MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus intermedius B196

Total Repeats: 105

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022246	TTATTT	2	12	5	16	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022246	ATAAAT	2	12	15122	15133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022246	ACTAAT	2	12	24384	24395	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_022246	GGTAAA	2	12	42012	42023	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022246	TTAAAA	2	12	50169	50180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022246	AAAAAG	2	12	51991	52002	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022246	AAAATC	2	12	72557	72568	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_022246	AGAAAA	2	12	106515	106526	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022246	AGGAAA	2	12	129321	129332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022246	TTAAAA	2	12	132309	132320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022246	TACTAT	2	12	178299	178310	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_022246	CTTTTT	2	12	201212	201223	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_022246	AATTAT	2	12	204724	204735	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022246	TATCTA	2	12	212286	212297	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_022246	AGTAAG	2	12	226194	226205	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022246	GAATGG	2	12	240403	240414	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022246	GGAAAA	2	12	252174	252185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022246	TGTCTA	2	12	259196	259207	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_022246	CTTTTT	2	12	259675	259686	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_022246	TTTGAA	2	12	283308	283319	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022246	GTTTTT	2	12	294211	294222	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022246	ACTAAT	2	12	316040	316051	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_022246	TTCATT	2	12	321909	321920	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_022246	TAAGGA	2	12	333730	333741	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022246	AAAATA	2	12	334441	334452	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022246	TTATGA	2	12	374581	374592	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022246	CCAATT	2	12	439463	439474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_022246	AAAAAG	2	12	440865	440876	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022246	GGAGAA	2	12	496715	496726	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022246	TTTTGA	2	12	535224	535235	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022246	AAAAAG	2	12	535261	535272	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022246	AGGAAT	2	12	537942	537953	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022246	TCTAAT	2	12	543829	543840	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_022246	TTTTAA	2	12	549972	549983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022246	TAAAAA	2	12	599624	599635	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022246	CTTTTT	2	12	601611	601622	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_022246	TATTTT	2	12	615275	615286	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022246	AAAAGG	2	12	633268	633279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022246	TTGCTT	2	12	633502	633513	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_022246	GAAAGA	2	12	651966	651977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022246	AAAGTA	2	12	660523	660534	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022246	AACTGA	2	12	660647	660658	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_022246	ATTTTA	2	12	700237	700248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022246	TGCTAT	2	12	702865	702876	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_022246	ATTTTT	2	12	713877	713888	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022246	AACAAA	2	12	736545	736556	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_022246	AGACAA	2	12	743627	743638	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_022246	TAAATT	2	12	744473	744484	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022246	TAAAAA	2	12	753897	753908	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022246	TTTGTT	2	12	779945	779956	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022246	ACGTAG	2	12	784491	784502	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_022246	TTAATT	2	12	808039	808050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022246	CCCGAA	2	12	832457	832468	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
54	NC_022246	AAAATT	2	12	839981	839992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022246	TCTCAA	2	12	864935	864946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_022246	ATTTTC	2	12	878500	878511	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_022246	CTTCGT	2	12	950288	950299	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_022246	ATTAAA	2	12	984136	984147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022246	CAAATT	2	12	1028758	1028769	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_022246	AAACAT	2	12	1033142	1033153	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_022246	AGAAAA	2	12	1084986	1084997	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022246	TTTAGG	2	12	1098693	1098704	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022246	GGTTTT	2	12	1197541	1197552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022246	AGTTTT	2	12	1218012	1218023	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022246	TTTGCT	2	12	1228318	1228329	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_022246	CCCTTT	2	12	1262434	1262445	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_022246	TTCGTT	2	12	1283990	1284001	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_022246	CACAGA	2	12	1285745	1285756	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_022246	CTTTAT	2	12	1291969	1291980	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_022246	TATAAT	2	12	1300298	1300309	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022246	TCCCAC	2	12	1320539	1320550	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_022246	AAATTA	2	12	1371870	1371881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022246	CTTATC	2	12	1403859	1403870	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_022246	TAATCT	2	12	1423407	1423418	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_022246	TAAAAA	2	12	1429654	1429665	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022246	AAATAA	2	12	1442301	1442312	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022246	TATAAA	2	12	1442521	1442532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022246	GCGATG	2	12	1453704	1453715	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_022246	AATAAA	2	12	1456433	1456444	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022246	ATTTTT	2	12	1473777	1473788	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022246	TATTAG	2	12	1514041	1514052	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022246	CTTTTT	2	12	1565725	1565736	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_022246	AATTTT	2	12	1573243	1573254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022246	AAAAAC	2	12	1592288	1592299	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_022246	CAATAC	2	12	1613613	1613624	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_022246	AAGTAA	2	12	1639489	1639500	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022246	AGCAAT	2	12	1640975	1640986	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_022246	CACTAT	2	12	1673116	1673127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_022246	TGTAAT	2	12	1717381	1717392	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022246	ATTTAT	2	12	1753715	1753726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_022246	AGATCA	2	12	1796510	1796521	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_022246	TTTTGA	2	12	1797453	1797464	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_022246	ACAAAT	2	12	1801584	1801595	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_022246	AAGGTC	2	12	1805332	1805343	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_022246	TAAAAT	2	12	1817888	1817899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022246	CCCGAA	2	12	1818085	1818096	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
97	NC_022246	TATTAG	2	12	1819160	1819171	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022246	TAATTT	2	12	1831058	1831069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_022246	ATTTAT	13	78	1890880	1890957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022246	AAAATC	2	12	1894780	1894791	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_022246	TGAAAG	2	12	1946210	1946221	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022246	CTCTTC	2	12	1951887	1951898	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_022246	AAATAT	2	12	1953430	1953441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022246	AATTTT	2	12	1958052	1958063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_022246	ATCGTA	2	12	1980722	1980733	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.