MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori SouthAfrica20

Total Repeats: 4732

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022130	GAGC	2	8	28	35	25 %	0 %	50 %	25 %	532530468
2	NC_022130	TCTG	2	8	810	817	0 %	50 %	25 %	25 %	532530469
3	NC_022130	GCTT	2	8	1455	1462	0 %	50 %	25 %	25 %	532530470
4	NC_022130	CCTG	2	8	1810	1817	0 %	25 %	25 %	50 %	532530471
5	NC_022130	CCAA	2	8	1834	1841	50 %	0 %	0 %	50 %	532530471
6	NC_022130	TGAA	2	8	1874	1881	50 %	25 %	25 %	0 %	532530471
7	NC_022130	ATTC	2	8	2350	2357	25 %	50 %	0 %	25 %	532530472
8	NC_022130	CTTT	2	8	2560	2567	0 %	75 %	0 %	25 %	532530473
9	NC_022130	GAAA	2	8	3248	3255	75 %	0 %	25 %	0 %	532530475
10	NC_022130	GAAA	2	8	3323	3330	75 %	0 %	25 %	0 %	532530475
11	NC_022130	AGAA	2	8	3779	3786	75 %	0 %	25 %	0 %	532530475
12	NC_022130	GCTT	2	8	5192	5199	0 %	50 %	25 %	25 %	532530477
13	NC_022130	ATTC	2	8	5219	5226	25 %	50 %	0 %	25 %	532530477
14	NC_022130	CATT	2	8	5263	5270	25 %	50 %	0 %	25 %	532530477
15	NC_022130	GCAT	2	8	6275	6282	25 %	25 %	25 %	25 %	532530477
16	NC_022130	TTGC	2	8	6533	6540	0 %	50 %	25 %	25 %	532530477
17	NC_022130	TGGT	2	8	6731	6738	0 %	50 %	50 %	0 %	532530477
18	NC_022130	ATCG	2	8	6914	6921	25 %	25 %	25 %	25 %	532530477
19	NC_022130	GTTT	2	8	7295	7302	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022130	TTTG	2	8	7379	7386	0 %	75 %	25 %	0 %	532530478
21	NC_022130	AAGC	2	8	7465	7472	50 %	0 %	25 %	25 %	532530478
22	NC_022130	TTCA	2	8	7723	7730	25 %	50 %	0 %	25 %	532530479
23	NC_022130	TCTT	2	8	8017	8024	0 %	75 %	0 %	25 %	532530479
24	NC_022130	CGTT	2	8	8499	8506	0 %	50 %	25 %	25 %	532530479
25	NC_022130	TATT	2	8	9715	9722	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022130	TCAA	2	8	9920	9927	50 %	25 %	0 %	25 %	532530481
27	NC_022130	TTTG	2	8	10739	10746	0 %	75 %	25 %	0 %	532530482
28	NC_022130	CTTT	2	8	11367	11374	0 %	75 %	0 %	25 %	532530482
29	NC_022130	TGCT	2	8	12110	12117	0 %	50 %	25 %	25 %	532530483
30	NC_022130	CGCT	2	8	12229	12236	0 %	25 %	25 %	50 %	532530483
31	NC_022130	GCCG	2	8	12374	12381	0 %	0 %	50 %	50 %	532530483
32	NC_022130	AGCA	2	8	12646	12653	50 %	0 %	25 %	25 %	532530484
33	NC_022130	GTTT	2	8	13004	13011	0 %	75 %	25 %	0 %	532530484
34	NC_022130	TCTT	2	8	13391	13398	0 %	75 %	0 %	25 %	532530484
35	NC_022130	TTAA	2	8	13539	13546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022130	AGCG	2	8	13862	13869	25 %	0 %	50 %	25 %	532530486
37	NC_022130	GATT	2	8	13970	13977	25 %	50 %	25 %	0 %	532530486
38	NC_022130	CAAA	2	8	14139	14146	75 %	0 %	0 %	25 %	532530487
39	NC_022130	ATTG	2	8	14398	14405	25 %	50 %	25 %	0 %	532530487
40	NC_022130	ATGC	2	8	14554	14561	25 %	25 %	25 %	25 %	532530487
41	NC_022130	TCAA	2	8	14813	14820	50 %	25 %	0 %	25 %	532530487
42	NC_022130	AAAG	2	8	14971	14978	75 %	0 %	25 %	0 %	532530487
43	NC_022130	TGAT	2	8	16343	16350	25 %	50 %	25 %	0 %	532530487
44	NC_022130	AGTT	2	8	16471	16478	25 %	50 %	25 %	0 %	532530487
45	NC_022130	TTCT	2	8	16715	16722	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_022130	AACG	2	8	17144	17151	50 %	0 %	25 %	25 %	532530488
47	NC_022130	TTAA	2	8	17318	17325	50 %	50 %	0 %	0 %	532530488
