MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Bovismorbificans str. 3114 complete genome

Total Repeats: 196

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022241	TCTTAA	2	12	23183	23194	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_022241	GTGCAG	2	12	64350	64361	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_022241	TGTGGT	2	12	73175	73186	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022241	AAAGAA	2	12	73491	73502	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022241	CGGGTG	2	12	114857	114868	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_022241	AATGCT	2	12	119483	119494	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_022241	TGGCGT	2	12	122715	122726	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_022241	AAGAGG	2	12	126666	126677	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022241	TCATTA	2	12	281950	281961	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_022241	AGATGA	2	12	315786	315797	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022241	TTCTCA	2	12	323835	323846	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_022241	TGGCTG	2	12	335156	335167	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_022241	CTCATT	2	12	342925	342936	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_022241	GTGATA	2	12	441200	441211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022241	AAACGA	2	12	455870	455881	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_022241	CAGGCG	2	12	503705	503716	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_022241	AGCGCC	2	12	509434	509445	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
18	NC_022241	TGCAAT	2	12	554864	554875	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_022241	TAACGT	2	12	587615	587626	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_022241	TGCAAA	2	12	599829	599840	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_022241	TTTTTA	2	12	705369	705380	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022241	CAAAAA	2	12	752323	752334	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_022241	CGGCGA	2	12	793528	793539	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_022241	TACTGA	2	12	805266	805277	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_022241	TGAAAA	2	12	842199	842210	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022241	ATTTTT	2	12	848821	848832	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022241	TCATCG	2	12	889619	889630	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_022241	GATGAC	2	12	911239	911250	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_022241	TGTCCC	2	12	992262	992273	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
30	NC_022241	GCACAG	2	12	1017784	1017795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_022241	AGAATC	2	12	1042676	1042687	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_022241	TAAATG	2	12	1045312	1045323	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022241	ATCTCG	2	12	1045778	1045789	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_022241	AAAAAT	2	12	1064827	1064838	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022241	CGTTTA	2	12	1076851	1076862	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_022241	TGAGTA	2	12	1079273	1079284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022241	TAATTA	2	12	1143985	1143996	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022241	CATTTT	2	12	1224207	1224218	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_022241	ATATGG	2	12	1229428	1229439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022241	AAAAAC	2	12	1269595	1269606	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_022241	TACAGA	2	12	1271368	1271379	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_022241	GGTTTA	2	12	1282756	1282767	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022241	GATTTT	2	12	1304143	1304154	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022241	GGACAT	2	12	1312500	1312511	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_022241	GGGGCA	2	12	1361304	1361315	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_022241	CTGGCG	2	12	1361869	1361880	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_022241	GTTCTT	2	12	1379237	1379248	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_022241	CGCTCG	2	12	1387853	1387864	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
49	NC_022241	AGTCTT	2	12	1403078	1403089	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_022241	GAGGCG	2	12	1439178	1439189	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_022241	CGCTAA	2	12	1445053	1445064	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_022241	CCACGC	2	12	1593567	1593578	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_022241	CATCAC	2	12	1595193	1595204	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_022241	CATTAA	2	12	1611622	1611633	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_022241	TTCCCC	2	12	1614535	1614546	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_022241	TTTATG	2	12	1661535	1661546	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022241	TATTTA	2	12	1665665	1665676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022241	TTATTT	2	12	1669183	1669194	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022241	ACTGCC	2	12	1670858	1670869	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
60	NC_022241	TATAGT	2	12	1742124	1742135	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022241	TCTGCG	2	12	1754730	1754741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_022241	CAACGG	2	12	1795016	1795027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_022241	GAGCGA	2	12	1837181	1837192	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_022241	GCTGGT	2	12	1837245	1837256	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_022241	TTGGCT	2	12	1839131	1839142	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_022241	TGTTAA	2	12	1843854	1843865	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022241	TCAACG	2	12	1879961	1879972	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_022241	TAAAAA	2	12	1903626	1903637	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022241	AGTAAA	2	12	1905065	1905076	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022241	CAGGTA	2	12	1956113	1956124	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_022241	TAAAGC	2	12	1974421	1974432	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_022241	TAGCAG	2	12	1999452	1999463	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_022241	ATCGAT	2	12	1999567	1999578	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_022241	TAATAC	2	12	2037727	2037738	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_022241	GATTCG	2	12	2085286	2085297	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_022241	AATCAG	2	12	2095326	2095337	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_022241	ATAACA	2	12	2179326	2179337	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_022241	ACATAA	2	12	2179544	2179555	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_022241	TGTTTA	2	12	2187531	2187542	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022241	CAACAG	2	12	2214076	2214087	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_022241	TTTATC	2	12	2217538	2217549	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_022241	GGCGCA	2	12	2291633	2291644	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_022241	CAGCAT	2	12	2292000	2292011	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_022241	CCTTCA	2	12	2310969	2310980	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_022241	TAACGC	2	12	2317226	2317237	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_022241	AGAAAA	2	12	2420241	2420252	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022241	CTGGCG	2	12	2434133	2434144	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_022241	GCCGCT	2	12	2434198	2434209	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
