MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Listonella anguillarum M3 plasmid

Total Repeats: 149

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022225	GCTT	2	8	870	877	0 %	50 %	25 %	25 %	537457723
2	NC_022225	TTGT	2	8	1376	1383	0 %	75 %	25 %	0 %	537457723
3	NC_022225	AGTT	2	8	1468	1475	25 %	50 %	25 %	0 %	537457723
4	NC_022225	GTTT	2	8	1819	1826	0 %	75 %	25 %	0 %	537457742
5	NC_022225	GCTT	2	8	2174	2181	0 %	50 %	25 %	25 %	537457742
6	NC_022225	AAAG	2	8	2202	2209	75 %	0 %	25 %	0 %	537457742
7	NC_022225	GAAA	2	8	2781	2788	75 %	0 %	25 %	0 %	537457743
8	NC_022225	TTTC	2	8	2792	2799	0 %	75 %	0 %	25 %	537457743
9	NC_022225	AATA	2	8	2893	2900	75 %	25 %	0 %	0 %	537457743
10	NC_022225	CAGC	2	8	3694	3701	25 %	0 %	25 %	50 %	537457724
11	NC_022225	TATT	2	8	4670	4677	25 %	75 %	0 %	0 %	537457725
12	NC_022225	TTCC	2	8	4687	4694	0 %	50 %	0 %	50 %	537457725
13	NC_022225	CACT	2	8	4871	4878	25 %	25 %	0 %	50 %	537457725
14	NC_022225	TATC	2	8	4931	4938	25 %	50 %	0 %	25 %	537457725
15	NC_022225	ATTT	2	8	5021	5028	25 %	75 %	0 %	0 %	537457725
16	NC_022225	CGCA	2	8	6031	6038	25 %	0 %	25 %	50 %	537457726
17	NC_022225	GCTC	2	8	6610	6617	0 %	25 %	25 %	50 %	537457726
18	NC_022225	TGCT	2	8	7014	7021	0 %	50 %	25 %	25 %	537457726
19	NC_022225	AACT	2	8	7536	7543	50 %	25 %	0 %	25 %	537457727
20	NC_022225	AAGC	2	8	8134	8141	50 %	0 %	25 %	25 %	537457727
21	NC_022225	AGTT	2	8	8594	8601	25 %	50 %	25 %	0 %	537457728
22	NC_022225	ATTG	2	8	8685	8692	25 %	50 %	25 %	0 %	537457728
23	NC_022225	GTTT	2	8	8907	8914	0 %	75 %	25 %	0 %	537457728
24	NC_022225	GATA	2	8	9660	9667	50 %	25 %	25 %	0 %	537457729
25	NC_022225	TGAG	2	8	11112	11119	25 %	25 %	50 %	0 %	537457730
26	NC_022225	GAGC	2	8	13985	13992	25 %	0 %	50 %	25 %	537457744
27	NC_022225	CCAA	2	8	14091	14098	50 %	0 %	0 %	50 %	537457744
28	NC_022225	TCCA	2	8	14366	14373	25 %	25 %	0 %	50 %	537457745
29	NC_022225	TTCT	2	8	14702	14709	0 %	75 %	0 %	25 %	537457746
30	NC_022225	CATC	2	8	14789	14796	25 %	25 %	0 %	50 %	537457746
31	NC_022225	GCTT	2	8	15703	15710	0 %	50 %	25 %	25 %	537457747
32	NC_022225	CCCA	2	8	15795	15802	25 %	0 %	0 %	75 %	537457747
33	NC_022225	TTCG	2	8	16913	16920	0 %	50 %	25 %	25 %	537457748
34	NC_022225	AGAA	2	8	17018	17025	75 %	0 %	25 %	0 %	537457748
35	NC_022225	CTGA	2	8	17314	17321	25 %	25 %	25 %	25 %	537457748
36	NC_022225	ATTA	2	8	17821	17828	50 %	50 %	0 %	0 %	537457748
37	NC_022225	GACC	2	8	18177	18184	25 %	0 %	25 %	50 %	537457748
38	NC_022225	TGAT	2	8	18266	18273	25 %	50 %	25 %	0 %	537457748
39	NC_022225	GCCA	2	8	18346	18353	25 %	0 %	25 %	50 %	537457748
40	NC_022225	CCTG	2	8	19279	19286	0 %	25 %	25 %	50 %	537457748
41	NC_022225	ATTG	2	8	19717	19724	25 %	50 %	25 %	0 %	537457732
42	NC_022225	CATT	2	8	20624	20631	25 %	50 %	0 %	25 %	537457749
43	NC_022225	CCAC	2	8	20846	20853	25 %	0 %	0 %	75 %	537457749
44	NC_022225	CAGC	2	8	20919	20926	25 %	0 %	25 %	50 %	537457749
45	NC_022225	ATTC	2	8	20973	20980	25 %	50 %	0 %	25 %	537457749
46	NC_022225	CATT	2	8	21253	21260	25 %	50 %	0 %	25 %	537457749
