MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter pylori SouthAfrica20

Total Repeats: 14711

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022130	TGA	3	9	121	129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532530468
2	NC_022130	GTT	2	6	305	310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532530468
3	NC_022130	TTC	2	6	356	361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532530468
4	NC_022130	ACA	2	6	382	387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532530468
5	NC_022130	AAT	2	6	457	462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532530469
6	NC_022130	TTA	2	6	493	498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532530469
7	NC_022130	CTT	2	6	800	805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532530469
8	NC_022130	TGA	2	6	818	823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532530469
9	NC_022130	TCA	2	6	958	963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532530470
10	NC_022130	AAC	2	6	1024	1029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532530470
11	NC_022130	GCC	2	6	1048	1053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532530470
12	NC_022130	CCA	2	6	1187	1192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532530470
13	NC_022130	GCT	2	6	1212	1217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532530470
14	NC_022130	CTA	2	6	1279	1284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532530470
15	NC_022130	GGC	2	6	1403	1408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532530470
16	NC_022130	TAG	2	6	1646	1651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532530470
17	NC_022130	CTT	2	6	1657	1662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532530470
18	NC_022130	TTC	2	6	1762	1767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532530471
19	NC_022130	GTT	2	6	1897	1902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532530471
20	NC_022130	TTC	2	6	1985	1990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532530472
21	NC_022130	TCA	2	6	2052	2057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532530472
22	NC_022130	AAT	2	6	2105	2110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532530472
23	NC_022130	AGC	2	6	2778	2783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532530474
24	NC_022130	GTG	2	6	2967	2972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532530474
25	NC_022130	AGA	2	6	3065	3070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532530474
26	NC_022130	AAG	2	6	3094	3099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532530474
27	NC_022130	GTG	2	6	3126	3131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532530474
28	NC_022130	GCC	2	6	3133	3138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532530474
29	NC_022130	GGT	2	6	3578	3583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532530475
30	NC_022130	ATT	2	6	3907	3912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532530475
31	NC_022130	GGC	2	6	3980	3985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532530475
32	NC_022130	TGT	2	6	4753	4758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532530476
33	NC_022130	ATT	2	6	5285	5290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532530477
34	NC_022130	TGG	2	6	5383	5388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532530477
35	NC_022130	TCT	2	6	5522	5527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532530477
36	NC_022130	GTT	2	6	5585	5590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532530477
37	NC_022130	TAA	2	6	5654	5659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532530477
38	NC_022130	GTG	2	6	5781	5786	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532530477
39	NC_022130	GTT	2	6	5801	5806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532530477
40	NC_022130	CAA	2	6	5849	5854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532530477
41	NC_022130	TGT	2	6	5902	5907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532530477
42	NC_022130	GTT	2	6	5957	5962	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532530477
43	NC_022130	GCT	2	6	6006	6011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532530477
44	NC_022130	AGA	2	6	6134	6139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532530477
45	NC_022130	GCG	2	6	6160	6165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532530477
46	NC_022130	CGA	2	6	6211	6216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532530477
47	NC_022130	TGC	2	6	6435	6440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532530477
48	NC_022130	TGT	2	6	6448	6453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532530477
49	NC_022130	TTG	2	6	6477	6482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532530477
50	NC_022130	AAC	2	6	6746	6751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532530477
51	NC_022130	CCG	2	6	6826	6831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532530477
52	NC_022130	GCT	2	6	6941	6946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532530477
53	NC_022130	GTT	2	6	6971	6976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532530477
54	NC_022130	AAG	2	6	7432	7437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532530478
55	NC_022130	CAT	2	6	7480	7485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532530479
56	NC_022130	GCC	2	6	7486	7491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532530479
57	NC_022130	TCT	2	6	7547	7552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532530479
58	NC_022130	AAT	2	6	7645	7650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532530479
59	NC_022130	CAT	2	6	7743	7748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532530479
60	NC_022130	ATG	2	6	7796	7801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532530479
61	NC_022130	TCA	2	6	7820	7825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532530479
62	NC_022130	CTT	2	6	7893	7898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532530479
63	NC_022130	CAT	2	6	7926	7931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532530479
64	NC_022130	GTG	2	6	8129	8134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532530479
65	NC_022130	TTC	2	6	8209	8214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532530479
66	NC_022130	CCG	2	6	8228	8233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532530479
67	NC_022130	CAC	2	6	8329	8334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532530479
68	NC_022130	GAT	2	6	8371	8376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532530479
69	NC_022130	TCT	2	6	8693	8698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532530479
70	NC_022130	CTT	2	6	8814	8819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532530479
71	NC_022130	GCA	2	6	8867	8872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532530479
72	NC_022130	CTT	2	6	8892	8897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532530479
73	NC_022130	TCT	2	6	9246	9251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532530480
74	NC_022130	ATG	2	6	9420	9425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532530480
75	NC_022130	TCT	2	6	9444	9449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532530480
76	NC_022130	CTA	2	6	9460	9465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532530480
77	NC_022130	TTG	2	6	9879	9884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532530481
78	NC_022130	CCG	2	6	10035	10040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532530481
79	NC_022130	AGA	2	6	10089	10094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532530481
80	NC_022130	ACC	2	6	10097	10102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532530481
81	NC_022130	AAG	2	6	10130	10135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532530481
82	NC_022130	ATT	2	6	10163	10168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532530481
83	NC_022130	CAT	2	6	10344	10349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532530481
84	NC_022130	GTG	2	6	10378	10383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532530481
85	NC_022130	ATG	2	6	10658	10663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532530481
