MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Variovorax paradoxus B4 chromosome 1

Total Repeats: 1458

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022247	GGCC	2	8	6138	6145	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_022247	CTTT	2	8	7250	7257	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_022247	CAAG	2	8	7351	7358	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_022247	TCGC	2	8	7918	7925	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_022247	CGCC	2	8	9244	9251	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6	NC_022247	CTTT	2	8	9917	9924	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_022247	CAGG	2	8	13775	13782	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_022247	GCGT	2	8	15068	15075	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_022247	TGCG	2	8	16234	16241	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_022247	TCGG	2	8	17151	17158	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_022247	AGCG	2	8	29927	29934	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_022247	CGTG	2	8	29960	29967	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_022247	CGAA	2	8	30445	30452	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_022247	TGAA	2	8	32056	32063	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022247	TGAA	2	8	32071	32078	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022247	GACG	2	8	43630	43637	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_022247	TGAT	2	8	50898	50905	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022247	GAGC	2	8	53437	53444	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_022247	GATG	2	8	56498	56505	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022247	GAGC	2	8	57243	57250	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_022247	CGCA	2	8	57574	57581	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_022247	AAAG	2	8	58600	58607	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022247	TCTT	2	8	59394	59401	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_022247	TTCT	2	8	60545	60552	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_022247	CGGG	2	8	63957	63964	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
26	NC_022247	CTTG	2	8	67817	67824	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_022247	TGAA	2	8	73868	73875	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022247	CTGA	2	8	73883	73890	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_022247	CTTT	2	8	79709	79716	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_022247	GGCT	2	8	93727	93734	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_022247	CCCA	2	8	98208	98215	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
32	NC_022247	CGCT	2	8	114999	115006	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
33	NC_022247	CGGC	2	8	115865	115872	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_022247	GAAG	2	8	115930	115937	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022247	CGGC	2	8	123226	123233	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_022247	ACGC	2	8	129598	129605	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_022247	CGCA	2	8	130570	130577	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_022247	AGAA	2	8	130578	130585	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022247	TGAG	2	8	132101	132108	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022247	TTTG	2	8	136300	136307	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022247	ATGA	2	8	136315	136322	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022247	GGGT	2	8	139732	139739	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022247	ATGA	2	8	157455	157462	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022247	CATC	2	8	159095	159102	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_022247	ACGG	2	8	163064	163071	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_022247	GGCG	2	8	163078	163085	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
47	NC_022247	CCGC	2	8	164391	164398	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
48	NC_022247	CCGA	2	8	169887	169894	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_022247	GGCG	2	8	173954	173961	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
50	NC_022247	TGCA	2	8	175343	175350	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_022247	TGCA	2	8	175490	175497	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_022247	GGCG	2	8	175532	175539	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
53	NC_022247	GCCG	2	8	179110	179117	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_022247	AGCA	2	8	185124	185131	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_022247	CCGC	2	8	185354	185361	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
56	NC_022247	GGCC	2	8	185431	185438	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_022247	TGGG	2	8	200037	200044	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022247	CTAT	2	8	209327	209334	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_022247	GCCG	2	8	209993	210000	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_022247	GCCG	2	8	212810	212817	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_022247	CGAG	2	8	218043	218050	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
62	NC_022247	GTTG	2	8	218864	218871	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022247	CGGC	2	8	218925	218932	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_022247	GGAG	2	8	226353	226360	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022247	CCCG	2	8	228709	228716	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
66	NC_022247	GGAG	2	8	230411	230418	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022247	CATT	2	8	234237	234244	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_022247	TTCT	2	8	235496	235503	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_022247	CGGC	2	8	236721	236728	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_022247	GCCA	2	8	240414	240421	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_022247	AATC	2	8	258349	258356	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_022247	GTGC	2	8	269328	269335	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
