MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter pylori SouthAfrica20

Total Repeats: 1149

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022130	TAAAA	2	10	1601	1610	80 %	20 %	0 %	0 %	532530470
2	NC_022130	GCTCG	2	10	5872	5881	0 %	20 %	40 %	40 %	532530477
3	NC_022130	TTTGA	2	10	6056	6065	20 %	60 %	20 %	0 %	532530477
4	NC_022130	TTTTA	2	10	7329	7338	20 %	80 %	0 %	0 %	532530478
5	NC_022130	GCCGC	2	10	7868	7877	0 %	0 %	40 %	60 %	532530479
6	NC_022130	TTTCT	2	10	8259	8268	0 %	80 %	0 %	20 %	532530479
7	NC_022130	AATTT	2	10	9098	9107	40 %	60 %	0 %	0 %	532530479
8	NC_022130	TGCCA	2	10	11720	11729	20 %	20 %	20 %	40 %	532530483
9	NC_022130	TTTTG	2	10	11776	11785	0 %	80 %	20 %	0 %	532530483
10	NC_022130	AAAGA	2	10	11820	11829	80 %	0 %	20 %	0 %	532530483
11	NC_022130	TGGTG	2	10	12614	12623	0 %	40 %	60 %	0 %	532530484
12	NC_022130	CAAAA	2	10	18472	18481	80 %	0 %	0 %	20 %	532530490
13	NC_022130	CGGAT	2	10	18587	18596	20 %	20 %	40 %	20 %	532530490
14	NC_022130	TGAAA	2	10	20827	20836	60 %	20 %	20 %	0 %	532530492
15	NC_022130	CCATG	2	10	23538	23547	20 %	20 %	20 %	40 %	532530494
16	NC_022130	TTGAT	2	10	24239	24248	20 %	60 %	20 %	0 %	532530494
17	NC_022130	GATCG	2	10	25306	25315	20 %	20 %	40 %	20 %	532530494
18	NC_022130	ATTTC	2	10	25986	25995	20 %	60 %	0 %	20 %	532530495
19	NC_022130	CAAGC	2	10	28158	28167	40 %	0 %	20 %	40 %	532530496
20	NC_022130	AAATG	2	10	29757	29766	60 %	20 %	20 %	0 %	532530498
21	NC_022130	TGAAA	2	10	30300	30309	60 %	20 %	20 %	0 %	532530499
22	NC_022130	TTTTA	2	10	30645	30654	20 %	80 %	0 %	0 %	532530499
23	NC_022130	TTATC	2	10	31301	31310	20 %	60 %	0 %	20 %	532530499
24	NC_022130	TGATT	2	10	32095	32104	20 %	60 %	20 %	0 %	532530500
25	NC_022130	GATAA	2	10	32513	32522	60 %	20 %	20 %	0 %	532530501
26	NC_022130	GTGGG	2	10	33972	33981	0 %	20 %	80 %	0 %	532530502
27	NC_022130	TGGGG	2	10	35223	35232	0 %	20 %	80 %	0 %	532530504
28	NC_022130	ATTTT	2	10	36753	36762	20 %	80 %	0 %	0 %	532530506
29	NC_022130	ATGAA	2	10	37527	37536	60 %	20 %	20 %	0 %	532530507
30	NC_022130	CAATG	2	10	38951	38960	40 %	20 %	20 %	20 %	532530509
31	NC_022130	AGTAA	2	10	42501	42510	60 %	20 %	20 %	0 %	532530513
32	NC_022130	TAAAA	2	10	45560	45569	80 %	20 %	0 %	0 %	532530515
33	NC_022130	CTAAA	2	10	46269	46278	60 %	20 %	0 %	20 %	532530516
34	NC_022130	TCCCA	2	10	46572	46581	20 %	20 %	0 %	60 %	532530516
35	NC_022130	GCTCC	2	10	46893	46902	0 %	20 %	20 %	60 %	532530516
36	NC_022130	AAAAT	2	10	47072	47081	80 %	20 %	0 %	0 %	532530516
37	NC_022130	CAAAG	2	10	47443	47452	60 %	0 %	20 %	20 %	532530516
38	NC_022130	TAATA	2	10	48998	49007	60 %	40 %	0 %	0 %	532530517
39	NC_022130	ATTGG	2	10	50257	50266	20 %	40 %	40 %	0 %	532530519
40	NC_022130	TAAAA	2	10	51379	51388	80 %	20 %	0 %	0 %	532530521
41	NC_022130	TTGCG	2	10	51720	51729	0 %	40 %	40 %	20 %	532530521