47	NC_022225	GGCC	2	8	21546	21553	0 %	0 %	50 %	50 %	537457749
48	NC_022225	TGAT	2	8	21754	21761	25 %	50 %	25 %	0 %	537457750
49	NC_022225	AAGC	2	8	22662	22669	50 %	0 %	25 %	25 %	537457733
50	NC_022225	TCAA	2	8	24015	24022	50 %	25 %	0 %	25 %	537457751
51	NC_022225	AGAT	2	8	24202	24209	50 %	25 %	25 %	0 %	537457751
52	NC_022225	AGTG	2	8	24228	24235	25 %	25 %	50 %	0 %	537457751
53	NC_022225	TAAA	2	8	24754	24761	75 %	25 %	0 %	0 %	537457751
54	NC_022225	AGCG	2	8	25012	25019	25 %	0 %	50 %	25 %	537457751
55	NC_022225	TGAT	2	8	25315	25322	25 %	50 %	25 %	0 %	537457751
56	NC_022225	AGTA	2	8	25365	25372	50 %	25 %	25 %	0 %	537457751
57	NC_022225	GACT	2	8	26258	26265	25 %	25 %	25 %	25 %	537457734
58	NC_022225	AGTT	2	8	26726	26733	25 %	50 %	25 %	0 %	537457734
59	NC_022225	CTGG	2	8	27707	27714	0 %	25 %	50 %	25 %	537457752
60	NC_022225	ACCT	2	8	27790	27797	25 %	25 %	0 %	50 %	537457752
61	NC_022225	CATT	2	8	27936	27943	25 %	50 %	0 %	25 %	537457752
62	NC_022225	GAGT	2	8	28186	28193	25 %	25 %	50 %	0 %	537457753
63	NC_022225	TATC	2	8	28213	28220	25 %	50 %	0 %	25 %	537457753
64	NC_022225	GGTA	2	8	28460	28467	25 %	25 %	50 %	0 %	537457753
65	NC_022225	GTGA	2	8	28749	28756	25 %	25 %	50 %	0 %	537457753
66	NC_022225	TTGC	2	8	28963	28970	0 %	50 %	25 %	25 %	537457753
67	NC_022225	ATGA	2	8	29354	29361	50 %	25 %	25 %	0 %	537457754
68	NC_022225	AAAG	2	8	29689	29696	75 %	0 %	25 %	0 %	537457754
69	NC_022225	TCAC	2	8	30358	30365	25 %	25 %	0 %	50 %	537457755
70	NC_022225	AAAG	2	8	30609	30616	75 %	0 %	25 %	0 %	537457755
71	NC_022225	TTGA	2	8	31023	31030	25 %	50 %	25 %	0 %	537457755
72	NC_022225	AAGC	2	8	32097	32104	50 %	0 %	25 %	25 %	537457755
73	NC_022225	GAAT	2	8	32503	32510	50 %	25 %	25 %	0 %	537457756
74	NC_022225	CTTT	2	8	33003	33010	0 %	75 %	0 %	25 %	537457756
75	NC_022225	GAAT	2	8	33095	33102	50 %	25 %	25 %	0 %	537457756
76	NC_022225	CTTT	2	8	33416	33423	0 %	75 %	0 %	25 %	537457756
77	NC_022225	CTTT	2	8	33627	33634	0 %	75 %	0 %	25 %	537457756
78	NC_022225	AACT	2	8	33850	33857	50 %	25 %	0 %	25 %	537457756
79	NC_022225	AGCA	2	8	35197	35204	50 %	0 %	25 %	25 %	537457756
80	NC_022225	AACA	2	8	35253	35260	75 %	0 %	0 %	25 %	537457756
81	NC_022225	ATAA	2	8	35388	35395	75 %	25 %	0 %	0 %	537457756
82	NC_022225	AAGG	2	8	36203	36210	50 %	0 %	50 %	0 %	537457757
83	NC_022225	GGGC	2	8	36325	36332	0 %	0 %	75 %	25 %	537457757
84	NC_022225	TGGA	2	8	37128	37135	25 %	25 %	50 %	0 %	537457758
85	NC_022225	GACC	2	8	38245	38252	25 %	0 %	25 %	50 %	537457759
86	NC_022225	GACT	2	8	38686	38693	25 %	25 %	25 %	25 %	537457759
87	NC_022225	GAGC	2	8	39079	39086	25 %	0 %	50 %	25 %	537457759
88	NC_022225	AGTA	2	8	39457	39464	50 %	25 %	25 %	0 %	537457759
89	NC_022225	CAAT	2	8	40183	40190	50 %	25 %	0 %	25 %	537457760
90	NC_022225	AACT	2	8	40703	40710	50 %	25 %	0 %	25 %	537457735
91	NC_022225	AAGC	2	8	41301	41308	50 %	0 %	25 %	25 %	537457735
92	NC_022225	CTAT	2	8	41830	41837	25 %	50 %	0 %	25 %	537457761
93	NC_022225	CTGT	2	8	42476	42483	0 %	50 %	25 %	25 %	537457761
94	NC_022225	ACAA	2	8	43447	43454	75 %	0 %	0 %	25 %	537457762