86	NC_022130	GCG	2	6	10684	10689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532530481
87	NC_022130	AAC	2	6	10749	10754	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532530482
88	NC_022130	TAA	2	6	10778	10783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532530482
89	NC_022130	TTG	2	6	11148	11153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532530482
90	NC_022130	GAC	2	6	11235	11240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532530482
91	NC_022130	TTA	3	9	11256	11264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532530482
92	NC_022130	TTG	2	6	11313	11318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532530482
93	NC_022130	CAT	2	6	11414	11419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532530482
94	NC_022130	TGT	2	6	11667	11672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532530483
95	NC_022130	ATT	3	9	11941	11949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532530483
96	NC_022130	TTG	2	6	12003	12008	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532530483
97	NC_022130	TAA	2	6	12136	12141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532530483
98	NC_022130	TAA	2	6	12223	12228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532530483
99	NC_022130	TGG	3	9	12237	12245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532530483
100	NC_022130	GAA	3	9	12254	12262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532530483
101	NC_022130	TGG	2	6	12336	12341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532530483
102	NC_022130	TTA	2	6	12670	12675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532530484
103	NC_022130	GAA	2	6	12687	12692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532530484
104	NC_022130	GTT	2	6	12754	12759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532530484
105	NC_022130	TAA	2	6	12764	12769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532530484
106	NC_022130	ATC	2	6	12777	12782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532530484
107	NC_022130	ACG	2	6	12904	12909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532530484
108	NC_022130	CAA	2	6	13025	13030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532530484
109	NC_022130	AAT	2	6	13059	13064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532530484
110	NC_022130	ACC	2	6	13153	13158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532530484
111	NC_022130	CCA	2	6	13205	13210	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532530484
112	NC_022130	CTA	2	6	13216	13221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532530484
113	NC_022130	GGT	2	6	13295	13300	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532530484
114	NC_022130	TTG	2	6	13350	13355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532530484
115	NC_022130	GAA	2	6	13356	13361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532530484
116	NC_022130	GTG	2	6	13780	13785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532530485
117	NC_022130	GAA	2	6	13871	13876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532530486
118	NC_022130	ATT	3	9	14058	14066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532530486
119	NC_022130	GAA	2	6	14197	14202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532530487
120	NC_022130	AAT	2	6	14203	14208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532530487
121	NC_022130	ATG	2	6	14222	14227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532530487
122	NC_022130	TTG	2	6	14258	14263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532530487
123	NC_022130	AAG	2	6	14468	14473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532530487
124	NC_022130	AAG	2	6	14622	14627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532530487
125	NC_022130	ATT	2	6	14792	14797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532530487
126	NC_022130	TTA	2	6	15083	15088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532530487
127	NC_022130	AGG	2	6	15189	15194	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532530487
128	NC_022130	ACC	2	6	15230	15235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532530487
129	NC_022130	ATT	2	6	15353	15358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532530487
130	NC_022130	AAG	2	6	15386	15391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532530487
131	NC_022130	TGA	2	6	15476	15481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532530487
132	NC_022130	ATG	2	6	15490	15495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532530487
133	NC_022130	CTT	2	6	15660	15665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532530487
134	NC_022130	AAG	2	6	15701	15706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532530487
135	NC_022130	AGA	2	6	15711	15716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532530487
136	NC_022130	ATG	2	6	15878	15883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532530487
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142	NC_022130	ATT	2	6	17073	17078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532530488
143	NC_022130	AAG	2	6	17181	17186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532530488
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149	NC_022130	ATT	3	9	17774	17782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532530489
150	NC_022130	ATA	2	6	18056	18061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532530489
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152	NC_022130	GTG	2	6	18343	18348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532530490
153	NC_022130	ATC	3	9	18409	18417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532530490
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156	NC_022130	GTG	2	6	18706	18711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532530490
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162	NC_022130	GAA	2	6	19392	19397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532530491
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251	NC_022130	TAT	2	6	28560	28565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532530496
252	NC_022130	ATG	2	6	28579	28584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532530496
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255	NC_022130	TTA	2	6	28918	28923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532530497
256	NC_022130	TTA	2	6	29290	29295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532530497
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270	NC_022130	TCA	2	6	31672	31677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532530499
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282	NC_022130	ACT	2	6	32709	32714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532530502
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286	NC_022130	AGA	2	6	33064	33069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532530502
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323	NC_022130	GTG	2	6	35928	35933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532530505
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357	NC_022130	CAA	2	6	39972	39977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532530510
358	NC_022130	ATC	2	6	40021	40026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532530510
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370	NC_022130	CAA	2	6	41246	41251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532530512
371	NC_022130	GAA	2	6	41321	41326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532530512
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374	NC_022130	ATC	2	6	41819	41824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532530512
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377	NC_022130	ATG	2	6	42642	42647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532530513
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490	NC_022130	CTT	2	6	55364	55369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532530525
491	NC_022130	TCA	2	6	55504	55509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532530525
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