MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Variovorax paradoxus B4 chromosome 1

Total Repeats: 4996

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022247	ACCAC	2	10	1374	1383	40 %	0 %	0 %	60 %	538392232
2	NC_022247	AAGAG	2	10	1551	1560	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022247	GCATC	2	10	2447	2456	20 %	20 %	20 %	40 %	538392233
4	NC_022247	CCGCG	2	10	5379	5388	0 %	0 %	40 %	60 %	538392234
5	NC_022247	GATGG	2	10	5860	5869	20 %	20 %	60 %	0 %	538392235
6	NC_022247	GCGCG	2	10	8830	8839	0 %	0 %	60 %	40 %	538392239
7	NC_022247	ACGCC	2	10	11155	11164	20 %	0 %	20 %	60 %	538392242
8	NC_022247	GCGCT	2	10	11547	11556	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
9	NC_022247	GACGG	2	10	13755	13764	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
10	NC_022247	GGCCA	2	10	13997	14006	20 %	0 %	40 %	40 %	538392245
11	NC_022247	TGCGC	2	10	14564	14573	0 %	20 %	40 %	40 %	538392246
12	NC_022247	CACGG	2	10	15200	15209	20 %	0 %	40 %	40 %	538392247
13	NC_022247	CGGTG	2	10	18032	18041	0 %	20 %	60 %	20 %	538392250
14	NC_022247	GGCGT	2	10	18888	18897	0 %	20 %	60 %	20 %	538392250
15	NC_022247	TGCCA	2	10	20579	20588	20 %	20 %	20 %	40 %	538392252
16	NC_022247	TTTTC	2	10	20784	20793	0 %	80 %	0 %	20 %	538392252
17	NC_022247	GCGCA	2	10	21157	21166	20 %	0 %	40 %	40 %	538392253
18	NC_022247	CGCGG	2	10	24354	24363	0 %	0 %	60 %	40 %	538392254
19	NC_022247	CATCG	2	10	27155	27164	20 %	20 %	20 %	40 %	538392256
20	NC_022247	GCCGC	2	10	28304	28313	0 %	0 %	40 %	60 %	538392257
21	NC_022247	TGCGC	2	10	28464	28473	0 %	20 %	40 %	40 %	538392257
22	NC_022247	GCGCC	2	10	29462	29471	0 %	0 %	40 %	60 %	538392258
23	NC_022247	GCGCC	2	10	32385	32394	0 %	0 %	40 %	60 %	538392262
24	NC_022247	GCGCG	2	10	35357	35366	0 %	0 %	60 %	40 %	538392264
25	NC_022247	TCGCC	2	10	35699	35708	0 %	20 %	20 %	60 %	538392264
26	NC_022247	TGGCA	2	10	38800	38809	20 %	20 %	40 %	20 %	538392268
27	NC_022247	AGCGC	2	10	39441	39450	20 %	0 %	40 %	40 %	538392268
28	NC_022247	AGGCC	2	10	39998	40007	20 %	0 %	40 %	40 %	538392269
29	NC_022247	CAGGC	2	10	41217	41226	20 %	0 %	40 %	40 %	538392270
30	NC_022247	TCGCC	2	10	41680	41689	0 %	20 %	20 %	60 %	538392270
31	NC_022247	CGCGG	2	10	43044	43053	0 %	0 %	60 %	40 %	538392271
32	NC_022247	CTTCG	2	10	43531	43540	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
33	NC_022247	GCGCA	2	10	45050	45059	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
34	NC_022247	GCCGG	2	10	47733	47742	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
35	NC_022247	GCCCG	2	10	49546	49555	0 %	0 %	40 %	60 %	538392279
36	NC_022247	GCGCG	2	10	49633	49642	0 %	0 %	60 %	40 %	538392279
37	NC_022247	GCGCG	2	10	51294	51303	0 %	0 %	60 %	40 %	538392281
38	NC_022247	GCAAG	2	10	51684	51693	40 %	0 %	40 %	20 %	538392281
39	NC_022247	ATGGC	2	10	53735	53744	20 %	20 %	40 %	20 %	538392283
40	NC_022247	ACGCG	2	10	54809	54818	20 %	0 %	40 %	40 %	538392285
41	NC_022247	GGCCG	2	10	56921	56930	0 %	0 %	60 %	40 %	538392289
42	NC_022247	GCCGC	2	10	57746	57755	0 %	0 %	40 %	60 %	538392291
43	NC_022247	ACGCC	2	10	57835	57844	20 %	0 %	20 %	60 %	538392291
44	NC_022247	GCAGG	2	10	58085	58094	20 %	0 %	60 %	20 %	538392291
45	NC_022247	TGCGC	2	10	59511	59520	0 %	20 %	40 %	40 %	538392293
46	NC_022247	TGCGC	2	10	60072	60081	0 %	20 %	40 %	40 %	538392294
47	NC_022247	GCGCG	2	10	62117	62126	0 %	0 %	60 %	40 %	538392297
