MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus constellatus subsp. pharyngis C232

Total Repeats: 124

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022236	ACTAAT	2	12	21387	21398	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_022236	GGTAAA	2	12	39242	39253	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022236	TCACTG	2	12	93688	93699	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_022236	TAGTGT	2	12	101081	101092	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022236	TTAAAA	2	12	122963	122974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022236	TTGAGA	2	12	146140	146151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022236	TATGAA	2	12	146937	146948	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022236	TATCTA	2	12	197604	197615	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_022236	AGTAAG	2	12	207745	207756	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022236	GAATGG	2	12	222604	222615	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022236	TATAAA	2	12	237064	237075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022236	GCAGGG	2	12	241905	241916	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_022236	GTTTCA	2	12	271239	271250	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_022236	ACTAAT	2	12	285057	285068	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_022236	TGAAAA	2	12	303846	303857	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022236	TTTATC	2	12	323625	323636	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_022236	AATTTG	2	12	324643	324654	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022236	ACCTAT	2	12	343277	343288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_022236	AAAAGC	2	12	344236	344247	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_022236	ATGAGA	2	12	345287	345298	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022236	CGAAAT	2	12	351527	351538	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_022236	TTTGTT	2	12	365666	365677	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022236	TTTTTA	2	12	379856	379867	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022236	TCAATA	2	12	399822	399833	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_022236	GTTTAG	2	12	406895	406906	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022236	ATTGCT	2	12	412583	412594	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_022236	ATGAGG	2	12	420721	420732	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022236	CTTGAA	2	12	428453	428464	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_022236	TCTTTC	2	12	431777	431788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_022236	TGAAAA	2	12	431879	431890	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022236	ATTTTT	2	12	459111	459122	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022236	TCTTAT	2	12	465109	465120	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_022236	ATGGTT	2	12	483419	483430	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022236	GTATAT	2	12	489636	489647	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022236	AGTCTT	2	12	495613	495624	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_022236	AAAGGG	2	12	504814	504825	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022236	TTTCTT	2	12	513267	513278	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_022236	GGGCAT	2	12	513288	513299	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_022236	AGAAAA	2	12	514355	514366	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022236	CTTTTC	2	12	529580	529591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_022236	TGAAAA	2	12	541462	541473	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022236	TATTCT	2	12	559367	559378	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_022236	TAAAAC	2	12	567906	567917	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_022236	AAGATA	2	12	606047	606058	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022236	TTTATA	2	12	621482	621493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022236	TTGGCT	2	12	667576	667587	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_022236	AATGCC	2	12	670828	670839	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_022236	TTAAGT	2	12	681773	681784	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022236	TTTTGA	2	12	708454	708465	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022236	AAAAAG	2	12	708491	708502	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022236	AGCTAT	2	12	730650	730661	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_022236	GTCGTG	2	12	745166	745177	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_022236	CCTTCT	2	12	759298	759309	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_022236	TGCTAT	2	12	774755	774766	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_022236	GAGAAG	2	12	791745	791756	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022236	TAAAAA	2	12	803339	803350	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022236	TAAAAA	2	12	824985	824996	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022236	TTTAAT	2	12	841347	841358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022236	AAATTA	2	12	850940	850951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022236	TTTATC	2	12	897114	897125	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_022236	CTTAAT	2	12	900361	900372	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_022236	TAAAAA	2	12	910851	910862	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022236	CCCGAA	2	12	912552	912563	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
64	NC_022236	TAAAAA	2	12	922999	923010	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022236	ACTAAG	2	12	923227	923238	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_022236	TCTCAA	2	12	943645	943656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_022236	TTCAAA	2	12	967033	967044	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_022236	ATTTTC	2	12	971043	971054	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_022236	AGTTCC	2	12	1003662	1003673	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_022236	TAGCAA	2	12	1023920	1023931	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_022236	ACTCGC	2	12	1063977	1063988	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
72	NC_022236	CTGCAT	2	12	1064565	1064576	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_022236	AAAAAG	2	12	1087913	1087924	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022236	CAAGAA	2	12	1117225	1117236	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_022236	AAAAGA	2	12	1145814	1145825	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022236	TATAAC	2	12	1157656	1157667	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_022236	CAATCA	2	12	1174781	1174792	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_022236	TCTTAT	2	12	1198894	1198905	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_022236	TCTTTT	2	12	1209944	1209955	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_022236	TTCAAC	2	12	1214773	1214784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_022236	TATCAT	2	12	1233083	1233094	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_022236	ACCTTT	2	12	1233794	1233805	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_022236	TAAAAA	2	12	1238816	1238827	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022236	ATATCT	2	12	1250948	1250959	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_022236	AAAGAA	2	12	1251011	1251022	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022236	TCGGAT	2	12	1251320	1251331	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_022236	ACTTTC	2	12	1251844	1251855	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_022236	TTTTAT	2	12	1274646	1274657	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022236	CATTAT	2	12	1295707	1295718	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_022236	CAAATT	2	12	1342595	1342606	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_022236	ACTTTT	2	12	1364510	1364521	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_022236	TTTTTA	2	12	1420373	1420384	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_022236	TTAACC	2	12	1441440	1441451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_022236	TATTAG	2	12	1522809	1522820	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022236	TCTAAA	2	12	1538795	1538806	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_022236	ATTTCA	2	12	1565376	1565387	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_022236	AAGCCA	2	12	1566590	1566601	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_022236	CAAAAC	2	12	1566998	1567009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_022236	CTTTTT	2	12	1570436	1570447	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_022236	AAATTT	2	12	1578244	1578255	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022236	CAAAAA	2	12	1597283	1597294	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_022236	ATTCAG	2	12	1613026	1613037	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_022236	CATCTA	2	12	1651258	1651269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_022236	AGAAAA	2	12	1651355	1651366	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_022236	AAAAAT	2	12	1707121	1707132	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_022236	TAAGAA	2	12	1721278	1721289	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022236	ATTTAT	2	12	1725590	1725601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022236	TAAAAA	2	12	1725750	1725761	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022236	TACTTT	2	12	1757510	1757521	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_022236	CCCGAA	2	12	1769280	1769291	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
111	NC_022236	TATTAG	2	12	1770454	1770465	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_022236	CTTCAA	2	12	1778820	1778831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_022236	CCAAGT	2	12	1781870	1781881	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_022236	TAATTT	2	12	1781937	1781948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022236	CATAGC	2	12	1796890	1796901	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_022236	TTGCTC	2	12	1807142	1807153	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_022236	TCAATC	2	12	1810631	1810642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_022236	CTTTTT	2	12	1811623	1811634	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_022236	TATCAT	2	12	1811843	1811854	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_022236	ACCTTT	2	12	1812554	1812565	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_022236	CTCTTC	2	12	1891251	1891262	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_022236	CTGCTT	2	12	1891343	1891354	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_022236	AAATAT	2	12	1893516	1893527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_022236	AATTTT	2	12	1897982	1897993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.