MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Variovorax paradoxus B4 chromosome 2

Total Repeats: 1116

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022234	ACGCC	2	10	1959	1968	20 %	0 %	20 %	60 %	538344197
2	NC_022234	GGTCC	2	10	2299	2308	0 %	20 %	40 %	40 %	538344197
3	NC_022234	AGCGC	2	10	2320	2329	20 %	0 %	40 %	40 %	538344197
4	NC_022234	CTGAA	2	10	3749	3758	40 %	20 %	20 %	20 %	538344198
5	NC_022234	AGGCG	2	10	3956	3965	20 %	0 %	60 %	20 %	538344199
6	NC_022234	CCAGC	2	10	4292	4301	20 %	0 %	20 %	60 %	538344199
7	NC_022234	GCGCC	2	10	5734	5743	0 %	0 %	40 %	60 %	538344201
8	NC_022234	CGCGG	2	10	5861	5870	0 %	0 %	60 %	40 %	538344201
9	NC_022234	CGCGC	2	10	6101	6110	0 %	0 %	40 %	60 %	538344201
10	NC_022234	GCCAG	2	10	6388	6397	20 %	0 %	40 %	40 %	538344201
11	NC_022234	ACGGC	2	10	6502	6511	20 %	0 %	40 %	40 %	538344201
12	NC_022234	GCGGT	2	10	6798	6807	0 %	20 %	60 %	20 %	538344201
13	NC_022234	CAGGG	2	10	7143	7152	20 %	0 %	60 %	20 %	538344201
14	NC_022234	CCGCG	2	10	10594	10603	0 %	0 %	40 %	60 %	538344203
15	NC_022234	GACCA	2	10	10838	10847	40 %	0 %	20 %	40 %	538344203
16	NC_022234	TGCGA	2	10	13789	13798	20 %	20 %	40 %	20 %	538344205
17	NC_022234	TCGCA	2	10	13828	13837	20 %	20 %	20 %	40 %	538344205
18	NC_022234	CGGCG	2	10	14061	14070	0 %	0 %	60 %	40 %	538344205
19	NC_022234	GCACT	2	10	14136	14145	20 %	20 %	20 %	40 %	538344205
20	NC_022234	GTGCG	2	10	14634	14643	0 %	20 %	60 %	20 %	538344206
21	NC_022234	CGCCT	2	10	14929	14938	0 %	20 %	20 %	60 %	538344206
22	NC_022234	CGTGC	2	10	15221	15230	0 %	20 %	40 %	40 %	538344207
23	NC_022234	GCCCG	2	10	15439	15448	0 %	0 %	40 %	60 %	538344207
24	NC_022234	TCGCC	2	10	15673	15682	0 %	20 %	20 %	60 %	538344208
25	NC_022234	CGATG	2	10	15977	15986	20 %	20 %	40 %	20 %	538344208
26	NC_022234	CTGCA	2	10	17944	17953	20 %	20 %	20 %	40 %	538344210
27	NC_022234	GCCGT	2	10	18303	18312	0 %	20 %	40 %	40 %	538344210
28	NC_022234	CAGCG	2	10	18530	18539	20 %	0 %	40 %	40 %	538344210
29	NC_022234	CGTGC	2	10	19365	19374	0 %	20 %	40 %	40 %	538344211
30	NC_022234	CGTCA	2	10	20974	20983	20 %	20 %	20 %	40 %	538344212
31	NC_022234	CATTG	2	10	22628	22637	20 %	40 %	20 %	20 %	538344213
32	NC_022234	CGTGC	2	10	23165	23174	0 %	20 %	40 %	40 %	538344214
33	NC_022234	GCCGG	2	10	24002	24011	0 %	0 %	60 %	40 %	538344215
34	NC_022234	CGTCC	2	10	26239	26248	0 %	20 %	20 %	60 %	538344217
35	NC_022234	CGGCG	2	10	26429	26438	0 %	0 %	60 %	40 %	538344217
36	NC_022234	TCGGA	2	10	26506	26515	20 %	20 %	40 %	20 %	538344217
37	NC_022234	CCCAT	2	10	26746	26755	20 %	20 %	0 %	60 %	538344217
38	NC_022234	GCAGG	2	10	27038	27047	20 %	0 %	60 %	20 %	538344217
39	NC_022234	CTGAA	2	10	27252	27261	40 %	20 %	20 %	20 %	538344218
40	NC_022234	CGGGT	2	10	27320	27329	0 %	20 %	60 %	20 %	538344218
41	NC_022234	CCTGG	2	10	30869	30878	0 %	20 %	40 %	40 %	538344221
42	NC_022234	CGGCT	2	10	33743	33752	0 %	20 %	40 %	40 %	538344224
43	NC_022234	GAAAA	2	10	36808	36817	80 %	0 %	20 %	0 %	538344226
44	NC_022234	TTCAG	2	10	40090	40099	20 %	40 %	20 %	20 %	538344230
45	NC_022234	GATCG	2	10	40838	40847	20 %	20 %	40 %	20 %	538344230
46	NC_022234	CCGGC	2	10	41059	41068	0 %	0 %	40 %	60 %	538344230
