MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Bovismorbificans str. 3114 plasmid pVIRBov complete sequence

Total Repeats: 121

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022248	CCAG	2	8	543	550	25 %	0 %	25 %	50 %	538397726
2	NC_022248	CGCC	2	8	610	617	0 %	0 %	25 %	75 %	538397726
3	NC_022248	TGTA	2	8	618	625	25 %	50 %	25 %	0 %	538397726
4	NC_022248	ATAA	2	8	650	657	75 %	25 %	0 %	0 %	538397726
5	NC_022248	CTGC	2	8	951	958	0 %	25 %	25 %	50 %	538397726
6	NC_022248	CAGC	2	8	1051	1058	25 %	0 %	25 %	50 %	538397726
7	NC_022248	GAAT	2	8	3114	3121	50 %	25 %	25 %	0 %	538397728
8	NC_022248	AGTC	2	8	4411	4418	25 %	25 %	25 %	25 %	538397729
9	NC_022248	CGGA	2	8	4622	4629	25 %	0 %	50 %	25 %	538397729
10	NC_022248	TGGG	2	8	4774	4781	0 %	25 %	75 %	0 %	538397729
11	NC_022248	CGCC	2	8	5190	5197	0 %	0 %	25 %	75 %	538397729
12	NC_022248	AGTA	2	8	7107	7114	50 %	25 %	25 %	0 %	538397730
13	NC_022248	ACAT	2	8	7620	7627	50 %	25 %	0 %	25 %	538397732
14	NC_022248	TGGC	2	8	9664	9671	0 %	25 %	50 %	25 %	538397733
15	NC_022248	CTGC	2	8	10837	10844	0 %	25 %	25 %	50 %	538397734
16	NC_022248	CGGG	2	8	10877	10884	0 %	0 %	75 %	25 %	538397734
17	NC_022248	TCAC	2	8	10923	10930	25 %	25 %	0 %	50 %	538397734
18	NC_022248	CCCG	2	8	10934	10941	0 %	0 %	25 %	75 %	538397734
19	NC_022248	CGGG	2	8	10973	10980	0 %	0 %	75 %	25 %	538397734
20	NC_022248	CTGC	2	8	11255	11262	0 %	25 %	25 %	50 %	538397734
21	NC_022248	GGCT	2	8	11334	11341	0 %	25 %	50 %	25 %	538397735
22	NC_022248	CGGA	2	8	11711	11718	25 %	0 %	50 %	25 %	538397735
23	NC_022248	CGGC	2	8	11772	11779	0 %	0 %	50 %	50 %	538397735
24	NC_022248	CAGC	2	8	11909	11916	25 %	0 %	25 %	50 %	538397735
25	NC_022248	CGGT	2	8	12326	12333	0 %	25 %	50 %	25 %	538397736
26	NC_022248	GCTG	2	8	12468	12475	0 %	25 %	50 %	25 %	538397736
27	NC_022248	CCGC	2	8	12513	12520	0 %	0 %	25 %	75 %	538397736
28	NC_022248	CTGC	2	8	12786	12793	0 %	25 %	25 %	50 %	538397736
29	NC_022248	ACAG	2	8	12796	12803	50 %	0 %	25 %	25 %	538397736
30	NC_022248	AATA	2	8	16351	16358	75 %	25 %	0 %	0 %	538397740
31	NC_022248	CAGC	2	8	16602	16609	25 %	0 %	25 %	50 %	538397741
32	NC_022248	CCCG	2	8	17517	17524	0 %	0 %	25 %	75 %	538397741
33	NC_022248	CTGT	2	8	17664	17671	0 %	50 %	25 %	25 %	538397741
34	NC_022248	TGGC	2	8	17712	17719	0 %	25 %	50 %	25 %	538397742
35	NC_022248	TCTG	2	8	18205	18212	0 %	50 %	25 %	25 %	538397742
36	NC_022248	TTCA	2	8	18478	18485	25 %	50 %	0 %	25 %	538397742
37	NC_022248	CTGA	2	8	18779	18786	25 %	25 %	25 %	25 %	538397742
38	NC_022248	AGGG	2	8	19397	19404	25 %	0 %	75 %	0 %	538397742
39	NC_022248	TGGT	2	8	19494	19501	0 %	50 %	50 %	0 %	538397742
