MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus CN1

Total Repeats: 2471

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022226	CAAAT	2	10	1445	1454	60 %	20 %	0 %	20 %	537459745
2	NC_022226	AATTT	2	10	2493	2502	40 %	60 %	0 %	0 %	537459746
3	NC_022226	CAATT	2	10	2559	2568	40 %	40 %	0 %	20 %	537459746
4	NC_022226	AAATT	2	10	2937	2946	60 %	40 %	0 %	0 %	537459746
5	NC_022226	CAAAT	2	10	5230	5239	60 %	20 %	0 %	20 %	537459749
6	NC_022226	TGAAT	2	10	6740	6749	40 %	40 %	20 %	0 %	537459749
7	NC_022226	TGAAC	2	10	6981	6990	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_022226	TTCAA	2	10	7727	7736	40 %	40 %	0 %	20 %	537459750
9	NC_022226	ACACG	2	10	10153	10162	40 %	0 %	20 %	40 %	537459751
10	NC_022226	ATCGC	2	10	10198	10207	20 %	20 %	20 %	40 %	537459751
11	NC_022226	CGTTG	2	10	11741	11750	0 %	40 %	40 %	20 %	537459752
12	NC_022226	GTAGG	2	10	14414	14423	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022226	TTATT	2	10	15457	15466	20 %	80 %	0 %	0 %	537459755
14	NC_022226	GCAAG	2	10	16629	16638	40 %	0 %	40 %	20 %	537459756
15	NC_022226	TTTGA	2	10	16788	16797	20 %	60 %	20 %	0 %	537459756
16	NC_022226	AGTTA	2	10	22103	22112	40 %	40 %	20 %	0 %	537459760
17	NC_022226	ATGTA	2	10	23662	23671	40 %	40 %	20 %	0 %	537459761
18	NC_022226	TCGAT	2	10	23826	23835	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_022226	ATATT	2	10	24363	24372	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022226	ACCAA	2	10	26272	26281	60 %	0 %	0 %	40 %	537459763
21	NC_022226	ATCAA	2	10	26984	26993	60 %	20 %	0 %	20 %	537459763
22	NC_022226	GAAAC	2	10	27605	27614	60 %	0 %	20 %	20 %	537459764
23	NC_022226	GAAGT	2	10	27755	27764	40 %	20 %	40 %	0 %	537459764
24	NC_022226	ATTAT	2	10	29398	29407	40 %	60 %	0 %	0 %	537459765
25	NC_022226	AAACG	2	10	31318	31327	60 %	0 %	20 %	20 %	537459767
26	NC_022226	AAGGT	2	10	32490	32499	40 %	20 %	40 %	0 %	537459767
27	NC_022226	TATGA	2	10	32687	32696	40 %	40 %	20 %	0 %	537459767
28	NC_022226	GTTGT	2	10	33080	33089	0 %	60 %	40 %	0 %	537459767
29	NC_022226	CATTA	2	10	33917	33926	40 %	40 %	0 %	20 %	537459768
30	NC_022226	TTTCA	2	10	34320	34329	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_022226	AAATG	2	10	35561	35570	60 %	20 %	20 %	0 %	537459769
32	NC_022226	ATTTT	2	10	35642	35651	20 %	80 %	0 %	0 %	537459769
33	NC_022226	TAAAA	2	10	35773	35782	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022226	AGATA	2	10	35931	35940	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022226	TTCTT	2	10	37424	37433	0 %	80 %	0 %	20 %	537459773
36	NC_022226	TTTTC	2	10	38094	38103	0 %	80 %	0 %	20 %	537459773
37	NC_022226	TTGTC	2	10	38130	38139	0 %	60 %	20 %	20 %	537459773
38	NC_022226	TAAAA	2	10	38340	38349	80 %	20 %	0 %	0 %	537459774
39	NC_022226	CAAAC	2	10	38956	38965	60 %	0 %	0 %	40 %	537459775
40	NC_022226	AAGTA	2	10	39767	39776	60 %	20 %	20 %	0 %	537459775
