MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Bovismorbificans str. 3114 plasmid pVIRBov complete sequence

Total Repeats: 761

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022248	TGG	2	6	24	29	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022248	ATT	2	6	64	69	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022248	TAA	2	6	70	75	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022248	CTA	2	6	1448	1453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_022248	ATT	2	6	1721	1726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022248	GTT	2	6	1766	1771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022248	CAT	2	6	1783	1788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_022248	ATT	2	6	1949	1954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022248	TAT	2	6	1972	1977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022248	TAA	2	6	1990	1995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022248	GAA	2	6	2134	2139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022248	AAC	2	6	2250	2255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_022248	ATA	2	6	2261	2266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022248	ATA	2	6	2369	2374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022248	GAA	2	6	2375	2380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022248	ATT	2	6	2421	2426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022248	GAG	2	6	2555	2560	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022248	ACA	2	6	2674	2679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_022248	CCT	2	6	2775	2780	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_022248	CAG	2	6	2840	2845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_022248	TCC	2	6	2942	2947	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_022248	TGG	2	6	3025	3030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022248	TGT	2	6	3210	3215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022248	CAG	2	6	3250	3255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_022248	AAT	2	6	3310	3315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022248	TCA	2	6	3369	3374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_022248	ACC	2	6	3396	3401	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_022248	ATT	3	9	3466	3474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022248	TTA	2	6	3511	3516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022248	GCA	2	6	3641	3646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_022248	CGG	2	6	3686	3691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_022248	TGG	2	6	3736	3741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022248	ATG	2	6	3745	3750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022248	CTG	2	6	3774	3779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_022248	CTG	2	6	3816	3821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_022248	AGC	2	6	3858	3863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_022248	AGC	2	6	3949	3954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_022248	ACA	2	6	3976	3981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_022248	CCG	2	6	4033	4038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_022248	AGT	2	6	4165	4170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022248	AGC	2	6	4172	4177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_022248	CGG	2	6	4236	4241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_022248	AGT	2	6	6203	6208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022248	CTT	2	6	6232	6237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_022248	TAA	2	6	6344	6349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022248	CAC	2	6	8203	8208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_022248	CAG	2	6	8240	8245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_022248	CTG	2	6	8279	8284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_022248	CGA	2	6	8297	8302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_022248	ATT	2	6	8315	8320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022248	CAG	2	6	8360	8365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_022248	GAA	2	6	8539	8544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022248	GTG	2	6	8561	8566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022248	CCT	2	6	9063	9068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_022248	CAG	2	6	9265	9270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_022248	CGG	2	6	9294	9299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_022248	TTC	2	6	9314	9319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_022248	ACG	2	6	9399	9404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_022248	TCC	2	6	9458	9463	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_022248	GTG	2	6	10063	10068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022248	AGG	2	6	10120	10125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022248	GTC	2	6	10220	10225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_022248	GCT	2	6	10228	10233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_022248	GCG	2	6	10242	10247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_022248	CAT	2	6	10261	10266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_022248	CAG	2	6	10312	10317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_022248	GCG	2	6	10339	10344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_022248	CGT	2	6	10452	10457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_022248	GCC	2	6	10463	10468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_022248	GCA	2	6	10535	10540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_022248	TCC	2	6	10584	10589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_022248	CAG	2	6	10596	10601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_022248	GCC	2	6	10675	10680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_022248	AGC	2	6	10681	10686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_022248	CGG	2	6	10701	10706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_022248	ACC	2	6	10718	10723	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_022248	CAT	2	6	12858	12863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_022248	CGC	2	6	12922	12927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_022248	CAG	2	6	12995	13000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_022248	GAC	2	6	13114	13119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_022248	CGT	2	6	13229	13234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_022248	CAG	2	6	13253	13258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_022248	GTC	2	6	13299	13304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_022248	CGC	2	6	14314	14319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_022248	TAT	2	6	14396	14401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022248	TAG	2	6	14641	14646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022248	GCA	2	6	14680	14685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_022248	GGA	2	6	14699	14704	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022248	TCA	2	6	14811	14816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_022248	TGC	2	6	14825	14830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_022248	CAT	2	6	14892	14897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_022248	CAA	2	6	14970	14975	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_022248	