MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Variovorax paradoxus B4 chromosome 2

Total Repeats: 3824

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022234	GCTG	2	8	103	110	0 %	25 %	50 %	25 %	538344195
2	NC_022234	CGGT	2	8	126	133	0 %	25 %	50 %	25 %	538344195
3	NC_022234	GATC	2	8	140	147	25 %	25 %	25 %	25 %	538344195
4	NC_022234	GGCC	2	8	1111	1118	0 %	0 %	50 %	50 %	538344196
5	NC_022234	CGAA	2	8	1839	1846	50 %	0 %	25 %	25 %	538344197
6	NC_022234	GCCG	2	8	2285	2292	0 %	0 %	50 %	50 %	538344197
7	NC_022234	CGCC	2	8	2519	2526	0 %	0 %	25 %	75 %	538344197
8	NC_022234	GATC	2	8	2762	2769	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_022234	AGGC	2	8	2811	2818	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_022234	TCGG	2	8	3075	3082	0 %	25 %	50 %	25 %	538344198
11	NC_022234	CGCT	2	8	3488	3495	0 %	25 %	25 %	50 %	538344198
12	NC_022234	AGGC	2	8	3861	3868	25 %	0 %	50 %	25 %	538344199
13	NC_022234	GCGA	2	8	4029	4036	25 %	0 %	50 %	25 %	538344199
14	NC_022234	CCAT	2	8	4037	4044	25 %	25 %	0 %	50 %	538344199
15	NC_022234	TGCG	2	8	4219	4226	0 %	25 %	50 %	25 %	538344199
16	NC_022234	AGAT	2	8	4230	4237	50 %	25 %	25 %	0 %	538344199
17	NC_022234	GCCG	2	8	4270	4277	0 %	0 %	50 %	50 %	538344199
18	NC_022234	AGAA	2	8	4357	4364	75 %	0 %	25 %	0 %	538344199
19	NC_022234	ACGG	2	8	4578	4585	25 %	0 %	50 %	25 %	538344200
20	NC_022234	GCGA	2	8	4952	4959	25 %	0 %	50 %	25 %	538344200
21	NC_022234	CGGG	2	8	5328	5335	0 %	0 %	75 %	25 %	538344200
22	NC_022234	CGGG	2	8	5449	5456	0 %	0 %	75 %	25 %	538344201
23	NC_022234	CGGC	2	8	6091	6098	0 %	0 %	50 %	50 %	538344201
24	NC_022234	CGGA	2	8	6269	6276	25 %	0 %	50 %	25 %	538344201
25	NC_022234	CCAG	2	8	6889	6896	25 %	0 %	25 %	50 %	538344201
26	NC_022234	GCGA	2	8	7230	7237	25 %	0 %	50 %	25 %	538344201
27	NC_022234	TGCA	2	8	7730	7737	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_022234	CCGC	2	8	7747	7754	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
29	NC_022234	TCGC	2	8	7763	7770	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_022234	GCCG	2	8	7959	7966	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_022234	CCGT	2	8	8622	8629	0 %	25 %	25 %	50 %	538344202
32	NC_022234	CCGC	2	8	9520	9527	0 %	0 %	25 %	75 %	538344203
33	NC_022234	CTGG	2	8	10018	10025	0 %	25 %	50 %	25 %	538344203
34	NC_022234	TGGA	2	8	10229	10236	25 %	25 %	50 %	0 %	538344203
35	NC_022234	ATGC	2	8	11537	11544	25 %	25 %	25 %	25 %	538344203
36	NC_022234	CGCC	2	8	12006	12013	0 %	0 %	25 %	75 %	538344203
37	NC_022234	TGGC	2	8	12053	12060	0 %	25 %	50 %	25 %	538344203
38	NC_022234	CGGA	2	8	12119	12126	25 %	0 %	50 %	25 %	538344203
39	NC_022234	TGCG	2	8	12775	12782	0 %	25 %	50 %	25 %	538344204
40	NC_022234	CGCA	2	8	12797	12804	25 %	0 %	25 %	50 %	538344204
41	NC_022234	GGCA	2	8	13437	13444	25 %	0 %	50 %	25 %	538344205
42	NC_022234	CATG	2	8	13859	13866	25 %	25 %	25 %	25 %	538344205
43	NC_022234	ATCC	2	8	14538	14545	25 %	25 %	0 %	50 %	538344206
44	NC_022234	GGTG	2	8	15166	15173	0 %	25 %	75 %	0 %	538344207
45	NC_022234	GGCG	2	8	15275	15282	0 %	0 %	75 %	25 %	538344207
46	NC_022234	CCGA	2	8	15726	15733	25 %	0 %	25 %	50 %	538344208