95	NC_022225	TCAT	2	8	43835	43842	25 %	50 %	0 %	25 %	537457762
96	NC_022225	ATAA	2	8	44257	44264	75 %	25 %	0 %	0 %	537457763
97	NC_022225	ACTT	2	8	44325	44332	25 %	50 %	0 %	25 %	537457763
98	NC_022225	CAAG	2	8	44558	44565	50 %	0 %	25 %	25 %	537457763
99	NC_022225	AAAC	2	8	45181	45188	75 %	0 %	0 %	25 %	537457763
100	NC_022225	TAAT	2	8	45257	45264	50 %	50 %	0 %	0 %	537457763
101	NC_022225	CTAG	2	8	45640	45647	25 %	25 %	25 %	25 %	537457763
102	NC_022225	TCAA	2	8	45656	45663	50 %	25 %	0 %	25 %	537457763
103	NC_022225	GTTG	2	8	45947	45954	0 %	50 %	50 %	0 %	537457764
104	NC_022225	AACT	2	8	46180	46187	50 %	25 %	0 %	25 %	537457764
105	NC_022225	ATTA	2	8	46673	46680	50 %	50 %	0 %	0 %	537457764
106	NC_022225	CTCA	2	8	48306	48313	25 %	25 %	0 %	50 %	537457737
107	NC_022225	TATC	2	8	49758	49765	25 %	50 %	0 %	25 %	537457738
108	NC_022225	GTAA	2	8	50307	50314	50 %	25 %	25 %	0 %	537457765
109	NC_022225	GTTT	2	8	50603	50610	0 %	75 %	25 %	0 %	537457765
110	NC_022225	TCTG	2	8	50636	50643	0 %	50 %	25 %	25 %	537457765
111	NC_022225	TTTC	2	8	50751	50758	0 %	75 %	0 %	25 %	537457765
112	NC_022225	TGAC	2	8	51142	51149	25 %	25 %	25 %	25 %	537457766
113	NC_022225	GAAC	2	8	51247	51254	50 %	0 %	25 %	25 %	537457766
114	NC_022225	TTGC	2	8	51320	51327	0 %	50 %	25 %	25 %	537457766
115	NC_022225	CATA	2	8	51581	51588	50 %	25 %	0 %	25 %	537457766
116	NC_022225	CGAT	2	8	51613	51620	25 %	25 %	25 %	25 %	537457766
117	NC_022225	ATAG	2	8	53620	53627	50 %	25 %	25 %	0 %	537457739
118	NC_022225	GCTC	2	8	53835	53842	0 %	25 %	25 %	50 %	537457739
119	NC_022225	CTAA	2	8	54694	54701	50 %	25 %	0 %	25 %	537457767
120	NC_022225	GGTT	2	8	54970	54977	0 %	50 %	50 %	0 %	537457768
121	NC_022225	TGCA	2	8	56287	56294	25 %	25 %	25 %	25 %	537457770
122	NC_022225	ATTC	2	8	56321	56328	25 %	50 %	0 %	25 %	537457770
123	NC_022225	ACGA	2	8	56478	56485	50 %	0 %	25 %	25 %	537457770
124	NC_022225	CACT	2	8	56707	56714	25 %	25 %	0 %	50 %	537457770
125	NC_022225	TTGA	2	8	56875	56882	25 %	50 %	25 %	0 %	537457771
126	NC_022225	TAAC	2	8	57150	57157	50 %	25 %	0 %	25 %	537457771
127	NC_022225	CAAT	2	8	57200	57207	50 %	25 %	0 %	25 %	537457772
128	NC_022225	TGGC	2	8	57218	57225	0 %	25 %	50 %	25 %	537457772
129	NC_022225	CTGG	2	8	57353	57360	0 %	25 %	50 %	25 %	537457772
130	NC_022225	TCTT	2	8	57451	57458	0 %	75 %	0 %	25 %	537457772
131	NC_022225	AGTG	2	8	57842	57849	25 %	25 %	50 %	0 %	537457772
132	NC_022225	CGTT	2	8	58683	58690	0 %	50 %	25 %	25 %	537457773
133	NC_022225	AATG	2	8	59496	59503	50 %	25 %	25 %	0 %	537457740
134	NC_022225	TAAT	2	8	60119	60126	50 %	50 %	0 %	0 %	537457740
135	NC_022225	TTGA	2	8	60685	60692	25 %	50 %	25 %	0 %	537457740
136	NC_022225	AACG	2	8	61007	61014	50 %	0 %	25 %	25 %	537457774
137	NC_022225	ATAG	2	8	62477	62484	50 %	25 %	25 %	0 %	537457741
138	NC_022225	GCTC	2	8	62692	62699	0 %	25 %	25 %	50 %	537457741
139	NC_022225	CAAA	2	8	63702	63709	75 %	0 %	0 %	25 %	537457776
140	NC_022225	GTTT	2	8	63791	63798	0 %	75 %	25 %	0 %	537457776
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.