MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Variovorax paradoxus B4 chromosome 2

Total Repeats: 38

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022234	TCCTAC	2	12	46461	46472	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_022234	TTCACA	2	12	153743	153754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_022234	CGCCAG	2	12	159172	159183	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
4	NC_022234	GAAATG	2	12	161372	161383	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022234	ACGCGG	2	12	172457	172468	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_022234	CGGACC	2	12	175633	175644	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
7	NC_022234	CGAAGG	2	12	204823	204834	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_022234	GCCAAC	2	12	238948	238959	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
9	NC_022234	TCCTAC	2	12	244700	244711	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_022234	CGGCGC	2	12	311600	311611	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_022234	GCCAGC	2	12	362641	362652	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
12	NC_022234	CTCTGC	2	12	404347	404358	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
13	NC_022234	TTGCGC	2	12	412106	412117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_022234	ACTCCG	2	12	421683	421694	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
15	NC_022234	CAGAGG	2	12	489565	489576	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_022234	TGCGCT	2	12	494902	494913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_022234	AGGCCG	2	12	495476	495487	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_022234	GTGGCG	2	12	509852	509863	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_022234	TATCAT	2	12	556613	556624	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_022234	CAATGG	8	48	571159	571206	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_022234	TTTCCA	2	12	575092	575103	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_022234	CGCCGG	2	12	602358	602369	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_022234	TCCTAC	2	12	684902	684913	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_022234	CCTGGC	2	12	881238	881249	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
25	NC_022234	CCCGAT	2	12	966078	966089	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
26	NC_022234	ATGCGC	2	12	1054953	1054964	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_022234	GCTGCA	2	12	1061988	1061999	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_022234	GCACCT	2	12	1087311	1087322	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
29	NC_022234	GCTCGA	2	12	1088394	1088405	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_022234	AGGGCG	2	12	1150153	1150164	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_022234	TGGCGG	2	12	1154390	1154401	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_022234	CGCGCT	2	12	1198802	1198813	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
33	NC_022234	AGGCAA	2	12	1210909	1210920	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_022234	GGCGCA	2	12	1219652	1219663	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_022234	TTTCGG	2	12	1327353	1327364	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_022234	TTCGAG	2	12	1329482	1329493	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_022234	GCAAAT	3	18	1334523	1334540	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_022234	GCAGAT	7	42	1334541	1334582	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.