89	NC_022241	ATTTTT	2	12	2448540	2448551	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022241	GTAAGT	2	12	2459653	2459664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_022241	TTTTCA	2	12	2468963	2468974	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_022241	CAAGTG	2	12	2485946	2485957	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_022241	CACGTA	2	12	2531476	2531487	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_022241	CTCAAC	2	12	2567354	2567365	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_022241	CCTGCG	2	12	2573747	2573758	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
96	NC_022241	AACTGG	2	12	2574121	2574132	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_022241	GCTGTC	2	12	2575998	2576009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_022241	CTCGCC	2	12	2576445	2576456	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_022241	CGATGA	2	12	2577829	2577840	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_022241	CCGTCG	2	12	2578085	2578096	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
101	NC_022241	TATCCG	2	12	2580169	2580180	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_022241	CAGCGT	2	12	2582306	2582317	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_022241	TCAGCG	2	12	2582926	2582937	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_022241	TTCACC	2	12	2583981	2583992	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_022241	CGGTGA	2	12	2585578	2585589	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_022241	GCTACA	2	12	2603772	2603783	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_022241	CAGCCC	2	12	2714524	2714535	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_022241	AGGTGA	2	12	2714594	2714605	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022241	TTTGTT	2	12	2720627	2720638	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022241	CGTTTC	2	12	2736309	2736320	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_022241	ACAAAA	2	12	2736897	2736908	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_022241	TAAAAA	2	12	2790534	2790545	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022241	ATCGAT	2	12	2792925	2792936	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_022241	CTTTGC	2	12	2794919	2794930	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_022241	CAATAA	2	12	2821739	2821750	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_022241	ATTAAA	2	12	2924711	2924722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_022241	ACAGCG	2	12	2963309	2963320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_022241	CCAGCA	2	12	2963330	2963341	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
119	NC_022241	TTGAGC	2	12	2964115	2964126	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_022241	GCGATC	2	12	3026970	3026981	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_022241	CCACCG	2	12	3071216	3071227	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_022241	TATTCT	2	12	3210615	3210626	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_022241	AGTTGT	2	12	3258445	3258456	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_022241	AATGAT	2	12	3264112	3264123	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022241	TAACCA	2	12	3302405	3302416	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_022241	ATTCAA	2	12	3304152	3304163	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_022241	TTATTT	2	12	3306351	3306362	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_022241	AACCCT	2	12	3333905	3333916	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_022241	TGTTAT	2	12	3396200	3396211	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_022241	CTCCGT	2	12	3400815	3400826	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
131	NC_022241	TCAGCG	2	12	3401021	3401032	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_022241	CGCCCA	2	12	3401126	3401137	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_022241	CGCCCA	2	12	3401199	3401210	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_022241	CAGCGC	2	12	3401329	3401340	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
135	NC_022241	GGCTCC	2	12	3453216	3453227	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
136	NC_022241	TGTCGC	2	12	3473616	3473627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_022241	CGCGAC	2	12	3504246	3504257	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
138	NC_022241	CTATCG	2	12	3505949	3505960	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_022241	GTGAGC	2	12	3507780	3507791	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
140	NC_022241	TCAGCG	2	12	3508096	3508107	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_022241	CACCAG	2	12	3508751	3508762	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
142	NC_022241	CCGATG	2	12	3508819	3508830	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_022241	GGACGC	2	12	3509393	3509404	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_022241	TTCTAT	2	12	3509604	3509615	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
145	NC_022241	CTTAAT	2	12	3648058	3648069	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
146	NC_022241	TAAAAA	2	12	3702276	3702287	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_022241	GCGATC	2	12	3718480	3718491	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_022241	ATTATA	2	12	3752453	3752464	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_022241	CAATGG	2	12	3753836	3753847	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
150	NC_022241	GGTATT	2	12	3756741	3756752	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
151	NC_022241	TGGCTC	2	12	3757214	3757225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_022241	GCGATG	2	12	3757644	3757655	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
153	NC_022241	CGGTGG	2	12	3806970	3806981	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
154	NC_022241	GCATTA	2	12	3821693	3821704	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
155	NC_022241	ACATGA	2	12	3833446	3833457	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
156	NC_022241	CCAGCT	2	12	3883028	3883039	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
157	NC_022241	ATGCCA	2	12	3931625	3931636	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_022241	ATTTTT	2	12	3980354	3980365	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_022241	TATCAA	2	12	4097349	4097360	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
160	NC_022241	AAATAT	2	12	4109419	4109430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_022241	TTTTAA	2	12	4109615	4109626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_022241	TTTTAC	2	12	4154256	4154267	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
163	NC_022241	CAGCGC	2	12	4174227	4174238	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
164	NC_022241	AGCGTT	2	12	4180673	4180684	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
165	NC_022241	AAAACG	2	12	4198476	4198487	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
166	NC_022241	AATAAA	2	12	4217146	4217157	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_022241	GGGGCT	2	12	4231451	4231462	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
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169	NC_022241	TAACCA	2	12	4280258	4280269	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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172	NC_022241	TGACGG	2	12	4324684	4324695	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
173	NC_022241	AAATAG	2	12	4330967	4330978	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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179	NC_022241	GAAAAA	2	12	4403047	4403058	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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196	NC_022241	AAGCGC	2	12	4657080	4657091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.