MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Bovismorbificans str. 3114 plasmid pVIRBov complete sequence

Total Repeats: 139

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022248	G	6	6	289	294	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022248	T	6	6	1671	1676	0 %	100 %	0 %	0 %	538397727
3	NC_022248	T	6	6	1939	1944	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022248	A	9	9	1958	1966	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022248	A	6	6	1994	1999	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022248	A	6	6	2293	2298	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022248	A	6	6	2331	2336	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022248	A	6	6	2489	2494	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022248	T	7	7	2593	2599	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022248	T	6	6	6270	6275	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022248	A	6	6	6284	6289	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022248	A	8	8	6321	6328	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022248	C	6	6	7214	7219	0 %	0 %	0 %	100 %	538397731
14	NC_022248	T	6	6	7311	7316	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022248	A	6	6	7318	7323	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022248	A	6	6	7426	7431	100 %	0 %	0 %	0 %	538397732
17	NC_022248	A	6	6	7892	7897	100 %	0 %	0 %	0 %	538397732
18	NC_022248	A	7	7	7960	7966	100 %	0 %	0 %	0 %	538397732
19	NC_022248	T	6	6	8028	8033	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022248	A	6	6	8815	8820	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022248	T	6	6	9876	9881	0 %	100 %	0 %	0 %	538397733
22	NC_022248	T	6	6	11341	11346	0 %	100 %	0 %	0 %	538397735
23	NC_022248	C	6	6	11415	11420	0 %	0 %	0 %	100 %	538397735
24	NC_022248	C	6	6	11585	11590	0 %	0 %	0 %	100 %	538397735
25	NC_022248	T	6	6	12865	12870	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022248	T	6	6	14206	14211	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022248	T	6	6	14518	14523	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022248	A	6	6	16627	16632	100 %	0 %	0 %	0 %	538397741
29	NC_022248	G	6	6	17847	17852	0 %	0 %	100 %	0 %	538397742
30	NC_022248	A	7	7	18059	18065	100 %	0 %	0 %	0 %	538397742
31	NC_022248	C	6	6	18636	18641	0 %	0 %	0 %	100 %	538397742
32	NC_022248	T	6	6	21347	21352	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022248	A	7	7	21444	21450	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022248	T	6	6	21895	21900	0 %	100 %	0 %	0 %	538397744
35	NC_022248	A	7	7	22828	22834	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022248	A	6	6	23290	23295	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022248	T	6	6	24753	24758	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022248	T	6	6	24846	24851	0 %	100 %	0 %	0 %	538397746
39	NC_022248	T	6	6	25055	25060	0 %	100 %	0 %	0 %	538397746
40	NC_022248	T	7	7	25204	25210	0 %	100 %	0 %	0 %	538397746
41	NC_022248	A	7	7	25228	25234	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022248	T	7	7	25449	25455	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022248	T	6	6	25574	25579	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022248	T	6	6	25627	25632	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022248	T	6	6	25634	25639	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022248	T	6	6	25689	25694	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022248	T	6	6	25753	25758	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022248	T	6	6	25761	25766	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022248	A	6	6	26469	26474	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022248	A	6	6	28298	28303	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022248	G	6	6	28438	28443	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022248	G	6	6	29568	29573	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022248	G	7	7	30670	30676	0 %	0 %	100 %	0 %	538397750
54	NC_022248	A	7	7	30994	31000	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022248	A	6	6	31098	31103	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022248	G	6	6	31164	31169	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022248	A	6	6	31255	31260	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022248	T	6	6	31266	31271	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022248	A	6	6	31729	31734	100 %	0 %	0 %	0 %	538397751
60	NC_022248	C	6	6	34006	34011	0 %	0 %	0 %	100 %	538397753
61	NC_022248	C	6	6	34035	34040	0 %	0 %	0 %	100 %	538397753
62	NC_022248	A	6	6	34698	34703	100 %	0 %	0 %	0 %	538397754
63	NC_022248	A	7	7	35135	35141	100 %	0 %	0 %	0 %	538397755
64	NC_022248	T	6	6	35772	35777	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022248	G	6	6	35900	35905	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022248	T	7	7	35977	35983	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022248	T	8	8	36343	36350	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022248	A	6	6	36483	36488	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022248	A	6	6	36540	36545	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022248	T	6	6	37026	37031	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022248	T	6	6	39211	39216	0 %	100 %	0 %	0 %	538397757