ATT	2	6	15052	15057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_022248	GAA	2	6	15170	15175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022248	TCA	2	6	15208	15213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_022248	AGC	2	6	15220	15225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_022248	TGC	2	6	15259	15264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_022248	CGC	2	6	15337	15342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_022248	CGC	2	6	15500	15505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_022248	AAT	2	6	15525	15530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022248	AAT	2	6	15580	15585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022248	GCT	2	6	16458	16463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_022248	TCA	2	6	16476	16481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_022248	GCA	2	6	16485	16490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_022248	CAT	2	6	16501	16506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_022248	AGC	2	6	20112	20117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_022248	TCA	2	6	20139	20144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_022248	CTT	2	6	20195	20200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_022248	TCA	2	6	20323	20328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_022248	CAT	2	6	20464	20469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_022248	ATG	2	6	20584	20589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_022248	CAG	2	6	20687	20692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_022248	TTC	2	6	20720	20725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_022248	GCA	2	6	20734	20739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_022248	ATC	2	6	20789	20794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_022248	GTT	2	6	20863	20868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_022248	AAC	2	6	21234	21239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_022248	GAA	2	6	21285	21290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_022248	CGT	2	6	21487	21492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_022248	CAT	2	6	22076	22081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_022248	CTG	2	6	22141	22146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_022248	GTT	2	6	22417	22422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_022248	AGG	2	6	22459	22464	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_022248	CTG	2	6	22478	22483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_022248	ATG	2	6	22491	22496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_022248	TGC	2	6	22616	22621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_022248	CAG	2	6	22658	22663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_022248	GAA	2	6	22672	22677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_022248	CTG	2	6	22702	22707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_022248	TAA	2	6	22772	22777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_022248	ATT	2	6	22879	22884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_022248	CAG	2	6	22913	22918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_022248	TAA	2	6	22949	22954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_022248	AGA	2	6	22985	22990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_022248	GGA	2	6	23028	23033	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_022248	TAT	2	6	23091	23096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_022248	CTT	2	6	23157	23162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_022248	GTT	2	6	23188	23193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_022248	GCT	2	6	23227	23232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_022248	GTT	2	6	23296	23301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_022248	TCC	2	6	23318	23323	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_022248	GAA	2	6	23462	23467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_022248	TGC	3	9	23868	23876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_022248	AGC	2	6	24048	24053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_022248	CCG	2	6	24124	24129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
146	NC_022248	ATG	2	6	24150	24155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_022248	CTT	2	6	24227	24232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_022248	TGA	2	6	24253	24258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_022248	ACT	2	6	24310	24315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_022248	TTA	2	6	24322	24327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_022248	TGA	2	6	24384	24389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
152	NC_022248	AGC	2	6	24391	24396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_022248	CGT	2	6	24472	24477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_022248	CAC	2	6	24572	24577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
155	NC_022248	GGA	2	6	24630	24635	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
156	NC_022248	CGT	2	6	24740	24745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
157	NC_022248	ATA	2	6	25534	25539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_022248	TAT	2	6	25567	25572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_022248	CTG	2	6	25747	25752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
160	NC_022248	TGT	2	6	26228	26233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
161	NC_022248	TTA	2	6	26332	26337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_022248	GAA	2	6	26409	26414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
163	NC_022248	TTA	2	6	27164	27169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_022248	TCC	2	6	27205	27210	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
165	NC_022248	GTT	2	6	27236	27241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
166	NC_022248	TCA	2	6	27250	27255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
167	NC_022248	TAT	2	6	27407	27412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_022248	TGC	2	6	27565	27570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
169	NC_022248	CGG	2	6	27708	27713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
170	NC_022248	CTG	2	6	27914	27919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
171	NC_022248	GGC	2	6	27973	27978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
172	NC_022248	TGC	2	6	27999	28004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
173	NC_022248	GTG	2	6	28103	28108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
174	NC_022248	GAT	2	6	28130	28135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
175	NC_022248	TGG	2	6	28161	28166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
176	NC_022248	GGA	2	6	28174	28179	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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183	NC_022248	CGG	2	6	28411	28416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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185	NC_022248	GCT	2	6	28567	28572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
186	NC_022248	ACA	2	6	28644	28649	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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191	NC_022248	CAG	3	9	28927	28935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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