41	NC_022226	TGACA	2	10	41415	41424	40 %	20 %	20 %	20 %	537459779
42	NC_022226	AAATT	2	10	44532	44541	60 %	40 %	0 %	0 %	537459783
43	NC_022226	AAATG	2	10	46400	46409	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022226	TAAGC	2	10	47290	47299	40 %	20 %	20 %	20 %	537459786
45	NC_022226	TTGAA	2	10	48121	48130	40 %	40 %	20 %	0 %	537459787
46	NC_022226	TTGAA	2	10	48467	48476	40 %	40 %	20 %	0 %	537459787
47	NC_022226	TTTGT	2	10	49371	49380	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022226	TTTGA	2	10	52721	52730	20 %	60 %	20 %	0 %	537459791
49	NC_022226	GTTTT	2	10	52804	52813	0 %	80 %	20 %	0 %	537459791
50	NC_022226	GTTTG	2	10	53434	53443	0 %	60 %	40 %	0 %	537459792
51	NC_022226	TTGCT	2	10	53762	53771	0 %	60 %	20 %	20 %	537459792
52	NC_022226	TATAT	2	10	57788	57797	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022226	ATTAT	2	10	57900	57909	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022226	TTATA	2	10	58070	58079	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022226	AATCA	2	10	58890	58899	60 %	20 %	0 %	20 %	537459797
56	NC_022226	GATTT	2	10	61003	61012	20 %	60 %	20 %	0 %	537459799
57	NC_022226	GAAGA	2	10	61099	61108	60 %	0 %	40 %	0 %	537459799
58	NC_022226	GGGAA	2	10	61416	61425	40 %	0 %	60 %	0 %	537459800
59	NC_022226	AAGAT	2	10	61638	61647	60 %	20 %	20 %	0 %	537459800
60	NC_022226	ATAAA	2	10	61863	61872	80 %	20 %	0 %	0 %	537459800
61	NC_022226	ATTGA	2	10	62460	62469	40 %	40 %	20 %	0 %	537459802
62	NC_022226	GAAAT	2	10	62500	62509	60 %	20 %	20 %	0 %	537459802
63	NC_022226	TTTGC	2	10	65304	65313	0 %	60 %	20 %	20 %	537459806
64	NC_022226	TATAT	2	10	65488	65497	40 %	60 %	0 %	0 %	537459806
65	NC_022226	GTAAA	2	10	66001	66010	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022226	GTTCT	2	10	66707	66716	0 %	60 %	20 %	20 %	537459807
67	NC_022226	TGATG	2	10	66880	66889	20 %	40 %	40 %	0 %	537459807
68	NC_022226	CAATT	2	10	67183	67192	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_022226	ATTTA	2	10	67808	67817	40 %	60 %	0 %	0 %	537459808
70	NC_022226	TATCA	2	10	68259	68268	40 %	40 %	0 %	20 %	537459810
71	NC_022226	TTACC	2	10	69862	69871	20 %	40 %	0 %	40 %	537459812
72	NC_022226	TACTA	2	10	71151	71160	40 %	40 %	0 %	20 %	537459813
73	NC_022226	TTTAC	2	10	71559	71568	20 %	60 %	0 %	20 %	537459814
74	NC_022226	GATAT	2	10	72270	72279	40 %	40 %	20 %	0 %	537459815
75	NC_022226	GATAT	2	10	73092	73101	40 %	40 %	20 %	0 %	537459816
76	NC_022226	ATATA	2	10	73914	73923	60 %	40 %	0 %	0 %	537459818
77	NC_022226	ATTGC	2	10	74854	74863	20 %	40 %	20 %	20 %	537459819
78	NC_022226	CATGG	2	10	76258	76267	20 %	20 %	40 %	20 %	537459819
79	NC_022226	TGAAA	2	10	76926	76935	60 %	20 %	20 %	0 %	537459820
80	NC_022226	TCAAT	2	10	77298	77307	40 %	40 %	0 %	20 %	537459820
81	NC_022226	GTATT	2	10	77787	77796	20 %	60 %	20 %	0 %	537459821
82	NC_022226	AGATA	2	10	84264	84273	60 %	20 %	20 %	0 %	537459825