40	NC_022248	CTGA	2	8	19865	19872	25 %	25 %	25 %	25 %	538397742
41	NC_022248	TTTC	2	8	21011	21018	0 %	75 %	0 %	25 %	538397743
42	NC_022248	ACTG	2	8	22191	22198	25 %	25 %	25 %	25 %	538397745
43	NC_022248	CTGT	2	8	22209	22216	0 %	50 %	25 %	25 %	538397745
44	NC_022248	AAAT	2	8	22302	22309	75 %	25 %	0 %	0 %	538397745
45	NC_022248	ATCT	2	8	24854	24861	25 %	50 %	0 %	25 %	538397746
46	NC_022248	TGGG	2	8	25080	25087	0 %	25 %	75 %	0 %	538397746
47	NC_022248	GAAA	2	8	25169	25176	75 %	0 %	25 %	0 %	538397746
48	NC_022248	TCAG	2	8	26182	26189	25 %	25 %	25 %	25 %	538397747
49	NC_022248	TGCG	2	8	30396	30403	0 %	25 %	50 %	25 %	538397750
50	NC_022248	CTGG	2	8	30733	30740	0 %	25 %	50 %	25 %	538397750
51	NC_022248	GGCG	2	8	31939	31946	0 %	0 %	75 %	25 %	538397751
52	NC_022248	CCTT	2	8	32101	32108	0 %	50 %	0 %	50 %	538397751
53	NC_022248	CTCC	2	8	32129	32136	0 %	25 %	0 %	75 %	538397751
54	NC_022248	GCCC	2	8	32893	32900	0 %	0 %	25 %	75 %	538397752
55	NC_022248	CGGC	2	8	33082	33089	0 %	0 %	50 %	50 %	538397752
56	NC_022248	GTGA	2	8	34749	34756	25 %	25 %	50 %	0 %	538397754
57	NC_022248	ACGG	2	8	35526	35533	25 %	0 %	50 %	25 %	538397755
58	NC_022248	CTTT	2	8	39160	39167	0 %	75 %	0 %	25 %	538397757
59	NC_022248	ATGT	2	8	39168	39175	25 %	50 %	25 %	0 %	538397757
60	NC_022248	CACG	2	8	40952	40959	25 %	0 %	25 %	50 %	538397758
61	NC_022248	ACTG	2	8	41038	41045	25 %	25 %	25 %	25 %	538397758
62	NC_022248	CAGC	2	8	41123	41130	25 %	0 %	25 %	50 %	538397758
63	NC_022248	CCCG	2	8	42076	42083	0 %	0 %	25 %	75 %	538397760
64	NC_022248	CTGC	2	8	42369	42376	0 %	25 %	25 %	50 %	538397760
65	NC_022248	CCAG	2	8	42572	42579	25 %	0 %	25 %	50 %	538397760
66	NC_022248	CTGC	2	8	43551	43558	0 %	25 %	25 %	50 %	538397760
67	NC_022248	CTGA	2	8	44677	44684	25 %	25 %	25 %	25 %	538397760
68	NC_022248	CCGG	2	8	45207	45214	0 %	0 %	50 %	50 %	538397760
69	NC_022248	TCCC	2	8	45261	45268	0 %	25 %	0 %	75 %	538397760
70	NC_022248	CCAG	2	8	45411	45418	25 %	0 %	25 %	50 %	538397760
71	NC_022248	CACG	2	8	45513	45520	25 %	0 %	25 %	50 %	538397760
72	NC_022248	GACA	2	8	46153	46160	50 %	0 %	25 %	25 %	538397760
73	NC_022248	CCGC	2	8	46428	46435	0 %	0 %	25 %	75 %	538397760
74	NC_022248	CGTC	2	8	46941	46948	0 %	25 %	25 %	50 %	538397760
75	NC_022248	TCAG	2	8	47015	47022	25 %	25 %	25 %	25 %	538397760
76	NC_022248	GAAA	2	8	47793	47800	75 %	0 %	25 %	0 %	538397761
77	NC_022248	GTTT	2	8	47819	47826	0 %	75 %	25 %	0 %	538397761
78	NC_022248	GCCG	2	8	47855	47862	0 %	0 %	50 %	50 %	538397761
79	NC_022248	CACG	2	8	47943	47950	25 %	0 %	25 %	50 %	538397761
80	NC_022248	GTGG	2	8	48000	48007	0 %	25 %	75 %	0 %	538397761
81	NC_022248	CAGC	2	8	49103	49110	25 %	0 %	25 %	50 %	538397762
