MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. CDC1983-67

Total Repeats: 10756

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022221	AGAC	2	8	153	160	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_022221	ACCA	2	8	466	473	50 %	0 %	0 %	50 %	537435371
3	NC_022221	GATC	2	8	777	784	25 %	25 %	25 %	25 %	537435371
4	NC_022221	ATGA	2	8	3128	3135	50 %	25 %	25 %	0 %	537435372
5	NC_022221	GATG	2	8	4633	4640	25 %	25 %	50 %	0 %	537435373
6	NC_022221	CAGC	2	8	4642	4649	25 %	0 %	25 %	50 %	537435373
7	NC_022221	CTGA	2	8	4700	4707	25 %	25 %	25 %	25 %	537435373
8	NC_022221	AAAG	2	8	4880	4887	75 %	0 %	25 %	0 %	537435373
9	NC_022221	CTGC	2	8	4970	4977	0 %	25 %	25 %	50 %	537435373
10	NC_022221	GCCA	2	8	6664	6671	25 %	0 %	25 %	50 %	537435375
11	NC_022221	TGAA	2	8	7290	7297	50 %	25 %	25 %	0 %	537435375
12	NC_022221	GCGT	2	8	8156	8163	0 %	25 %	50 %	25 %	537435376
13	NC_022221	AAGA	2	8	8238	8245	75 %	0 %	25 %	0 %	537435376
14	NC_022221	CTGT	2	8	8666	8673	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_022221	GAAC	2	8	9718	9725	50 %	0 %	25 %	25 %	537435378
16	NC_022221	CAGG	2	8	10122	10129	25 %	0 %	50 %	25 %	537435379
17	NC_022221	TGGC	2	8	11004	11011	0 %	25 %	50 %	25 %	537435380
18	NC_022221	TCGT	2	8	11124	11131	0 %	50 %	25 %	25 %	537435380
19	NC_022221	ATTT	2	8	11370	11377	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022221	TGTT	2	8	11384	11391	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022221	ATGG	2	8	11648	11655	25 %	25 %	50 %	0 %	537435381
22	NC_022221	TGGT	2	8	11739	11746	0 %	50 %	50 %	0 %	537435381
23	NC_022221	CAAC	2	8	12252	12259	50 %	0 %	0 %	50 %	537435381
24	NC_022221	AAGA	2	8	12326	12333	75 %	0 %	25 %	0 %	537435381
25	NC_022221	CCAT	2	8	12903	12910	25 %	25 %	0 %	50 %	537435381
26	NC_022221	GGCT	2	8	13423	13430	0 %	25 %	50 %	25 %	537435381
27	NC_022221	CGGT	2	8	14593	14600	0 %	25 %	50 %	25 %	537435382
28	NC_022221	TCAG	2	8	15245	15252	25 %	25 %	25 %	25 %	537435384
29	NC_022221	TTTG	2	8	15535	15542	0 %	75 %	25 %	0 %	537435384
30	NC_022221	CGAA	2	8	15750	15757	50 %	0 %	25 %	25 %	537435384
31	NC_022221	ATTG	2	8	15762	15769	25 %	50 %	25 %	0 %	537435384
32	NC_022221	ATTA	2	8	16430	16437	50 %	50 %	0 %	0 %	537435385
33	NC_022221	ATAA	2	8	16522	16529	75 %	25 %	0 %	0 %	537435386
34	NC_022221	AATA	2	8	17998	18005	75 %	25 %	0 %	0 %	537435388
35	NC_022221	GGGC	2	8	18584	18591	0 %	0 %	75 %	25 %	537435388
36	NC_022221	CGTG	2	8	19284	19291	0 %	25 %	50 %	25 %	537435388
37	NC_022221	CCAA	2	8	21285	21292	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_022221	GACG	2	8	21631	21638	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_022221	TGGC	2	8	22284	22291	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_022221	TGGC	2	8	22390	22397	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
41	NC_022221	CGCC	2	8	22656	22663	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
42	NC_022221	CTGG	2	8	23002	23009	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_022221	TTAT	2	8	23267	23274	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022221	TTTA	2	8	23500	23507	25 %	75 %	0 %	0 %	537435389
45	NC_022221	TCTG	2	8	23957	23964	0 %	50 %	25 %	25 %	537435389
46	NC_022221	TGAA	2	8	24468	24475	50 %	25 %	25 %	0 %	537435390
47	NC_022221	CCAG	2	8	24739	24746	25 %	0 %	25 %	50 %	537435390
