MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Corynebacterium argentoratense DSM 44202

Total Repeats: 54

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022198	GGGGGT	2	12	12049	12060	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022198	CACCAG	2	12	72263	72274	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
3	NC_022198	CCTACC	2	12	73198	73209	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_022198	AGAAAA	2	12	124982	124993	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022198	CGCAGC	2	12	174577	174588	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
6	NC_022198	GCTTTT	2	12	224860	224871	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_022198	ATTTTT	2	12	291087	291098	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022198	CTTGCG	2	12	381005	381016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_022198	CTGGAA	2	12	381118	381129	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_022198	GTCCAC	2	12	419539	419550	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
11	NC_022198	GTTTTC	2	12	477121	477132	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_022198	GAACGT	2	12	501331	501342	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_022198	CCTAGA	2	12	503647	503658	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_022198	CCGGCA	2	12	627622	627633	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
15	NC_022198	ACTCCG	2	12	645566	645577	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
16	NC_022198	TGGCGG	2	12	696248	696259	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_022198	AATTCA	2	12	699484	699495	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_022198	GGGGTG	2	12	776258	776269	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022198	GCCTAA	2	12	780706	780717	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_022198	AGGGCT	2	12	826859	826870	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_022198	GTTTTA	2	12	871578	871589	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022198	GTTTGT	2	12	886723	886734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022198	ACCGTC	2	12	987567	987578	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
24	NC_022198	GGTGGA	2	12	987612	987623	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022198	CGGCTG	2	12	1029573	1029584	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_022198	GCCGAA	2	12	1059767	1059778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_022198	CTGAGG	2	12	1087052	1087063	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_022198	TTACAC	2	12	1099674	1099685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_022198	TAGCTA	2	12	1149731	1149742	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_022198	TGTTTA	2	12	1173309	1173320	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022198	CCTCCC	2	12	1189960	1189971	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
32	NC_022198	TTCGCT	2	12	1210790	1210801	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_022198	AAGACC	2	12	1227375	1227386	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_022198	ACCTCA	2	12	1241343	1241354	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_022198	TCACAG	2	12	1249714	1249725	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_022198	GGTTTT	2	12	1322738	1322749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022198	CGCGTG	2	12	1355309	1355320	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_022198	TCGCAC	2	12	1384822	1384833	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
39	NC_022198	AAAAAG	2	12	1387691	1387702	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022198	AGGCGC	2	12	1517865	1517876	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_022198	AGCCCC	2	12	1550745	1550756	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_022198	AAACAC	2	12	1695951	1695962	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_022198	CGAAGC	2	12	1714642	1714653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_022198	GCCCGG	2	12	1740927	1740938	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_022198	GTCGCG	2	12	1758864	1758875	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_022198	AAACTT	2	12	1825614	1825625	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_022198	CTTTTG	2	12	1829387	1829398	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_022198	ATCGTC	2	12	1858750	1858761	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_022198	AGGCTT	2	12	1871498	1871509	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_022198	TTTCCC	2	12	1886017	1886028	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_022198	CCCGTC	2	12	1949018	1949029	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_022198	CGAGCA	2	12	1949168	1949179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_022198	GGGCGC	2	12	1952047	1952058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_022198	AAAAAG	2	12	1959356	1959367	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.