MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Bovismorbificans str. 3114 plasmid pVIRBov complete sequence

Total Repeats: 573

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022248	TGA	2	6	434	439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538397726
2	NC_022248	GAT	2	6	574	579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538397726
3	NC_022248	CCA	2	6	591	596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538397726
4	NC_022248	TGC	3	9	669	677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397726
5	NC_022248	TTC	2	6	892	897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538397726
6	NC_022248	TGA	2	6	1011	1016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538397726
7	NC_022248	GGC	2	6	1210	1215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397726
8	NC_022248	GCA	2	6	1257	1262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397726
9	NC_022248	TTG	2	6	1306	1311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538397726
10	NC_022248	TTC	2	6	1336	1341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538397726
11	NC_022248	TGC	2	6	1351	1356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397726
12	NC_022248	TAA	2	6	1577	1582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538397727
13	NC_022248	GAA	2	6	3078	3083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538397728
14	NC_022248	GTT	2	6	3151	3156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538397728
15	NC_022248	GTT	2	6	3188	3193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538397728
16	NC_022248	CAG	2	6	4503	4508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397729
17	NC_022248	GGC	2	6	4513	4518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397729
18	NC_022248	CGC	2	6	4567	4572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397729
19	NC_022248	GAT	2	6	4795	4800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538397729
20	NC_022248	CTG	2	6	4837	4842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397729
21	NC_022248	CCG	2	6	4850	4855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397729
22	NC_022248	GCC	2	6	4879	4884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397729
23	NC_022248	GAG	2	6	4909	4914	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538397729
24	NC_022248	CGC	2	6	5058	5063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397729
25	NC_022248	GTG	2	6	5138	5143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538397729
26	NC_022248	GCC	2	6	5252	5257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397729
27	NC_022248	CCA	2	6	5271	5276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538397729
28	NC_022248	TGA	2	6	5283	5288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538397729
29	NC_022248	CTG	3	9	5320	5328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397729
30	NC_022248	GCT	2	6	5365	5370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397729
31	NC_022248	AGA	2	6	5401	5406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538397729
32	NC_022248	CAA	2	6	5415	5420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538397729
33	NC_022248	ATG	2	6	5422	5427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538397729
34	NC_022248	CCT	2	6	5440	5445	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538397729
35	NC_022248	GAT	2	6	5448	5453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538397729
36	NC_022248	TAA	2	6	5556	5561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538397729
37	NC_022248	GAT	2	6	5575	5580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538397729
38	NC_022248	TGA	2	6	5646	5651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538397729
39	NC_022248	ACT	2	6	5791	5796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538397729
40	NC_022248	TGA	2	6	6039	6044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538397729
41	NC_022248	CTG	2	6	6050	6055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397729
42	NC_022248	AAT	2	6	6075	6080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538397729
43	NC_022248	CCT	2	6	6422	6427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538397730
44	NC_022248	GCT	2	6	6440	6445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397730
45	NC_022248	ATG	2	6	6447	6452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538397730
46	NC_022248	AAT	2	6	6488	6493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538397730
47	NC_022248	TCG	2	6	6652	6657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397730
48	NC_022248	CAA	2	6	6818	6823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538397730
49	NC_022248	CGT	2	6	6894	6899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397730
50	NC_022248	TGG	2	6	7048	7053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538397730
51	NC_022248	TGA	2	6	7098	7103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538397730
52	NC_022248	TTA	2	6	7177	7182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538397731
53	NC_022248	ATA	2	6	7406	7411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538397732
54	NC_022248	AAT	3	9	7436	7444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538397732
55	NC_022248	ATA	2	6	7560	7565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538397732
56	NC_022248	TAT	2	6	7596	7601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538397732
57	NC_022248	GAA	2	6	7651	7656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538397732
58	NC_022248	TTG	2	6	7692	7697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538397732
59	NC_022248	AAT	2	6	7837	7842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538397732
60	NC_022248	TCA	3	9	7973	7981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538397732
61	NC_022248	ATG	2	6	8004	8009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538397732
62	NC_022248	CGC	2	6	9540	9545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397733
63	NC_022248	CGG	3	9	9641	9649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397733
64	NC_022248	CTG	2	6	9708	9713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397733
65	NC_022248	CAG	2	6	9740	9745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397733
66	NC_022248	CCG	2	6	9787	9792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397733
67	NC_022248	CCG	2	6	9803	9808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397733
68	NC_022248	TCG	2	6	9820	9825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397733
69	NC_022248	GGT	2	6	9836	9841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538397733
70	NC_022248	GGC	2	6	9966	9971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397733
71	NC_022248	ATG	2	6	10813	10818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538397734
72	NC_022248	GGC	2	6	10847	10852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397734
73	NC_022248	CCG	2	6	10869	10874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397734
74	NC_022248	CAG	2	6	10886	10891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397734
75	NC_022248	CGG	2	6	10959	10964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397734
76	NC_022248	CAC	2	6	11000	11005	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538397734
77	NC_022248	GTC	3	9	11057	11065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397734
78	NC_022248	CGG	2	6	11106	11111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397734
79	NC_022248	CCA	2	6	11174	11179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538397734
80	NC_022248	AAC	2	6	11280	11285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538397734
81	NC_022248	ATC	2	6	11514	11519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538397735
