MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Bovismorbificans str. 3114 plasmid pVIRBov complete sequence

Total Repeats: 52

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022248	T	6	6	1671	1676	0 %	100 %	0 %	0 %	538397727
2	NC_022248	C	6	6	7214	7219	0 %	0 %	0 %	100 %	538397731
3	NC_022248	A	6	6	7426	7431	100 %	0 %	0 %	0 %	538397732
4	NC_022248	A	6	6	7892	7897	100 %	0 %	0 %	0 %	538397732
5	NC_022248	A	7	7	7960	7966	100 %	0 %	0 %	0 %	538397732
6	NC_022248	T	6	6	9876	9881	0 %	100 %	0 %	0 %	538397733
7	NC_022248	T	6	6	11341	11346	0 %	100 %	0 %	0 %	538397735
8	NC_022248	C	6	6	11415	11420	0 %	0 %	0 %	100 %	538397735
9	NC_022248	C	6	6	11585	11590	0 %	0 %	0 %	100 %	538397735
10	NC_022248	A	6	6	16627	16632	100 %	0 %	0 %	0 %	538397741
11	NC_022248	G	6	6	17847	17852	0 %	0 %	100 %	0 %	538397742
12	NC_022248	A	7	7	18059	18065	100 %	0 %	0 %	0 %	538397742
13	NC_022248	C	6	6	18636	18641	0 %	0 %	0 %	100 %	538397742
14	NC_022248	T	6	6	21895	21900	0 %	100 %	0 %	0 %	538397744
15	NC_022248	T	6	6	24846	24851	0 %	100 %	0 %	0 %	538397746
16	NC_022248	T	6	6	25055	25060	0 %	100 %	0 %	0 %	538397746
17	NC_022248	T	7	7	25204	25210	0 %	100 %	0 %	0 %	538397746
18	NC_022248	G	7	7	30670	30676	0 %	0 %	100 %	0 %	538397750
19	NC_022248	A	6	6	31729	31734	100 %	0 %	0 %	0 %	538397751
20	NC_022248	C	6	6	34006	34011	0 %	0 %	0 %	100 %	538397753
21	NC_022248	C	6	6	34035	34040	0 %	0 %	0 %	100 %	538397753
22	NC_022248	A	6	6	34698	34703	100 %	0 %	0 %	0 %	538397754
23	NC_022248	A	7	7	35135	35141	100 %	0 %	0 %	0 %	538397755
24	NC_022248	T	6	6	39211	39216	0 %	100 %	0 %	0 %	538397757
25	NC_022248	T	8	8	41085	41092	0 %	100 %	0 %	0 %	538397758
26	NC_022248	A	6	6	41362	41367	100 %	0 %	0 %	0 %	538397759
27	NC_022248	G	6	6	43365	43370	0 %	0 %	100 %	0 %	538397760
28	NC_022248	A	6	6	47678	47683	100 %	0 %	0 %	0 %	538397761
29	NC_022248	A	6	6	47776	47781	100 %	0 %	0 %	0 %	538397761
30	NC_022248	G	6	6	48206	48211	0 %	0 %	100 %	0 %	538397762
31	NC_022248	T	6	6	48302	48307	0 %	100 %	0 %	0 %	538397762
32	NC_022248	T	7	7	49113	49119	0 %	100 %	0 %	0 %	538397762
33	NC_022248	T	6	6	49252	49257	0 %	100 %	0 %	0 %	538397762
34	NC_022248	T	6	6	49754	49759	0 %	100 %	0 %	0 %	538397762
35	NC_022248	A	6	6	49865	49870	100 %	0 %	0 %	0 %	538397762
36	NC_022248	T	6	6	50711	50716	0 %	100 %	0 %	0 %	538397763
37	NC_022248	T	7	7	51976	51982	0 %	100 %	0 %	0 %	538397764
38	NC_022248	T	6	6	58074	58079	0 %	100 %	0 %	0 %	538397765
39	NC_022248	T	6	6	63653	63658	0 %	100 %	0 %	0 %	538397769
40	NC_022248	A	6	6	63674	63679	100 %	0 %	0 %	0 %	538397769
41	NC_022248	T	6	6	71100	71105	0 %	100 %	0 %	0 %	538397772
42	NC_022248	A	6	6	71278	71283	100 %	0 %	0 %	0 %	538397772
43	NC_022248	T	6	6	71799	71804	0 %	100 %	0 %	0 %	538397773
44	NC_022248	A	6	6	72887	72892	100 %	0 %	0 %	0 %	538397775
45	NC_022248	A	7	7	72987	72993	100 %	0 %	0 %	0 %	538397775
46	NC_022248	T	7	7	73079	73085	0 %	100 %	0 %	0 %	538397775
47	NC_022248	T	6	6	73284	73289	0 %	100 %	0 %	0 %	538397775
48	NC_022248	G	6	6	74764	74769	0 %	0 %	100 %	0 %	538397777
49	NC_022248	A	6	6	75951	75956	100 %	0 %	0 %	0 %	538397779
50	NC_022248	A	6	6	77161	77166	100 %	0 %	0 %	0 %	538397782
51	NC_022248	A	6	6	89490	89495	100 %	0 %	0 %	0 %	538397786
52	NC_022248	A	6	6	92390	92395	100 %	0 %	0 %	0 %	538397787

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.