MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Campylobacter coli 76339

Total Repeats: 65

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022132	TAAAAA	2	12	542	553	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022132	TATTTT	2	12	11538	11549	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022132	TTTTAT	2	12	54837	54848	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022132	AATTAA	2	12	86126	86137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022132	AATTAA	2	12	166432	166443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022132	AATATT	2	12	219896	219907	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022132	TAATAT	2	12	220037	220048	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022132	TTTAAT	2	12	251657	251668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022132	TGGGGT	2	12	281994	282005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022132	AGAAAA	2	12	286731	286742	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022132	TAAAAA	2	12	328895	328906	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022132	GTAAGT	2	12	331045	331056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022132	TAAACT	2	12	356954	356965	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_022132	TATTTT	2	12	362729	362740	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022132	ATATTT	2	12	374140	374151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022132	TTTTTA	2	12	377595	377606	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022132	ATTTTT	2	12	385171	385182	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022132	ATTTTA	2	12	399264	399275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022132	AAAAGT	2	12	401930	401941	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022132	ATTTTT	2	12	417981	417992	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022132	TTTATT	2	12	427570	427581	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022132	TAAAAT	2	12	427629	427640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022132	ATTTTG	2	12	447022	447033	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022132	AAATAA	2	12	447034	447045	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022132	AATAAA	2	12	481299	481310	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022132	TTTAAG	2	12	487239	487250	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022132	ATAAAA	2	12	510261	510272	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022132	ATAAAT	2	12	522134	522145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022132	TAATTT	2	12	596660	596671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022132	AAGTAT	2	12	655429	655440	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022132	ATTTTT	2	12	712143	712154	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022132	AAATTA	2	12	731785	731796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022132	TAAAAA	2	12	736824	736835	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022132	GATAAA	2	12	736924	736935	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022132	ATTATA	2	12	776844	776855	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022132	TATAAA	2	12	818848	818859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022132	ATTTTA	2	12	837024	837035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022132	TGAAGT	2	12	876610	876621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022132	AAATCA	2	12	901910	901921	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_022132	TATTTT	2	12	1019098	1019109	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022132	TTTAAT	2	12	1054159	1054170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022132	ATTTTA	2	12	1067218	1067229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022132	AATTTT	2	12	1108545	1108556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022132	TTTTAA	2	12	1114374	1114385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022132	TATAAT	2	12	1114466	1114477	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022132	TTTAAA	2	12	1147832	1147843	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022132	TAAATT	2	12	1152262	1152273	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022132	TTTATA	2	12	1152386	1152397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022132	ATCTTA	2	12	1192043	1192054	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_022132	TTTTAA	2	12	1194934	1194945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022132	ATTATA	2	12	1195236	1195247	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022132	TTTTTA	2	12	1210269	1210280	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022132	TATAAT	2	12	1246083	1246094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022132	TATAAA	2	12	1307463	1307474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022132	AAAAAT	2	12	1309942	1309953	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022132	TAAAAA	2	12	1317392	1317403	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022132	TAAAAA	2	12	1337899	1337910	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022132	TAAATT	2	12	1346638	1346649	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022132	ATAAAA	2	12	1350236	1350247	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022132	TTTTAT	2	12	1360379	1360390	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022132	AAATTT	2	12	1446480	1446491	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022132	TATAAT	2	12	1461928	1461939	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022132	ATATTT	2	12	1513193	1513204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022132	TTATAA	2	12	1566445	1566456	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022132	AAAACA	2	12	1579387	1579398	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.