MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori SouthAfrica20

Total Repeats: 75

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022130	AAAAAG	2	12	23173	23184	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022130	TTTCAA	2	12	44130	44141	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_022130	ACCATT	2	12	44634	44645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_022130	TAAAGA	2	12	62476	62487	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022130	AGAAAA	2	12	62521	62532	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022130	ATGATA	2	12	131257	131268	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022130	TTATTC	2	12	134732	134743	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_022130	TTGTTT	2	12	156782	156793	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022130	TAAAAA	2	12	171981	171992	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022130	TTCTTT	2	12	179465	179476	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_022130	AAATAG	2	12	191146	191157	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022130	TTTTTA	2	12	204794	204805	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022130	CTTGAT	2	12	216708	216719	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_022130	ATTAAA	2	12	230467	230478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022130	CCCTAA	2	12	232179	232190	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_022130	TGTTTT	2	12	313861	313872	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022130	AGCGTT	2	12	326817	326828	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_022130	AAAAAG	2	12	329879	329890	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022130	TAAAAA	2	12	451614	451625	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022130	CTAAAG	2	12	479196	479207	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_022130	TTTAAA	2	12	489326	489337	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022130	CTTTTT	2	12	506742	506753	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_022130	ATTTTA	2	12	554662	554673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022130	AAAATC	2	12	561723	561734	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_022130	AATTTC	2	12	585767	585778	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_022130	CATAGC	2	12	631220	631231	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_022130	TTGAAT	2	12	675798	675809	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022130	TTAGAT	2	12	703318	703329	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022130	AGGAAA	2	12	718782	718793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022130	TATCGC	2	12	728607	728618	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_022130	GTGTTG	2	12	745750	745761	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022130	TCCAAA	2	12	753941	753952	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_022130	TCTTTT	2	12	754337	754348	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_022130	AATTAT	2	12	767100	767111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022130	AATATC	2	12	791193	791204	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_022130	TTTGTT	2	12	825079	825090	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022130	ATTTTT	2	12	860875	860886	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022130	ATTAAA	2	12	880743	880754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022130	TTTTTG	2	12	906508	906519	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022130	ATTCTA	2	12	932168	932179	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_022130	ATTGAT	2	12	942842	942853	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022130	GAAAAA	2	12	943372	943383	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022130	TGAGCG	2	12	1038570	1038581	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_022130	CATAGC	2	12	1039346	1039357	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_022130	TTTTTC	2	12	1060668	1060679	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_022130	TCAAAT	2	12	1135317	1135328	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_022130	GTTTGT	2	12	1144259	1144270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022130	TTTCAT	2	12	1151872	1151883	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_022130	TCAAGC	2	12	1151927	1151938	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_022130	AAAACC	2	12	1152378	1152389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_022130	TTCTTT	2	12	1154864	1154875	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_022130	ACTTCC	2	12	1208907	1208918	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_022130	CATATA	2	12	1216609	1216620	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_022130	AAATAT	2	12	1218156	1218167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022130	AAATTC	2	12	1236495	1236506	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_022130	CCCTAA	2	12	1237376	1237387	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_022130	AAAAAG	2	12	1260344	1260355	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022130	AAGGCG	2	12	1273010	1273021	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_022130	AAACTA	2	12	1273851	1273862	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_022130	ACAGAA	2	12	1294952	1294963	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_022130	AAGAGC	2	12	1329674	1329685	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_022130	TCTTAG	2	12	1366706	1366717	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_022130	AAAAAT	2	12	1366840	1366851	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022130	GATTAG	2	12	1367073	1367084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022130	TGATGG	2	12	1367246	1367257	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022130	AATTTC	2	12	1373402	1373413	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_022130	TCGCAT	2	12	1378520	1378531	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_022130	AAAACC	2	12	1381095	1381106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_022130	GGCACA	2	12	1384413	1384424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_022130	CCCAAA	3	18	1392199	1392216	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_022130	TTCAAT	2	12	1407009	1407020	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_022130	AATTTC	2	12	1485669	1485680	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_022130	ATCAAT	2	12	1515602	1515613	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_022130	AAAAGA	2	12	1563213	1563224	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022130	TGAAAA	2	12	1570040	1570051	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.