MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Listonella anguillarum M3 plasmid

Total Repeats: 51

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022225	GCCAG	2	10	418	427	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
2	NC_022225	ATCCT	2	10	447	456	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
3	NC_022225	TGAGG	2	10	6080	6089	20 %	20 %	60 %	0 %	537457726
4	NC_022225	AAACA	2	10	7621	7630	80 %	0 %	0 %	20 %	537457727
5	NC_022225	CAGTA	2	10	11208	11217	40 %	20 %	20 %	20 %	537457730
6	NC_022225	TGCAT	2	10	11926	11935	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_022225	AACTT	2	10	13450	13459	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_022225	GCGCT	2	10	17205	17214	0 %	20 %	40 %	40 %	537457748
9	NC_022225	ATTTT	2	10	19139	19148	20 %	80 %	0 %	0 %	537457748
10	NC_022225	CCAGC	2	10	19839	19848	20 %	0 %	20 %	60 %	537457732
11	NC_022225	TCAGT	2	10	20047	20056	20 %	40 %	20 %	20 %	537457732
12	NC_022225	AAACA	2	10	22149	22158	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_022225	GTTAA	2	10	24330	24339	40 %	40 %	20 %	0 %	537457751
14	NC_022225	TCTTA	2	10	25772	25781	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_022225	GATCA	2	10	26784	26793	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_022225	TTTGC	2	10	27551	27560	0 %	60 %	20 %	20 %	537457752
17	NC_022225	GCTCT	2	10	28410	28419	0 %	40 %	20 %	40 %	537457753
18	NC_022225	CATCA	2	10	30082	30091	40 %	20 %	0 %	40 %	537457754
19	NC_022225	GCCAA	2	10	30403	30412	40 %	0 %	20 %	40 %	537457755
20	NC_022225	ATGTT	2	10	30652	30661	20 %	60 %	20 %	0 %	537457755
21	NC_022225	CGTCC	2	10	31103	31112	0 %	20 %	20 %	60 %	537457755
22	NC_022225	TGGAA	2	10	31662	31671	40 %	20 %	40 %	0 %	537457755
23	NC_022225	TACGG	2	10	32004	32013	20 %	20 %	40 %	20 %	537457755
24	NC_022225	TGGAA	2	10	32140	32149	40 %	20 %	40 %	0 %	537457755
25	NC_022225	AATAA	2	10	33822	33831	80 %	20 %	0 %	0 %	537457756
26	NC_022225	TCTTT	2	10	34208	34217	0 %	80 %	0 %	20 %	537457756
27	NC_022225	TGGAT	2	10	34668	34677	20 %	40 %	40 %	0 %	537457756
28	NC_022225	GAAAA	2	10	35367	35376	80 %	0 %	20 %	0 %	537457756
29	NC_022225	TTGAC	2	10	36907	36916	20 %	40 %	20 %	20 %	537457758
30	NC_022225	TAAGC	2	10	36927	36936	40 %	20 %	20 %	20 %	537457758
31	NC_022225	TTGCA	2	10	39414	39423	20 %	40 %	20 %	20 %	537457759
32	NC_022225	GCCAT	2	10	39951	39960	20 %	20 %	20 %	40 %	537457760
33	NC_022225	TGAGT	2	10	40337	40346	20 %	40 %	40 %	0 %	537457760
34	NC_022225	AAACA	2	10	40788	40797	80 %	0 %	0 %	20 %	537457735
35	NC_022225	AAACT	2	10	43155	43164	60 %	20 %	0 %	20 %	537457762
36	NC_022225	AGATA	2	10	43346	43355	60 %	20 %	20 %	0 %	537457762
37	NC_022225	GTAAA	2	10	43858	43867	60 %	20 %	20 %	0 %	537457762
38	NC_022225	GTCAC	2	10	45444	45453	20 %	20 %	20 %	40 %	537457763
39	NC_022225	GTACT	2	10	48207	48216	20 %	40 %	20 %	20 %	537457737
40	NC_022225	GAAGA	2	10	49244	49253	60 %	0 %	40 %	0 %	537457738
41	NC_022225	GATGA	2	10	51967	51976	40 %	20 %	40 %	0 %	537457766
42	NC_022225	AGGAT	2	10	54231	54240	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022225	CATTC	2	10	56221	56230	20 %	40 %	0 %	40 %	537457770
44	NC_022225	TTGAC	2	10	57466	57475	20 %	40 %	20 %	20 %	537457772
45	NC_022225	TCACT	2	10	57602	57611	20 %	40 %	0 %	40 %	537457772
46	NC_022225	AATAG	2	10	58011	58020	60 %	20 %	20 %	0 %	537457772
47	NC_022225	GATTT	2	10	61300	61309	20 %	60 %	20 %	0 %	537457775
48	NC_022225	AGGAT	2	10	63088	63097	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022225	ATGGT	2	10	63737	63746	20 %	40 %	40 %	0 %	537457776
50	NC_022225	TTGAT	2	10	64579	64588	20 %	60 %	20 %	0 %	537457778
51	NC_022225	ATACA	2	10	65753	65762	60 %	20 %	0 %	20 %	537457781

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.