MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus constellatus subsp. pharyngis C1050

Total Repeats: 125

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022238	ACTAAT	2	12	21387	21398	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_022238	GGTAAA	2	12	39242	39253	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022238	TCACTG	2	12	111733	111744	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_022238	TAGTGT	2	12	119126	119137	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022238	TTAAAA	2	12	141008	141019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022238	TTGAGA	2	12	164185	164196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022238	TATGAA	2	12	164982	164993	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022238	TATCTA	2	12	215649	215660	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_022238	AGTAAG	2	12	225790	225801	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022238	GAATGG	2	12	240649	240660	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022238	TATAAA	2	12	255109	255120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022238	GCAGGG	2	12	259950	259961	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_022238	GTTTCA	2	12	289284	289295	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_022238	ACTAAT	2	12	303102	303113	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_022238	TGAAAA	2	12	321891	321902	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022238	TTTATC	2	12	341670	341681	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_022238	AATTTG	2	12	342688	342699	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022238	ACCTAT	2	12	361322	361333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_022238	AAAAGC	2	12	362281	362292	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_022238	ATGAGA	2	12	363332	363343	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022238	CGAAAT	2	12	369572	369583	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_022238	TTTGTT	2	12	383711	383722	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022238	TTTTTA	2	12	397901	397912	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022238	TCAATA	2	12	417867	417878	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_022238	GTTTAG	2	12	424940	424951	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022238	ATTGCT	2	12	430628	430639	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_022238	ATGAGG	2	12	438766	438777	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022238	CTTGAA	2	12	446498	446509	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_022238	TCTTTC	2	12	450368	450379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_022238	TGAAAA	2	12	450470	450481	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022238	ATTTTT	2	12	477702	477713	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022238	TCTTAT	2	12	483700	483711	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_022238	ATGGTT	2	12	502010	502021	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022238	GTATAT	2	12	508227	508238	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022238	AGTCTT	2	12	514204	514215	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_022238	AAAGGG	2	12	523405	523416	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022238	TTTCTT	2	12	531859	531870	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_022238	GGGCAT	2	12	531880	531891	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_022238	AGAAAA	2	12	532947	532958	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022238	CTTTTC	2	12	548172	548183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_022238	TGAAAA	2	12	560054	560065	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022238	TATTCT	2	12	577960	577971	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_022238	TAAAAC	2	12	586499	586510	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_022238	AAGATA	2	12	624640	624651	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022238	TTTATA	2	12	640074	640085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022238	TTGGCT	2	12	686209	686220	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_022238	AATGCC	2	12	689461	689472	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_022238	TTAAGT	2	12	700406	700417	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022238	TTTTGA	2	12	727089	727100	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022238	AAAAAG	2	12	727126	727137	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022238	AGCTAT	2	12	749285	749296	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_022238	GTCGTG	2	12	763801	763812	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_022238	CCTTCT	2	12	777974	777985	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_022238	TGCTAT	2	12	793431	793442	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_022238	GAGAAG	2	12	810421	810432	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022238	TAGATC	2	12	834112	834123	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_022238	TCTTTT	2	12	861961	861972	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_022238	TAAAAA	2	12	882997	883008	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022238	TAAAAA	2	12	904644	904655	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022238	TTTAAT	2	12	921006	921017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022238	AAATTA	2	12	930599	930610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022238	TTTATC	2	12	976773	976784	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_022238	CTTAAT	2	12	980020	980031	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_022238	TAAAAA	2	12	990510	990521	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022238	CCCGAA	2	12	992211	992222	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
66	NC_022238	TAAAAA	2	12	1002658	1002669	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022238	ACTAAG	2	12	1002886	1002897	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_022238	TCTCAA	2	12	1023304	1023315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_022238	ATTTTC	2	12	1038551	1038562	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_022238	AGTTCC	2	12	1071170	1071181	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_022238	TAGCAA	2	12	1091520	1091531	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_022238	ACTCGC	2	12	1131577	1131588	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
73	NC_022238	CTGCAT	2	12	1132165	1132176	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_022238	AAAAAG	2	12	1155513	1155524	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022238	CAAGAA	2	12	1184825	1184836	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_022238	AAAAGA	2	12	1213414	1213425	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022238	CAATAT	2	12	1223022	1223033	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_022238	TATAAC	2	12	1225255	1225266	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_022238	CAATCA	2	12	1242380	1242391	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_022238	TCTTAT	2	12	1266493	1266504	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_022238	TCTTTT	2	12	1277543	1277554	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_022238	TTCAAC	2	12	1282372	1282383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_022238	TATCAT	2	12	1300682	1300693	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_022238	ACCTTT	2	12	1301393	1301404	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_022238	TAAAAA	2	12	1306415	1306426	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022238	ATATCT	2	12	1318547	1318558	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_022238	AAAGAA	2	12	1318610	1318621	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022238	TCGGAT	2	12	1318919	1318930	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_022238	ACTTTC	2	12	1319443	1319454	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_022238	CATTAT	2	12	1351687	1351698	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_022238	CAAATT	2	12	1398575	1398586	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_022238	ACTTTT	2	12	1420490	1420501	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_022238	TTTTTA	2	12	1476352	1476363	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_022238	TTAACC	2	12	1497419	1497430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_022238	TATTAG	2	12	1578870	1578881	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022238	TCTAAA	2	12	1594855	1594866	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_022238	ATTTCA	2	12	1621436	1621447	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_022238	AAGCCA	2	12	1622650	1622661	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_022238	CAAAAC	2	12	1623058	1623069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_022238	CTTTTT	2	12	1626496	1626507	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_022238	AAATTT	2	12	1634304	1634315	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022238	CAAAAA	2	12	1653344	1653355	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_022238	ATTCAG	2	12	1669087	1669098	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_022238	CATCTA	2	12	1707319	1707330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_022238	AGAAAA	2	12	1707416	1707427	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_022238	AAAAAT	2	12	1762863	1762874	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022238	TAAGAA	2	12	1777020	1777031	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022238	ATTTAT	2	12	1781332	1781343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022238	TAAAAA	2	12	1781492	1781503	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022238	TACTTT	2	12	1813252	1813263	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_022238	CCCGAA	2	12	1825022	1825033	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
112	NC_022238	TATTAG	2	12	1826196	1826207	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022238	CTTCAA	2	12	1834563	1834574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_022238	CCAAGT	2	12	1837613	1837624	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_022238	TAATTT	2	12	1837680	1837691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_022238	CATAGC	2	12	1852633	1852644	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_022238	TTGCTC	2	12	1862885	1862896	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_022238	TCAATC	2	12	1866374	1866385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_022238	CTTTTT	2	12	1867366	1867377	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_022238	TATCAT	2	12	1867586	1867597	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_022238	ACCTTT	2	12	1868297	1868308	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_022238	CTCTTC	2	12	1946993	1947004	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_022238	CTGCTT	2	12	1947085	1947096	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_022238	AAATAT	2	12	1949258	1949269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022238	AATTTT	2	12	1953724	1953735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.