MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Fusobacterium nucleatum subsp. vincentii 3_1_36A2

Total Repeats: 377

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022196	TATAT	2	10	20272	20281	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022196	TTAAA	2	10	20332	20341	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022196	ATAAA	2	10	31273	31282	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022196	TTTCT	2	10	37167	37176	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_022196	AAAAT	2	10	39015	39024	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022196	AATTA	2	10	50353	50362	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022196	TATAA	2	10	62470	62479	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022196	AATTT	2	10	66994	67003	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022196	TAATT	2	10	74479	74488	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022196	TAAAA	2	10	80588	80597	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022196	TTAAA	2	10	81147	81156	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022196	TCGTG	2	10	82231	82240	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
13	NC_022196	TCTAT	2	10	82724	82733	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_022196	AAATT	2	10	85994	86003	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022196	TATTT	2	10	86062	86071	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022196	GCTCA	2	10	113030	113039	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
17	NC_022196	ATTAA	2	10	116139	116148	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022196	CTTTA	2	10	120427	120436	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_022196	TAAAA	2	10	120535	120544	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022196	TGAAA	2	10	124389	124398	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022196	TAAAA	2	10	127255	127264	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022196	GTATA	2	10	131492	131501	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022196	TATAG	2	10	131617	131626	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022196	AAATT	2	10	140770	140779	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022196	ATATA	2	10	141892	141901	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022196	AAAAT	2	10	152229	152238	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022196	AATTA	2	10	152390	152399	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022196	ATTTT	2	10	160675	160684	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022196	AAATA	2	10	161927	161936	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022196	AAATA	2	10	165013	165022	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022196	AAGGA	2	10	170209	170218	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022196	TTAAA	2	10	170268	170277	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022196	TCGTG	2	10	171352	171361	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
34	NC_022196	TCTAT	2	10	171845	171854	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_022196	TTTTG	2	10	186707	186716	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022196	AAAAT	2	10	204765	204774	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022196	AAGTG	2	10	205085	205094	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022196	TAAAA	2	10	219599	219608	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022196	CTTTT	2	10	220184	220193	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_022196	AAAAT	2	10	230645	230654	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022196	ATTTA	2	10	231577	231586	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022196	AAATT	2	10	258009	258018	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022196	TTAAA	2	10	270883	270892	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022196	TAAAT	2	10	271025	271034	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022196	TATAT	2	10	286751	286760	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022196	AAATA	2	10	292243	292252	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022196	AGTAA	2	10	296549	296558	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022196	TTTTA	2	10	297307	297316	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022196	TAATA	2	10	297901	297910	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022196	TAAAT	2	10	298989	298998	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022196	ATTTA	2	10	298999	299008	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022196	ATTTT	2	10	312347	312356	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022196	AATAA	2	10	316653	316662	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022196	TTTCA	2	10	316822	316831	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_022196	ATTTT	2	10	317458	317467	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022196	TAAAG	2	10	319088	319097	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022196	AATCT	2	10	342423	342432	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_022196	AGTAG	2	10	350998	351007	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022196	ATAAA	2	10	352557	352566	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022196	ATTAA	2	10	367880	367889	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022196	ATAAA	2	10	368693	368702	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022196	TAAGT	2	10	369825	369834	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022196	ATTAA	2	10	369878	369887	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022196	TATAA	2	10	370338	370347	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022196	AATTA	2	10	371932	371941	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022196	CAAAA	2	10	389028	389037	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_022196	TAGCT	2	10	390190	390199	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
