MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Variovorax paradoxus B4 chromosome 2

Total Repeats: 268

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022234	G	6	6	7008	7013	0 %	0 %	100 %	0 %	538344201
2	NC_022234	C	6	6	7135	7140	0 %	0 %	0 %	100 %	538344201
3	NC_022234	G	6	6	7929	7934	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022234	C	6	6	8793	8798	0 %	0 %	0 %	100 %	538344203
5	NC_022234	C	6	6	12977	12982	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6	NC_022234	T	6	6	14252	14257	0 %	100 %	0 %	0 %	538344206
7	NC_022234	G	6	6	21669	21674	0 %	0 %	100 %	0 %	538344212
8	NC_022234	C	6	6	22801	22806	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
9	NC_022234	T	7	7	26043	26049	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022234	T	9	9	27983	27991	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022234	G	6	6	33277	33282	0 %	0 %	100 %	0 %	538344224
12	NC_022234	A	6	6	42562	42567	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022234	C	6	6	43593	43598	0 %	0 %	0 %	100 %	538344232
14	NC_022234	A	6	6	47875	47880	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022234	G	6	6	49840	49845	0 %	0 %	100 %	0 %	538344237
16	NC_022234	C	6	6	67059	67064	0 %	0 %	0 %	100 %	538344255
17	NC_022234	G	6	6	70400	70405	0 %	0 %	100 %	0 %	538344259
18	NC_022234	T	6	6	72312	72317	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022234	G	6	6	76113	76118	0 %	0 %	100 %	0 %	538344265
20	NC_022234	A	6	6	85466	85471	100 %	0 %	0 %	0 %	538344279
21	NC_022234	G	6	6	90319	90324	0 %	0 %	100 %	0 %	538344284
22	NC_022234	G	6	6	92083	92088	0 %	0 %	100 %	0 %	538344286
23	NC_022234	T	6	6	92456	92461	0 %	100 %	0 %	0 %	538344287
24	NC_022234	C	7	7	98483	98489	0 %	0 %	0 %	100 %	538344292
25	NC_022234	T	6	6	98801	98806	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022234	C	6	6	115890	115895	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
27	NC_022234	A	6	6	129056	129061	100 %	0 %	0 %	0 %	538344324
28	NC_022234	C	6	6	130853	130858	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
29	NC_022234	G	7	7	134564	134570	0 %	0 %	100 %	0 %	538344330
30	NC_022234	G	6	6	135937	135942	0 %	0 %	100 %	0 %	538344331
31	NC_022234	A	7	7	144596	144602	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022234	G	8	8	151748	151755	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022234	G	8	8	158049	158056	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022234	C	6	6	158195	158200	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
35	NC_022234	T	7	7	163096	163102	0 %	100 %	0 %	0 %	538344360
36	NC_022234	T	6	6	164438	164443	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022234	A	6	6	173396	173401	100 %	0 %	0 %	0 %	538344370
38	NC_022234	C	6	6	178159	178164	0 %	0 %	0 %	100 %	538344375
39	NC_022234	T	7	7	182179	182185	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022234	C	6	6	200809	200814	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
41	NC_022234	T	7	7	202204	202210	0 %	100 %	0 %	0 %	538344398
42	NC_022234	T	6	6	202739	202744	0 %	100 %	0 %	0 %	538344398
43	NC_022234	T	7	7	203166	203172	0 %	100 %	0 %	0 %	538344399
44	NC_022234	T	6	6	205216	205221	0 %	100 %	0 %	0 %	538344401
45	NC_022234	G	6	6	209640	209645	0 %	0 %	100 %	0 %	538344403
46	NC_022234	T	6	6	210215	210220	0 %	100 %	0 %	0 %	538344403
47	NC_022234	G	6	6	210738	210743	0 %	0 %	100 %	0 %	538344403