83	NC_022226	TAAAA	2	10	84824	84833	80 %	20 %	0 %	0 %	537459825
84	NC_022226	AAAGA	2	10	86457	86466	80 %	0 %	20 %	0 %	537459826
85	NC_022226	GTAAT	2	10	86676	86685	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022226	CAATT	2	10	87108	87117	40 %	40 %	0 %	20 %	537459827
87	NC_022226	ATGTT	2	10	87942	87951	20 %	60 %	20 %	0 %	537459828
88	NC_022226	TTGCG	2	10	88513	88522	0 %	40 %	40 %	20 %	537459828
89	NC_022226	AGTTA	2	10	90049	90058	40 %	40 %	20 %	0 %	537459829
90	NC_022226	AGATG	2	10	93422	93431	40 %	20 %	40 %	0 %	537459831
91	NC_022226	GGTGA	2	10	94018	94027	20 %	20 %	60 %	0 %	537459832
92	NC_022226	GAAAA	2	10	97455	97464	80 %	0 %	20 %	0 %	537459835
93	NC_022226	TTATT	2	10	97622	97631	20 %	80 %	0 %	0 %	537459835
94	NC_022226	AATCA	2	10	100644	100653	60 %	20 %	0 %	20 %	537459837
95	NC_022226	ATTTT	2	10	101342	101351	20 %	80 %	0 %	0 %	537459838
96	NC_022226	ATCAA	2	10	101369	101378	60 %	20 %	0 %	20 %	537459838
97	NC_022226	ATCAC	2	10	102602	102611	40 %	20 %	0 %	40 %	537459839
98	NC_022226	AACGA	2	10	103279	103288	60 %	0 %	20 %	20 %	537459839
99	NC_022226	ACACA	2	10	105335	105344	60 %	0 %	0 %	40 %	537459841
100	NC_022226	GACAA	2	10	106486	106495	60 %	0 %	20 %	20 %	537459842
101	NC_022226	ATTAC	2	10	109126	109135	40 %	40 %	0 %	20 %	537459845
102	NC_022226	ATTTT	2	10	109430	109439	20 %	80 %	0 %	0 %	537459847
103	NC_022226	TATCT	2	10	109786	109795	20 %	60 %	0 %	20 %	537459848
104	NC_022226	ATACG	2	10	112219	112228	40 %	20 %	20 %	20 %	537459850
105	NC_022226	TTATA	2	10	112877	112886	40 %	60 %	0 %	0 %	537459851
106	NC_022226	TTTTA	2	10	113675	113684	20 %	80 %	0 %	0 %	537459851
107	NC_022226	GTATT	2	10	114188	114197	20 %	60 %	20 %	0 %	537459852
108	NC_022226	AATAA	2	10	114781	114790	80 %	20 %	0 %	0 %	537459852
109	NC_022226	TACGC	2	10	115048	115057	20 %	20 %	20 %	40 %	537459852
110	NC_022226	GACAA	2	10	116390	116399	60 %	0 %	20 %	20 %	537459854
111	NC_022226	TCCCT	2	10	117855	117864	0 %	40 %	0 %	60 %	537459855
112	NC_022226	GCTTT	2	10	120089	120098	0 %	60 %	20 %	20 %	537459857
113	NC_022226	TAATT	2	10	120174	120183	40 %	60 %	0 %	0 %	537459857
114	NC_022226	ATACT	2	10	121355	121364	40 %	40 %	0 %	20 %	537459859
115	NC_022226	TAATA	2	10	122521	122530	60 %	40 %	0 %	0 %	537459860
116	NC_022226	ATTTT	2	10	123512	123521	20 %	80 %	0 %	0 %	537459861
117	NC_022226	TTGTA	2	10	125736	125745	20 %	60 %	20 %	0 %	537459863
118	NC_022226	TGCAA	2	10	126741	126750	40 %	20 %	20 %	20 %	537459864
119	NC_022226	ATATG	2	10	128759	128768	40 %	40 %	20 %	0 %	537459865
120	NC_022226	AATAT	2	10	129621	129630	60 %	40 %	0 %	0 %	537459866
121	NC_022226	ATTTT	2	10	131115	131124	20 %	80 %	0 %	0 %	537459869
122	NC_022226	GATTT	2	10	131169	131178	20 %	60 %	20 %	0 %	537459869
123	NC_022226	TTCAA	2	10	136121	136130	40 %	40 %	0 %	20 %	537459873
124	NC_022226	ACATC	2	10	136964	136973	40 %	20 %	0 %	40 %	537459875