68	NC_022196	AGATA	2	10	391928	391937	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022196	TAAAA	2	10	396951	396960	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022196	TCTTT	2	10	411363	411372	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_022196	TTATA	2	10	432524	432533	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022196	TAAAA	2	10	439150	439159	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022196	AAAAG	2	10	458517	458526	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022196	AATTT	2	10	483189	483198	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022196	GATAT	2	10	485816	485825	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022196	AATTA	2	10	491808	491817	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022196	AATTA	2	10	494978	494987	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022196	TAAAA	2	10	498925	498934	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022196	GGTTG	2	10	513613	513622	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022196	AAGGA	2	10	518596	518605	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022196	TTTTC	2	10	523256	523265	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_022196	TAATA	2	10	523294	523303	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022196	AAAAT	2	10	523887	523896	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022196	AAAGA	2	10	523938	523947	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022196	TAATG	2	10	528322	528331	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022196	ATTTA	2	10	540042	540051	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022196	TAAAA	2	10	556612	556621	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022196	AGAAC	2	10	557723	557732	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
89	NC_022196	ATTTT	2	10	557870	557879	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022196	TAAAA	2	10	557888	557897	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_022196	TAATA	2	10	567689	567698	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_022196	TTATT	2	10	572678	572687	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_022196	CTTTT	2	10	580903	580912	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_022196	ATTAT	2	10	584557	584566	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022196	ACTTT	2	10	590984	590993	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_022196	TTAAT	2	10	597294	597303	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_022196	TTTTA	2	10	598757	598766	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022196	TAATA	2	10	599843	599852	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_022196	AAGGA	2	10	602980	602989	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022196	TTAAA	2	10	603039	603048	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022196	TCGTG	2	10	604123	604132	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
102	NC_022196	TCTAT	2	10	604616	604625	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_022196	TTTTA	2	10	616688	616697	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022196	TTTTA	2	10	628433	628442	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_022196	ATAAA	2	10	639213	639222	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_022196	ATAAA	2	10	646199	646208	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022196	AAATG	2	10	652209	652218	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022196	AATAA	2	10	652258	652267	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022196	ATCAA	2	10	652270	652279	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_022196	ATTTA	2	10	660087	660096	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_022196	TAAAA	2	10	669379	669388	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_022196	ATATT	2	10	670956	670965	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022196	TAAAA	2	10	670976	670985	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022196	ATTTT	2	10	672101	672110	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022196	ATTTT	2	10	683887	683896	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_022196	TTTAT	2	10	684226	684235	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_022196	AATTA	2	10	685733	685742	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_022196	ATAAA	2	10	690308	690317	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_022196	AGTAG	2	10	691116	691125	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
120	NC_022196	AATTA	2	10	703372	703381	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022196	TAAAA	2	10	703471	703480	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_022196	AAGGA	2	10	703559	703568	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
123	NC_022196	TTAAA	2	10	703618	703627	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_022196	TCGTG	2	10	704701	704710	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
125	NC_022196	TCTAT	2	10	705194	705203	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_022196	TATAA	2	10	714466	714475	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_022196	TTTAT	2	10	720525	720534	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_022196	TAATT	2	10	720558	720567	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_022196	ATTAA	2	10	721204	721213	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_022196	TTAAA	2	10	734981	734990	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_022196	TAAAA	2	10	736886	736895	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_022196	TATAA	2	10	741369	741378	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_022196	AAAAG	2	10	750883	750892	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_022196	AAATA	2	10	750953	750962	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_022196	ATTTT	2	10	756755	756764	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_022196	AAAAG	2	10	758100	758109	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_022196	TTAAT	2	10	765175	765184	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_022196	ATTTT	2	10	769573	769582	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_022196	TAAAA	2	10	775357	775366	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_022196	AAATA	2	10	776271	776280	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_022196	TAAAT	2	10	778745	778754	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_022196	ATTTT	2	10	779341	779350	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_022196	AGTTT	2	10	818833	818842	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_022196	AAAAT	2	10	820078	820087	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_022196	TAAAA	2	10	826429	826438	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_022196	TTTTA	2	10	844978	844987	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_022196	TTATT	2	10	854884	854893	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_022196	AATTT	2	10	858968	858977	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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150	NC_022196	TTATT	2	10	870622	870631	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_022196	AGGTA	2	10	872336	872345	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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157	NC_022196	AAATT	2	10	904225	904234	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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165	NC_022196	ATATT	2	10	966530	966539	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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173	NC_022196	AAAAT	2	10	1003505	1003514	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.