48	NC_022234	G	6	6	212810	212815	0 %	0 %	100 %	0 %	538344406
49	NC_022234	A	6	6	220645	220650	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022234	G	6	6	239760	239765	0 %	0 %	100 %	0 %	538344427
51	NC_022234	T	9	9	252191	252199	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022234	C	7	7	254710	254716	0 %	0 %	0 %	100 %	538344440
53	NC_022234	G	7	7	262244	262250	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022234	G	6	6	287435	287440	0 %	0 %	100 %	0 %	538344470
55	NC_022234	G	6	6	288857	288862	0 %	0 %	100 %	0 %	538344472
56	NC_022234	C	6	6	289522	289527	0 %	0 %	0 %	100 %	538344472
57	NC_022234	G	6	6	292024	292029	0 %	0 %	100 %	0 %	538344475
58	NC_022234	A	6	6	295856	295861	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022234	C	6	6	297690	297695	0 %	0 %	0 %	100 %	538344482
60	NC_022234	G	6	6	311565	311570	0 %	0 %	100 %	0 %	538344495
61	NC_022234	C	7	7	317111	317117	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
62	NC_022234	A	6	6	320848	320853	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022234	A	6	6	320902	320907	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022234	A	7	7	320924	320930	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022234	A	6	6	326270	326275	100 %	0 %	0 %	0 %	538344510
66	NC_022234	G	6	6	326316	326321	0 %	0 %	100 %	0 %	538344510
67	NC_022234	A	6	6	331332	331337	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022234	G	8	8	334803	334810	0 %	0 %	100 %	0 %	538344519
69	NC_022234	G	6	6	346752	346757	0 %	0 %	100 %	0 %	538344533
70	NC_022234	G	6	6	351205	351210	0 %	0 %	100 %	0 %	538344538
71	NC_022234	G	6	6	354725	354730	0 %	0 %	100 %	0 %	538344542
72	NC_022234	G	9	9	354771	354779	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022234	G	6	6	362265	362270	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022234	T	8	8	363444	363451	0 %	100 %	0 %	0 %	538344551
75	NC_022234	C	6	6	380406	380411	0 %	0 %	0 %	100 %	538344568
76	NC_022234	A	7	7	402060	402066	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022234	C	6	6	403043	403048	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
78	NC_022234	G	6	6	405548	405553	0 %	0 %	100 %	0 %	538344592
79	NC_022234	G	6	6	409693	409698	0 %	0 %	100 %	0 %	538344596
80	NC_022234	C	6	6	415050	415055	0 %	0 %	0 %	100 %	538344601
81	NC_022234	G	6	6	415556	415561	0 %	0 %	100 %	0 %	538344601
82	NC_022234	C	6	6	417955	417960	0 %	0 %	0 %	100 %	538344605
83	NC_022234	C	6	6	421582	421587	0 %	0 %	0 %	100 %	538344608
84	NC_022234	T	6	6	423820	423825	0 %	100 %	0 %	0 %	538344610
85	NC_022234	G	6	6	424319	424324	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022234	G	6	6	426519	426524	0 %	0 %	100 %	0 %	538344613
87	NC_022234	T	6	6	443865	443870	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022234	G	6	6	454694	454699	0 %	0 %	100 %	0 %	538344643
89	NC_022234	A	7	7	468662	468668	100 %	0 %	0 %	0 %	538344654
90	NC_022234	G	6	6	474593	474598	0 %	0 %	100 %	0 %	538344659
91	NC_022234	G	6	6	489452	489457	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
92	NC_022234	T	6	6	507665	507670	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_022234	C	6	6	516725	516730	0 %	0 %	0 %	100 %	538344698
94	NC_022234	T	7	7	517865	517871	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022234	G	6	6	523885	523890	0 %	0 %	100 %	0 %	538344703