42	NC_022130	TTTGA	2	10	52052	52061	20 %	60 %	20 %	0 %	532530521
43	NC_022130	CCAAA	2	10	53567	53576	60 %	0 %	0 %	40 %	532530524
44	NC_022130	CTTTT	2	10	53740	53749	0 %	80 %	0 %	20 %	532530525
45	NC_022130	TAAAA	2	10	55617	55626	80 %	20 %	0 %	0 %	532530525
46	NC_022130	TGAAA	2	10	56375	56384	60 %	20 %	20 %	0 %	532530526
47	NC_022130	AAATT	2	10	56631	56640	60 %	40 %	0 %	0 %	532530526
48	NC_022130	AAAGG	2	10	56846	56855	60 %	0 %	40 %	0 %	532530526
49	NC_022130	CGCTT	2	10	58177	58186	0 %	40 %	20 %	40 %	532530527
50	NC_022130	TAAAA	2	10	59665	59674	80 %	20 %	0 %	0 %	532530527
51	NC_022130	CAACA	2	10	60034	60043	60 %	0 %	0 %	40 %	532530527
52	NC_022130	TCAAA	2	10	60381	60390	60 %	20 %	0 %	20 %	532530527
53	NC_022130	TGTTT	2	10	63154	63163	0 %	80 %	20 %	0 %	532530530
54	NC_022130	TATCC	2	10	65591	65600	20 %	40 %	0 %	40 %	532530532
55	NC_022130	GGAAG	2	10	66714	66723	40 %	0 %	60 %	0 %	532530532
56	NC_022130	GATAC	2	10	66816	66825	40 %	20 %	20 %	20 %	532530532
57	NC_022130	GAATG	2	10	68206	68215	40 %	20 %	40 %	0 %	532530535
58	NC_022130	TGGAT	2	10	68583	68592	20 %	40 %	40 %	0 %	532530535
59	NC_022130	GGTGG	2	10	71395	71404	0 %	20 %	80 %	0 %	532530538
60	NC_022130	AATGC	2	10	72230	72239	40 %	20 %	20 %	20 %	532530538
61	NC_022130	CGAAG	2	10	72538	72547	40 %	0 %	40 %	20 %	532530538
62	NC_022130	TGGGT	2	10	74905	74914	0 %	40 %	60 %	0 %	532530541
63	NC_022130	TATTT	2	10	75379	75388	20 %	80 %	0 %	0 %	532530542
64	NC_022130	CTTCT	2	10	75692	75701	0 %	60 %	0 %	40 %	532530542
65	NC_022130	TCCAA	2	10	76181	76190	40 %	20 %	0 %	40 %	532530543
66	NC_022130	CATCA	2	10	78892	78901	40 %	20 %	0 %	40 %	532530546
67	NC_022130	TTTTG	2	10	79458	79467	0 %	80 %	20 %	0 %	532530547
68	NC_022130	AAATC	2	10	79550	79559	60 %	20 %	0 %	20 %	532530547
69	NC_022130	ACGCC	2	10	79764	79773	20 %	0 %	20 %	60 %	532530547
70	NC_022130	AAAGC	2	10	80530	80539	60 %	0 %	20 %	20 %	532530548
71	NC_022130	ATTGT	2	10	83247	83256	20 %	60 %	20 %	0 %	532530551
72	NC_022130	ATCTT	2	10	88705	88714	20 %	60 %	0 %	20 %	532530555
73	NC_022130	TTTTG	2	10	88775	88784	0 %	80 %	20 %	0 %	532530555
74	NC_022130	ATGCC	2	10	89660	89669	20 %	20 %	20 %	40 %	532530556
75	NC_022130	TTGAT	2	10	90731	90740	20 %	60 %	20 %	0 %	532530559
76	NC_022130	GGCGT	2	10	92540	92549	0 %	20 %	60 %	20 %	532530561
77	NC_022130	AAAAT	2	10	93623	93632	80 %	20 %	0 %	0 %	532530561
78	NC_022130	AAAAT	2	10	96030	96039	80 %	20 %	0 %	0 %	532530563
79	NC_022130	AAATT	2	10	97072	97081	60 %	40 %	0 %	0 %	532530565
80	NC_022130	TGATT	2	10	99321	99330	20 %	60 %	20 %	0 %	532530567
81	NC_022130	TTTCC	2	10	105849	105858	0 %	60 %	0 %	40 %	532530576
82	NC_022130	TTTTC	2	10	110014	110023	0 %	80 %	0 %	20 %	532530579
83	NC_022130	ATGGA	2	10	115354	115363	40 %	20 %	40 %	0 %	532530586
