MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Campylobacter coli 76339

Total Repeats: 183

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022132	AACAA	2	10	692	701	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_022132	TAAAA	2	10	4608	4617	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022132	TTTCT	2	10	4711	4720	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_022132	TTAAT	2	10	4779	4788	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022132	ATTTT	2	10	11516	11525	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022132	TCTTA	2	10	19901	19910	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_022132	ACTTT	2	10	32786	32795	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_022132	TAAAA	2	10	52253	52262	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022132	TTATA	2	10	60868	60877	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022132	TATTT	2	10	67500	67509	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022132	ATAAA	2	10	70835	70844	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022132	TAAAA	2	10	76222	76231	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022132	GATAG	2	10	76526	76535	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022132	TTAGT	2	10	100670	100679	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022132	GTAAA	2	10	120324	120333	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022132	ATTTT	2	10	123678	123687	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022132	AAAAT	2	10	140724	140733	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022132	TAATC	2	10	146150	146159	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_022132	ATTTT	2	10	148059	148068	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022132	TTTAA	2	10	151308	151317	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022132	ATCAA	2	10	153146	153155	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_022132	TGATT	2	10	153796	153805	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022132	ATTTT	2	10	160696	160705	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022132	CTTTC	2	10	164381	164390	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
25	NC_022132	AAAAG	2	10	164414	164423	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022132	TAAAA	2	10	189627	189636	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022132	ATTTT	2	10	194786	194795	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022132	ATTTT	2	10	201983	201992	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022132	TTTAA	2	10	212415	212424	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022132	TAAAA	2	10	214784	214793	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022132	TTAAT	2	10	220062	220071	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022132	TAAAA	2	10	225961	225970	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022132	TTAAA	2	10	245320	245329	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022132	TCTTA	2	10	285296	285305	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_022132	TCAAA	2	10	286106	286115	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_022132	AAAAT	2	10	290835	290844	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022132	ATTTT	2	10	322833	322842	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022132	TAATT	2	10	323147	323156	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022132	TTGAA	2	10	328978	328987	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022132	CAAAA	2	10	329074	329083	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_022132	ATATT	2	10	331683	331692	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022132	ATTTT	2	10	343297	343306	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022132	AATTA	2	10	357549	357558	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022132	TTTTA	2	10	357709	357718	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022132	ATTTT	2	10	358987	358996	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022132	AAGTC	2	10	359266	359275	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_022132	AAATT	2	10	362763	362772	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022132	TAAAA	2	10	374239	374248	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022132	TTATT	2	10	374251	374260	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022132	TTATA	2	10	374286	374295	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022132	TCGTG	2	10	378702	378711	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
52	NC_022132	TCTTT	2	10	379638	379647	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_022132	TAAGA	2	10	379799	379808	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022132	GACTT	2	10	381058	381067	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_022132	CCGTA	2	10	381498	381507	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
56	NC_022132	GTTTG	2	10	383175	383184	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022132	TTTTA	2	10	383187	383196	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022132	TTCTT	2	10	383424	383433	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_022132	AAGCT	2	10	394768	394777	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_022132	TTTTG	2	10	421334	421343	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022132	TTATT	2	10	422831	422840	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022132	AAAAT	2	10	425789	425798	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022132	AATTT	2	10	431701	431710	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022132	TTTAA	2	10	454545	454554	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022132	ATTTT	2	10	454601	454610	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022132	TGATT	2	10	481268	481277	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022132	TTCAC	2	10	482168	482177	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
68	NC_022132	TAAAA	2	10	482769	482778	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022132	GTCTT	2	10	496659	496668	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_022132	TTGAT	2	10	542748	542757	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022132	TATAA	2	10	551447	551456	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022132	AAATT	2	10	561503	561512	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022132	TTTAT	2	10	564117	564126	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022132	ATAAA	2	10	572554	572563	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022132	TAAAA	2	10	581121	581130	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022132	AATTT	2	10	581706	581715	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022132	GTTTT	2	10	590987	590996	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022132	AAATG	2	10	596597	596606	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022132	GGTTT	2	10	598202	598211	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022132	TTTTA	2	10	599997	600006	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022132	ATTTG	2	10	605188	605197	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022132	TATAA	2	10	613534	613543	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022132	TTTTC	2	10	684056	684065	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_022132	ATTAT	2	10	702942	702951	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022132	TAAAA	2	10	709486	709495	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022132	GTGAA	2	10	737821	737830	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022132	AATTT	2	10	737854	737863	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022132	AAAAT	2	10	741620	741629	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022132	TAAAA	2	10	741637	741646	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022132	TTAAT	2	10	770717	770726	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_022132	ATTTT	2	10	791936	791945	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_022132	ATTTT	2	10	800708	800717	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_022132	TTAAA	2	10	800729	800738	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_022132	ATTTT	2	10	822771	822780	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022132	TTGTT	2	10	844329	844338	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022132	TTTAT	2	10	848428	848437	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_022132	TTTAG	2	10	857786	857795	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022132	AATAT	2	10	870616	870625	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_022132	ATAAA	2	10	885465	885474	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022132	ATAAA	2	10	890647	890656	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022132	TTTAT	2	10	898848	898857	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022132	TAAAA	2	10	898881	898890	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022132	ATCAT	2	10	910131	910140	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_022132	CTTTG	2	10	913107	913116	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