47	NC_022234	CAGCG	2	10	41645	41654	20 %	0 %	40 %	40 %	538344230
48	NC_022234	TGTCC	2	10	42776	42785	0 %	40 %	20 %	40 %	538344232
49	NC_022234	CTTGC	2	10	42787	42796	0 %	40 %	20 %	40 %	538344232
50	NC_022234	CGGCG	2	10	44450	44459	0 %	0 %	60 %	40 %	538344233
51	NC_022234	TGGTG	2	10	44465	44474	0 %	40 %	60 %	0 %	538344233
52	NC_022234	TGCGC	2	10	46555	46564	0 %	20 %	40 %	40 %	538344234
53	NC_022234	CTTGC	2	10	46853	46862	0 %	40 %	20 %	40 %	538344234
54	NC_022234	TGCGG	2	10	47622	47631	0 %	20 %	60 %	20 %	538344234
55	NC_022234	CAGCC	2	10	47697	47706	20 %	0 %	20 %	60 %	538344234
56	NC_022234	TGCGA	2	10	48634	48643	20 %	20 %	40 %	20 %	538344235
57	NC_022234	TGTCT	2	10	48863	48872	0 %	60 %	20 %	20 %	538344235
58	NC_022234	GCGCA	2	10	48998	49007	20 %	0 %	40 %	40 %	538344236
59	NC_022234	GCCGC	2	10	49273	49282	0 %	0 %	40 %	60 %	538344236
60	NC_022234	CGCGG	2	10	50839	50848	0 %	0 %	60 %	40 %	538344237
61	NC_022234	CGGCC	2	10	51920	51929	0 %	0 %	40 %	60 %	538344239
62	NC_022234	AGCGC	2	10	54880	54889	20 %	0 %	40 %	40 %	538344242
63	NC_022234	GCGCC	2	10	55091	55100	0 %	0 %	40 %	60 %	538344242
64	NC_022234	ACGGC	2	10	59231	59240	20 %	0 %	40 %	40 %	538344245
65	NC_022234	GGCCG	2	10	60278	60287	0 %	0 %	60 %	40 %	538344247
66	NC_022234	TCGCG	2	10	62844	62853	0 %	20 %	40 %	40 %	538344250
67	NC_022234	GCTGA	2	10	63198	63207	20 %	20 %	40 %	20 %	538344251
68	NC_022234	CGGCG	2	10	69510	69519	0 %	0 %	60 %	40 %	538344257
69	NC_022234	AGGCC	2	10	70162	70171	20 %	0 %	40 %	40 %	538344258
70	NC_022234	TGGTC	2	10	70252	70261	0 %	40 %	40 %	20 %	538344258
71	NC_022234	TGCCG	2	10	70435	70444	0 %	20 %	40 %	40 %	538344259
72	NC_022234	GCAGC	2	10	73618	73627	20 %	0 %	40 %	40 %	538344262
73	NC_022234	GCCGC	2	10	75312	75321	0 %	0 %	40 %	60 %	538344263
74	NC_022234	GCAAG	2	10	75583	75592	40 %	0 %	40 %	20 %	538344264
75	NC_022234	TGGCG	2	10	76517	76526	0 %	20 %	60 %	20 %	538344266
76	NC_022234	GATCA	2	10	77475	77484	40 %	20 %	20 %	20 %	538344267
77	NC_022234	CACAT	2	10	77719	77728	40 %	20 %	0 %	40 %	538344267
78	NC_022234	GCCGA	2	10	78094	78103	20 %	0 %	40 %	40 %	538344267
79	NC_022234	GCCTT	2	10	78382	78391	0 %	40 %	20 %	40 %	538344268
80	NC_022234	ATCGA	2	10	78916	78925	40 %	20 %	20 %	20 %	538344268
81	NC_022234	ATCTG	2	10	79621	79630	20 %	40 %	20 %	20 %	538344269
82	NC_022234	TCGAA	2	10	79954	79963	40 %	20 %	20 %	20 %	538344269
83	NC_022234	GTCAC	2	10	80618	80627	20 %	20 %	20 %	40 %	538344270
84	NC_022234	CTTCG	2	10	81153	81162	0 %	40 %	20 %	40 %	538344271
85	NC_022234	GCCAC	2	10	81843	81852	20 %	0 %	20 %	60 %	538344272
86	NC_022234	GCTTC	2	10	83839	83848	0 %	40 %	20 %	40 %	538344276
87	NC_022234	ATCAG	2	10	84440	84449	40 %	20 %	20 %	20 %	538344277
88	NC_022234	GCTCG	2	10	84809	84818	0 %	20 %	40 %	40 %	538344278
89	NC_022234	GCTTG	2	10	84909	84918	0 %	40 %	40 %	20 %	538344278
90	NC_022234	ACATC	2	10	86330	86339	40 %	20 %	0 %	40 %	538344280
91	NC_022234	GCAAT	2	10	86564	86573	40 %	20 %	20 %	20 %	538344280
92	NC_022234	CAGGG	2	10	87004	87013	20 %	0 %	60 %	20 %	538344280
93	NC_022234	TCGCA	2	10	91246	91255	20 %	20 %	20 %	40 %	538344285
