MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Listonella anguillarum M3 chromosome 2

Total Repeats: 46

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022224	TTTTGG	2	12	237	248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022224	TAGCTG	2	12	2083	2094	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_022224	AGTTTA	2	12	18507	18518	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022224	AAAAAC	2	12	56759	56770	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_022224	CATTTC	2	12	62000	62011	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_022224	GCTCGT	2	12	115494	115505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_022224	CAAAGA	2	12	117010	117021	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_022224	CAATTT	2	12	146889	146900	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_022224	TTAAAA	2	12	184686	184697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022224	CAAACT	2	12	187814	187825	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_022224	ATTTTT	2	12	204552	204563	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022224	TTCTTA	2	12	218177	218188	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_022224	TTTGCA	2	12	251853	251864	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_022224	TAAACA	2	12	262889	262900	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_022224	ACTAAG	2	12	266094	266105	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_022224	CTTCAA	2	12	280273	280284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_022224	ATTTTT	2	12	308292	308303	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022224	TTCATT	2	12	326466	326477	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_022224	TGGTTT	2	12	330414	330425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022224	TAAAAA	2	12	357302	357313	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022224	ATCGAG	2	12	362617	362628	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_022224	CTAAAA	2	12	374406	374417	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_022224	TTGAAA	2	12	402509	402520	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022224	GTTATT	2	12	444776	444787	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022224	AAAGTG	2	12	561460	561471	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022224	TTTGAT	2	12	568197	568208	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022224	CTTTTT	2	12	593519	593530	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_022224	CAAAGA	2	12	665092	665103	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_022224	TCTCGC	2	12	688432	688443	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
30	NC_022224	TGCGTT	2	12	727919	727930	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_022224	ATGAAT	2	12	752873	752884	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022224	TTTTTC	2	12	765350	765361	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_022224	CCAATC	2	12	777906	777917	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_022224	GTTTTA	5	30	787573	787602	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022224	ATATCA	2	12	792724	792735	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_022224	CCTTTT	2	12	895083	895094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_022224	TTTTAT	2	12	924033	924044	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022224	GGCAAG	2	12	939288	939299	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_022224	CGTTTA	2	12	940579	940590	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_022224	TCTTTT	2	12	941191	941202	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_022224	ACGATG	2	12	943151	943162	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_022224	GCTTGA	2	12	947819	947830	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_022224	TTTTGC	2	12	977123	977134	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_022224	CTTAAG	2	12	982510	982521	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_022224	TAGCGC	3	18	983324	983341	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_022224	ATTTAG	2	12	985025	985036	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.