC	2	8	10428	10435	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_022248	CAGC	2	8	10485	10492	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_022248	CTGC	2	8	10693	10700	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
33	NC_022248	CTGC	2	8	10837	10844	0 %	25 %	25 %	50 %	538397734
34	NC_022248	CGGG	2	8	10877	10884	0 %	0 %	75 %	25 %	538397734
35	NC_022248	TCAC	2	8	10923	10930	25 %	25 %	0 %	50 %	538397734
36	NC_022248	CCCG	2	8	10934	10941	0 %	0 %	25 %	75 %	538397734
37	NC_022248	CGGG	2	8	10973	10980	0 %	0 %	75 %	25 %	538397734
38	NC_022248	CTGC	2	8	11255	11262	0 %	25 %	25 %	50 %	538397734
39	NC_022248	GGCT	2	8	11334	11341	0 %	25 %	50 %	25 %	538397735
40	NC_022248	CGGA	2	8	11711	11718	25 %	0 %	50 %	25 %	538397735
41	NC_022248	CGGC	2	8	11772	11779	0 %	0 %	50 %	50 %	538397735
42	NC_022248	CAGC	2	8	11909	11916	25 %	0 %	25 %	50 %	538397735
43	NC_022248	CGGT	2	8	12326	12333	0 %	25 %	50 %	25 %	538397736
44	NC_022248	GCTG	2	8	12468	12475	0 %	25 %	50 %	25 %	538397736
45	NC_022248	CCGC	2	8	12513	12520	0 %	0 %	25 %	75 %	538397736
46	NC_022248	CTGC	2	8	12786	12793	0 %	25 %	25 %	50 %	538397736
47	NC_022248	ACAG	2	8	12796	12803	50 %	0 %	25 %	25 %	538397736
48	NC_022248	AGAA	2	8	14740	14747	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022248	GAGC	2	8	15018	15025	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_022248	AATA	2	8	16351	16358	75 %	25 %	0 %	0 %	538397740
51	NC_022248	ATTA	2	8	16527	16534	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022248	CAGC	2	8	16602	16609	25 %	0 %	25 %	50 %	538397741
53	NC_022248	CCCG	2	8	17517	17524	0 %	0 %	25 %	75 %	538397741
54	NC_022248	CTGT	2	8	17664	17671	0 %	50 %	25 %	25 %	538397741
55	NC_022248	TGGC	2	8	17712	17719	0 %	25 %	50 %	25 %	538397742
56	NC_022248	TCTG	2	8	18205	18212	0 %	50 %	25 %	25 %	538397742
57	NC_022248	TTCA	2	8	18478	18485	25 %	50 %	0 %	25 %	538397742
58	NC_022248	CTGA	2	8	18779	18786	25 %	25 %	25 %	25 %	538397742
59	NC_022248	AGGG	2	8	19397	19404	25 %	0 %	75 %	0 %	538397742
60	NC_022248	TGGT	2	8	19494	19501	0 %	50 %	50 %	0 %	538397742
61	NC_022248	CTGA	2	8	19865	19872	25 %	25 %	25 %	25 %	538397742
62	NC_022248	TCCA	2	8	20125	20132	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_022248	AGAA	2	8	20405	20412	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022248	CTGC	2	8	20827	20834	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
65	NC_022248	TTTC	2	8	21011	21018	0 %	75 %	0 %	25 %	538397743
66	NC_022248	ACTG	2	8	22191	22198	25 %	25 %	25 %	25 %	538397745
67	NC_022248	CTGT	2	8	22209	22216	0 %	50 %	25 %	25 %	538397745
68	NC_022248	AAAT	2	8	22302	22309	75 %	25 %	0 %	0 %	538397745
69	NC_022248	GATG	2	8	22506	22513	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022248	GTCT	2	8	23475	23482	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_022248	CAGT	2	8	23656	23663	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_022248	GCCA	2	8	24178	24185	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
73	NC_022248	TTTA	2	8	24531	24538	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022248	GTGA	2	8	24595	24602	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022248	ATCT	2	8	24854	24861	25 %	50 %	0 %	25 %	538397746
76	NC_022248	TGGG	2	8	25080	25087	0 %	25 %	75 %	0 %	538397746
77	NC_022248	GAAA	2	8	25169	25176	75 %	0 %	25 %	0 %	538397746
78	NC_022248	TATT	2	8	25621	25628	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022248	TTGT	2	8	25779	25786	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022248	TTTG	2	8	25787	25794	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022248	AAAC	2	8	25830	25837	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_022248	GTTT	2	8	25863	25870	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022248	TCAG	2	8	26182	26189	25 %	25 %	25 %	25 %	538397747
84	NC_022248	AGCC	2	8	26419	26426	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
85	NC_022248	CCGG	2	8	27395	27402	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_022248	GACG	2	8	29444	29451	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_022248	ACCA	2	8	29778	29785	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_022248	AGAA	2	8	30360	30367	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022248	TGCG	2	8	30396	30403	0 %	25 %	50 %	25 %	538397750