96	NC_022234	C	6	6	525140	525145	0 %	0 %	0 %	100 %	538344704
97	NC_022234	G	6	6	527296	527301	0 %	0 %	100 %	0 %	538344705
98	NC_022234	C	6	6	527735	527740	0 %	0 %	0 %	100 %	538344706
99	NC_022234	A	6	6	528674	528679	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022234	A	7	7	538134	538140	100 %	0 %	0 %	0 %	538344717
101	NC_022234	G	6	6	540026	540031	0 %	0 %	100 %	0 %	538344721
102	NC_022234	G	6	6	544335	544340	0 %	0 %	100 %	0 %	538344725
103	NC_022234	A	6	6	544366	544371	100 %	0 %	0 %	0 %	538344725
104	NC_022234	G	6	6	547745	547750	0 %	0 %	100 %	0 %	538344727
105	NC_022234	C	6	6	547853	547858	0 %	0 %	0 %	100 %	538344727
106	NC_022234	C	6	6	550414	550419	0 %	0 %	0 %	100 %	538344730
107	NC_022234	C	6	6	551214	551219	0 %	0 %	0 %	100 %	538344730
108	NC_022234	G	6	6	552417	552422	0 %	0 %	100 %	0 %	538344731
109	NC_022234	C	6	6	555389	555394	0 %	0 %	0 %	100 %	538344734
110	NC_022234	C	6	6	568078	568083	0 %	0 %	0 %	100 %	538344745
111	NC_022234	C	7	7	569172	569178	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
112	NC_022234	A	6	6	569672	569677	100 %	0 %	0 %	0 %	538344746
113	NC_022234	T	6	6	584710	584715	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022234	A	7	7	584786	584792	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022234	A	8	8	586918	586925	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_022234	C	6	6	593292	593297	0 %	0 %	0 %	100 %	538344768
117	NC_022234	C	6	6	595293	595298	0 %	0 %	0 %	100 %	538344769
118	NC_022234	G	6	6	600509	600514	0 %	0 %	100 %	0 %	538344774
119	NC_022234	A	6	6	602725	602730	100 %	0 %	0 %	0 %	538344776
120	NC_022234	T	6	6	609204	609209	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022234	G	6	6	652915	652920	0 %	0 %	100 %	0 %	538344814
122	NC_022234	T	8	8	664930	664937	0 %	100 %	0 %	0 %	538344832
123	NC_022234	G	7	7	665384	665390	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
124	NC_022234	G	6	6	665501	665506	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022234	T	7	7	666468	666474	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_022234	G	6	6	669609	669614	0 %	0 %	100 %	0 %	538344838
127	NC_022234	C	6	6	670289	670294	0 %	0 %	0 %	100 %	538344838
128	NC_022234	C	6	6	676593	676598	0 %	0 %	0 %	100 %	538344843
129	NC_022234	A	6	6	681985	681990	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_022234	C	6	6	688604	688609	0 %	0 %	0 %	100 %	538344855
131	NC_022234	G	7	7	698171	698177	0 %	0 %	100 %	0 %	538344865
132	NC_022234	C	6	6	705244	705249	0 %	0 %	0 %	100 %	538344871
133	NC_022234	G	6	6	726523	726528	0 %	0 %	100 %	0 %	538344890
134	NC_022234	A	6	6	728507	728512	100 %	0 %	0 %	0 %	538344892
135	NC_022234	C	6	6	732154	732159	0 %	0 %	0 %	100 %	538344894
136	NC_022234	G	6	6	732969	732974	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
137	NC_022234	G	6	6	735146	735151	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
138	NC_022234	A	8	8	738259	738266	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_022234	A	6	6	741726	741731	100 %	0 %	0 %	0 %	538344904
140	NC_022234	C	7	7	745479	745485	0 %	0 %	0 %	100 %	538344907
141	NC_022234	G	6	6	750178	750183	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
142	NC_022234	T	6	6	750516	750521	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_022234	C	7	7	762533	762539	0 %	0 %	0 %	100 %	538344925
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.