82	NC_022248	AGGT	2	8	49290	49297	25 %	25 %	50 %	0 %	538397762
83	NC_022248	GTCC	2	8	49398	49405	0 %	25 %	25 %	50 %	538397762
84	NC_022248	CTTC	2	8	49426	49433	0 %	50 %	0 %	50 %	538397762
85	NC_022248	AGCC	2	8	49631	49638	25 %	0 %	25 %	50 %	538397762
86	NC_022248	ACTG	2	8	49664	49671	25 %	25 %	25 %	25 %	538397762
87	NC_022248	TTAA	2	8	50028	50035	50 %	50 %	0 %	0 %	538397762
88	NC_022248	TTTA	2	8	50664	50671	25 %	75 %	0 %	0 %	538397763
89	NC_022248	GATT	2	8	51275	51282	25 %	50 %	25 %	0 %	538397764
90	NC_022248	CCGT	2	8	51835	51842	0 %	25 %	25 %	50 %	538397764
91	NC_022248	ACGG	2	8	57713	57720	25 %	0 %	50 %	25 %	538397765
92	NC_022248	CAGC	2	8	57953	57960	25 %	0 %	25 %	50 %	538397765
93	NC_022248	TGCC	2	8	67342	67349	0 %	25 %	25 %	50 %	538397770
94	NC_022248	CAGC	2	8	68885	68892	25 %	0 %	25 %	50 %	538397771
95	NC_022248	CCAG	2	8	71132	71139	25 %	0 %	25 %	50 %	538397772
96	NC_022248	ACAG	2	8	71886	71893	50 %	0 %	25 %	25 %	538397773
97	NC_022248	AATT	2	8	71901	71908	50 %	50 %	0 %	0 %	538397773
98	NC_022248	TGGT	2	8	71938	71945	0 %	50 %	50 %	0 %	538397773
99	NC_022248	CCTT	2	8	72927	72934	0 %	50 %	0 %	50 %	538397775
100	NC_022248	AATA	2	8	73057	73064	75 %	25 %	0 %	0 %	538397775
101	NC_022248	TTCC	2	8	73395	73402	0 %	50 %	0 %	50 %	538397775
102	NC_022248	TCTG	2	8	73837	73844	0 %	50 %	25 %	25 %	538397776
103	NC_022248	TCCT	2	8	73950	73957	0 %	50 %	0 %	50 %	538397776
104	NC_022248	CTGT	2	8	74460	74467	0 %	50 %	25 %	25 %	538397777
105	NC_022248	GGAA	2	8	74569	74576	50 %	0 %	50 %	0 %	538397777
106	NC_022248	CCTG	2	8	74710	74717	0 %	25 %	25 %	50 %	538397777
107	NC_022248	CCCG	2	8	74904	74911	0 %	0 %	25 %	75 %	538397777
108	NC_022248	CAGT	2	8	75485	75492	25 %	25 %	25 %	25 %	538397778
109	NC_022248	GGCA	2	8	75846	75853	25 %	0 %	50 %	25 %	538397779
110	NC_022248	GGGC	2	8	77183	77190	0 %	0 %	75 %	25 %	538397782
111	NC_022248	TCGA	2	8	82441	82448	25 %	25 %	25 %	25 %	538397783
112	NC_022248	GGCT	2	8	82466	82473	0 %	25 %	50 %	25 %	538397783
113	NC_022248	TACA	2	8	82994	83001	50 %	25 %	0 %	25 %	538397783
114	NC_022248	GCCA	2	8	85506	85513	25 %	0 %	25 %	50 %	538397784
115	NC_022248	TTTC	2	8	86476	86483	0 %	75 %	0 %	25 %	538397785
116	NC_022248	ACCA	2	8	88898	88905	50 %	0 %	0 %	50 %	538397786
117	NC_022248	AAAC	2	8	88933	88940	75 %	0 %	0 %	25 %	538397786
118	NC_022248	TGTC	2	8	88958	88965	0 %	50 %	25 %	25 %	538397786
119	NC_022248	GTAT	2	8	89582	89589	25 %	50 %	25 %	0 %	538397786
120	NC_022248	TGTT	2	8	92415	92422	0 %	75 %	25 %	0 %	538397787
121	NC_022248	CGGT	2	8	92982	92989	0 %	25 %	50 %	25 %	538397787

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.