94	NC_022234	ATGGC	2	10	91854	91863	20 %	20 %	40 %	20 %	538344286
95	NC_022234	CCGAC	2	10	93707	93716	20 %	0 %	20 %	60 %	538344288
96	NC_022234	AGCCA	2	10	94931	94940	40 %	0 %	20 %	40 %	538344289
97	NC_022234	TCATT	2	10	95600	95609	20 %	60 %	0 %	20 %	538344290
98	NC_022234	GGTGG	2	10	96106	96115	0 %	20 %	80 %	0 %	538344290
99	NC_022234	GAATG	2	10	96450	96459	40 %	20 %	40 %	0 %	538344291
100	NC_022234	GCCGC	2	10	97293	97302	0 %	0 %	40 %	60 %	538344292
101	NC_022234	GCGCC	2	10	99513	99522	0 %	0 %	40 %	60 %	538344293
102	NC_022234	CGGCG	2	10	100786	100795	0 %	0 %	60 %	40 %	538344294
103	NC_022234	GCTGC	2	10	101715	101724	0 %	20 %	40 %	40 %	538344295
104	NC_022234	GCACT	2	10	101749	101758	20 %	20 %	20 %	40 %	538344295
105	NC_022234	GCTGC	2	10	102034	102043	0 %	20 %	40 %	40 %	538344295
106	NC_022234	GCGCC	2	10	102316	102325	0 %	0 %	40 %	60 %	538344296
107	NC_022234	CGCAG	2	10	103230	103239	20 %	0 %	40 %	40 %	538344297
108	NC_022234	GCGCG	2	10	104501	104510	0 %	0 %	60 %	40 %	538344298
109	NC_022234	GCCGC	2	10	104800	104809	0 %	0 %	40 %	60 %	538344298
110	NC_022234	CCGGC	2	10	105942	105951	0 %	0 %	40 %	60 %	538344299
111	NC_022234	TGGCC	2	10	106490	106499	0 %	20 %	40 %	40 %	538344300
112	NC_022234	CGCAG	2	10	107480	107489	20 %	0 %	40 %	40 %	538344302
113	NC_022234	GCGCG	2	10	108638	108647	0 %	0 %	60 %	40 %	538344303
114	NC_022234	GCGCT	2	10	109212	109221	0 %	20 %	40 %	40 %	538344304
115	NC_022234	GCGCG	2	10	111429	111438	0 %	0 %	60 %	40 %	538344306
116	NC_022234	CGAAG	2	10	114237	114246	40 %	0 %	40 %	20 %	538344309
117	NC_022234	GGGGC	2	10	114707	114716	0 %	0 %	80 %	20 %	538344310
118	NC_022234	GCCGG	2	10	115489	115498	0 %	0 %	60 %	40 %	538344310
119	NC_022234	CTGAA	2	10	116346	116355	40 %	20 %	20 %	20 %	538344311
120	NC_022234	GCTGC	2	10	118767	118776	0 %	20 %	40 %	40 %	538344313
121	NC_022234	CGTCG	2	10	119511	119520	0 %	20 %	40 %	40 %	538344314
122	NC_022234	GCGCA	2	10	119731	119740	20 %	0 %	40 %	40 %	538344314
123	NC_022234	AGCCG	2	10	119999	120008	20 %	0 %	40 %	40 %	538344315
124	NC_022234	GCGTG	2	10	120343	120352	0 %	20 %	60 %	20 %	538344315
125	NC_022234	GCGTC	2	10	120704	120713	0 %	20 %	40 %	40 %	538344315
126	NC_022234	CGTGG	2	10	121038	121047	0 %	20 %	60 %	20 %	538344315
127	NC_022234	CCATG	2	10	123986	123995	20 %	20 %	20 %	40 %	538344318
128	NC_022234	GCCAT	2	10	125029	125038	20 %	20 %	20 %	40 %	538344320
129	NC_022234	GCCGT	2	10	127156	127165	0 %	20 %	40 %	40 %	538344322
130	NC_022234	GCGCT	2	10	133018	133027	0 %	20 %	40 %	40 %	538344329
131	NC_022234	CGGCC	2	10	135202	135211	0 %	0 %	40 %	60 %	538344331
132	NC_022234	GCGCC	2	10	136429	136438	0 %	0 %	40 %	60 %	538344332
133	NC_022234	GCGCG	2	10	137332	137341	0 %	0 %	60 %	40 %	538344332
134	NC_022234	ATCCA	2	10	137476	137485	40 %	20 %	0 %	40 %	538344333
135	NC_022234	CCGGC	2	10	137571	137580	0 %	0 %	40 %	60 %	538344333
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139	NC_022234	GCTCG	2	10	143321	143330	0 %	20 %	40 %	40 %	538344338
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263	NC_022234	CGAAG	2	10	291385	291394	40 %	0 %	40 %	20 %	538344475
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