48	NC_022221	ACCG	2	8	25416	25423	25 %	0 %	25 %	50 %	537435391
49	NC_022221	AAAT	2	8	25476	25483	75 %	25 %	0 %	0 %	537435391
50	NC_022221	TCTG	2	8	25933	25940	0 %	50 %	25 %	25 %	537435392
51	NC_022221	GCCT	2	8	26114	26121	0 %	25 %	25 %	50 %	537435392
52	NC_022221	CCTT	2	8	26620	26627	0 %	50 %	0 %	50 %	537435392
53	NC_022221	TCAG	2	8	26979	26986	25 %	25 %	25 %	25 %	537435392
54	NC_022221	ATCA	2	8	27392	27399	50 %	25 %	0 %	25 %	537435392
55	NC_022221	CAGC	2	8	27436	27443	25 %	0 %	25 %	50 %	537435392
56	NC_022221	AGCC	2	8	27926	27933	25 %	0 %	25 %	50 %	537435392
57	NC_022221	CCGA	2	8	28133	28140	25 %	0 %	25 %	50 %	537435392
58	NC_022221	ATTA	2	8	28526	28533	50 %	50 %	0 %	0 %	537435393
59	NC_022221	GGCG	2	8	28768	28775	0 %	0 %	75 %	25 %	537435393
60	NC_022221	ATGA	2	8	29971	29978	50 %	25 %	25 %	0 %	537435394
61	NC_022221	TGCT	2	8	30541	30548	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_022221	TATC	2	8	30597	30604	25 %	50 %	0 %	25 %	537435396
63	NC_022221	GTAA	2	8	30634	30641	50 %	25 %	25 %	0 %	537435396
64	NC_022221	TTCG	2	8	30896	30903	0 %	50 %	25 %	25 %	537435396
65	NC_022221	GTCA	2	8	31405	31412	25 %	25 %	25 %	25 %	537435397
66	NC_022221	ACCG	2	8	32225	32232	25 %	0 %	25 %	50 %	537435398
67	NC_022221	AGGC	2	8	32263	32270	25 %	0 %	50 %	25 %	537435398
68	NC_022221	CCTG	2	8	32699	32706	0 %	25 %	25 %	50 %	537435399
69	NC_022221	AACA	2	8	32715	32722	75 %	0 %	0 %	25 %	537435399
70	NC_022221	CGCA	2	8	32889	32896	25 %	0 %	25 %	50 %	537435399
71	NC_022221	TAAA	2	8	32959	32966	75 %	25 %	0 %	0 %	537435399
72	NC_022221	CCAG	2	8	33345	33352	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
73	NC_022221	TTAT	2	8	33528	33535	25 %	75 %	0 %	0 %	537435400
74	NC_022221	TTGG	2	8	33912	33919	0 %	50 %	50 %	0 %	537435400
75	NC_022221	CTTT	2	8	34292	34299	0 %	75 %	0 %	25 %	537435400
76	NC_022221	GAAG	2	8	34332	34339	50 %	0 %	50 %	0 %	537435400
77	NC_022221	ATAA	2	8	34663	34670	75 %	25 %	0 %	0 %	537435401
78	NC_022221	GTGC	2	8	34786	34793	0 %	25 %	50 %	25 %	537435401
79	NC_022221	TTAA	2	8	34796	34803	50 %	50 %	0 %	0 %	537435401
80	NC_022221	TGAT	2	8	35031	35038	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022221	TGGA	2	8	35548	35555	25 %	25 %	50 %	0 %	537435403
82	NC_022221	GGGA	2	8	36492	36499	25 %	0 %	75 %	0 %	537435403
83	NC_022221	ATAC	2	8	37477	37484	50 %	25 %	0 %	25 %	537435404
84	NC_022221	GAAG	2	8	37549	37556	50 %	0 %	50 %	0 %	537435404
85	NC_022221	CACG	2	8	38112	38119	25 %	0 %	25 %	50 %	537435404
86	NC_022221	TAAT	2	8	38214	38221	50 %	50 %	0 %	0 %	537435404
87	NC_022221	CCAT	2	8	38670	38677	25 %	25 %	0 %	50 %	537435404
88	NC_022221	ATTA	2	8	38764	38771	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022221	AATT	2	8	40044	40051	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022221	GCGG	2	8	40535	40542	0 %	0 %	75 %	25 %	537435406
91	NC_022221	CTGG	2	8	40753	40760	0 %	25 %	50 %	25 %	537435406
92	NC_022221	CCGA	2	8	41270	41277	25 %	0 %	25 %	50 %	537435406
93	NC_022221	ATCG	2	8	41426	41433	25 %	25 %	25 %	25 %	537435406
94	NC_022221	TCAA	2	8	41487	41494	50 %	25 %	0 %	25 %	537435406
95	NC_022221	AACC	2	8	41753	41760	50 %	0 %	0 %	50 %	537435407
96	NC_022221	GAAA	2	8	41805	41812	75 %	0 %	25 %	0 %	537435407
97	NC_022221	GGTC	2	8	42377	42384	0 %	25 %	50 %	25 %	537435407
98	NC_022221	TTTG	2	8	42901	42908	0 %	75 %	25 %	0 %	537435407
