MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Streptococcus intermedius C270

Total Repeats: 695

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022237	TAGAAA	2	12	1318	1329	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	538349852
2	NC_022237	ATTGGT	2	12	5094	5105	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	538349857
3	NC_022237	TGCTTA	2	12	8031	8042	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	538349858
4	NC_022237	TAGAAA	2	12	11010	11021	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	538349863
5	NC_022237	AGCTCA	2	12	27898	27909	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	538349870
6	NC_022237	TGAAAA	2	12	27970	27981	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	538349870
7	NC_022237	GTAGAT	2	12	35165	35176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538349877
8	NC_022237	CAGGTG	2	12	35331	35342	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	538349877
9	NC_022237	GCAATG	2	12	35727	35738	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	538349877
10	NC_022237	TTGATT	2	12	36747	36758	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	538349877
11	NC_022237	TTACGA	2	12	40022	40033	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	538349879
12	NC_022237	GCTGGT	2	12	40719	40730	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	538349880
13	NC_022237	ATGCGG	2	12	42863	42874	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	538349883
14	NC_022237	ATATTG	2	12	42881	42892	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	538349883
15	NC_022237	TGGATT	2	12	44986	44997	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	538349884
16	NC_022237	GTCCTA	2	12	50660	50671	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	538349890
17	NC_022237	TGAAAA	2	12	50721	50732	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	538349890
18	NC_022237	ATTTTG	2	12	52964	52975	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	538349892
19	NC_022237	GAAAGA	2	12	53153	53164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538349892
20	NC_022237	TTCCTT	2	12	57894	57905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538349898
21	NC_022237	TGACGA	2	12	61411	61422	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	538349901
22	NC_022237	GACGAA	2	12	63061	63072	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	538349904
23	NC_022237	ATTACA	2	12	63244	63255	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	538349904
24	NC_022237	CAGATT	2	12	65768	65779	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	538349906
25	NC_022237	GATGTG	2	12	68543	68554	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	538349909
26	NC_022237	TTGACA	2	12	70443	70454	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	538349911
27	NC_022237	TTGGTG	2	12	75982	75993	0 %	50 %	50 %	0 %	538349913
28	NC_022237	TTTGCT	2	12	79699	79710	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	538349917
29	NC_022237	CCAGAT	2	12	82481	82492	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	538349918
30	NC_022237	TGAATT	2	12	87948	87959	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	538349923
31	NC_022237	GAGCAG	2	12	97866	97877	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	538349933
32	NC_022237	GTATTG	2	12	98737	98748	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	538349933
33	NC_022237	AATTTT	2	12	99242	99253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538349934
34	NC_022237	TGAAAA	2	12	99753	99764	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	538349935
35	NC_022237	CTATGC	2	12	106322	106333	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	538349941
36	NC_022237	AGGAGA	2	12	107415	107426	50 %	0 %	50 %	0 %	538349942
37	NC_022237	TTTGGG	2	12	108142	108153	0 %	50 %	50 %	0 %	538349942
38	NC_022237	TGGGCT	2	12	108371	108382	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	538349942
39	NC_022237	CAAATT	2	12	111161	111172	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	538349945
40	NC_022237	TTGACC	2	12	111636	111647	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	538349945
41	NC_022237	GTTACG	2	12	111655	111666	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	538349945
42	NC_022237	TCAAAT	2	12	112180	112191	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	538349945
43	NC_022237	ATAAAA	2	12	117076	117087	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	538349947
44	NC_022237	TTTGAG	2	12	117943	117954	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	538349947
45	NC_022237	TTTGAG	2	12	118285	118296	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	538349947
46	NC_022237	AAGTCA	2	12	118457	118468	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	538349947
47	NC_022237	GAGTTT	2	12	118624	118635	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	538349947
48	NC_022237	GAATTT	2	12	120010	120021	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	538349947
49	NC_022237	GAGTTT	2	12	120349	120360	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	538349947
50	NC_022237	AACCGT	2	12	120534	120545	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	538349947
51	NC_022237	GGTCAA	2	12	120556	120567	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	538349947
52	NC_022237	TGAATT	2	12	121029	121040	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	538349947
53	NC_022237	AGTTCC	2	12	126973	126984	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	538349952
54	NC_022237	ATGAAA	2	12	127706	127717	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	538349953
55	NC_022237	GATCAT	2	12	127828	127839	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	538349953
56	NC_022237	ATATCA	2	12	128630	128641	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	538349953
57	NC_022237	TTGGTT	2	12	133438	133449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538349958
58	NC_022237	CCAAAA	2	12	135571	135582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538349959
59	NC_022237	CTGGTG	2	12	139062	139073	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	538349963
60	NC_022237	ACCTTG	2	12	145519	145530	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	538349969
61	NC_022237	AAGGAA	2	12	150712	150723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538349973
62	NC_022237	GATTGG	2	12	156405	156416	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	538349979
63	NC_022237	GTCTTT	2	12	160392	160403	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	538349983
64	NC_022237	TCAATG	2	12	161422	161433	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	538349984
65	NC_022237	TATAAT	2	12	165079	165090	50 %	50 %	0 %	0 %	538349989
66	NC_022237	ATCTGC	2	12	167573	167584	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	538349992
