MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori SouthAfrica20

Total Repeats: 520

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022130	GTTT	2	8	7295	7302	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022130	TATT	2	8	9715	9722	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022130	TTAA	2	8	13539	13546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022130	TTCT	2	8	16715	16722	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_022130	TTAA	2	8	20398	20405	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022130	ATCA	2	8	22583	22590	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_022130	AGAA	2	8	23306	23313	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022130	GATT	2	8	44501	44508	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022130	CAAA	2	8	44651	44658	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_022130	GCTC	2	8	44694	44701	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_022130	GCAA	2	8	49110	49117	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_022130	AAGA	2	8	52229	52236	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022130	TAAA	2	8	52271	52278	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022130	TTTC	2	8	53227	53234	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_022130	TAAT	2	8	61231	61238	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022130	AAAT	2	8	61398	61405	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022130	AGAA	2	8	62211	62218	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022130	CTAA	2	8	62240	62247	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_022130	CTGA	2	8	62555	62562	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_022130	AGAA	2	8	64550	64557	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022130	CAAA	2	8	76498	76505	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_022130	TATT	2	8	79204	79211	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022130	ATTT	2	8	81708	81715	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022130	TGGT	2	8	82939	82946	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022130	ACCA	2	8	83004	83011	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_022130	ATAA	2	8	83075	83082	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022130	TAAA	2	8	83121	83128	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022130	TGTT	2	8	85133	85140	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022130	AAAT	2	8	87237	87244	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022130	GCTT	2	8	90579	90586	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_022130	TATT	2	8	90600	90607	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022130	GGTG	2	8	97876	97883	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022130	TCCC	2	8	97946	97953	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
34	NC_022130	GTTT	2	8	100565	100572	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022130	TGTT	2	8	108845	108852	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022130	AAAC	2	8	112201	112208	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_022130	TTTG	2	8	112321	112328	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022130	TTAG	2	8	112529	112536	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022130	TAAA	2	8	115241	115248	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022130	GGGA	2	8	115601	115608	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022130	GCTT	2	8	115656	115663	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_022130	TCAA	2	8	115859	115866	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_022130	ATTT	2	8	115958	115965	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022130	CGCT	2	8	116052	116059	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_022130	CTTT	2	8	117952	117959	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_022130	AAAT	2	8	117963	117970	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022130	AGTT	2	8	119504	119511	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022130	GACA	2	8	127422	127429	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_022130	TGAT	2	8	128671	128678	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022130	AAAG	2	8	131539	131546	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022130	AAAG	2	8	134266	134273	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022130	AAAG	2	8	134763	134770	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022130	GAAG	2	8	134820	134827	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022130	AAGA	2	8	136654	136661	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022130	TATT	2	8	136680	136687	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022130	TGAT	2	8	137793	137800	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022130	GAAT	2	8	137864	137871	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022130	AAAC	2	8	138552	138559	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_022130	CTTT	2	8	138567	138574	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_022130	TTGT	2	8	142909	142916	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022130	CTAA	2	8	143158	143165	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_022130	TAAA	2	8	143332	143339	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022130	TAAG	2	8	147043	147050	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022130	ATTT	2	8	165911	165918	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022130	TTTA	2	8	167023	167030	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022130	TTAG	2	8	167194	167201	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022130	AGTG	2	8	167734	167741	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022130	GAAA	2	8	167954	167961	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022130	CTTT	2	8	169826	169833	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_022130	TTTC	2	8	169857	169864	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_022130	AACT	2	8	171874	171881	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_022130	ATTT	2	8	172060	172067	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022130	GCTA	2	8	172184	172191	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_022130	ATCA	2	8	172253	172260	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_022130	CGCT	2	8	172704	172711	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
