MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus intermedius C270

Total Repeats: 328

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022237	ATTGA	2	10	3480	3489	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022237	ATACT	2	10	14780	14789	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_022237	TCTAT	2	10	15456	15465	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_022237	AACAG	2	10	15555	15564	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_022237	TCGTG	2	10	20555	20564	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
6	NC_022237	GAAGT	2	10	21186	21195	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022237	GGGAG	2	10	21938	21947	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022237	AGGGA	2	10	24147	24156	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022237	AATAA	2	10	44066	44075	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022237	CTTTT	2	10	69035	69044	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_022237	AAAAT	2	10	80760	80769	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022237	TTATA	2	10	91706	91715	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022237	TAAAA	2	10	95298	95307	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022237	CTTTT	2	10	109104	109113	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_022237	TAGTC	2	10	109904	109913	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_022237	ATTTA	2	10	110543	110552	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022237	TATAA	2	10	115590	115599	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022237	AAAGC	2	10	135714	135723	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_022237	AGGAA	2	10	135964	135973	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022237	TGATA	2	10	138025	138034	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022237	GGGGC	2	10	138951	138960	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
22	NC_022237	TAAAA	2	10	149027	149036	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022237	AGATA	2	10	150493	150502	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022237	TAAAA	2	10	155288	155297	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022237	TTGAA	2	10	164575	164584	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022237	GAATA	2	10	165588	165597	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022237	TAAAA	2	10	183059	183068	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022237	AAGGA	2	10	190529	190538	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022237	AATAA	2	10	195383	195392	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022237	TGAGG	2	10	196226	196235	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022237	TTCCT	2	10	196400	196409	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
32	NC_022237	AGAGA	2	10	201221	201230	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022237	GTTTT	2	10	203472	203481	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022237	TGATA	2	10	212983	212992	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022237	TCTTT	2	10	220242	220251	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_022237	TATTC	2	10	229775	229784	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_022237	CTTTT	2	10	231109	231118	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_022237	AAAGA	2	10	239422	239431	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022237	ATCCT	2	10	246213	246222	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
40	NC_022237	CCCTG	2	10	252825	252834	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
41	NC_022237	ATTTT	2	10	263177	263186	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022237	AATGA	2	10	263246	263255	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022237	TATAA	2	10	265045	265054	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022237	ATTGA	2	10	266877	266886	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022237	AAAAT	2	10	281964	281973	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022237	GATAA	2	10	282305	282314	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022237	TCTAT	2	10	284988	284997	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_022237	ATAAA	2	10	293462	293471	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022237	ATAAA	2	10	307810	307819	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022237	TCGTG	2	10	311149	311158	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
51	NC_022237	GAAGT	2	10	311781	311790	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022237	GGGAG	2	10	312533	312542	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022237	AGGGA	2	10	314742	314751	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022237	ATTTG	2	10	316246	316255	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022237	ATGAA	2	10	316258	316267	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022237	TCTTT	2	10	316429	316438	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_022237	TGATA	2	10	316974	316983	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022237	TTATG	2	10	317013	317022	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022237	ATTGT	2	10	327670	327679	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022237	AGTAA	2	10	329078	329087	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022237	ATAAA	2	10	329757	329766	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022237	AAACA	2	10	341206	341215	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_022237	TAACA	2	10	341216	341225	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_022237	ATAAA	2	10	341390	341399	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022237	TTGAT	2	10	349363	349372	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022237	TATCC	2	10	364270	364279	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
67	NC_022237	CAGGG	2	10	365156	365165	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
68	NC_022237	TATTT	2	10	367094	367103	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022237	ACAAG	2	10	371924	371933	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_022237	TTTGT	2	10	397499	397508	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022237	AATAG	2	10	398132	398141	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022237	TAAGA	2	10	402987	402996	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022237	AAGTG	2	10	412523	412532	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022237	TTTTA	2	10	413640	413649	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022237	AATAA	2	10	418231	418240	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022237	TAGAG	2	10	419315	419324	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022237	TTTTA	2	10	426267	426276	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022237	AGGAA	2	10	427160	427169	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022237	TTGTT	2	10	447251	447260	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022237	CCTAT	2	10	447938	447947	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
81	NC_022237	CTATA	2	10	448543	448552	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_022237	TTTTG	2	10	450910	450919	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022237	ACTAA	2	10	469066	469075	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_022237	ATAAA	2	10	473530	473539	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022237	GTTTG	2	10	477096	477105	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022237	CTTGG	2	10	477118	477127	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
87	NC_022237	ATTTT	2	10	477252	477261	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022237	TGGTA	2	10	486261	486270	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022237	ATTTT	2	10	486422	486431	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022237	ATTAT	2	10	490754	490763	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_022237	AGTAT	2	10	507935	507944	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_022237	ATAGA	2	10	510003	510012	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_022237	AGGAG	2	10	525683	525692	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