67	NC_022237	GCTTCT	2	12	167715	167726	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	538349992
68	NC_022237	TTTAGG	2	12	168068	168079	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	538349992
69	NC_022237	TGTTTT	2	12	169891	169902	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	538349996
70	NC_022237	TTGATT	2	12	170976	170987	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	538349997
71	NC_022237	TTAAGA	2	12	182259	182270	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	538350002
72	NC_022237	TTGATA	2	12	182987	182998	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	538350003
73	NC_022237	CAAATG	2	12	186949	186960	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	538350010
74	NC_022237	AATGTT	2	12	189728	189739	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	538350013
75	NC_022237	GGTGAA	2	12	195239	195250	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	538350018
76	NC_022237	GATAAA	2	12	197131	197142	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	538350022
77	NC_022237	TCACGT	2	12	197463	197474	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	538350022
78	NC_022237	ACAAGA	2	12	197922	197933	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	538350023
79	NC_022237	ATTACA	2	12	197941	197952	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	538350023
80	NC_022237	AAGCTT	2	12	199835	199846	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	538350023
81	NC_022237	CGTGCT	2	12	200793	200804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538350024
82	NC_022237	TCCAAC	2	12	200906	200917	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	538350024
83	NC_022237	AAGTGC	2	12	202735	202746	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	538350025
84	NC_022237	TTTTCC	2	12	205297	205308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538350029
85	NC_022237	CAAAAT	2	12	209970	209981	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	538350035
86	NC_022237	ATTAGA	2	12	213450	213461	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	538350039
87	NC_022237	CAGGTC	2	12	219590	219601	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	538350044
88	NC_022237	CTCCAC	2	12	228104	228115	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	538350052
89	NC_022237	AGAAAA	2	12	230614	230625	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	538350055
90	NC_022237	TCGTAG	2	12	231837	231848	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	538350056
91	NC_022237	GTGACA	2	12	234888	234899	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	538350057
92	NC_022237	TGGATG	2	12	244293	244304	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	538350064
93	NC_022237	GTCTAC	2	12	244945	244956	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	538350065
94	NC_022237	GCCATG	2	12	245483	245494	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	538350065
95	NC_022237	CTTAGG	2	12	246103	246114	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	538350065
96	NC_022237	TCAGCT	2	12	248206	248217	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	538350067
97	NC_022237	AGTAGA	2	12	252020	252031	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	538350071
98	NC_022237	TCAATG	2	12	252109	252120	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	538350071
99	NC_022237	TGGTTG	2	12	252335	252346	0 %	50 %	50 %	0 %	538350071
100	NC_022237	GGCTAT	2	12	252558	252569	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	538350071
101	NC_022237	TGGCGG	2	12	257092	257103	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	538350075
102	NC_022237	AAAGAA	2	12	261650	261661	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	538350081
103	NC_022237	TTTCAG	2	12	262714	262725	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	538350081
104	NC_022237	TAATCA	2	12	264797	264808	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	538350083
105	NC_022237	ATCTTT	2	12	267401	267412	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	538350085
106	NC_022237	TGATAA	2	12	270763	270774	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	538350087
107	NC_022237	ATTATG	2	12	270891	270902	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	538350087
108	NC_022237	TTGCAA	2	12	280500	280511	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	538350097
109	NC_022237	AAAGGT	2	12	281295	281306	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	538350097
110	NC_022237	CTTTGC	2	12	283368	283379	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	538350099
111	NC_022237	AACACC	2	12	286145	286156	50 %	0 %	0 %	50 %	538350100
112	NC_022237	AGTGTA	2	12	286268	286279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538350101
113	NC_022237	GGCAAG	2	12	287865	287876	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	538350103
114	NC_022237	TAAAGA	2	12	288514	288525	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	538350104
115	NC_022237	AGCATA	2	12	289458	289469	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	538350105
116	NC_022237	TAGAAG	2	12	294195	294206	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	538350109
117	NC_022237	GAGGAA	2	12	296943	296954	50 %	0 %	50 %	0 %	538350112
118	NC_022237	TATTAC	2	12	298276	298287	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	538350114
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337	NC_022237	CACAAT	2	12	933744	933755	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	538350717
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340	NC_022237	ACAATC	2	12	950077	950088	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	538350733
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343	NC_022237	AATTTC	2	12	957049	957060	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	538350737
344	NC_022237	TCAATA	2	12	958963	958974	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	538350740
345	NC_022237	CAAAAT	2	12	961217	961228	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	538350742
346	NC_022237	TTATAC	2	12	965159	965170	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	538350746
347	NC_022237	CAGTTG	2	12	966406	966417	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	538350747
348	NC_022237	TGGTAT	2	12	966587	966598	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	538350747
349	NC_022237	TACAAG	2	12	966755	966766	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	538350747
350	NC_022237	TGCCAA	2	12	967989	968000	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	538350749
351	NC_022237	ATCTGC	2	12	969858	969869	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	538350750
352	NC_022237	CAATAT	2	12	972745	972756	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	538350754
353	NC_022237	GTAAAT	2	12	976698	976709	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	538350757