76	NC_022130	TAAC	2	8	179489	179496	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_022130	AGCG	2	8	182151	182158	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_022130	TAAA	2	8	182384	182391	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022130	AAAC	2	8	182463	182470	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_022130	AAAG	2	8	185608	185615	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022130	GACT	2	8	190641	190648	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_022130	AGCG	2	8	191030	191037	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
83	NC_022130	TGAA	2	8	191212	191219	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022130	ACGA	2	8	200435	200442	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_022130	CTTT	2	8	205388	205395	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_022130	ATAA	2	8	205407	205414	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022130	CAAC	2	8	205528	205535	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_022130	AAAC	2	8	205603	205610	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_022130	TTTA	2	8	215344	215351	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022130	AGCC	2	8	215392	215399	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
91	NC_022130	TTGA	2	8	216777	216784	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_022130	ATGC	2	8	225550	225557	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_022130	ATTT	2	8	225607	225614	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_022130	AAAT	2	8	225646	225653	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022130	TTAT	2	8	230424	230431	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022130	CTGT	2	8	231697	231704	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_022130	CTAA	2	8	231749	231756	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_022130	GCTT	2	8	232215	232222	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_022130	CAAA	2	8	236928	236935	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_022130	TTTA	2	8	238533	238540	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022130	TTAT	2	8	251281	251288	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022130	ATTT	2	8	257102	257109	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022130	TAAT	2	8	259956	259963	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022130	TTAA	2	8	260077	260084	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_022130	GCCA	2	8	269902	269909	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
106	NC_022130	TGAT	2	8	269936	269943	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022130	ATTT	2	8	277369	277376	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022130	ATTG	2	8	287990	287997	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022130	CATT	2	8	310085	310092	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_022130	AGGG	2	8	311200	311207	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
111	NC_022130	CAAA	2	8	313805	313812	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_022130	TGAA	2	8	313918	313925	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022130	TTTA	2	8	313930	313937	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022130	GTTG	2	8	321082	321089	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022130	AAAT	2	8	321174	321181	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_022130	TTGG	2	8	333130	333137	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_022130	AATC	2	8	339451	339458	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_022130	AGGG	2	8	339513	339520	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
119	NC_022130	AAAT	2	8	341621	341628	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_022130	CCAA	2	8	346763	346770	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_022130	AATC	2	8	346802	346809	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_022130	TGAA	2	8	351094	351101	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_022130	CGAT	2	8	368026	368033	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_022130	AAAT	2	8	375008	375015	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022130	TTAT	2	8	375222	375229	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_022130	TTAA	2	8	375363	375370	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_022130	TAAA	2	8	375374	375381	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_022130	TCAA	2	8	375784	375791	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_022130	ATTT	2	8	379894	379901	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_022130	TTTG	2	8	379959	379966	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_022130	GATT	2	8	381972	381979	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_022130	CTTT	2	8	382652	382659	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_022130	ATTT	2	8	386683	386690	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_022130	CAAA	2	8	390102	390109	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_022130	GTTT	2	8	393638	393645	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_022130	AAAG	2	8	393710	393717	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_022130	TTTC	2	8	397936	397943	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_022130	GGGT	2	8	399884	399891	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
139	NC_022130	GAAA	2	8	399942	399949	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_022130	CAAG	2	8	412117	412124	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_022130	AAGC	2	8	413186	413193	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_022130	AGGA	2	8	425832	425839	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_022130	TCAA	2	8	429989	429996	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_022130	CAAT	2	8	432405	432412	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_022130	GCTT	2	8	432601	432608	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
146	NC_022130	ATTG	2	8	437972	437979	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_022130	CACC	2	8	445463	445470	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
148	NC_022130	TCGC	2	8	465098	465105	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