47	NC_022234	CGGC	2	8	16245	16252	0 %	0 %	50 %	50 %	538344208
48	NC_022234	GGGC	2	8	16593	16600	0 %	0 %	75 %	25 %	538344209
49	NC_022234	CGAG	2	8	16952	16959	25 %	0 %	50 %	25 %	538344209
50	NC_022234	GCGG	2	8	17526	17533	0 %	0 %	75 %	25 %	538344209
51	NC_022234	GGCA	2	8	17781	17788	25 %	0 %	50 %	25 %	538344209
52	NC_022234	CCTG	2	8	17967	17974	0 %	25 %	25 %	50 %	538344210
53	NC_022234	AGCC	2	8	18378	18385	25 %	0 %	25 %	50 %	538344210
54	NC_022234	CGAT	2	8	18597	18604	25 %	25 %	25 %	25 %	538344210
55	NC_022234	TCGA	2	8	18709	18716	25 %	25 %	25 %	25 %	538344211
56	NC_022234	GCCG	2	8	19293	19300	0 %	0 %	50 %	50 %	538344211
57	NC_022234	CGTC	2	8	19403	19410	0 %	25 %	25 %	50 %	538344211
58	NC_022234	TCCC	2	8	19628	19635	0 %	25 %	0 %	75 %	538344211
59	NC_022234	CGGC	2	8	19817	19824	0 %	0 %	50 %	50 %	538344211
60	NC_022234	CGGC	2	8	20640	20647	0 %	0 %	50 %	50 %	538344211
61	NC_022234	CGGT	2	8	21009	21016	0 %	25 %	50 %	25 %	538344212
62	NC_022234	CAGC	2	8	21054	21061	25 %	0 %	25 %	50 %	538344212
63	NC_022234	TTTG	2	8	21070	21077	0 %	75 %	25 %	0 %	538344212
64	NC_022234	TGAT	2	8	21179	21186	25 %	50 %	25 %	0 %	538344212
65	NC_022234	GTCG	2	8	21589	21596	0 %	25 %	50 %	25 %	538344212
66	NC_022234	AGCG	2	8	21691	21698	25 %	0 %	50 %	25 %	538344212
67	NC_022234	AAGA	2	8	21782	21789	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022234	GGCA	2	8	22385	22392	25 %	0 %	50 %	25 %	538344213
69	NC_022234	CGCA	2	8	22448	22455	25 %	0 %	25 %	50 %	538344213
70	NC_022234	GCGG	2	8	23752	23759	0 %	0 %	75 %	25 %	538344214
71	NC_022234	GCCG	2	8	24187	24194	0 %	0 %	50 %	50 %	538344215
72	NC_022234	CGGC	2	8	24640	24647	0 %	0 %	50 %	50 %	538344215
73	NC_022234	CTGC	2	8	24847	24854	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_022234	GAGC	2	8	25630	25637	25 %	0 %	50 %	25 %	538344216
75	NC_022234	GCCG	2	8	25678	25685	0 %	0 %	50 %	50 %	538344216
76	NC_022234	GGCG	2	8	25759	25766	0 %	0 %	75 %	25 %	538344216
77	NC_022234	CGGC	2	8	25807	25814	0 %	0 %	50 %	50 %	538344216
78	NC_022234	GGCG	2	8	26567	26574	0 %	0 %	75 %	25 %	538344217
79	NC_022234	GATC	2	8	27053	27060	25 %	25 %	25 %	25 %	538344217
80	NC_022234	TGGA	2	8	27596	27603	25 %	25 %	50 %	0 %	538344218
81	NC_022234	GTGG	2	8	28683	28690	0 %	25 %	75 %	0 %	538344219
82	NC_022234	TCGA	2	8	28942	28949	25 %	25 %	25 %	25 %	538344219
83	NC_022234	CGCC	2	8	28952	28959	0 %	0 %	25 %	75 %	538344219
84	NC_022234	CTCG	2	8	29022	29029	0 %	25 %	25 %	50 %	538344219
85	NC_022234	AAGC	2	8	29059	29066	50 %	0 %	25 %	25 %	538344219
86	NC_022234	ACGG	2	8	29662	29669	25 %	0 %	50 %	25 %	538344220
87	NC_022234	GCGG	2	8	30126	30133	0 %	0 %	75 %	25 %	538344220
88	NC_022234	CCGC	2	8	30266	30273	0 %	0 %	25 %	75 %	538344220
89	NC_022234	GCGT	2	8	31224	31231	0 %	25 %	50 %	25 %	538344221
90	NC_022234	ATCG	2	8	31753	31760	25 %	25 %	25 %	25 %	538344222
91	NC_022234	CAGG	2	8	31786	31793	25 %	0 %	50 %	25 %	538344222
92	NC_022234	CGGC	2	8	31947	31954	0 %	0 %	50 %	50 %	538344222
93	NC_022234	GGCA	2	8	32253	32260	25 %	0 %	50 %	25 %	538344223
94	NC_022234	CGCC	2	8	32760	32767	0 %	0 %	25 %	75 %	538344223
95	NC_022234	GATC	2	8	32801	32808	25 %	25 %	25 %	25 %	538344223
96	NC_022234	ACGA	2	8	32836	32843	50 %	0 %	25 %	25 %	538344223