105	NC_022132	ATTAT	2	10	924061	924070	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_022132	TTAAG	2	10	953581	953590	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022132	AAATT	2	10	962238	962247	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022132	TTATT	2	10	964752	964761	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022132	ATTTT	2	10	988950	988959	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022132	TAAAG	2	10	1035419	1035428	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_022132	AAATT	2	10	1078537	1078546	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_022132	TAAAA	2	10	1087320	1087329	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022132	ATAAA	2	10	1095684	1095693	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022132	TAATA	2	10	1110165	1110174	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022132	TAAAA	2	10	1114343	1114352	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_022132	ATTTG	2	10	1114559	1114568	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_022132	ATTTT	2	10	1134623	1134632	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_022132	TAAAA	2	10	1134642	1134651	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_022132	TTATT	2	10	1147815	1147824	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_022132	ATTTT	2	10	1147855	1147864	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022132	AAATA	2	10	1152561	1152570	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_022132	ATTTT	2	10	1152682	1152691	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_022132	TAAAT	2	10	1154224	1154233	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_022132	AAAAT	2	10	1168452	1168461	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022132	AAATT	2	10	1169422	1169431	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_022132	AGTGT	2	10	1180671	1180680	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
127	NC_022132	TACTT	2	10	1182756	1182765	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_022132	TATTT	2	10	1184378	1184387	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_022132	ATTTA	2	10	1184403	1184412	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_022132	ATTTT	2	10	1192088	1192097	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_022132	TATAA	2	10	1195093	1195102	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_022132	ATTAA	2	10	1195106	1195115	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_022132	ATTTA	2	10	1195297	1195306	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_022132	ATTTT	2	10	1219187	1219196	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_022132	ATTTA	2	10	1219423	1219432	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_022132	ATTTT	2	10	1219634	1219643	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_022132	GATTT	2	10	1221170	1221179	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_022132	CTAAA	2	10	1240459	1240468	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_022132	TTATT	2	10	1242117	1242126	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_022132	AAATT	2	10	1247138	1247147	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_022132	AAAAT	2	10	1277139	1277148	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_022132	AAAAT	3	15	1277242	1277256	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_022132	AATTT	2	10	1286533	1286542	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_022132	TAAAA	2	10	1289135	1289144	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_022132	TTATT	2	10	1309966	1309975	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_022132	AGACT	2	10	1311011	1311020	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
147	NC_022132	ACCAA	2	10	1311052	1311061	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
148	NC_022132	CAATA	2	10	1311063	1311072	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
149	NC_022132	TACGG	2	10	1313487	1313496	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
150	NC_022132	AAGTC	2	10	1313927	1313936	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
151	NC_022132	TCTTA	2	10	1315189	1315198	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
152	NC_022132	AAAGA	2	10	1315351	1315360	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
153	NC_022132	CACGA	2	10	1316287	1316296	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
154	NC_022132	AACAA	2	10	1317542	1317551	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
155	NC_022132	TAAAA	2	10	1323812	1323821	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_022132	ATTTT	2	10	1346588	1346597	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_022132	TTTAA	2	10	1348501	1348510	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_022132	AAATT	2	10	1356802	1356811	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_022132	TTTAG	2	10	1363638	1363647	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
160	NC_022132	TAAAA	2	10	1364458	1364467	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_022132	TAAAA	2	10	1371712	1371721	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_022132	ATTTT	2	10	1384279	1384288	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_022132	AATTT	2	10	1386156	1386165	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_022132	ATTTT	2	10	1400484	1400493	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_022132	TCTTA	2	10	1422800	1422809	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
166	NC_022132	AGATA	2	10	1463082	1463091	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
167	NC_022132	AATTA	2	10	1463230	1463239	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_022132	TAAAA	2	10	1463455	1463464	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_022132	AAAAC	2	10	1477617	1477626	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
170	NC_022132	ATTTT	2	10	1496776	1496785	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_022132	TAAAA	2	10	1524535	1524544	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_022132	TAAAA	2	10	1526966	1526975	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_022132	CTAAA	2	10	1526984	1526993	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
174	NC_022132	CTTTT	2	10	1558825	1558834	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
175	NC_022132	TAAAA	2	10	1565990	1565999	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_022132	AAATT	2	10	1575114	1575123	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
177	NC_022132	ACCAA	2	10	1579310	1579319	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
178	NC_022132	CAATA	2	10	1579321	1579330	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
179	NC_022132	TACGG	2	10	1580997	1581006	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
180	NC_022132	AAGTC	2	10	1581437	1581446	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
181	NC_022132	TCTTA	2	10	1582702	1582711	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
182	NC_022132	AAAGA	2	10	1582865	1582874	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
183	NC_022132	CACGA	2	10	1583802	1583811	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.