84	NC_022130	CAAAT	2	10	116585	116594	60 %	20 %	0 %	20 %	532530587
85	NC_022130	ATGCC	2	10	118143	118152	20 %	20 %	20 %	40 %	532530588
86	NC_022130	AACAA	2	10	118988	118997	80 %	0 %	0 %	20 %	532530589
87	NC_022130	TGATT	2	10	120117	120126	20 %	60 %	20 %	0 %	532530590
88	NC_022130	CTAAA	2	10	120586	120595	60 %	20 %	0 %	20 %	532530592
89	NC_022130	AACTT	2	10	123920	123929	40 %	40 %	0 %	20 %	532530593
90	NC_022130	TTGAT	2	10	128391	128400	20 %	60 %	20 %	0 %	532530597
91	NC_022130	TTTGA	2	10	129625	129634	20 %	60 %	20 %	0 %	532530598
92	NC_022130	GACTT	2	10	130158	130167	20 %	40 %	20 %	20 %	532530599
93	NC_022130	ATCTC	2	10	130909	130918	20 %	40 %	0 %	40 %	532530599
94	NC_022130	TGCGT	2	10	133450	133459	0 %	40 %	40 %	20 %	532530602
95	NC_022130	GAAAA	2	10	133611	133620	80 %	0 %	20 %	0 %	532530602
96	NC_022130	AAATC	2	10	139642	139651	60 %	20 %	0 %	20 %	532530610
97	NC_022130	AAAAT	2	10	141114	141123	80 %	20 %	0 %	0 %	532530611
98	NC_022130	AAAAT	2	10	143133	143142	80 %	20 %	0 %	0 %	532530613
99	NC_022130	TTTTC	2	10	143840	143849	0 %	80 %	0 %	20 %	532530615
100	NC_022130	TTCTT	2	10	145796	145805	0 %	80 %	0 %	20 %	532530617
101	NC_022130	TCTTT	2	10	146285	146294	0 %	80 %	0 %	20 %	532530618
102	NC_022130	ACTTG	2	10	146498	146507	20 %	40 %	20 %	20 %	532530618
103	NC_022130	TTTTG	2	10	147449	147458	0 %	80 %	20 %	0 %	532530619
104	NC_022130	CGTGG	2	10	147967	147976	0 %	20 %	60 %	20 %	532530619
105	NC_022130	GCGAT	2	10	148242	148251	20 %	20 %	40 %	20 %	532530619
106	NC_022130	GCTTG	2	10	148498	148507	0 %	40 %	40 %	20 %	532530619
107	NC_022130	TTTTG	2	10	149148	149157	0 %	80 %	20 %	0 %	532530620
108	NC_022130	GGCTT	2	10	150087	150096	0 %	40 %	40 %	20 %	532530620
109	NC_022130	GCAAG	2	10	152334	152343	40 %	0 %	40 %	20 %	532530623
110	NC_022130	ACGCC	2	10	154640	154649	20 %	0 %	20 %	60 %	532530624
111	NC_022130	TGACA	2	10	156960	156969	40 %	20 %	20 %	20 %	532530629
112	NC_022130	ATTTG	2	10	157871	157880	20 %	60 %	20 %	0 %	532530630
113	NC_022130	AAAAC	2	10	160768	160777	80 %	0 %	0 %	20 %	532530633
114	NC_022130	GCAAA	2	10	162606	162615	60 %	0 %	20 %	20 %	532530635
115	NC_022130	AAGCC	2	10	164004	164013	40 %	0 %	20 %	40 %	532530638
116	NC_022130	ATTCA	2	10	168199	168208	40 %	40 %	0 %	20 %	532530643
117	NC_022130	ATCTT	2	10	171606	171615	20 %	60 %	0 %	20 %	532530646
118	NC_022130	AAAGC	2	10	174053	174062	60 %	0 %	20 %	20 %	532530650
119	NC_022130	CGCAC	2	10	179916	179925	20 %	0 %	20 %	60 %	532530656
120	NC_022130	TATCA	2	10	180393	180402	40 %	40 %	0 %	20 %	532530656
121	NC_022130	ATTTG	2	10	181400	181409	20 %	60 %	20 %	0 %	532530657
122	NC_022130	GGTGA	2	10	182025	182034	20 %	20 %	60 %	0 %	532530658
123	NC_022130	AAATG	2	10	182812	182821	60 %	20 %	20 %	0 %	532530659
124	NC_022130	TGTAA	2	10	183601	183610	40 %	40 %	20 %	0 %	532530660
