MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Listonella anguillarum M3 chromosome 1

Total Repeats: 107

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022223	AGATAC	2	12	10762	10773	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_022223	ATTCAA	2	12	12935	12946	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_022223	ACGGCA	2	12	24938	24949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_022223	GTTTGA	2	12	25284	25295	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022223	CTCATG	2	12	49332	49343	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_022223	AGAATA	2	12	69223	69234	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022223	ATTTCA	2	12	70538	70549	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_022223	TCTTTC	2	12	74887	74898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_022223	AAGAAA	2	12	118695	118706	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022223	TAAAAA	4	24	128241	128264	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022223	ATTTCA	2	12	151195	151206	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_022223	GTATCT	2	12	184755	184766	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_022223	TTTTTG	2	12	224478	224489	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022223	TGAAAT	2	12	253005	253016	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022223	GTGCGT	2	12	272970	272981	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_022223	TTTTTA	2	12	326097	326108	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022223	AGGTAT	2	12	395709	395720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022223	AAAATG	2	12	406711	406722	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022223	TGAATA	2	12	445343	445354	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022223	TATGAA	2	12	488622	488633	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022223	TGAAAA	2	12	494449	494460	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022223	AATATT	2	12	499337	499348	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022223	TAAAAG	2	12	529026	529037	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022223	GAAAGC	2	12	577345	577356	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_022223	CTAAGC	2	12	586992	587003	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_022223	TCAATC	2	12	613668	613679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_022223	GCCATT	2	12	718751	718762	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_022223	TTCTTT	2	12	722936	722947	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_022223	TAGATA	2	12	723116	723127	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022223	TGAAAT	2	12	730074	730085	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022223	TGCGAT	2	12	826543	826554	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_022223	AATAAA	2	12	939674	939685	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022223	AGTTTT	3	18	945951	945968	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022223	AATAAA	2	12	1011766	1011777	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022223	ACCGCA	2	12	1021035	1021046	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
36	NC_022223	GAGATG	2	12	1027158	1027169	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022223	AAAGGG	2	12	1047019	1047030	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022223	CTATAA	2	12	1122786	1122797	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_022223	ATTAAC	2	12	1139102	1139113	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_022223	ATTATA	2	12	1246735	1246746	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022223	ATTTTA	2	12	1290552	1290563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022223	TGAGTT	2	12	1296336	1296347	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022223	AACATA	2	12	1368912	1368923	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_022223	GTTTTA	2	12	1410925	1410936	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022223	GTTTTG	2	12	1441146	1441157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022223	TGAAAT	2	12	1445464	1445475	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022223	CCATCA	2	12	1445489	1445500	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_022223	ATAATG	2	12	1445960	1445971	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022223	AAAAAT	2	12	1527967	1527978	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022223	AAAATC	2	12	1559053	1559064	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_022223	TAAGCG	2	12	1570755	1570766	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_022223	TAAAAT	2	12	1582158	1582169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022223	TTTGTG	2	12	1597161	1597172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022223	TAAAAA	2	12	1660494	1660505	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022223	GTTTAC	2	12	1717710	1717721	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_022223	GAATAA	2	12	1735513	1735524	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022223	ACGTAG	2	12	1763937	1763948	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_022223	AAGTAA	2	12	1827695	1827706	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022223	AGAAGT	2	12	1846609	1846620	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022223	TCCTTT	2	12	1860697	1860708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_022223	AAGATG	2	12	1863756	1863767	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022223	AAATTA	2	12	1879186	1879197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022223	TCCCTT	2	12	1906512	1906523	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_022223	TTTTAA	2	12	1979285	1979296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022223	GTGATG	2	12	2023217	2023228	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022223	AGATAC	2	12	2064741	2064752	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_022223	TTGTTA	2	12	2094988	2094999	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022223	CATATA	2	12	2099375	2099386	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_022223	TCAACA	2	12	2151062	2151073	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_022223	CTCTTT	2	12	2156956	2156967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_022223	CAAATC	2	12	2213301	2213312	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_022223	TGCATC	2	12	2233732	2233743	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_022223	CAGAAA	2	12	2265259	2265270	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_022223	ACAAAT	2	12	2334541	2334552	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_022223	AAAATG	2	12	2359861	2359872	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022223	ACGGAT	2	12	2390006	2390017	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_022223	TTAATT	2	12	2445618	2445629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022223	AAATAA	2	12	2446050	2446061	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022223	CTTTTT	2	12	2469391	2469402	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_022223	TCAATC	2	12	2474849	2474860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_022223	GATTTG	2	12	2476476	2476487	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022223	ATTTCA	2	12	2527195	2527206	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_022223	AGCTTT	2	12	2582476	2582487	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_022223	CTGAGC	2	12	2584604	2584615	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_022223	CGTTTC	2	12	2603743	2603754	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_022223	ATCTAA	2	12	2611452	2611463	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_022223	CTCTGA	2	12	2642605	2642616	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_022223	TTGGCT	2	12	2726542	2726553	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_022223	ACAAAA	2	12	2750023	2750034	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_022223	GTAAAC	2	12	2786505	2786516	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_022223	ATGGAT	2	12	2799361	2799372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_022223	CATTTA	2	12	2810352	2810363	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_022223	ACCAGT	2	12	2851428	2851439	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_022223	TTGAAG	2	12	2853725	2853736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022223	TTTCAC	2	12	2858114	2858125	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_022223	TCGCTT	2	12	2872879	2872890	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_022223	CTCTAC	2	12	2891902	2891913	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_022223	AAAGGC	2	12	2919815	2919826	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_022223	CTAGCT	2	12	2929842	2929853	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_022223	CACCAA	2	12	2933318	2933329	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_022223	ATCTTT	2	12	2935109	2935120	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_022223	AAATAA	2	12	2968854	2968865	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022223	TCAAGC	2	12	2976701	2976712	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_022223	TCAGCA	2	12	2977413	2977424	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_022223	ATTTCA	2	12	2987329	2987340	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_022223	GAATAA	2	12	3027088	3027099	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022223	AGTGGG	2	12	3027489	3027500	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.