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365	NC_022237	TCATTT	2	12	1008985	1008996	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	538350783
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372	NC_022237	TTGACA	2	12	1021050	1021061	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	538350796
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376	NC_022237	CATTGA	2	12	1035974	1035985	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	538350801
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402	NC_022237	GGAATT	2	12	1115606	1115617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538350869
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437	NC_022237	AGAGCT	2	12	1211477	1211488	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	538350948
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440	NC_022237	ACGAGT	2	12	1215108	1215119	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	538350950
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442	NC_022237	CATAAT	2	12	1218459	1218470	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	538350953
443	NC_022237	TGTTTT	2	12	1220546	1220557	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	538350956
444	NC_022237	AGCTCC	2	12	1223008	1223019	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	538350961
445	NC_022237	AAGAAT	2	12	1228925	1228936	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	538350969
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447	NC_022237	CATAAA	2	12	1233781	1233792	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	538350973
448	NC_022237	ATTTTA	2	12	1237474	1237485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538350975
449	NC_022237	TGCATT	2	12	1238870	1238881	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	538350976
450	NC_022237	CTGTCC	2	12	1241050	1241061	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	538350978
451	NC_022237	ATTTTG	2	12	1241432	1241443	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	538350978
452	NC_022237	ATTAGC	2	12	1245143	1245154	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	538350983
453	NC_022237	TTTCAT	2	12	1246680	1246691	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	538350984
454	NC_022237	TAGAGC	2	12	1249223	1249234	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	538350985
455	NC_022237	CATCTG	2	12	1249498	1249509	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	538350985
456	NC_022237	TGGCTT	2	12	1252903	1252914	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	538350988
457	NC_022237	CACATC	2	12	1254657	1254668	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	538350990
458	NC_022237	TCTACA	2	12	1256475	1256486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538350993
459	NC_022237	GCTGTC	2	12	1257672	1257683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538350994
460	NC_022237	CAGCTC	2	12	1258384	1258395	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	538350995
461	NC_022237	AATCCG	2	12	1259165	1259176	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	538350996
462	NC_022237	GAAAAT	2	12	1259899	1259910	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	538350997
463	NC_022237	CTGTGC	2	12	1259978	1259989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538350997
464	NC_022237	CCAAAT	2	12	1263166	1263177	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	538351003
465	NC_022237	CGGTCT	2	12	1264252	1264263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538351004
466	NC_022237	CCAGAC	2	12	1266584	1266595	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	538351005
467	NC_022237	CAAGTC	2	12	1272906	1272917	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	538351011
468	NC_022237	CCAGAC	2	12	1273893	1273904	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	538351012
469	NC_022237	TTGAGA	2	12	1276366	1276377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538351016
470	NC_022237	ATGCCC	2	12	1277867	1277878	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	538351015
471	NC_022237	AAGAAA	2	12	1277888	1277899	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	538351015
472	NC_022237	TTAGAC	2	12	1279198	1279209	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	538351017
473	NC_022237	TTTCCT	2	12	1281555	1281566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538351019
474	NC_022237	GTACTA	2	12	1287679	1287690	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	538351030
475	NC_022237	TTTTTG	2	12	1288395	1288406	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	538351031
476	NC_022237	ACATTC	2	12	1288871	1288882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538351032
477	NC_022237	TTCCTC	2	12	1289297	1289308	0 %	50 %	0 %	50 %	538351032
478	NC_022237	TAAGAA	2	12	1298830	1298841	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	538351044
479	NC_022237	TCAAAA	2	12	1300136	1300147	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	538351044
480	NC_022237	TTTGTT	2	12	1305387	1305398	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	538351046
481	NC_022237	AAAGTT	2	12	1308211	1308222	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	538351049
482	NC_022237	CCCATC	2	12	1309057	1309068	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	538351050
483	NC_022237	TGAGTT	2	12	1309992	1310003	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	538351051
484	NC_022237	ATCAAT	2	12	1310169	1310180	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	538351051
485	NC_022237	AAATTC	2	12	1312518	1312529	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	538351053
486	NC_022237	TAAGGT	2	12	1321393	1321404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538351058
487	NC_022237	TAATGG	2	12	1322455	1322466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538351059
488	NC_022237	TACCAG	2	12	1326221	1326232	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	538351060
489	NC_022237	ATCAAA	2	12	1329305	1329316	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	538351064
490	NC_022237	CATCTG	2	12	1332877	1332888	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	538351067
491	NC_022237	CTCTTT	2	12	1334245	1334256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538351068
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493	NC_022237	CCAATC	2	12	1338365	1338376	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	538351072
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499	NC_022237	TTTATC	2	12	1353149	1353160	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	538351090
500	NC_022237	ATCTAA	2	12	1353197	1353208	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	538351090

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