MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. CDC1983-67

Total Repeats: 7413

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022221	GC	3	6	575	580	0 %	0 %	50 %	50 %	537435371
2	NC_022221	CT	3	6	1105	1110	0 %	50 %	0 %	50 %	537435371
3	NC_022221	TG	3	6	1417	1422	0 %	50 %	50 %	0 %	537435371
4	NC_022221	GC	3	6	1436	1441	0 %	0 %	50 %	50 %	537435371
5	NC_022221	CT	3	6	2254	2259	0 %	50 %	0 %	50 %	537435371
6	NC_022221	TC	3	6	2292	2297	0 %	50 %	0 %	50 %	537435371
7	NC_022221	GC	3	6	2314	2319	0 %	0 %	50 %	50 %	537435371
8	NC_022221	CG	3	6	2345	2350	0 %	0 %	50 %	50 %	537435371
9	NC_022221	CG	4	8	3503	3510	0 %	0 %	50 %	50 %	537435372
10	NC_022221	GC	3	6	3558	3563	0 %	0 %	50 %	50 %	537435372
11	NC_022221	CG	3	6	3962	3967	0 %	0 %	50 %	50 %	537435373
12	NC_022221	CG	3	6	4206	4211	0 %	0 %	50 %	50 %	537435373
13	NC_022221	TG	3	6	5148	5153	0 %	50 %	50 %	0 %	537435374
14	NC_022221	CG	3	6	5251	5256	0 %	0 %	50 %	50 %	537435374
15	NC_022221	CG	3	6	5470	5475	0 %	0 %	50 %	50 %	537435374
16	NC_022221	AG	3	6	5552	5557	50 %	0 %	50 %	0 %	537435374
17	NC_022221	CG	3	6	5971	5976	0 %	0 %	50 %	50 %	537435375
18	NC_022221	GC	3	6	6889	6894	0 %	0 %	50 %	50 %	537435375
19	NC_022221	TC	3	6	7773	7778	0 %	50 %	0 %	50 %	537435376
20	NC_022221	CG	3	6	7860	7865	0 %	0 %	50 %	50 %	537435376
21	NC_022221	CG	3	6	7958	7963	0 %	0 %	50 %	50 %	537435376
22	NC_022221	CT	3	6	8451	8456	0 %	50 %	0 %	50 %	537435376
23	NC_022221	GC	3	6	8475	8480	0 %	0 %	50 %	50 %	537435376
24	NC_022221	TG	3	6	8901	8906	0 %	50 %	50 %	0 %	537435377
25	NC_022221	GC	3	6	9573	9578	0 %	0 %	50 %	50 %	537435378
26	NC_022221	CG	3	6	10533	10538	0 %	0 %	50 %	50 %	537435379
27	NC_022221	CG	3	6	12990	12995	0 %	0 %	50 %	50 %	537435381
28	NC_022221	GC	3	6	14551	14556	0 %	0 %	50 %	50 %	537435382
29	NC_022221	GA	3	6	14662	14667	50 %	0 %	50 %	0 %	537435382
30	NC_022221	AT	3	6	15374	15379	50 %	50 %	0 %	0 %	537435384
31	NC_022221	AT	3	6	15649	15654	50 %	50 %	0 %	0 %	537435384
32	NC_022221	AT	3	6	15902	15907	50 %	50 %	0 %	0 %	537435384
33	NC_022221	GA	3	6	17066	17071	50 %	0 %	50 %	0 %	537435387
34	NC_022221	GC	3	6	18368	18373	0 %	0 %	50 %	50 %	537435388
35	NC_022221	AT	3	6	23584	23589	50 %	50 %	0 %	0 %	537435389
36	NC_022221	CG	3	6	23654	23659	0 %	0 %	50 %	50 %	537435389
37	NC_022221	GC	4	8	23797	23804	0 %	0 %	50 %	50 %	537435389
38	NC_022221	CG	3	6	25066	25071	0 %	0 %	50 %	50 %	537435391
39	NC_022221	CT	3	6	25352	25357	0 %	50 %	0 %	50 %	537435391
40	NC_022221	AT	3	6	25382	25387	50 %	50 %	0 %	0 %	537435391
41	NC_022221	GC	3	6	26085	26090	0 %	0 %	50 %	50 %	537435392
42	NC_022221	CG	3	6	28015	28020	0 %	0 %	50 %	50 %	537435392
43	NC_022221	GC	3	6	28143	28148	0 %	0 %	50 %	50 %	537435392
44	NC_022221	GC	3	6	28179	28184	0 %	0 %	50 %	50 %	537435392
45	NC_022221	GT	3	6	28357	28362	0 %	50 %	50 %	0 %	537435392
46	NC_022221	TC	3	6	28375	28380	0 %	50 %	0 %	50 %	537435392
47	NC_022221	GT	3	6	28622	28627	0 %	50 %	50 %	0 %	537435393
48	NC_022221	CT	3	6	30105	30110	0 %	50 %	0 %	50 %	537435395
49	NC_022221	CG	3	6	30168	30173	0 %	0 %	50 %	50 %	537435395
50	NC_022221	AG	3	6	30374	30379	50 %	0 %	50 %	0 %	537435395
51	NC_022221	CG	3	6	30431	30436	0 %	0 %	50 %	50 %	537435395
52	NC_022221	GC	3	6	30763	30768	0 %	0 %	50 %	50 %	537435396
53	NC_022221	GC	3	6	31053	31058	0 %	0 %	50 %	50 %	537435396
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57	NC_022221	AT	3	6	34433	34438	50 %	50 %	0 %	0 %	537435401
58	NC_022221	AT	3	6	34694	34699	50 %	50 %	0 %	0 %	537435401
59	NC_022221	AT	3	6	35440	35445	50 %	50 %	0 %	0 %	537435403
60	NC_022221	TG	4	8	35655	35662	0 %	50 %	50 %	0 %	537435403
61	NC_022221	GC	3	6	36248	36253	0 %	0 %	50 %	50 %	537435403
