MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Bovismorbificans str. 3114 complete genome

Total Repeats: 59681

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022241	CGG	2	6	354	359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360567
2	NC_022241	TGG	2	6	476	481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538360567
3	NC_022241	GAT	2	6	483	488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538360567
4	NC_022241	CGG	2	6	501	506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360567
5	NC_022241	CTG	2	6	664	669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360567
6	NC_022241	CGC	2	6	693	698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538360567
7	NC_022241	CGC	2	6	858	863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538360567
8	NC_022241	CCG	2	6	908	913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538360567
9	NC_022241	TGG	2	6	932	937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538360567
10	NC_022241	ACT	2	6	959	964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538360567
11	NC_022241	GCC	2	6	967	972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538360567
12	NC_022241	GCC	2	6	979	984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538360567
13	NC_022241	CTG	2	6	999	1004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360567
14	NC_022241	CTG	2	6	1069	1074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360567
15	NC_022241	CGA	2	6	1233	1238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538360567
16	NC_022241	AAC	2	6	1273	1278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538360567
17	NC_022241	GAT	2	6	1317	1322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538360567
18	NC_022241	GGC	2	6	1329	1334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360567
19	NC_022241	CGC	2	6	1344	1349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538360567
20	NC_022241	GGT	2	6	1371	1376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538360567
21	NC_022241	TCC	2	6	1390	1395	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538360567
22	NC_022241	CCG	2	6	1446	1451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538360567
23	NC_022241	GCT	2	6	1491	1496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360567
24	NC_022241	TGT	2	6	1536	1541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538360567
25	NC_022241	TTC	2	6	1582	1587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538360567
26	NC_022241	TCT	2	6	1636	1641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538360567
27	NC_022241	TGG	2	6	1658	1663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538360567
28	NC_022241	ACG	2	6	1670	1675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538360567
29	NC_022241	CCA	2	6	1679	1684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538360567
30	NC_022241	CGG	2	6	1755	1760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360567
31	NC_022241	CGG	2	6	1764	1769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360567
32	NC_022241	GAA	2	6	1809	1814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538360567
33	NC_022241	GCG	2	6	1838	1843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360567
34	NC_022241	ATC	2	6	1967	1972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538360567
35	NC_022241	TTG	2	6	1988	1993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538360567
36	NC_022241	TCG	2	6	2086	2091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360567
37	NC_022241	ACT	2	6	2096	2101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538360567
38	NC_022241	CGC	3	9	2118	2126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538360567
39	NC_022241	CTG	2	6	2200	2205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360567
40	NC_022241	TGA	2	6	2214	2219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538360567
41	NC_022241	GAC	2	6	2512	2517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538360567
42	NC_022241	GCC	2	6	2524	2529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538360567
43	NC_022241	TGA	2	6	2547	2552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538360567
44	NC_022241	TAT	2	6	2686	2691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538360567
45	NC_022241	TGC	2	6	2708	2713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360567
46	NC_022241	ATG	2	6	2732	2737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538360567
47	NC_022241	CGG	3	9	2741	2749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360567
48	NC_022241	AGC	2	6	2917	2922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538360568
49	NC_022241	GCC	2	6	2968	2973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538360568
50	NC_022241	CGT	2	6	3106	3111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360568
51	NC_022241	GCA	2	6	3207	3212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538360568
52	NC_022241	TGA	2	6	3258	3263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538360568
53	NC_022241	GAA	2	6	3266	3271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538360568
54	NC_022241	ATT	2	6	3278	3283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538360568
55	NC_022241	CAG	2	6	3287	3292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538360568
56	NC_022241	TGA	2	6	3304	3309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538360568
57	NC_022241	GCC	2	6	3464	3469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538360568
58	NC_022241	TGA	2	6	3474	3479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538360568
59	NC_022241	CGG	2	6	3705	3710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360568
60	NC_022241	AGT	2	6	3718	3723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538360568
61	NC_022241	CAG	2	6	3809	3814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538360569
62	NC_022241	TGA	2	6	3862	3867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538360569