48	NC_022247	GCGGA	2	10	64119	64128	20 %	0 %	60 %	20 %	538392299
49	NC_022247	CGGCG	2	10	65667	65676	0 %	0 %	60 %	40 %	538392300
50	NC_022247	TCGCG	2	10	68560	68569	0 %	20 %	40 %	40 %	538392303
51	NC_022247	CGCGC	2	10	68600	68609	0 %	0 %	40 %	60 %	538392303
52	NC_022247	CGCGG	2	10	69425	69434	0 %	0 %	60 %	40 %	538392304
53	NC_022247	CAGCG	2	10	72011	72020	20 %	0 %	40 %	40 %	538392306
54	NC_022247	AGCCC	2	10	73675	73684	20 %	0 %	20 %	60 %	538392307
55	NC_022247	AGGGC	2	10	76085	76094	20 %	0 %	60 %	20 %	538392309
56	NC_022247	TTTCA	2	10	76644	76653	20 %	60 %	0 %	20 %	538392309
57	NC_022247	CGCGC	2	10	76731	76740	0 %	0 %	40 %	60 %	538392310
58	NC_022247	TGGTC	2	10	77106	77115	0 %	40 %	40 %	20 %	538392310
59	NC_022247	GCGCG	2	10	78652	78661	0 %	0 %	60 %	40 %	538392312
60	NC_022247	CGCGG	2	10	79676	79685	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
61	NC_022247	CGGCG	2	10	79875	79884	0 %	0 %	60 %	40 %	538392313
62	NC_022247	GCCGC	2	10	80905	80914	0 %	0 %	40 %	60 %	538392314
63	NC_022247	TCGCC	2	10	82017	82026	0 %	20 %	20 %	60 %	538392314
64	NC_022247	GGCGC	2	10	82289	82298	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
65	NC_022247	CGTGC	2	10	82333	82342	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
66	NC_022247	TGCCG	2	10	82474	82483	0 %	20 %	40 %	40 %	538392315
67	NC_022247	AGCGC	2	10	83852	83861	20 %	0 %	40 %	40 %	538392315
68	NC_022247	CGCGC	2	10	84181	84190	0 %	0 %	40 %	60 %	538392315
69	NC_022247	GCAGT	2	10	85984	85993	20 %	20 %	40 %	20 %	538392317
70	NC_022247	GCCAC	2	10	86052	86061	20 %	0 %	20 %	60 %	538392318
71	NC_022247	ACCGC	2	10	86174	86183	20 %	0 %	20 %	60 %	538392318
72	NC_022247	GCGCC	2	10	86400	86409	0 %	0 %	40 %	60 %	538392318
73	NC_022247	CGCGC	2	10	86932	86941	0 %	0 %	40 %	60 %	538392318
74	NC_022247	CGAAG	2	10	87393	87402	40 %	0 %	40 %	20 %	538392319
75	NC_022247	GGGAG	2	10	90073	90082	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022247	GGCGA	2	10	90824	90833	20 %	0 %	60 %	20 %	538392322
77	NC_022247	TCTCT	2	10	91678	91687	0 %	60 %	0 %	40 %	538392323
78	NC_022247	CCCGG	2	10	94319	94328	0 %	0 %	40 %	60 %	538392325
79	NC_022247	GCGCG	2	10	94355	94364	0 %	0 %	60 %	40 %	538392325
80	NC_022247	GCGCC	2	10	94508	94517	0 %	0 %	40 %	60 %	538392325
81	NC_022247	GCCGC	2	10	94738	94747	0 %	0 %	40 %	60 %	538392325
82	NC_022247	GCCGC	2	10	96321	96330	0 %	0 %	40 %	60 %	538392326
83	NC_022247	GGCGC	2	10	99876	99885	0 %	0 %	60 %	40 %	538392329
84	NC_022247	CGATG	2	10	104293	104302	20 %	20 %	40 %	20 %	538392335
85	NC_022247	CTTTT	2	10	104699	104708	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_022247	GCGCG	2	10	104874	104883	0 %	0 %	60 %	40 %	538392336
87	NC_022247	GCGCA	2	10	105754	105763	20 %	0 %	40 %	40 %	538392336
88	NC_022247	GCAGG	2	10	105949	105958	20 %	0 %	60 %	20 %	538392336
89	NC_022247	TTGGC	2	10	106050	106059	0 %	40 %	40 %	20 %	538392336
90	NC_022247	TGGCC	2	10	107050	107059	0 %	20 %	40 %	40 %	538392338
91	NC_022247	CCAGC	2	10	107794	107803	20 %	0 %	20 %	60 %	538392339
92	NC_022247	GGCGC	2	10	107943	107952	0 %	0 %	60 %	40 %	538392339
93	NC_022247	CGAAG	2	10	109225	109234	40 %	0 %	40 %	20 %	538392340
94	NC_022247	GCGCG	2	10	110249	110258	0 %	0 %	60 %	40 %	538392342
95	NC_022247	TGGCG	2	10	110831	110840	0 %	20 %	60 %	20 %	538392342
96	NC_022247	CGGGC	2	10	110846	110855	0 %	0 %	60 %	40 %	538392342
