MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Listonella anguillarum M3 plasmid

Total Repeats: 42

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022225	TGAGG	2	10	6080	6089	20 %	20 %	60 %	0 %	537457726
2	NC_022225	AAACA	2	10	7621	7630	80 %	0 %	0 %	20 %	537457727
3	NC_022225	CAGTA	2	10	11208	11217	40 %	20 %	20 %	20 %	537457730
4	NC_022225	GCGCT	2	10	17205	17214	0 %	20 %	40 %	40 %	537457748
5	NC_022225	ATTTT	2	10	19139	19148	20 %	80 %	0 %	0 %	537457748
6	NC_022225	CCAGC	2	10	19839	19848	20 %	0 %	20 %	60 %	537457732
7	NC_022225	TCAGT	2	10	20047	20056	20 %	40 %	20 %	20 %	537457732
8	NC_022225	GTTAA	2	10	24330	24339	40 %	40 %	20 %	0 %	537457751
9	NC_022225	TTTGC	2	10	27551	27560	0 %	60 %	20 %	20 %	537457752
10	NC_022225	GCTCT	2	10	28410	28419	0 %	40 %	20 %	40 %	537457753
11	NC_022225	CATCA	2	10	30082	30091	40 %	20 %	0 %	40 %	537457754
12	NC_022225	GCCAA	2	10	30403	30412	40 %	0 %	20 %	40 %	537457755
13	NC_022225	ATGTT	2	10	30652	30661	20 %	60 %	20 %	0 %	537457755
14	NC_022225	CGTCC	2	10	31103	31112	0 %	20 %	20 %	60 %	537457755
15	NC_022225	TGGAA	2	10	31662	31671	40 %	20 %	40 %	0 %	537457755
16	NC_022225	TACGG	2	10	32004	32013	20 %	20 %	40 %	20 %	537457755
17	NC_022225	TGGAA	2	10	32140	32149	40 %	20 %	40 %	0 %	537457755
18	NC_022225	AATAA	2	10	33822	33831	80 %	20 %	0 %	0 %	537457756
19	NC_022225	TCTTT	2	10	34208	34217	0 %	80 %	0 %	20 %	537457756
20	NC_022225	TGGAT	2	10	34668	34677	20 %	40 %	40 %	0 %	537457756
21	NC_022225	GAAAA	2	10	35367	35376	80 %	0 %	20 %	0 %	537457756
22	NC_022225	TTGAC	2	10	36907	36916	20 %	40 %	20 %	20 %	537457758
23	NC_022225	TAAGC	2	10	36927	36936	40 %	20 %	20 %	20 %	537457758
24	NC_022225	TTGCA	2	10	39414	39423	20 %	40 %	20 %	20 %	537457759
25	NC_022225	GCCAT	2	10	39951	39960	20 %	20 %	20 %	40 %	537457760
26	NC_022225	TGAGT	2	10	40337	40346	20 %	40 %	40 %	0 %	537457760
27	NC_022225	AAACA	2	10	40788	40797	80 %	0 %	0 %	20 %	537457735
28	NC_022225	AAACT	2	10	43155	43164	60 %	20 %	0 %	20 %	537457762
29	NC_022225	AGATA	2	10	43346	43355	60 %	20 %	20 %	0 %	537457762
30	NC_022225	GTAAA	2	10	43858	43867	60 %	20 %	20 %	0 %	537457762
31	NC_022225	GTCAC	2	10	45444	45453	20 %	20 %	20 %	40 %	537457763
32	NC_022225	GTACT	2	10	48207	48216	20 %	40 %	20 %	20 %	537457737
33	NC_022225	GAAGA	2	10	49244	49253	60 %	0 %	40 %	0 %	537457738
34	NC_022225	GATGA	2	10	51967	51976	40 %	20 %	40 %	0 %	537457766
35	NC_022225	CATTC	2	10	56221	56230	20 %	40 %	0 %	40 %	537457770
36	NC_022225	TTGAC	2	10	57466	57475	20 %	40 %	20 %	20 %	537457772
37	NC_022225	TCACT	2	10	57602	57611	20 %	40 %	0 %	40 %	537457772
38	NC_022225	AATAG	2	10	58011	58020	60 %	20 %	20 %	0 %	537457772
39	NC_022225	GATTT	2	10	61300	61309	20 %	60 %	20 %	0 %	537457775
40	NC_022225	ATGGT	2	10	63737	63746	20 %	40 %	40 %	0 %	537457776
41	NC_022225	TTGAT	2	10	64579	64588	20 %	60 %	20 %	0 %	537457778
42	NC_022225	ATACA	2	10	65753	65762	60 %	20 %	0 %	20 %	537457781

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.