90	NC_022248	CTGG	2	8	30733	30740	0 %	25 %	50 %	25 %	538397750
91	NC_022248	ACTG	2	8	31002	31009	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_022248	TCCA	2	8	31283	31290	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_022248	CTGG	2	8	31300	31307	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
94	NC_022248	AGGG	2	8	31325	31332	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022248	GGCG	2	8	31939	31946	0 %	0 %	75 %	25 %	538397751
96	NC_022248	CCTT	2	8	32101	32108	0 %	50 %	0 %	50 %	538397751
97	NC_022248	CTCC	2	8	32129	32136	0 %	25 %	0 %	75 %	538397751
98	NC_022248	ATTT	2	8	32521	32528	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_022248	GCCC	2	8	32893	32900	0 %	0 %	25 %	75 %	538397752
100	NC_022248	CGGC	2	8	33082	33089	0 %	0 %	50 %	50 %	538397752
101	NC_022248	TTTA	2	8	33424	33431	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022248	TTCA	2	8	33954	33961	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_022248	GACC	2	8	34403	34410	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
104	NC_022248	GTGA	2	8	34749	34756	25 %	25 %	50 %	0 %	538397754
105	NC_022248	TGTA	2	8	34837	34844	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_022248	ACGG	2	8	35526	35533	25 %	0 %	50 %	25 %	538397755
107	NC_022248	CCGG	2	8	35885	35892	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_022248	GGGA	2	8	35934	35941	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022248	CAGA	2	8	36069	36076	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_022248	TCCG	2	8	36229	36236	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
111	NC_022248	ATTT	2	8	36685	36692	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_022248	GGGC	2	8	37510	37517	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
113	NC_022248	TTAT	3	12	37557	37568	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022248	TCGG	2	8	38309	38316	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
115	NC_022248	GGTA	2	8	38352	38359	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_022248	CGAA	3	12	38581	38592	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_022248	GTCA	2	8	38746	38753	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_022248	CTGC	2	8	38757	38764	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
119	NC_022248	GCCA	2	8	38986	38993	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
120	NC_022248	CTTT	2	8	39160	39167	0 %	75 %	0 %	25 %	538397757
121	NC_022248	ATGT	2	8	39168	39175	25 %	50 %	25 %	0 %	538397757
122	NC_022248	ACTT	2	8	39384	39391	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_022248	GCCA	2	8	39793	39800	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
124	NC_022248	ACGG	2	8	39910	39917	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
125	NC_022248	CACG	2	8	40952	40959	25 %	0 %	25 %	50 %	538397758
126	NC_022248	ACTG	2	8	41038	41045	25 %	25 %	25 %	25 %	538397758
127	NC_022248	CAGC	2	8	41123	41130	25 %	0 %	25 %	50 %	538397758
128	NC_022248	CCCG	2	8	42076	42083	0 %	0 %	25 %	75 %	538397760
129	NC_022248	CTGC	2	8	42369	42376	0 %	25 %	25 %	50 %	538397760
130	NC_022248	CCAG	2	8	42572	42579	25 %	0 %	25 %	50 %	538397760
131	NC_022248	CTGC	2	8	43551	43558	0 %	25 %	25 %	50 %	538397760
132	NC_022248	CTGA	2	8	44677	44684	25 %	25 %	25 %	25 %	538397760
133	NC_022248	CCGG	2	8	45207	45214	0 %	0 %	50 %	50 %	538397760
134	NC_022248	TCCC	2	8	45261	45268	0 %	25 %	0 %	75 %	538397760
135	NC_022248	CCAG	2	8	45411	45418	25 %	0 %	25 %	50 %	538397760
136	NC_022248	CACG	2	8	45513	45520	25 %	0 %	25 %	50 %	538397760
137	NC_022248	GACA	2	8	46153	46160	50 %	0 %	25 %	25 %	538397760
138	NC_022248	CCGC	2	8	46428	46435	0 %	0 %	25 %	75 %	538397760
139	NC_022248	CGTC	2	8	46941	46948	0 %	25 %	25 %	50 %	538397760
140	NC_022248	TCAG	2	8	47015	47022	25 %	25 %	25 %	25 %	538397760
141	NC_022248	GAAA	2	8	47793	47800	75 %	0 %	25 %	0 %	538397761
142	NC_022248	GTTT	2	8	47819	47826	0 %	75 %	25 %	0 %	538397761
143	NC_022248	GCCG	2	8	47855	47862	0 %	0 %	50 %	50 %	538397761
144	NC_022248	CACG	2	8	47943	47950	25 %	0 %	25 %	50 %	538397761
145	NC_022248	GTGG	2	8	48000	48007	0 %	25 %	75 %	0 %	538397761
146	NC_022248	CAGC	2	8	49103	49110	25 %	0 %	25 %	50 %	538397762
147	NC_022248	AGGT	2	8	49290	49297	25 %	25 %	50 %	0 %	538397762
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.