48	NC_022130	TGAT	2	8	17549	17556	25 %	50 %	25 %	0 %	532530488
49	NC_022130	GCGA	2	8	17686	17693	25 %	0 %	50 %	25 %	532530489
50	NC_022130	GTTT	2	8	18090	18097	0 %	75 %	25 %	0 %	532530489
51	NC_022130	AGCA	2	8	18228	18235	50 %	0 %	25 %	25 %	532530490
52	NC_022130	TGAT	2	8	18437	18444	25 %	50 %	25 %	0 %	532530490
53	NC_022130	TGCT	2	8	18812	18819	0 %	50 %	25 %	25 %	532530490
54	NC_022130	AGCG	2	8	18984	18991	25 %	0 %	50 %	25 %	532530490
55	NC_022130	TTAA	2	8	20398	20405	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022130	TAAA	2	8	20501	20508	75 %	25 %	0 %	0 %	532530492
57	NC_022130	GCGA	2	8	20510	20517	25 %	0 %	50 %	25 %	532530492
58	NC_022130	TTTG	2	8	20962	20969	0 %	75 %	25 %	0 %	532530492
59	NC_022130	TAAA	2	8	21261	21268	75 %	25 %	0 %	0 %	532530493
60	NC_022130	CTTT	2	8	21367	21374	0 %	75 %	0 %	25 %	532530493
61	NC_022130	AAGT	2	8	21679	21686	50 %	25 %	25 %	0 %	532530493
62	NC_022130	TTTA	2	8	22266	22273	25 %	75 %	0 %	0 %	532530493
63	NC_022130	CTTT	2	8	22444	22451	0 %	75 %	0 %	25 %	532530493
64	NC_022130	ATCA	2	8	22583	22590	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_022130	AGAA	2	8	23306	23313	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022130	TTGA	2	8	24839	24846	25 %	50 %	25 %	0 %	532530494
67	NC_022130	GCTC	2	8	28236	28243	0 %	25 %	25 %	50 %	532530496
68	NC_022130	GATG	2	8	28683	28690	25 %	25 %	50 %	0 %	532530496
69	NC_022130	GAAT	2	8	28942	28949	50 %	25 %	25 %	0 %	532530497
70	NC_022130	CAAC	2	8	29135	29142	50 %	0 %	0 %	50 %	532530497
71	NC_022130	TGGC	2	8	29162	29169	0 %	25 %	50 %	25 %	532530497
72	NC_022130	TGAT	2	8	29833	29840	25 %	50 %	25 %	0 %	532530498
73	NC_022130	TCAA	2	8	30190	30197	50 %	25 %	0 %	25 %	532530499
74	NC_022130	CTTA	2	8	30363	30370	25 %	50 %	0 %	25 %	532530499
75	NC_022130	AAAG	2	8	30708	30715	75 %	0 %	25 %	0 %	532530499
76	NC_022130	AATA	2	8	30898	30905	75 %	25 %	0 %	0 %	532530499
77	NC_022130	AAAT	2	8	31191	31198	75 %	25 %	0 %	0 %	532530499
78	NC_022130	TTTA	2	8	31955	31962	25 %	75 %	0 %	0 %	532530500
79	NC_022130	GCGA	2	8	32153	32160	25 %	0 %	50 %	25 %	532530500
80	NC_022130	ACCC	2	8	32264	32271	25 %	0 %	0 %	75 %	532530501
81	NC_022130	GAAG	2	8	32363	32370	50 %	0 %	50 %	0 %	532530501
82	NC_022130	TCGT	2	8	32902	32909	0 %	50 %	25 %	25 %	532530502
83	NC_022130	GGGA	2	8	33056	33063	25 %	0 %	75 %	0 %	532530502
84	NC_022130	CATG	2	8	33652	33659	25 %	25 %	25 %	25 %	532530502
85	NC_022130	TTGT	2	8	34156	34163	0 %	75 %	25 %	0 %	532530502
86	NC_022130	GCTT	2	8	34667	34674	0 %	50 %	25 %	25 %	532530502
87	NC_022130	CAAT	2	8	34684	34691	50 %	25 %	0 %	25 %	532530502
88	NC_022130	GAAA	2	8	34699	34706	75 %	0 %	25 %	0 %	532530502
89	NC_022130	GAAA	2	8	34726	34733	75 %	0 %	25 %	0 %	532530502
90	NC_022130	GATC	2	8	34804	34811	25 %	25 %	25 %	25 %	532530503
91	NC_022130	AGCC	2	8	35477	35484	25 %	0 %	25 %	50 %	532530505
92	NC_022130	TTCT	2	8	36414	36421	0 %	75 %	0 %	25 %	532530506
93	NC_022130	AATA	2	8	37429	37436	75 %	25 %	0 %	0 %	532530506
94	NC_022130	TAAA	2	8	37451	37458	75 %	25 %	0 %	0 %	532530506
95	NC_022130	GAAA	2	8	37581	37588	75 %	0 %	25 %	0 %	532530507