97	NC_022247	GGCCT	2	10	111993	112002	0 %	20 %	40 %	40 %	538392343
98	NC_022247	CTCGA	2	10	112683	112692	20 %	20 %	20 %	40 %	538392343
99	NC_022247	CGGCT	2	10	113715	113724	0 %	20 %	40 %	40 %	538392344
100	NC_022247	AGGCC	2	10	113845	113854	20 %	0 %	40 %	40 %	538392344
101	NC_022247	GCCGC	2	10	113997	114006	0 %	0 %	40 %	60 %	538392344
102	NC_022247	GCCGT	2	10	114018	114027	0 %	20 %	40 %	40 %	538392344
103	NC_022247	CGCGC	2	10	114458	114467	0 %	0 %	40 %	60 %	538392344
104	NC_022247	TGCGC	2	10	114592	114601	0 %	20 %	40 %	40 %	538392344
105	NC_022247	CGGTG	2	10	114691	114700	0 %	20 %	60 %	20 %	538392344
106	NC_022247	GCCGC	2	10	115911	115920	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
107	NC_022247	CGCGC	2	10	116637	116646	0 %	0 %	40 %	60 %	538392346
108	NC_022247	GGGGC	2	10	117132	117141	0 %	0 %	80 %	20 %	538392347
109	NC_022247	GCCAG	2	10	117167	117176	20 %	0 %	40 %	40 %	538392347
110	NC_022247	CAGTG	2	10	119379	119388	20 %	20 %	40 %	20 %	538392349
111	NC_022247	CAGCT	2	10	119647	119656	20 %	20 %	20 %	40 %	538392349
112	NC_022247	GCCGC	2	10	120039	120048	0 %	0 %	40 %	60 %	538392349
113	NC_022247	CCGCG	2	10	121215	121224	0 %	0 %	40 %	60 %	538392351
114	NC_022247	GGCGC	2	10	121814	121823	0 %	0 %	60 %	40 %	538392351
115	NC_022247	GCCGT	2	10	122709	122718	0 %	20 %	40 %	40 %	538392352
116	NC_022247	GCCGC	2	10	123279	123288	0 %	0 %	40 %	60 %	538392353
117	NC_022247	GCGCG	2	10	124071	124080	0 %	0 %	60 %	40 %	538392353
118	NC_022247	CGGCG	2	10	124349	124358	0 %	0 %	60 %	40 %	538392353
119	NC_022247	GCCGC	2	10	126756	126765	0 %	0 %	40 %	60 %	538392356
120	NC_022247	GCGCG	2	10	126877	126886	0 %	0 %	60 %	40 %	538392356
121	NC_022247	CGCGC	2	10	127248	127257	0 %	0 %	40 %	60 %	538392357
122	NC_022247	CCGCG	2	10	131327	131336	0 %	0 %	40 %	60 %	538392361
123	NC_022247	CCGCG	2	10	131734	131743	0 %	0 %	40 %	60 %	538392362
124	NC_022247	GCGCG	2	10	131840	131849	0 %	0 %	60 %	40 %	538392362
125	NC_022247	ACGAC	2	10	133196	133205	40 %	0 %	20 %	40 %	538392363
126	NC_022247	CACAA	2	10	133269	133278	60 %	0 %	0 %	40 %	538392363
127	NC_022247	GGCAG	2	10	135626	135635	20 %	0 %	60 %	20 %	538392365
128	NC_022247	GGCCT	2	10	135809	135818	0 %	20 %	40 %	40 %	538392365
129	NC_022247	CGCGC	2	10	137058	137067	0 %	0 %	40 %	60 %	538392367
130	NC_022247	TGCGG	2	10	137629	137638	0 %	20 %	60 %	20 %	538392367
131	NC_022247	CGAAT	2	10	138458	138467	40 %	20 %	20 %	20 %	538392368
132	NC_022247	GCGCC	2	10	138826	138835	0 %	0 %	40 %	60 %	538392368
133	NC_022247	CCGCG	2	10	139104	139113	0 %	0 %	40 %	60 %	538392369
134	NC_022247	AGGGC	2	10	139554	139563	20 %	0 %	60 %	20 %	538392369
135	NC_022247	ATGGA	2	10	139721	139730	40 %	20 %	40 %	0 %	538392369
136	NC_022247	GGTCG	2	10	139866	139875	0 %	20 %	60 %	20 %	538392370
137	NC_022247	TGGCC	2	10	140414	140423	0 %	20 %	40 %	40 %	538392370
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141	NC_022247	GCCTT	2	10	142953	142962	0 %	40 %	20 %	40 %	538392372
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148	NC_022247	CATCG	2	10	155374	155383	20 %	20 %	20 %	40 %	538392385
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150	NC_022247	CGCGG	2	10	157259	157268	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
151	NC_022247	GCGTG	2	10	157809	157818	0 %	20 %	60 %	20 %	538392387
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