97	NC_022234	CTGG	2	8	33164	33171	0 %	25 %	50 %	25 %	538344224
98	NC_022234	CGCA	2	8	33319	33326	25 %	0 %	25 %	50 %	538344224
99	NC_022234	GGGC	2	8	33408	33415	0 %	0 %	75 %	25 %	538344224
100	NC_022234	GAAG	2	8	34192	34199	50 %	0 %	50 %	0 %	538344224
101	NC_022234	CGGG	2	8	34288	34295	0 %	0 %	75 %	25 %	538344224
102	NC_022234	CGGC	3	12	34551	34562	0 %	0 %	50 %	50 %	538344225
103	NC_022234	GAAC	2	8	34654	34661	50 %	0 %	25 %	25 %	538344225
104	NC_022234	CAGC	2	8	35047	35054	25 %	0 %	25 %	50 %	538344225
105	NC_022234	ACGA	2	8	36536	36543	50 %	0 %	25 %	25 %	538344226
106	NC_022234	GAAA	2	8	36858	36865	75 %	0 %	25 %	0 %	538344226
107	NC_022234	GCAT	2	8	37520	37527	25 %	25 %	25 %	25 %	538344227
108	NC_022234	CGCT	2	8	37583	37590	0 %	25 %	25 %	50 %	538344227
109	NC_022234	CGAT	2	8	38797	38804	25 %	25 %	25 %	25 %	538344228
110	NC_022234	CGGG	2	8	38817	38824	0 %	0 %	75 %	25 %	538344228
111	NC_022234	AGGA	2	8	39344	39351	50 %	0 %	50 %	0 %	538344229
112	NC_022234	TCGG	2	8	40206	40213	0 %	25 %	50 %	25 %	538344230
113	NC_022234	TCCT	2	8	40310	40317	0 %	50 %	0 %	50 %	538344230
114	NC_022234	CCGG	2	8	40513	40520	0 %	0 %	50 %	50 %	538344230
115	NC_022234	GGGC	2	8	41077	41084	0 %	0 %	75 %	25 %	538344230
116	NC_022234	AGGT	2	8	41484	41491	25 %	25 %	50 %	0 %	538344230
117	NC_022234	ATCG	2	8	41513	41520	25 %	25 %	25 %	25 %	538344230
118	NC_022234	CGGC	2	8	42427	42434	0 %	0 %	50 %	50 %	538344231
119	NC_022234	CCGC	2	8	42915	42922	0 %	0 %	25 %	75 %	538344232
120	NC_022234	CGAT	2	8	43282	43289	25 %	25 %	25 %	25 %	538344232
121	NC_022234	GCGT	2	8	43472	43479	0 %	25 %	50 %	25 %	538344232
122	NC_022234	GCCC	2	8	44432	44439	0 %	0 %	25 %	75 %	538344233
123	NC_022234	TGAA	2	8	44545	44552	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_022234	CTGG	2	8	45581	45588	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
125	NC_022234	GCGG	2	8	46166	46173	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
126	NC_022234	GCCG	2	8	46823	46830	0 %	0 %	50 %	50 %	538344234
127	NC_022234	CGGC	2	8	46870	46877	0 %	0 %	50 %	50 %	538344234
128	NC_022234	GATG	2	8	47506	47513	25 %	25 %	50 %	0 %	538344234
129	NC_022234	GGTG	2	8	47524	47531	0 %	25 %	75 %	0 %	538344234
130	NC_022234	GGGT	2	8	47860	47867	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
131	NC_022234	GCCG	2	8	48090	48097	0 %	0 %	50 %	50 %	538344235
132	NC_022234	GGTC	2	8	48338	48345	0 %	25 %	50 %	25 %	538344235
133	NC_022234	GAGC	2	8	48378	48385	25 %	0 %	50 %	25 %	538344235
134	NC_022234	CGCC	2	8	48389	48396	0 %	0 %	25 %	75 %	538344235
135	NC_022234	CGTG	2	8	48572	48579	0 %	25 %	50 %	25 %	538344235
136	NC_022234	CGGC	2	8	48611	48618	0 %	0 %	50 %	50 %	538344235
137	NC_022234	GGAA	2	8	48828	48835	50 %	0 %	50 %	0 %	538344235
138	NC_022234	GGTT	3	12	48875	48886	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_022234	GCAG	2	8	49822	49829	25 %	0 %	50 %	25 %	538344237
140	NC_022234	GGGC	2	8	49898	49905	0 %	0 %	75 %	25 %	538344237
141	NC_022234	CGCT	2	8	50074	50081	0 %	25 %	25 %	50 %	538344237
142	NC_022234	CCAC	2	8	50945	50952	25 %	0 %	0 %	75 %	538344238
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