73	NC_022247	GACG	2	8	269822	269829	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
74	NC_022247	ATGC	2	8	269851	269858	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_022247	AGGT	2	8	273440	273447	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022247	CAAA	2	8	274542	274549	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_022247	TGCC	2	8	281203	281210	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
78	NC_022247	ATCG	2	8	284176	284183	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_022247	TGAG	2	8	287108	287115	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022247	GTCA	2	8	289441	289448	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_022247	TTGC	2	8	291731	291738	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_022247	GCCT	2	8	293991	293998	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
83	NC_022247	CCAA	2	8	295192	295199	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_022247	CATT	2	8	296074	296081	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_022247	TCCT	2	8	296655	296662	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_022247	GCCC	2	8	298222	298229	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
87	NC_022247	GCTG	2	8	307474	307481	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_022247	GTCT	2	8	312268	312275	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_022247	CTGG	2	8	329352	329359	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
90	NC_022247	GGCG	2	8	344900	344907	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
91	NC_022247	GGAG	2	8	347427	347434	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
92	NC_022247	GTGG	2	8	347765	347772	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
93	NC_022247	GATG	2	8	347987	347994	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_022247	AGCT	2	8	348807	348814	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_022247	CGGC	2	8	348961	348968	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_022247	GCCT	2	8	349621	349628	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
97	NC_022247	TGCC	2	8	349861	349868	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
98	NC_022247	TTGC	2	8	349940	349947	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_022247	CCGC	2	8	355935	355942	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
100	NC_022247	GCCG	2	8	361295	361302	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_022247	ACCA	2	8	365081	365088	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_022247	CGGC	2	8	372800	372807	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_022247	ATGA	2	8	379035	379042	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022247	TGCG	2	8	379051	379058	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
105	NC_022247	GAAC	2	8	382086	382093	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_022247	CGTG	2	8	401939	401946	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
107	NC_022247	ATGG	2	8	406130	406137	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022247	GCCC	2	8	406421	406428	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
109	NC_022247	TCGA	2	8	412295	412302	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_022247	GCAG	2	8	424126	424133	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_022247	GCAG	2	8	424141	424148	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
112	NC_022247	TTCG	2	8	424185	424192	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_022247	TGGA	2	8	426723	426730	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022247	GACT	2	8	445965	445972	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_022247	GCGA	2	8	448030	448037	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
116	NC_022247	GCAC	2	8	448072	448079	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
117	NC_022247	TTTC	2	8	452305	452312	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_022247	CTAC	2	8	467792	467799	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_022247	GTGC	2	8	475098	475105	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
120	NC_022247	GGAA	2	8	481110	481117	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022247	GCGG	2	8	493966	493973	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
122	NC_022247	CGGC	3	12	494014	494025	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_022247	CAGG	2	8	494735	494742	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_022247	CGAG	2	8	498198	498205	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
125	NC_022247	ACCC	2	8	498235	498242	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
126	NC_022247	GATC	2	8	498907	498914	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_022247	GCCG	2	8	498988	498995	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_022247	GCCG	2	8	500706	500713	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_022247	TATC	2	8	503635	503642	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_022247	CAAA	2	8	503718	503725	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_022247	ACAA	2	8	514303	514310	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_022247	TGGA	2	8	518082	518089	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_022247	AGTA	2	8	521000	521007	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_022247	GGCC	2	8	521586	521593	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_022247	CGTT	2	8	532710	532717	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_022247	CAGC	2	8	532756	532763	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
137	NC_022247	GGCT	2	8	532781	532788	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
138	NC_022247	GCCG	2	8	543747	543754	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_022247	GGAG	2	8	548173	548180	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
140	NC_022247	GGCG	2	8	549547	549554	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
141	NC_022247	CGGC	2	8	550998	551005	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_022247	GAAT	2	8	571374	571381	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_022247	GTGC	2	8	573143	573150	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
144	NC_022247	ACCG	2	8	573267	573274	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