63	NC_022241	GCA	2	6	3937	3942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538360569
64	NC_022241	CGG	2	6	4060	4065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360569
65	NC_022241	GCG	2	6	4098	4103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360569
66	NC_022241	GTC	2	6	4190	4195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360569
67	NC_022241	GGC	2	6	4253	4258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360569
68	NC_022241	TGA	2	6	4324	4329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538360569
69	NC_022241	GAA	2	6	4331	4336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538360569
70	NC_022241	GCC	2	6	4383	4388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538360569
71	NC_022241	CTA	2	6	4405	4410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538360569
72	NC_022241	CTG	2	6	4502	4507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360569
73	NC_022241	CGC	2	6	4543	4548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538360569
74	NC_022241	GGA	2	6	4669	4674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538360569
75	NC_022241	CCG	2	6	4681	4686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538360569
76	NC_022241	GCG	2	6	4718	4723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360569
77	NC_022241	GAT	2	6	4727	4732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538360569
78	NC_022241	ACA	2	6	4741	4746	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538360569
79	NC_022241	GCG	2	6	4793	4798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360569
80	NC_022241	GCT	2	6	4954	4959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360569
81	NC_022241	CAT	2	6	4964	4969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538360569
82	NC_022241	GCC	2	6	4985	4990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538360569
83	NC_022241	TGA	3	9	5001	5009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538360569
84	NC_022241	TCA	2	6	5163	5168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538360570
85	NC_022241	AAT	2	6	5228	5233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538360570
86	NC_022241	TCA	2	6	5242	5247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538360570
87	NC_022241	ACC	2	6	5277	5282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538360570
88	NC_022241	TCA	2	6	5301	5306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538360570
89	NC_022241	TTC	2	6	5340	5345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538360570
90	NC_022241	CAC	3	9	5384	5392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538360570
91	NC_022241	TGT	2	6	5568	5573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538360570
92	NC_022241	CGT	2	6	5593	5598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360570
93	NC_022241	GCG	2	6	5755	5760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360570
94	NC_022241	GCT	2	6	5788	5793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360570
95	NC_022241	ACC	2	6	6096	6101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538360571
96	NC_022241	CAA	2	6	6110	6115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538360571
97	NC_022241	CGA	2	6	6301	6306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538360571
98	NC_022241	CAG	2	6	6437	6442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538360571
99	NC_022241	ATC	2	6	6447	6452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538360571
100	NC_022241	GAT	2	6	6467	6472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538360571
101	NC_022241	ACG	2	6	6535	6540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538360571
102	NC_022241	GCC	2	6	6543	6548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538360571
103	NC_022241	GAT	2	6	6764	6769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538360571
104	NC_022241	GCG	2	6	6862	6867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360571
105	NC_022241	CGA	2	6	6940	6945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538360571
106	NC_022241	GCC	2	6	7013	7018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538360571
107	NC_022241	AGG	2	6	7078	7083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538360571
108	NC_022241	ATG	2	6	7095	7100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538360571
109	NC_022241	GCG	2	6	7140	7145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360572
110	NC_022241	GCC	2	6	7204	7209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538360572
111	NC_022241	CAC	2	6	7675	7680	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538360573
112	NC_022241	CAG	2	6	7823	7828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538360573
113	NC_022241	AGC	2	6	7829	7834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538360573
114	NC_022241	CAG	2	6	7844	7849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538360573
115	NC_022241	GTT	2	6	7850	7855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538360573
116	NC_022241	ATG	2	6	8001	8006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538360573
117	NC_022241	AAG	2	6	8085	8090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538360573
118	NC_022241	GCT	2	6	8110	8115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360573
119	NC_022241	TAC	2	6	8276	8281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538360573
120	NC_022241	CGT	2	6	8302	8307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360573
121	NC_022241	GCA	2	6	8491	8496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538360573
122	NC_022241	CTG	2	6	8588	8593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360573
123	NC_022241	GCG	2	6	8756	8761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360574
124	NC_022241	GAG	2	6	8791	8796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538360574
125	NC_022241	GCG	2	6	8835	8840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360574
126	NC_022241	TGA	2	6	8850	8855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538360574