82	NC_022248	GTC	2	6	11564	11569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397735
83	NC_022248	GGC	2	6	11591	11596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397735
84	NC_022248	CCG	2	6	11611	11616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397735
85	NC_022248	CAG	2	6	11702	11707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397735
86	NC_022248	GCG	2	6	11722	11727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397735
87	NC_022248	TCA	3	9	11758	11766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538397735
88	NC_022248	TCG	2	6	11814	11819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397735
89	NC_022248	GCA	2	6	11830	11835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397735
90	NC_022248	CCG	2	6	11841	11846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397735
91	NC_022248	CAG	2	6	11888	11893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397735
92	NC_022248	CAC	2	6	11936	11941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538397735
93	NC_022248	CCT	2	6	11946	11951	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538397735
94	NC_022248	CCT	2	6	12050	12055	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538397736
95	NC_022248	GCA	2	6	12183	12188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397736
96	NC_022248	ACG	2	6	12379	12384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397736
97	NC_022248	CCA	2	6	12408	12413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538397736
98	NC_022248	GCC	2	6	12503	12508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397736
99	NC_022248	GGT	2	6	12554	12559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538397736
100	NC_022248	CAG	2	6	12631	12636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397736
101	NC_022248	CAG	2	6	12691	12696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397736
102	NC_022248	GTC	2	6	12709	12714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397736
103	NC_022248	TGC	2	6	12716	12721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397736
104	NC_022248	GCC	2	6	12746	12751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397736
105	NC_022248	GCA	2	6	12771	12776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397736
106	NC_022248	GGT	2	6	13384	13389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538397737
107	NC_022248	CCG	2	6	13424	13429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397737
108	NC_022248	ACC	2	6	13487	13492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538397737
109	NC_022248	GCG	2	6	13597	13602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397737
110	NC_022248	GCC	2	6	13621	13626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397737
111	NC_022248	ACT	2	6	13636	13641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538397737
112	NC_022248	AGC	2	6	13643	13648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397737
113	NC_022248	CAG	2	6	13784	13789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397738
114	NC_022248	CAG	2	6	13850	13855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397738
115	NC_022248	CCG	2	6	13883	13888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397738
116	NC_022248	ATG	2	6	13902	13907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538397738
117	NC_022248	TGT	2	6	13988	13993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538397739
118	NC_022248	TTC	2	6	14055	14060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538397739
119	NC_022248	CGG	2	6	14083	14088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397739
120	NC_022248	CGT	2	6	14132	14137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397739
121	NC_022248	AGC	2	6	14146	14151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397739
122	NC_022248	GCT	2	6	14186	14191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397739
123	NC_022248	AAG	2	6	15676	15681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538397740
124	NC_022248	CTT	2	6	15721	15726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538397740
125	NC_022248	AAT	2	6	15739	15744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538397740
126	NC_022248	CTG	2	6	16018	16023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397740
127	NC_022248	ATT	2	6	16030	16035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538397740
128	NC_022248	GTG	2	6	16043	16048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538397740
129	NC_022248	AGG	2	6	16115	16120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538397740
130	NC_022248	AGA	2	6	16212	16217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538397740
131	NC_022248	GCA	2	6	16321	16326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397740
132	NC_022248	GAT	2	6	16593	16598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538397741
133	NC_022248	GCC	3	9	16723	16731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397741
134	NC_022248	CAT	2	6	16794	16799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538397741
135	NC_022248	CGA	2	6	16836	16841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397741
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137	NC_022248	CTG	2	6	16945	16950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397741
138	NC_022248	CCT	2	6	17094	17099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538397741
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141	NC_022248	GTG	2	6	17404	17409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538397741
142	NC_022248	GCT	2	6	17436	17441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397741
143	NC_022248	CAG	2	6	17579	17584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397741
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145	NC_022248	CAT	2	6	17794	17799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538397742
146	NC_022248	GAA	2	6	17885	17890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538397742
147	NC_022248	CCA	2	6	17906	17911	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538397742
148	NC_022248	TCC	2	6	17948	17953	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538397742
149	NC_022248	TGA	2	6	18001	18006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538397742
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151	NC_022248	TTC	2	6	18193	18198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538397742
152	NC_022248	CGG	2	6	18215	18220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397742
153	NC_022248	ACC	2	6	18224	18229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538397742
154	NC_022248	CGA	2	6	18295	18300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397742
155	NC_022248	TGC	2	6	18336	18341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397742
156	NC_022248	CGG	2	6	18515	18520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397742
157	NC_022248	GCC	2	6	18623	18628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397742
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161	NC_022248	AGA	2	6	19007	19012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538397742
162	NC_022248	GTT	2	6	19093	19098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538397742
163	NC_022248	GAA	2	6	19160	19165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538397742
164	NC_022248	ATT	2	6	19199	19204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538397742
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252	NC_022248	CAG	2	6	34568	34573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397754
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500	NC_022248	CGG	3	9	77203	77211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397782

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