125	NC_022130	ATCTA	2	10	184968	184977	40 %	40 %	0 %	20 %	532530661
126	NC_022130	AATAA	2	10	185096	185105	80 %	20 %	0 %	0 %	532530661
127	NC_022130	AAAAG	2	10	186236	186245	80 %	0 %	20 %	0 %	532530662
128	NC_022130	ACCCA	2	10	186296	186305	40 %	0 %	0 %	60 %	532530662
129	NC_022130	CTTTC	2	10	186692	186701	0 %	60 %	0 %	40 %	532530663
130	NC_022130	ATTCA	2	10	192913	192922	40 %	40 %	0 %	20 %	532530670
131	NC_022130	TATTG	2	10	198193	198202	20 %	60 %	20 %	0 %	532530674
132	NC_022130	TCATT	2	10	198524	198533	20 %	60 %	0 %	20 %	532530674
133	NC_022130	CTATT	2	10	199415	199424	20 %	60 %	0 %	20 %	532530676
134	NC_022130	TTTTC	2	10	200475	200484	0 %	80 %	0 %	20 %	532530677
135	NC_022130	TGCGA	2	10	202276	202285	20 %	20 %	40 %	20 %	532530679
136	NC_022130	ATTTG	2	10	206541	206550	20 %	60 %	20 %	0 %	532530685
137	NC_022130	TGCTT	2	10	207065	207074	0 %	60 %	20 %	20 %	532530685
138	NC_022130	GAATT	2	10	207795	207804	40 %	40 %	20 %	0 %	532530685
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150	NC_022130	TGGGG	2	10	229165	229174	0 %	20 %	80 %	0 %	532530706
151	NC_022130	TAGAT	2	10	229282	229291	40 %	40 %	20 %	0 %	532530706
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233	NC_022130	TCAAG	2	10	345875	345884	40 %	20 %	20 %	20 %	532530830
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246	NC_022130	TTGGC	2	10	359165	359174	0 %	40 %	40 %	20 %	532530843
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248	NC_022130	CACTT	2	10	363161	363170	20 %	40 %	0 %	40 %	532530850
249	NC_022130	AATCC	2	10	366453	366462	40 %	20 %	0 %	40 %	532530851
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251	NC_022130	TTTTA	2	10	370951	370960	20 %	80 %	0 %	0 %	532530854
252	NC_022130	TCAAA	2	10	371643	371652	60 %	20 %	0 %	20 %	532530854
253	NC_022130	AAGCG	2	10	371849	371858	40 %	0 %	40 %	20 %	532530854
254	NC_022130	CCATG	2	10	374343	374352	20 %	20 %	20 %	40 %	532530858
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256	NC_022130	GATTT	2	10	376477	376486	20 %	60 %	20 %	0 %	532530860
257	NC_022130	AATTT	2	10	376492	376501	40 %	60 %	0 %	0 %	532530860
258	NC_022130	AGCCA	2	10	378169	378178	40 %	0 %	20 %	40 %	532530861
259	NC_022130	ATTTT	2	10	379286	379295	20 %	80 %	0 %	0 %	532530863
260	NC_022130	GATTT	2	10	379607	379616	20 %	60 %	20 %	0 %	532530863
261	NC_022130	TTGGA	2	10	381661	381670	20 %	40 %	40 %	0 %	532530867
262	NC_022130	AAATC	2	10	384707	384716	60 %	20 %	0 %	20 %	532530871
263	NC_022130	GATGC	2	10	384793	384802	20 %	20 %	40 %	20 %	532530871
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396	NC_022130	TTTTA	2	10	571284	571293	20 %	80 %	0 %	0 %	532531080
397	NC_022130	TCTAT	2	10	571339	571348	20 %	60 %	0 %	20 %	532531080
398	NC_022130	AATGA	2	10	573928	573937	60 %	20 %	20 %	0 %	532531083
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