MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Fusobacterium nucleatum subsp. vincentii 3_1_36A2

Total Repeats: 115

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022196	TAAAAA	2	12	48631	48642	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022196	AAAAAT	2	12	80538	80549	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022196	TAAAAG	2	12	80983	80994	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022196	GAGATA	2	12	82164	82175	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022196	TTTAAA	2	12	86077	86088	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022196	AAGTAG	2	12	123614	123625	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022196	TAAAAA	2	12	134463	134474	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022196	ATAAAA	2	12	141831	141842	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022196	ATTGTA	2	12	151984	151995	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022196	TTTTTA	2	12	152272	152283	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022196	TTTATT	2	12	152422	152433	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022196	ATAAAA	2	12	170118	170129	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022196	GTAAAT	2	12	182242	182253	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022196	TTTAAT	2	12	184750	184761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022196	TTATTT	2	12	205055	205066	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022196	TTATAA	2	12	251803	251814	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022196	TGTTTT	2	12	252725	252736	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022196	TGTATA	2	12	296456	296467	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022196	ATTTTA	2	12	299560	299571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022196	CTTTTT	2	12	327994	328005	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_022196	AAAAGA	2	12	342397	342408	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022196	AATTTT	2	12	368881	368892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022196	AAGATA	2	12	372475	372486	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022196	TAAAAA	2	12	387217	387228	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022196	TAAAAA	2	12	388858	388869	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022196	TTTTAA	2	12	388915	388926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022196	AAATAT	2	12	439001	439012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022196	AAAAAT	2	12	449148	449159	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022196	TAGCAG	2	12	451215	451226	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_022196	TGAAAA	2	12	454279	454290	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022196	GATGAG	2	12	457892	457903	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022196	AAGATA	2	12	459727	459738	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022196	AAGGAA	2	12	523898	523909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022196	AAGTAA	2	12	523984	523995	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022196	TTTTAA	2	12	566624	566635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022196	TATAGA	2	12	597305	597316	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022196	ATTTTA	2	12	599917	599928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022196	AAGTAG	2	12	599959	599970	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022196	TGAATA	2	12	671049	671060	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022196	TAAAAA	2	12	677917	677928	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022196	AAATAA	2	12	684072	684083	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022196	ATTCAG	2	12	685750	685761	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_022196	AATTTT	2	12	691093	691104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022196	ATAAAA	2	12	701303	701314	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022196	ATAAGA	2	12	703360	703371	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022196	GAGATA	2	12	704634	704645	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022196	TTATTT	2	12	748755	748766	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022196	TTTTAT	2	12	749769	749780	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022196	GTATTT	2	12	755431	755442	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022196	CTATAA	2	12	776414	776425	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_022196	ATTTTT	2	12	800472	800483	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022196	TATTAA	2	12	841947	841958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022196	ATTTTT	2	12	855707	855718	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022196	TATTAA	2	12	887336	887347	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022196	TTAAAA	2	12	890016	890027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022196	TCATTT	2	12	898010	898021	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_022196	CCTTTT	2	12	933592	933603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_022196	AATTCA	2	12	946762	946773	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_022196	AAAAAT	2	12	949818	949829	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022196	GATATT	2	12	952370	952381	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022196	TAAAAT	2	12	985854	985865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022196	TAGAAT	2	12	1003614	1003625	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022196	AAAAAT	2	12	1057340	1057351	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022196	TAATTT	2	12	1064989	1065000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022196	ATTATA	2	12	1101724	1101735	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022196	TTTTTC	2	12	1124068	1124079	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_022196	ATAAAA	2	12	1130277	1130288	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022196	TAAAAT	2	12	1227073	1227084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022196	TAAATA	2	12	1255374	1255385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022196	TTTTAT	2	12	1266872	1266883	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022196	AAATTA	2	12	1314916	1314927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022196	ATTAAA	2	12	1351673	1351684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022196	AAAGGA	2	12	1377354	1377365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022196	AAATTA	2	12	1401188	1401199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022196	TTAAAG	2	12	1407734	1407745	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022196	TATTTT	2	12	1447357	1447368	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022196	AAATTT	2	12	1480877	1480888	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022196	ACAATT	2	12	1583421	1583432	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_022196	AATATT	2	12	1587185	1587196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022196	AAAAAT	2	12	1669219	1669230	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022196	TCTTTT	2	12	1679541	1679552	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_022196	TTTATT	2	12	1709083	1709094	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022196	AAATAA	2	12	1743017	1743028	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022196	ATTTTG	2	12	1743190	1743201	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022196	TAAATA	2	12	1766599	1766610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022196	CTTTTT	2	12	1786950	1786961	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_022196	ATTTTT	2	12	1795864	1795875	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022196	TATTTT	2	12	1839932	1839943	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022196	CTATTT	2	12	1852328	1852339	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_022196	ATTTAT	2	12	1877235	1877246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_022196	TAATAT	2	12	1907177	1907188	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_022196	ATTTGT	2	12	1933773	1933784	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_022196	TTTTAC	2	12	1944280	1944291	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_022196	TTAAAA	2	12	1952796	1952807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022196	TTTATT	2	12	1987817	1987828	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022196	CTATTC	2	12	1991243	1991254	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_022196	ATCTTA	2	12	1991790	1991801	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_022196	AATTTG	2	12	2012487	2012498	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_022196	AATTAA	2	12	2016674	2016685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022196	ATTTTT	2	12	2020590	2020601	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022196	TATAAA	2	12	2113778	2113789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022196	TAAAAA	2	12	2124940	2124951	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022196	ATGTAT	2	12	2133555	2133566	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022196	AATATA	2	12	2133606	2133617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_022196	TAAAAA	2	12	2147977	2147988	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_022196	TAAATC	2	12	2150789	2150800	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_022196	TTTTAT	2	12	2166145	2166156	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022196	TAATTT	2	12	2169923	2169934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022196	ACTTTT	2	12	2176629	2176640	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_022196	TAATAT	2	12	2178602	2178613	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_022196	TATTTT	2	12	2211565	2211576	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_022196	AATATT	2	12	2243937	2243948	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022196	TCAAAA	2	12	2244880	2244891	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_022196	ATAGTT	2	12	2246000	2246011	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022196	TATTTT	2	12	2267909	2267920	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.