145	NC_022247	CCGG	2	8	573277	573284	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NC_022247	TGAA	2	8	577961	577968	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_022247	GAAG	2	8	578743	578750	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_022247	TCGA	2	8	602327	602334	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
149	NC_022247	TTCT	3	12	625266	625277	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_022247	TCGC	2	8	625505	625512	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
151	NC_022247	TTTC	2	8	646271	646278	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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440	NC_022247	CGGC	2	8	1654464	1654471	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
441	NC_022247	GGCC	2	8	1660658	1660665	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
442	NC_022247	CGGC	2	8	1661748	1661755	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
443	NC_022247	CTTG	2	8	1664145	1664152	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
444	NC_022247	CGGA	2	8	1670051	1670058	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
445	NC_022247	GACT	2	8	1670612	1670619	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
446	NC_022247	CGGG	2	8	1682065	1682072	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
447	NC_022247	TTCA	2	8	1684760	1684767	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
448	NC_022247	GCGG	2	8	1685092	1685099	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
449	NC_022247	CTTC	2	8	1685100	1685107	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
450	NC_022247	CAAC	2	8	1695575	1695582	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
451	NC_022247	GCCG	2	8	1697900	1697907	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
452	NC_022247	GCCG	2	8	1711378	1711385	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
453	NC_022247	AAAG	2	8	1711396	1711403	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
454	NC_022247	TTGA	2	8	1711470	1711477	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
455	NC_022247	CATT	2	8	1715906	1715913	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
456	NC_022247	CATC	2	8	1728157	1728164	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
457	NC_022247	GAAC	2	8	1730772	1730779	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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459	NC_022247	GAGT	2	8	1742791	1742798	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
460	NC_022247	GTTG	2	8	1743279	1743286	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
461	NC_022247	AGCG	2	8	1744320	1744327	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
462	NC_022247	GGGA	2	8	1759573	1759580	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
463	NC_022247	TGAT	2	8	1761976	1761983	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
464	NC_022247	GCCG	2	8	1762036	1762043	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
465	NC_022247	GCAG	2	8	1762780	1762787	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
466	NC_022247	CCGG	2	8	1765917	1765924	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
467	NC_022247	CCGG	2	8	1765939	1765946	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
468	NC_022247	GAAA	2	8	1771207	1771214	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
469	NC_022247	GCAC	2	8	1771221	1771228	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
470	NC_022247	GGGA	2	8	1774674	1774681	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
471	NC_022247	GCCG	2	8	1774720	1774727	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
472	NC_022247	GCTC	2	8	1775782	1775789	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
473	NC_022247	GGCG	2	8	1778598	1778605	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
474	NC_022247	GAAA	2	8	1786139	1786146	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
475	NC_022247	GTAG	2	8	1788800	1788807	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
476	NC_022247	TCGG	2	8	1789893	1789900	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
477	NC_022247	GGCA	2	8	1790009	1790016	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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480	NC_022247	TGCC	3	12	1810260	1810271	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
481	NC_022247	GGGC	2	8	1811648	1811655	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
482	NC_022247	TCCC	2	8	1813750	1813757	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
483	NC_022247	TCGA	2	8	1839174	1839181	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
484	NC_022247	CAAA	2	8	1844950	1844957	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
485	NC_022247	TTCC	2	8	1846713	1846720	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
486	NC_022247	CAGG	2	8	1846723	1846730	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
487	NC_022247	TGCG	2	8	1846754	1846761	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
488	NC_022247	GGTT	2	8	1846805	1846812	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
489	NC_022247	TGCC	2	8	1856370	1856377	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
490	NC_022247	GGCG	2	8	1856389	1856396	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
491	NC_022247	CAAA	2	8	1857930	1857937	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
492	NC_022247	GGCT	2	8	1858067	1858074	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
493	NC_022247	CGGC	2	8	1858408	1858415	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
494	NC_022247	GGTC	2	8	1858630	1858637	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
495	NC_022247	GTCG	2	8	1858969	1858976	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
496	NC_022247	AGGG	2	8	1862179	1862186	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
497	NC_022247	CCGT	2	8	1863647	1863654	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
498	NC_022247	CCAA	2	8	1880545	1880552	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
499	NC_022247	GGGC	2	8	1889946	1889953	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
500	NC_022247	GTTC	2	8	1902278	1902285	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding

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