MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Variovorax paradoxus B4 chromosome 1

Total Repeats: 104354

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022247	AGC	2	6	171	176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392232
2	NC_022247	GAC	2	6	218	223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392232
3	NC_022247	GCC	2	6	299	304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392232
4	NC_022247	GAG	2	6	437	442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538392232
5	NC_022247	TGG	2	6	498	503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392232
6	NC_022247	CGC	3	9	529	537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392232
7	NC_022247	CGG	2	6	589	594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392232
8	NC_022247	CGA	2	6	778	783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392232
9	NC_022247	TTC	2	6	791	796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538392232
10	NC_022247	CAA	2	6	799	804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538392232
11	NC_022247	GAA	2	6	818	823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538392232
12	NC_022247	TTC	2	6	824	829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538392232
13	NC_022247	CTG	2	6	845	850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392232
14	NC_022247	AAG	2	6	854	859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538392232
15	NC_022247	TGA	2	6	870	875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538392232
16	NC_022247	GCC	2	6	961	966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392232
17	NC_022247	CAA	2	6	997	1002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538392232
18	NC_022247	CTT	2	6	1042	1047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538392232
19	NC_022247	CTG	2	6	1172	1177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392232
20	NC_022247	AGA	2	6	1215	1220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538392232
21	NC_022247	ACT	2	6	1230	1235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538392232
22	NC_022247	CGG	2	6	1363	1368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392232
23	NC_022247	CAG	2	6	1421	1426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392232
24	NC_022247	CAG	2	6	1442	1447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392232
25	NC_022247	CGC	2	6	1605	1610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392233
26	NC_022247	CGG	2	6	1686	1691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392233
27	NC_022247	ACC	2	6	1705	1710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392233
28	NC_022247	CAC	2	6	1734	1739	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392233
29	NC_022247	CGG	2	6	1749	1754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392233
30	NC_022247	CAC	3	9	1770	1778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392233
31	NC_022247	GGC	2	6	1873	1878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392233
32	NC_022247	GCC	2	6	1936	1941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392233
33	NC_022247	CTA	2	6	2031	2036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538392233
34	NC_022247	AGC	2	6	2069	2074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392233
35	NC_022247	TGG	2	6	2081	2086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392233
36	NC_022247	TCG	2	6	2113	2118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392233
37	NC_022247	TTC	2	6	2156	2161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538392233
38	NC_022247	CTG	2	6	2191	2196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392233
39	NC_022247	AAC	2	6	2233	2238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538392233
40	NC_022247	CGG	2	6	2256	2261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392233
41	NC_022247	GCT	2	6	2361	2366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392233
42	NC_022247	AAC	2	6	2458	2463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538392233
43	NC_022247	CGG	2	6	2505	2510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392233
44	NC_022247	AGA	2	6	2675	2680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538392233
45	NC_022247	AGA	2	6	2819	2824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538392234
46	NC_022247	GGT	2	6	3029	3034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392234
47	NC_022247	CGA	2	6	3047	3052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392234
48	NC_022247	CGA	2	6	3071	3076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392234
49	NC_022247	TCG	2	6	3079	3084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392234
50	NC_022247	GAC	2	6	3156	3161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392234
51	NC_022247	GGC	2	6	3216	3221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392234
52	NC_022247	GGC	2	6	3252	3257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392234
53	NC_022247	TGC	2	6	3301	3306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392234
54	NC_022247	ATC	2	6	3417	3422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538392234
55	NC_022247	AAC	2	6	3543	3548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538392234
56	NC_022247	GAC	2	6	3591	3596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392234
57	NC_022247	TCA	2	6	3634	3639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538392234
58	NC_022247	CGG	2	6	3707	3712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392234
59	NC_022247	CAA	2	6	3791	3796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538392234
60	NC_022247	CGG	2	6	3812	3817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392234
61	NC_022247	TCA	2	6	3856	3861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538392234
62	NC_022247	CGA	2	6	3917	3922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392234
63	NC_022247	TGC	2	6	3939	3944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392234
64	NC_022247	TCG	2	6	4036	4041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392234
65	NC_022247	GCT	2	6	4046	4051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392234
66	NC_022247	ACG	2	6	4078	4083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392234
67	NC_022247	ATC	2	6	4089	4094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538392234
68	NC_022247	TCG	2	6	4105	4110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392234
69	NC_022247	CGC	2	6	4158	4163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392234
70	NC_022247	TGG	2	6	4246	4251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392234
71	NC_022247	CCG	2	6	4261	4266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392234
72	NC_022247	GCT	2	6	4361	4366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392234
73	NC_022247	GAT	2	6	4388	4393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538392234
74	NC_022247	CCA	2	6	4429	4434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392234
75	NC_022247	GAC	2	6	4452	4457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392234
76	NC_022247	ACC	2	6	4480	4485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392234
77	NC_022247	CAT	4	12	4487	4498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538392234
78	NC_022247	GCT	3	9	4535	4543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392234
79	NC_022247	CTT	2	6	4547	4552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538392234