125	NC_022226	TAATT	2	10	139187	139196	40 %	60 %	0 %	0 %	537459876
126	NC_022226	AGAGA	2	10	142213	142222	60 %	0 %	40 %	0 %	537459879
127	NC_022226	AATCC	2	10	142569	142578	40 %	20 %	0 %	40 %	537459879
128	NC_022226	TGAAT	2	10	151325	151334	40 %	40 %	20 %	0 %	537459888
129	NC_022226	TGATT	2	10	152456	152465	20 %	60 %	20 %	0 %	537459890
130	NC_022226	CAAAA	2	10	152709	152718	80 %	0 %	0 %	20 %	537459890
131	NC_022226	CAAAA	2	10	154820	154829	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_022226	TAAAG	2	10	155169	155178	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_022226	TTCAT	2	10	155563	155572	20 %	60 %	0 %	20 %	537459892
134	NC_022226	TTTAC	2	10	155946	155955	20 %	60 %	0 %	20 %	537459892
135	NC_022226	TTATT	2	10	157101	157110	20 %	80 %	0 %	0 %	537459895
136	NC_022226	GGATT	2	10	158089	158098	20 %	40 %	40 %	0 %	537459896
137	NC_022226	TAACT	2	10	161126	161135	40 %	40 %	0 %	20 %	537459899
138	NC_022226	TTTAT	2	10	164035	164044	20 %	80 %	0 %	0 %	537459902
139	NC_022226	TATCA	2	10	165139	165148	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_022226	ATGCA	2	10	165638	165647	40 %	20 %	20 %	20 %	537459903
141	NC_022226	TATGA	2	10	172884	172893	40 %	40 %	20 %	0 %	537459904
142	NC_022226	GTGAA	2	10	172918	172927	40 %	20 %	40 %	0 %	537459904
143	NC_022226	ATCAT	2	10	173271	173280	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_022226	TTAAT	2	10	173361	173370	40 %	60 %	0 %	0 %	537459905
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151	NC_022226	TTGTT	2	10	184552	184561	0 %	80 %	20 %	0 %	537459913
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161	NC_022226	TGATT	2	10	190246	190255	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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172	NC_022226	TTATT	2	10	198812	198821	20 %	80 %	0 %	0 %	537459924
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197	NC_022226	CAAGC	2	10	229754	229763	40 %	0 %	20 %	40 %	537459948
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242	NC_022226	TGGCA	2	10	278633	278642	20 %	20 %	40 %	20 %	537459993
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252	NC_022226	CTTTG	2	10	292617	292626	0 %	60 %	20 %	20 %	537460008
253	NC_022226	ATTTA	2	10	293141	293150	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
254	NC_022226	GCAAT	2	10	294087	294096	40 %	20 %	20 %	20 %	537460010
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266	NC_022226	CATGA	2	10	304998	305007	40 %	20 %	20 %	20 %	537460019
267	NC_022226	TGGTA	2	10	305657	305666	20 %	40 %	40 %	0 %	537460019
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269	NC_022226	ATGAA	2	10	306322	306331	60 %	20 %	20 %	0 %	537460019
270	NC_022226	TGAAT	2	10	307014	307023	40 %	40 %	20 %	0 %	537460020
271	NC_022226	TTATT	2	10	309125	309134	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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