94	NC_022237	GATAA	2	10	539068	539077	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022237	TGAGA	2	10	544642	544651	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022237	AGTAT	2	10	545588	545597	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_022237	TAAAA	2	10	549738	549747	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022237	CTTTT	2	10	555066	555075	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_022237	TTTAT	2	10	555111	555120	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022237	TTTTA	2	10	558540	558549	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022237	ATTAA	2	10	559812	559821	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022237	TCATT	2	10	560273	560282	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_022237	TGAAA	2	10	560327	560336	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022237	GAAAT	2	10	560637	560646	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_022237	ATTAG	2	10	566959	566968	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_022237	TAAAA	2	10	582213	582222	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022237	AAAAT	2	10	597456	597465	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022237	AGTTG	2	10	606150	606159	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022237	GTTCT	2	10	612651	612660	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
110	NC_022237	CAAGA	2	10	614186	614195	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
111	NC_022237	AAAAG	2	10	620928	620937	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_022237	GAAAG	2	10	634428	634437	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022237	TCTGC	2	10	647493	647502	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
114	NC_022237	TTCCT	2	10	657102	657111	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
115	NC_022237	AAAGG	2	10	658509	658518	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
116	NC_022237	AAGAA	2	10	667155	667164	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_022237	TTATC	2	10	675449	675458	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_022237	GATTT	2	10	676174	676183	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_022237	ATCAC	2	10	687276	687285	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
120	NC_022237	TGAAA	2	10	717165	717174	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022237	TAAAT	2	10	717466	717475	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_022237	ATAAC	2	10	719425	719434	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_022237	AAAGA	2	10	721414	721423	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_022237	TTATG	2	10	723762	723771	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022237	AAAAC	2	10	725465	725474	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_022237	AGCAC	2	10	725511	725520	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
127	NC_022237	AAGAA	2	10	732054	732063	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_022237	TGATA	2	10	741662	741671	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_022237	AAAGC	2	10	747805	747814	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
130	NC_022237	TGATA	2	10	763834	763843	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_022237	TGTTT	2	10	767680	767689	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_022237	TAAAG	2	10	775167	775176	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_022237	GCTTA	2	10	775652	775661	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
134	NC_022237	GGATT	2	10	775986	775995	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
135	NC_022237	GAATG	2	10	786627	786636	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
136	NC_022237	GCCAA	2	10	786682	786691	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
137	NC_022237	TTTGT	2	10	791185	791194	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_022237	ATTAT	2	10	793169	793178	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_022237	ACAAA	2	10	793384	793393	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_022237	TTAAT	2	10	795802	795811	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_022237	CTCAC	2	10	795838	795847	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
142	NC_022237	ACAAA	2	10	795943	795952	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_022237	TAGCA	2	10	800753	800762	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
144	NC_022237	ATAAA	2	10	807944	807953	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_022237	ACTAT	2	10	809609	809618	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_022237	TTCTC	2	10	812862	812871	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
147	NC_022237	GTATG	2	10	812926	812935	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
148	NC_022237	TCCCA	2	10	814827	814836	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
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289	NC_022237	AGTAC	2	10	1738290	1738299	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
290	NC_022237	AAACA	2	10	1749476	1749485	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
291	NC_022237	TACTA	2	10	1750466	1750475	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
292	NC_022237	TTTTA	2	10	1773459	1773468	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
293	NC_022237	TAAAA	2	10	1778070	1778079	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
294	NC_022237	ATTTT	2	10	1782097	1782106	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
295	NC_022237	AAGAA	2	10	1782310	1782319	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
296	NC_022237	GAATA	2	10	1782646	1782655	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
297	NC_022237	TCCCT	2	10	1784327	1784336	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
298	NC_022237	CTCCC	2	10	1786535	1786544	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
299	NC_022237	ACTTC	2	10	1787287	1787296	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
300	NC_022237	CACGA	2	10	1787918	1787927	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
301	NC_022237	CTTTA	3	15	1794095	1794109	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
302	NC_022237	TCCTT	2	10	1799349	1799358	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
303	NC_022237	TTTTA	2	10	1815662	1815671	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
304	NC_022237	TCATT	2	10	1820960	1820969	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
305	NC_022237	ATAGA	2	10	1830239	1830248	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
306	NC_022237	ATTTT	2	10	1838485	1838494	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
307	NC_022237	TTTTA	2	10	1849680	1849689	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
308	NC_022237	TAAAA	2	10	1861132	1861141	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
309	NC_022237	TTGAT	2	10	1865918	1865927	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
310	NC_022237	AATTA	2	10	1866140	1866149	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
311	NC_022237	ATTAG	2	10	1873836	1873845	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
312	NC_022237	ACTTT	2	10	1878361	1878370	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
313	NC_022237	AGCAA	2	10	1890183	1890192	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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319	NC_022237	ACTAT	2	10	1910407	1910416	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
320	NC_022237	AAAAC	2	10	1915578	1915587	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
321	NC_022237	CAGTA	2	10	1915911	1915920	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
322	NC_022237	CATTT	2	10	1919631	1919640	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
323	NC_022237	CATTA	2	10	1924676	1924685	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
324	NC_022237	GTGCT	2	10	1932245	1932254	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
325	NC_022237	GATAG	2	10	1934969	1934978	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
326	NC_022237	ATCTC	2	10	1935085	1935094	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
327	NC_022237	TAATT	2	10	1943184	1943193	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
328	NC_022237	TTTTA	2	10	1958298	1958307	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.