MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus intermedius C270

Total Repeats: 104

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022237	CATATT	2	12	15043	15054	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_022237	ACTAAT	2	12	24288	24299	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_022237	AAAAAG	2	12	47780	47791	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022237	GGTTGC	2	12	69998	70009	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_022237	TCACTG	2	12	105377	105388	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_022237	AGAAAA	2	12	109137	109148	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022237	AGGAAA	2	12	137552	137563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022237	TTAAAA	2	12	140540	140551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022237	TACTAT	2	12	179015	179026	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_022237	TCAATT	2	12	187642	187653	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_022237	AGTTTG	2	12	188097	188108	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022237	CTTTTT	2	12	199880	199891	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_022237	AATTAT	2	12	203393	203404	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022237	TATCTA	2	12	213002	213013	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_022237	AGTAAG	2	12	223291	223302	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022237	GATTTT	2	12	233769	233780	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022237	GAATGG	2	12	237504	237515	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022237	GGAAAA	2	12	247247	247258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022237	TGTCTA	2	12	254273	254284	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_022237	CTCTGC	2	12	254729	254740	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
21	NC_022237	TTTGAA	2	12	273747	273758	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022237	GTTTTT	2	12	284651	284662	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022237	TATCAA	2	12	290651	290662	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_022237	ACTAAT	2	12	314883	314894	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_022237	TTCATT	2	12	320260	320271	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_022237	TAAGGA	2	12	332081	332092	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022237	AAAATA	2	12	332792	332803	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022237	TTATGA	2	12	372893	372904	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022237	CCAATT	2	12	432830	432841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_022237	AAAAAG	2	12	434232	434243	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022237	TTGGCT	2	12	483682	483693	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_022237	GGAGAA	2	12	484394	484405	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022237	TTTTGA	2	12	522903	522914	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022237	AAAAAG	2	12	522940	522951	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022237	AGGAAT	2	12	525621	525632	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022237	TGTTGA	2	12	531035	531046	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022237	TCTAAT	2	12	531583	531594	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_022237	TTTTAA	2	12	537723	537734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022237	TAAAAA	2	12	572411	572422	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022237	CTTTTT	2	12	574380	574391	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_022237	TATTTT	2	12	588027	588038	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022237	AAAAGG	2	12	606024	606035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022237	TTGCTT	2	12	606265	606276	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_022237	AAAATA	2	12	633246	633257	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022237	AATGGA	2	12	675085	675096	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022237	AAAGTA	2	12	692303	692314	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022237	AACTGA	2	12	692427	692438	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_022237	TGAGGT	2	12	694401	694412	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022237	TGCTAT	2	12	714124	714135	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_022237	ATTTTT	2	12	725281	725292	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022237	AACAAA	2	12	747958	747969	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_022237	TAAATT	2	12	754453	754464	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022237	TAAAAA	2	12	763873	763884	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022237	ACGTAG	2	12	786903	786914	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_022237	TTTTTA	2	12	789349	789360	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022237	TTAATT	2	12	818163	818174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022237	CCCGAA	2	12	843577	843588	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
58	NC_022237	AAAATT	2	12	851043	851054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022237	TCTCAA	2	12	876051	876062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_022237	ATTTTC	2	12	889615	889626	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_022237	ATTAAA	2	12	995344	995355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022237	TACTAT	2	12	1047245	1047256	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_022237	TTTAGG	2	12	1116520	1116531	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022237	TTACGA	2	12	1162542	1162553	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_022237	AGTTTT	2	12	1241969	1241980	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022237	TGCTTC	2	12	1252273	1252284	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_022237	CAAAAG	2	12	1280745	1280756	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_022237	CCCTTT	2	12	1286380	1286391	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_022237	TTCGTT	2	12	1307965	1307976	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_022237	CACAGA	2	12	1309720	1309731	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_022237	CTTTAT	2	12	1315935	1315946	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_022237	TCCCAC	2	12	1344510	1344521	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_022237	TAAAAA	2	12	1408752	1408763	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022237	TATAAA	2	12	1421620	1421631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022237	GCGATG	2	12	1432802	1432813	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_022237	AATAAA	2	12	1435530	1435541	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022237	ATCTGG	2	12	1453164	1453175	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_022237	TATTAG	2	12	1494307	1494318	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022237	CTTTTT	2	12	1544911	1544922	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_022237	AATTTT	2	12	1552429	1552440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022237	AAAAAC	2	12	1571513	1571524	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_022237	ATTCAG	2	12	1587194	1587205	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_022237	CAATAC	2	12	1594035	1594046	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_022237	AAGTAA	2	12	1620638	1620649	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022237	CACTAT	2	12	1654440	1654451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_022237	TGTAAT	2	12	1696695	1696706	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022237	ATTTAT	2	12	1733631	1733642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022237	TAAAAA	2	12	1733790	1733801	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022237	AGATCA	2	12	1780766	1780777	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_022237	TAAAAT	2	12	1782911	1782922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_022237	CCCGAA	2	12	1783108	1783119	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
92	NC_022237	TATTAG	2	12	1784183	1784194	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_022237	CCAAGT	2	12	1796130	1796141	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_022237	TAATTT	2	12	1796197	1796208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022237	ATTTCA	2	12	1841968	1841979	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_022237	AAATAA	2	12	1849925	1849936	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_022237	AAAATC	2	12	1852339	1852350	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_022237	TTCTCA	2	12	1882607	1882618	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_022237	TGAAAG	2	12	1910393	1910404	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022237	CTCTTC	2	12	1916070	1916081	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_022237	CTGCTT	2	12	1916162	1916173	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_022237	AATTTT	2	12	1922351	1922362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022237	ATCGTA	2	12	1945021	1945032	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_022237	TTATTT	2	12	1960517	1960528	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.