96	NC_022130	TGAA	2	8	38159	38166	50 %	25 %	25 %	0 %	532530508
97	NC_022130	ATTC	2	8	38336	38343	25 %	50 %	0 %	25 %	532530509
98	NC_022130	CGTT	2	8	38347	38354	0 %	50 %	25 %	25 %	532530509
99	NC_022130	TGAT	2	8	38692	38699	25 %	50 %	25 %	0 %	532530509
100	NC_022130	TTGT	2	8	39026	39033	0 %	75 %	25 %	0 %	532530509
101	NC_022130	ACAA	2	8	39088	39095	75 %	0 %	0 %	25 %	532530509
102	NC_022130	ACCC	2	8	39395	39402	25 %	0 %	0 %	75 %	532530510
103	NC_022130	CCAA	2	8	39465	39472	50 %	0 %	0 %	50 %	532530510
104	NC_022130	CAAA	2	8	39690	39697	75 %	0 %	0 %	25 %	532530510
105	NC_022130	ATTG	2	8	40103	40110	25 %	50 %	25 %	0 %	532530510
106	NC_022130	ATTG	2	8	40169	40176	25 %	50 %	25 %	0 %	532530511
107	NC_022130	TCAA	2	8	40291	40298	50 %	25 %	0 %	25 %	532530511
108	NC_022130	TGTT	2	8	41061	41068	0 %	75 %	25 %	0 %	532530512
109	NC_022130	AAAG	2	8	41381	41388	75 %	0 %	25 %	0 %	532530512
110	NC_022130	CTTT	2	8	41654	41661	0 %	75 %	0 %	25 %	532530512
111	NC_022130	GAAA	2	8	41933	41940	75 %	0 %	25 %	0 %	532530513
112	NC_022130	GATC	2	8	42062	42069	25 %	25 %	25 %	25 %	532530513
113	NC_022130	TTGA	2	8	42792	42799	25 %	50 %	25 %	0 %	532530513
114	NC_022130	GAGC	2	8	42817	42824	25 %	0 %	50 %	25 %	532530513
115	NC_022130	ATGA	2	8	43069	43076	50 %	25 %	25 %	0 %	532530513
116	NC_022130	TATT	2	8	43186	43193	25 %	75 %	0 %	0 %	532530514
117	NC_022130	CCAA	2	8	43459	43466	50 %	0 %	0 %	50 %	532530514
118	NC_022130	CAAA	2	8	43908	43915	75 %	0 %	0 %	25 %	532530514
119	NC_022130	GATT	2	8	44501	44508	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_022130	CAAA	2	8	44651	44658	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_022130	GCTC	2	8	44694	44701	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
122	NC_022130	TTGA	2	8	45017	45024	25 %	50 %	25 %	0 %	532530515
123	NC_022130	AAAC	2	8	45031	45038	75 %	0 %	0 %	25 %	532530515
124	NC_022130	CGCT	2	8	45172	45179	0 %	25 %	25 %	50 %	532530515
125	NC_022130	TCAA	2	8	45783	45790	50 %	25 %	0 %	25 %	532530515
126	NC_022130	GTTT	2	8	45794	45801	0 %	75 %	25 %	0 %	532530515
127	NC_022130	CAAA	2	8	46290	46297	75 %	0 %	0 %	25 %	532530516
128	NC_022130	TCGC	2	8	47105	47112	0 %	25 %	25 %	50 %	532530516
129	NC_022130	AGGG	2	8	47116	47123	25 %	0 %	75 %	0 %	532530516
130	NC_022130	TTCA	2	8	47317	47324	25 %	50 %	0 %	25 %	532530516
131	NC_022130	CAAC	2	8	47901	47908	50 %	0 %	0 %	50 %	532530516
132	NC_022130	TAAA	2	8	48038	48045	75 %	25 %	0 %	0 %	532530516
133	NC_022130	CAAT	2	8	48151	48158	50 %	25 %	0 %	25 %	532530517
134	NC_022130	AGCG	3	12	48461	48472	25 %	0 %	50 %	25 %	532530517
135	NC_022130	GCAA	2	8	49110	49117	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_022130	CTTT	2	8	49438	49445	0 %	75 %	0 %	25 %	532530518
137	NC_022130	TTGC	2	8	49915	49922	0 %	50 %	25 %	25 %	532530519
138	NC_022130	TGGT	2	8	50198	50205	0 %	50 %	50 %	0 %	532530519
139	NC_022130	GAAT	2	8	50306	50313	50 %	25 %	25 %	0 %	532530519
140	NC_022130	CTTT	2	8	50493	50500	0 %	75 %	0 %	25 %	532530520
141	NC_022130	CAAT	2	8	51010	51017	50 %	25 %	0 %	25 %	532530521
142	NC_022130	AAAC	2	8	51518	51525	75 %	0 %	0 %	25 %	532530521
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