99	NC_022221	GTAT	2	8	43196	43203	25 %	50 %	25 %	0 %	537435408
100	NC_022221	TCCG	2	8	43590	43597	0 %	25 %	25 %	50 %	537435408
101	NC_022221	ATGA	2	8	45652	45659	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022221	AACG	2	8	45954	45961	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_022221	TGAC	2	8	46038	46045	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_022221	GAAA	2	8	46902	46909	75 %	0 %	25 %	0 %	537435409
105	NC_022221	TCGC	2	8	46917	46924	0 %	25 %	25 %	50 %	537435409
106	NC_022221	GCTG	2	8	47108	47115	0 %	25 %	50 %	25 %	537435409
107	NC_022221	CACG	2	8	47806	47813	25 %	0 %	25 %	50 %	537435410
108	NC_022221	CAGC	2	8	47833	47840	25 %	0 %	25 %	50 %	537435410
109	NC_022221	CTGC	2	8	47970	47977	0 %	25 %	25 %	50 %	537435410
110	NC_022221	TACC	2	8	48317	48324	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_022221	CATG	2	8	48538	48545	25 %	25 %	25 %	25 %	537435411
112	NC_022221	AAGT	2	8	49332	49339	50 %	25 %	25 %	0 %	537435411
113	NC_022221	CCAG	2	8	49390	49397	25 %	0 %	25 %	50 %	537435411
114	NC_022221	TTGA	2	8	50171	50178	25 %	50 %	25 %	0 %	537435411
115	NC_022221	GAAA	2	8	50506	50513	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_022221	GCCA	2	8	50847	50854	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
117	NC_022221	TAAA	2	8	51239	51246	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_022221	AGTA	2	8	51932	51939	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_022221	ATCA	2	8	51972	51979	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_022221	GAAA	2	8	52092	52099	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022221	AGGG	2	8	52125	52132	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
122	NC_022221	CATA	2	8	52884	52891	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_022221	TCAG	2	8	52895	52902	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_022221	GCCC	2	8	53067	53074	0 %	0 %	25 %	75 %	537435414
125	NC_022221	TGGC	2	8	53609	53616	0 %	25 %	50 %	25 %	537435414
126	NC_022221	AGCC	2	8	57436	57443	25 %	0 %	25 %	50 %	537435417
127	NC_022221	AAAG	2	8	57515	57522	75 %	0 %	25 %	0 %	537435417
128	NC_022221	ATGG	2	8	57648	57655	25 %	25 %	50 %	0 %	537435417
129	NC_022221	TGAT	2	8	58320	58327	25 %	50 %	25 %	0 %	537435418
130	NC_022221	TGGA	2	8	58989	58996	25 %	25 %	50 %	0 %	537435419
131	NC_022221	CCTG	2	8	59025	59032	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
132	NC_022221	GATT	2	8	59387	59394	25 %	50 %	25 %	0 %	537435420
133	NC_022221	GATC	2	8	59756	59763	25 %	25 %	25 %	25 %	537435420
134	NC_022221	CTGG	2	8	60881	60888	0 %	25 %	50 %	25 %	537435421
135	NC_022221	GTGG	2	8	61046	61053	0 %	25 %	75 %	0 %	537435421
136	NC_022221	CTGC	2	8	61256	61263	0 %	25 %	25 %	50 %	537435422
137	NC_022221	ACCA	2	8	61892	61899	50 %	0 %	0 %	50 %	537435423
138	NC_022221	CATT	2	8	62117	62124	25 %	50 %	0 %	25 %	537435423
139	NC_022221	TCAA	2	8	63158	63165	50 %	25 %	0 %	25 %	537435423
140	NC_022221	TACT	2	8	63477	63484	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_022221	TTTC	2	8	63485	63492	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_022221	GCCA	2	8	64744	64751	25 %	0 %	25 %	50 %	537435424
143	NC_022221	GCTG	2	8	65126	65133	0 %	25 %	50 %	25 %	537435425
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