MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori SouthAfrica20

Total Repeats: 2215

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022130	TG	3	6	138	143	0 %	50 %	50 %	0 %	532530468
2	NC_022130	CT	3	6	691	696	0 %	50 %	0 %	50 %	532530469
3	NC_022130	CA	3	6	1226	1231	50 %	0 %	0 %	50 %	532530470
4	NC_022130	CT	3	6	1561	1566	0 %	50 %	0 %	50 %	532530470
5	NC_022130	TG	3	6	2522	2527	0 %	50 %	50 %	0 %	532530473
6	NC_022130	AG	3	6	2948	2953	50 %	0 %	50 %	0 %	532530474
7	NC_022130	TG	3	6	3430	3435	0 %	50 %	50 %	0 %	532530475
8	NC_022130	GC	3	6	5843	5848	0 %	0 %	50 %	50 %	532530477
9	NC_022130	CG	3	6	6959	6964	0 %	0 %	50 %	50 %	532530477
10	NC_022130	GA	9	18	7127	7144	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022130	GC	3	6	7790	7795	0 %	0 %	50 %	50 %	532530479
12	NC_022130	CG	3	6	7855	7860	0 %	0 %	50 %	50 %	532530479
13	NC_022130	AG	3	6	8002	8007	50 %	0 %	50 %	0 %	532530479
14	NC_022130	AG	3	6	10191	10196	50 %	0 %	50 %	0 %	532530481
15	NC_022130	AG	3	6	12472	12477	50 %	0 %	50 %	0 %	532530483
16	NC_022130	GA	3	6	12655	12660	50 %	0 %	50 %	0 %	532530484
17	NC_022130	AG	3	6	13495	13500	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022130	TG	3	6	13607	13612	0 %	50 %	50 %	0 %	532530485
19	NC_022130	TG	3	6	13728	13733	0 %	50 %	50 %	0 %	532530485
20	NC_022130	GC	3	6	14371	14376	0 %	0 %	50 %	50 %	532530487
21	NC_022130	TC	3	6	14586	14591	0 %	50 %	0 %	50 %	532530487
22	NC_022130	GC	3	6	14945	14950	0 %	0 %	50 %	50 %	532530487
23	NC_022130	CA	3	6	16525	16530	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_022130	GC	3	6	17032	17037	0 %	0 %	50 %	50 %	532530488
25	NC_022130	CG	3	6	17138	17143	0 %	0 %	50 %	50 %	532530488
26	NC_022130	AG	3	6	18418	18423	50 %	0 %	50 %	0 %	532530490
27	NC_022130	CT	3	6	18781	18786	0 %	50 %	0 %	50 %	532530490
28	NC_022130	AG	3	6	19217	19222	50 %	0 %	50 %	0 %	532530491
29	NC_022130	GA	3	6	19408	19413	50 %	0 %	50 %	0 %	532530491
30	NC_022130	GC	3	6	20810	20815	0 %	0 %	50 %	50 %	532530492
31	NC_022130	AG	3	6	23349	23354	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022130	AG	3	6	23416	23421	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022130	GC	3	6	23550	23555	0 %	0 %	50 %	50 %	532530494
34	NC_022130	AG	3	6	25769	25774	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022130	GC	3	6	26299	26304	0 %	0 %	50 %	50 %	532530495
36	NC_022130	AC	3	6	26852	26857	50 %	0 %	0 %	50 %	532530495
37	NC_022130	AG	3	6	26862	26867	50 %	0 %	50 %	0 %	532530495
38	NC_022130	CA	3	6	27013	27018	50 %	0 %	0 %	50 %	532530495
39	NC_022130	TG	3	6	27873	27878	0 %	50 %	50 %	0 %	532530496
40	NC_022130	AG	3	6	29222	29227	50 %	0 %	50 %	0 %	532530497
41	NC_022130	TC	3	6	31135	31140	0 %	50 %	0 %	50 %	532530499
42	NC_022130	AG	3	6	31653	31658	50 %	0 %	50 %	0 %	532530499
43	NC_022130	AT	3	6	32722	32727	50 %	50 %	0 %	0 %	532530502
44	NC_022130	AG	3	6	32812	32817	50 %	0 %	50 %	0 %	532530502
45	NC_022130	AC	3	6	32854	32859	50 %	0 %	0 %	50 %	532530502
46	NC_022130	GA	3	6	34576	34581	50 %	0 %	50 %	0 %	532530502
47	NC_022130	GC	4	8	34711	34718	0 %	0 %	50 %	50 %	532530502
48	NC_022130	AG	3	6	34848	34853	50 %	0 %	50 %	0 %	532530503
49	NC_022130	CA	3	6	35029	35034	50 %	0 %	0 %	50 %	532530503
50	NC_022130	GC	3	6	35611	35616	0 %	0 %	50 %	50 %	532530505
51	NC_022130	CT	3	6	35715	35720	0 %	50 %	0 %	50 %	532530505