72	NC_022248	C	7	7	39749	39755	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
73	NC_022248	T	8	8	41085	41092	0 %	100 %	0 %	0 %	538397758
74	NC_022248	A	6	6	41362	41367	100 %	0 %	0 %	0 %	538397759
75	NC_022248	G	6	6	43365	43370	0 %	0 %	100 %	0 %	538397760
76	NC_022248	A	6	6	47678	47683	100 %	0 %	0 %	0 %	538397761
77	NC_022248	A	6	6	47776	47781	100 %	0 %	0 %	0 %	538397761
78	NC_022248	G	6	6	48206	48211	0 %	0 %	100 %	0 %	538397762
79	NC_022248	T	6	6	48302	48307	0 %	100 %	0 %	0 %	538397762
80	NC_022248	T	7	7	49113	49119	0 %	100 %	0 %	0 %	538397762
81	NC_022248	T	6	6	49252	49257	0 %	100 %	0 %	0 %	538397762
82	NC_022248	T	6	6	49754	49759	0 %	100 %	0 %	0 %	538397762
83	NC_022248	A	6	6	49865	49870	100 %	0 %	0 %	0 %	538397762
84	NC_022248	T	9	9	50465	50473	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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87	NC_022248	T	7	7	52408	52414	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022248	T	6	6	52433	52438	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022248	C	6	6	54625	54630	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
90	NC_022248	A	6	6	54649	54654	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_022248	C	6	6	56113	56118	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
92	NC_022248	A	6	6	56239	56244	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_022248	T	6	6	56387	56392	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_022248	A	7	7	57297	57303	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022248	A	6	6	57494	57499	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022248	T	6	6	58074	58079	0 %	100 %	0 %	0 %	538397765
97	NC_022248	C	6	6	58387	58392	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
98	NC_022248	C	6	6	61773	61778	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
99	NC_022248	T	6	6	61916	61921	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022248	T	6	6	63653	63658	0 %	100 %	0 %	0 %	538397769
101	NC_022248	A	6	6	63674	63679	100 %	0 %	0 %	0 %	538397769
102	NC_022248	T	6	6	64714	64719	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022248	T	8	8	65963	65970	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022248	T	6	6	67253	67258	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_022248	T	6	6	67315	67320	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_022248	A	6	6	67730	67735	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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109	NC_022248	T	6	6	69756	69761	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022248	T	6	6	71100	71105	0 %	100 %	0 %	0 %	538397772
111	NC_022248	A	6	6	71278	71283	100 %	0 %	0 %	0 %	538397772
112	NC_022248	T	6	6	71799	71804	0 %	100 %	0 %	0 %	538397773
113	NC_022248	A	6	6	72730	72735	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022248	A	6	6	72887	72892	100 %	0 %	0 %	0 %	538397775
115	NC_022248	A	7	7	72987	72993	100 %	0 %	0 %	0 %	538397775
116	NC_022248	T	7	7	73079	73085	0 %	100 %	0 %	0 %	538397775
117	NC_022248	T	6	6	73284	73289	0 %	100 %	0 %	0 %	538397775
118	NC_022248	T	6	6	73533	73538	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_022248	T	6	6	74042	74047	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_022248	G	6	6	74125	74130	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022248	T	6	6	74184	74189	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_022248	G	6	6	74764	74769	0 %	0 %	100 %	0 %	538397777
123	NC_022248	T	6	6	74976	74981	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_022248	T	6	6	75326	75331	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022248	A	6	6	75951	75956	100 %	0 %	0 %	0 %	538397779
126	NC_022248	A	6	6	76072	76077	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_022248	T	6	6	76308	76313	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_022248	A	6	6	77161	77166	100 %	0 %	0 %	0 %	538397782
129	NC_022248	T	6	6	77582	77587	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_022248	A	7	7	79932	79938	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_022248	C	6	6	80527	80532	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
132	NC_022248	T	6	6	83353	83358	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_022248	A	6	6	83641	83646	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_022248	T	6	6	83702	83707	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_022248	A	6	6	84087	84092	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_022248	C	6	6	88580	88585	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
137	NC_022248	A	6	6	89490	89495	100 %	0 %	0 %	0 %	538397786
138	NC_022248	T	6	6	89709	89714	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_022248	A	6	6	92390	92395	100 %	0 %	0 %	0 %	538397787

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.