62	NC_022221	TA	3	6	37198	37203	50 %	50 %	0 %	0 %	537435404
63	NC_022221	GC	3	6	37965	37970	0 %	0 %	50 %	50 %	537435404
64	NC_022221	AT	3	6	39514	39519	50 %	50 %	0 %	0 %	537435405
65	NC_022221	CG	3	6	40373	40378	0 %	0 %	50 %	50 %	537435406
66	NC_022221	CG	3	6	41061	41066	0 %	0 %	50 %	50 %	537435406
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68	NC_022221	TG	3	6	42797	42802	0 %	50 %	50 %	0 %	537435407
69	NC_022221	CG	3	6	43312	43317	0 %	0 %	50 %	50 %	537435408
70	NC_022221	TA	3	6	43685	43690	50 %	50 %	0 %	0 %	537435408
71	NC_022221	TA	3	6	46805	46810	50 %	50 %	0 %	0 %	537435409
72	NC_022221	TG	3	6	47186	47191	0 %	50 %	50 %	0 %	537435409
73	NC_022221	GC	4	8	47325	47332	0 %	0 %	50 %	50 %	537435409
74	NC_022221	GA	3	6	48239	48244	50 %	0 %	50 %	0 %	537435410
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80	NC_022221	CG	3	6	54348	54353	0 %	0 %	50 %	50 %	537435415
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82	NC_022221	CG	3	6	55095	55100	0 %	0 %	50 %	50 %	537435415
83	NC_022221	CG	3	6	55829	55834	0 %	0 %	50 %	50 %	537435415
84	NC_022221	CG	3	6	56084	56089	0 %	0 %	50 %	50 %	537435415
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91	NC_022221	AT	3	6	63059	63064	50 %	50 %	0 %	0 %	537435423
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102	NC_022221	TG	3	6	71378	71383	0 %	50 %	50 %	0 %	537435430
103	NC_022221	GC	3	6	71889	71894	0 %	0 %	50 %	50 %	537435430
104	NC_022221	TG	3	6	72038	72043	0 %	50 %	50 %	0 %	537435430
105	NC_022221	GC	3	6	72196	72201	0 %	0 %	50 %	50 %	537435430
106	NC_022221	GC	3	6	72373	72378	0 %	0 %	50 %	50 %	537435431
107	NC_022221	CG	3	6	73234	73239	0 %	0 %	50 %	50 %	537435432
108	NC_022221	GC	3	6	73380	73385	0 %	0 %	50 %	50 %	537435432
109	NC_022221	CT	3	6	75904	75909	0 %	50 %	0 %	50 %	537435436
110	NC_022221	GC	3	6	77072	77077	0 %	0 %	50 %	50 %	537435437
111	NC_022221	CG	3	6	77208	77213	0 %	0 %	50 %	50 %	537435437
112	NC_022221	CG	3	6	77684	77689	0 %	0 %	50 %	50 %	537435437
113	NC_022221	GC	5	10	78730	78739	0 %	0 %	50 %	50 %	537435437
114	NC_022221	GC	3	6	79375	79380	0 %	0 %	50 %	50 %	537435437
115	NC_022221	GC	3	6	79874	79879	0 %	0 %	50 %	50 %	537435437
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119	NC_022221	CG	3	6	81606	81611	0 %	0 %	50 %	50 %	537435440
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122	NC_022221	GT	4	8	84221	84228	0 %	50 %	50 %	0 %	537435442
123	NC_022221	TC	3	6	85874	85879	0 %	50 %	0 %	50 %	537435443
124	NC_022221	GC	3	6	86139	86144	0 %	0 %	50 %	50 %	537435443
125	NC_022221	GC	4	8	86760	86767	0 %	0 %	50 %	50 %	537435444
126	NC_022221	TA	3	6	86958	86963	50 %	50 %	0 %	0 %	537435444
127	NC_022221	TG	3	6	88303	88308	0 %	50 %	50 %	0 %	537435445
128	NC_022221	CT	3	6	88646	88651	0 %	50 %	0 %	50 %	537435446
129	NC_022221	AC	3	6	88711	88716	50 %	0 %	0 %	50 %	537435446
130	NC_022221	CT	4	8	88865	88872	0 %	50 %	0 %	50 %	537435446
131	NC_022221	CA	3	6	89077	89082	50 %	0 %	0 %	50 %	537435446
132	NC_022221	GC	3	6	89271	89276	0 %	0 %	50 %	50 %	537435447
133	NC_022221	GC	3	6	90021	90026	0 %	0 %	50 %	50 %	537435447
134	NC_022221	CG	3	6	91728	91733	0 %	0 %	50 %	50 %	537435449
135	NC_022221	GC	3	6	92078	92083	0 %	0 %	50 %	50 %	537435450
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137	NC_022221	TG	3	6	94025	94030	0 %	50 %	50 %	0 %	537435452
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139	NC_022221	GC	3	6	98755	98760	0 %	0 %	50 %	50 %	537435455
140	NC_022221	CG	3	6	99139	99144	0 %	0 %	50 %	50 %	537435455
141	NC_022221	GC	3	6	99674	99679	0 %	0 %	50 %	50 %	537435455
142	NC_022221	GC	3	6	100071	100076	0 %	0 %	50 %	50 %	537435455
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