80	NC_022247	GCC	2	6	4604	4609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392234
81	NC_022247	CGG	2	6	4715	4720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392234
82	NC_022247	ACC	2	6	4731	4736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392234
83	NC_022247	GCG	2	6	4741	4746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392234
84	NC_022247	ACC	2	6	4929	4934	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392234
85	NC_022247	AGC	2	6	4953	4958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392234
86	NC_022247	TGC	2	6	4987	4992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392234
87	NC_022247	GCC	3	9	4999	5007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392234
88	NC_022247	AGC	2	6	5025	5030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392234
89	NC_022247	CGC	2	6	5066	5071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392234
90	NC_022247	AGC	2	6	5109	5114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392234
91	NC_022247	CCG	2	6	5129	5134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392234
92	NC_022247	GAA	2	6	5157	5162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538392234
93	NC_022247	ACC	2	6	5277	5282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392234
94	NC_022247	GCC	2	6	5299	5304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392234
95	NC_022247	TGC	2	6	5305	5310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392234
96	NC_022247	CGA	2	6	5321	5326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392234
97	NC_022247	CGA	2	6	5366	5371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392234
98	NC_022247	GAT	2	6	5440	5445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538392235
99	NC_022247	CCG	2	6	5466	5471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392235
100	NC_022247	CTG	2	6	5481	5486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392235
101	NC_022247	CTG	3	9	5631	5639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392235
102	NC_022247	CGC	2	6	5640	5645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392235
103	NC_022247	GCT	2	6	5655	5660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392235
104	NC_022247	AGC	2	6	5814	5819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392235
105	NC_022247	GGC	2	6	5902	5907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392235
106	NC_022247	CGC	2	6	6183	6188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392236
107	NC_022247	TGC	2	6	6192	6197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392236
108	NC_022247	CAT	2	6	6205	6210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538392236
109	NC_022247	CCG	2	6	6230	6235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392236
110	NC_022247	CGC	2	6	6244	6249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392236
111	NC_022247	CCG	2	6	6266	6271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392236
112	NC_022247	GCG	2	6	6272	6277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392236
113	NC_022247	CAG	2	6	6283	6288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392236
114	NC_022247	GCG	2	6	6289	6294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392236
115	NC_022247	CAG	2	6	6322	6327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392236
116	NC_022247	GCG	2	6	6379	6384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392236
117	NC_022247	CAG	2	6	6783	6788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392237
118	NC_022247	TTC	2	6	6791	6796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538392237
119	NC_022247	CGC	2	6	6912	6917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392237
120	NC_022247	CCA	2	6	6927	6932	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392237
121	NC_022247	GCC	2	6	7014	7019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392237
122	NC_022247	ACG	2	6	7080	7085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392237
123	NC_022247	CGG	2	6	7099	7104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392237
124	NC_022247	TGC	2	6	7194	7199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392237
125	NC_022247	ACC	2	6	7376	7381	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392238
126	NC_022247	GGC	2	6	7408	7413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392238
127	NC_022247	GCG	2	6	7425	7430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392238
128	NC_022247	TTC	2	6	7434	7439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538392238
129	NC_022247	GCG	2	6	7466	7471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392238
130	NC_022247	CCG	2	6	7478	7483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392238
131	NC_022247	GCG	2	6	7515	7520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392238
132	NC_022247	TGC	2	6	7662	7667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392238
133	NC_022247	TGG	2	6	7698	7703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392238
134	NC_022247	GGC	2	6	7798	7803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392238
135	NC_022247	CGG	2	6	7815	7820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392238
136	NC_022247	CCG	2	6	7836	7841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392238
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139	NC_022247	TCA	2	6	8262	8267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538392239
140	NC_022247	GCT	2	6	8302	8307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392239
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164	NC_022247	GCT	2	6	9211	9216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392239
165	NC_022247	GCC	2	6	9275	9280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392240
166	NC_022247	GGC	3	9	9294	9302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392240
167	NC_022247	CGC	2	6	9369	9374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392240
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240	NC_022247	GCA	2	6	13283	13288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392244
241	NC_022247	GCA	2	6	13295	13300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392244
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243	NC_022247	GCG	2	6	13460	13465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392244
244	NC_022247	GTT	2	6	13476	13481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538392244
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246	NC_022247	GGA	2	6	13671	13676	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538392244
247	NC_022247	TCC	2	6	13899	13904	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538392245
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249	NC_022247	CCG	2	6	14019	14024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392245
250	NC_022247	CGC	2	6	14037	14042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392245
251	NC_022247	CAA	2	6	14110	14115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538392245
252	NC_022247	CAA	2	6	14119	14124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538392245
253	NC_022247	CAC	2	6	14149	14154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392245
254	NC_022247	CGC	2	6	14428	14433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392246
255	NC_022247	TCT	2	6	14497	14502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538392246
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