149	NC_022130	CATG	2	8	465510	465517	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
150	NC_022130	GAAA	2	8	465810	465817	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_022130	TTGA	2	8	465913	465920	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
152	NC_022130	AAAT	2	8	466017	466024	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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155	NC_022130	ATTT	2	8	466503	466510	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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261	NC_022130	TTCA	2	8	834493	834500	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
262	NC_022130	CTTT	2	8	839369	839376	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
263	NC_022130	ATCA	2	8	840313	840320	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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443	NC_022130	GGGA	2	8	1350677	1350684	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
444	NC_022130	AGCT	2	8	1350975	1350982	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
445	NC_022130	CTTT	2	8	1351333	1351340	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
446	NC_022130	GATT	2	8	1351457	1351464	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
447	NC_022130	CACC	2	8	1351469	1351476	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
448	NC_022130	GTTT	2	8	1351629	1351636	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
449	NC_022130	TCGC	2	8	1352206	1352213	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
450	NC_022130	TAGT	2	8	1353201	1353208	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
451	NC_022130	AATA	2	8	1353996	1354003	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
452	NC_022130	GCCT	2	8	1358927	1358934	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
453	NC_022130	TTTC	2	8	1366736	1366743	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
454	NC_022130	GCTC	2	8	1366784	1366791	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
455	NC_022130	TTGA	2	8	1366891	1366898	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
456	NC_022130	CAAT	2	8	1367413	1367420	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
457	NC_022130	GAAA	2	8	1367428	1367435	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
458	NC_022130	TTTC	2	8	1371913	1371920	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
459	NC_022130	AGCA	2	8	1372887	1372894	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
460	NC_022130	CAGA	2	8	1378533	1378540	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
461	NC_022130	CCAA	2	8	1380865	1380872	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
462	NC_022130	CAAG	2	8	1380943	1380950	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
463	NC_022130	AAAG	2	8	1380954	1380961	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
464	NC_022130	ACCA	2	8	1380969	1380976	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
465	NC_022130	ATTA	2	8	1381016	1381023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
466	NC_022130	CAAA	2	8	1381085	1381092	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
467	NC_022130	AGCA	2	8	1381153	1381160	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
468	NC_022130	AGAA	2	8	1381200	1381207	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
469	NC_022130	CATC	2	8	1382020	1382027	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
470	NC_022130	ACCT	2	8	1382174	1382181	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
471	NC_022130	CTGA	2	8	1382245	1382252	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
472	NC_022130	AGAA	2	8	1382943	1382950	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
473	NC_022130	CCTC	2	8	1383425	1383432	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
474	NC_022130	GAAA	2	8	1383471	1383478	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
475	NC_022130	TTTG	2	8	1394578	1394585	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
476	NC_022130	AACA	2	8	1394698	1394705	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
477	NC_022130	ACCC	2	8	1394745	1394752	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
478	NC_022130	CTTT	2	8	1400581	1400588	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
479	NC_022130	TCGC	2	8	1414175	1414182	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
480	NC_022130	TTCA	2	8	1418225	1418232	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
481	NC_022130	TTTC	2	8	1438040	1438047	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
482	NC_022130	CTAT	2	8	1445575	1445582	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
483	NC_022130	ATTT	2	8	1446044	1446051	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
484	NC_022130	ATCA	2	8	1446101	1446108	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
485	NC_022130	ATGG	2	8	1457760	1457767	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
486	NC_022130	ACCC	2	8	1461968	1461975	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
487	NC_022130	TTTG	2	8	1465347	1465354	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
488	NC_022130	GAAC	2	8	1477066	1477073	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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490	NC_022130	TTAT	2	8	1485804	1485811	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
491	NC_022130	ATTG	2	8	1490141	1490148	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
492	NC_022130	GAAT	2	8	1490164	1490171	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
493	NC_022130	GAAA	2	8	1498667	1498674	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
494	NC_022130	TTGC	2	8	1501367	1501374	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
495	NC_022130	AGCG	2	8	1508204	1508211	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
496	NC_022130	AAGC	2	8	1515365	1515372	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
497	NC_022130	ACAG	2	8	1515563	1515570	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
498	NC_022130	ATTT	2	8	1515698	1515705	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
499	NC_022130	CCGC	2	8	1528628	1528635	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
500	NC_022130	GCGA	2	8	1538627	1538634	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding

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