127	NC_022241	TGA	2	6	8892	8897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538360574
128	NC_022241	GCT	2	6	9207	9212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360574
129	NC_022241	CAG	2	6	9507	9512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538360575
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249	NC_022241	CAA	2	6	17920	17925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538360585
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253	NC_022241	AGA	2	6	18170	18175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538360585
254	NC_022241	CTG	2	6	18339	18344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360585
255	NC_022241	CGG	2	6	18413	18418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360585
256	NC_022241	CCG	2	6	18448	18453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538360585
257	NC_022241	GTG	2	6	18489	18494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538360585
258	NC_022241	GCT	2	6	18605	18610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360585
259	NC_022241	CTG	2	6	18679	18684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360585
260	NC_022241	ACT	2	6	18687	18692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538360585
261	NC_022241	TGA	2	6	18751	18756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538360585
262	NC_022241	CTT	2	6	18764	18769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538360585
263	NC_022241	CCA	2	6	18797	18802	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538360585
264	NC_022241	CTG	2	6	18861	18866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360585
265	NC_022241	CGC	2	6	18952	18957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538360585
266	NC_022241	CTA	2	6	18988	18993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538360585
267	NC_022241	CGC	2	6	19159	19164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538360585
268	NC_022241	CGA	2	6	19367	19372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538360585
269	NC_022241	GCG	2	6	19401	19406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360585
270	NC_022241	TTC	2	6	19457	19462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538360585
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273	NC_022241	GAA	2	6	19725	19730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538360585
274	NC_022241	GAT	2	6	19749	19754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538360585
275	NC_022241	CAG	2	6	19759	19764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538360585
276	NC_022241	TGG	2	6	19872	19877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538360585
277	NC_022241	CGG	2	6	19913	19918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360585
278	NC_022241	TCA	2	6	20105	20110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538360586
279	NC_022241	GCG	2	6	20192	20197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360586
280	NC_022241	AAC	2	6	20260	20265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538360586
281	NC_022241	ATC	2	6	20266	20271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538360586
282	NC_022241	TAA	2	6	20274	20279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538360586
283	NC_022241	CTT	2	6	20293	20298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538360586
284	NC_022241	CGC	2	6	20448	20453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538360586
285	NC_022241	AAC	2	6	20459	20464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538360586
286	NC_022241	CCG	2	6	20465	20470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538360586
287	NC_022241	GAA	2	6	20727	20732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538360586
288	NC_022241	GGC	2	6	20769	20774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360586
289	NC_022241	CCG	2	6	20783	20788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538360586
290	NC_022241	GCC	2	6	20806	20811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538360586
291	NC_022241	GCT	2	6	20937	20942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360586
292	NC_022241	ATG	2	6	21050	21055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538360586
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294	NC_022241	TGA	2	6	21170	21175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538360586
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299	NC_022241	CTG	2	6	21383	21388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360586
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311	NC_022241	GTA	2	6	22192	22197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538360586
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315	NC_022241	TGC	2	6	22412	22417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360586
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334	NC_022241	TGA	2	6	23769	23774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538360587
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488	NC_022241	GGA	2	6	35810	35815	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538360601
489	NC_022241	GGT	2	6	35881	35886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538360601
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491	NC_022241	TCT	2	6	36020	36025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538360601
492	NC_022241	TTC	2	6	36049	36054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538360601
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497	NC_022241	TAT	2	6	36374	36379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538360601
498	NC_022241	TTA	2	6	36420	36425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538360601
499	NC_022241	GAT	3	9	36435	36443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538360601
500	NC_022241	GCA	2	6	36515	36520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538360601

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