52	NC_022130	GC	3	6	36319	36324	0 %	0 %	50 %	50 %	532530505
53	NC_022130	TG	3	6	36820	36825	0 %	50 %	50 %	0 %	532530506
54	NC_022130	TG	3	6	36904	36909	0 %	50 %	50 %	0 %	532530506
55	NC_022130	CT	3	6	37663	37668	0 %	50 %	0 %	50 %	532530508
56	NC_022130	GA	3	6	37943	37948	50 %	0 %	50 %	0 %	532530508
57	NC_022130	AG	3	6	38077	38082	50 %	0 %	50 %	0 %	532530508
58	NC_022130	CT	3	6	39057	39062	0 %	50 %	0 %	50 %	532530509
59	NC_022130	CT	3	6	39129	39134	0 %	50 %	0 %	50 %	532530509
60	NC_022130	TG	3	6	40008	40013	0 %	50 %	50 %	0 %	532530510
61	NC_022130	AG	3	6	40341	40346	50 %	0 %	50 %	0 %	532530511
62	NC_022130	AG	3	6	40477	40482	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022130	AG	3	6	40799	40804	50 %	0 %	50 %	0 %	532530512
64	NC_022130	CG	3	6	41182	41187	0 %	0 %	50 %	50 %	532530512
65	NC_022130	GC	3	6	41421	41426	0 %	0 %	50 %	50 %	532530512
66	NC_022130	AG	3	6	42450	42455	50 %	0 %	50 %	0 %	532530513
67	NC_022130	GA	3	6	42959	42964	50 %	0 %	50 %	0 %	532530513
68	NC_022130	AG	3	6	43428	43433	50 %	0 %	50 %	0 %	532530514
69	NC_022130	CT	3	6	43489	43494	0 %	50 %	0 %	50 %	532530514
70	NC_022130	CA	3	6	45695	45700	50 %	0 %	0 %	50 %	532530515
71	NC_022130	CT	3	6	46193	46198	0 %	50 %	0 %	50 %	532530516
72	NC_022130	CA	3	6	47999	48004	50 %	0 %	0 %	50 %	532530516
73	NC_022130	GT	3	6	48178	48183	0 %	50 %	50 %	0 %	532530517
74	NC_022130	CT	3	6	48649	48654	0 %	50 %	0 %	50 %	532530517
75	NC_022130	CT	4	8	48982	48989	0 %	50 %	0 %	50 %	532530517
76	NC_022130	TG	3	6	49292	49297	0 %	50 %	50 %	0 %	532530518
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79	NC_022130	AC	3	6	52028	52033	50 %	0 %	0 %	50 %	532530521
80	NC_022130	AT	3	6	52531	52536	50 %	50 %	0 %	0 %	532530522
81	NC_022130	TA	3	6	52623	52628	50 %	50 %	0 %	0 %	532530522
82	NC_022130	TG	3	6	52675	52680	0 %	50 %	50 %	0 %	532530522
83	NC_022130	TA	3	6	54473	54478	50 %	50 %	0 %	0 %	532530525
84	NC_022130	CT	3	6	54613	54618	0 %	50 %	0 %	50 %	532530525
85	NC_022130	GT	3	6	54798	54803	0 %	50 %	50 %	0 %	532530525
86	NC_022130	CT	3	6	55041	55046	0 %	50 %	0 %	50 %	532530525
87	NC_022130	AG	3	6	56237	56242	50 %	0 %	50 %	0 %	532530526
88	NC_022130	TG	3	6	57301	57306	0 %	50 %	50 %	0 %	532530526
89	NC_022130	CG	3	6	58120	58125	0 %	0 %	50 %	50 %	532530527
90	NC_022130	CT	3	6	60752	60757	0 %	50 %	0 %	50 %	532530527
91	NC_022130	TC	3	6	62073	62078	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_022130	AG	3	6	62590	62595	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_022130	AG	3	6	62729	62734	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_022130	AG	3	6	63689	63694	50 %	0 %	50 %	0 %	532530530
95	NC_022130	GC	3	6	63786	63791	0 %	0 %	50 %	50 %	532530530
96	NC_022130	AG	3	6	64608	64613	50 %	0 %	50 %	0 %	532530532
97	NC_022130	AG	3	6	65484	65489	50 %	0 %	50 %	0 %	532530532
98	NC_022130	GC	3	6	66085	66090	0 %	0 %	50 %	50 %	532530532
99	NC_022130	AG	3	6	66630	66635	50 %	0 %	50 %	0 %	532530532
100	NC_022130	GT	3	6	66922	66927	0 %	50 %	50 %	0 %	532530532
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102	NC_022130	AG	3	6	67817	67822	50 %	0 %	50 %	0 %	532530534
103	NC_022130	GA	4	8	68100	68107	50 %	0 %	50 %	0 %	532530535
104	NC_022130	GA	3	6	68784	68789	50 %	0 %	50 %	0 %	532530535
105	NC_022130	GA	3	6	69582	69587	50 %	0 %	50 %	0 %	532530535
106	NC_022130	AC	3	6	69609	69614	50 %	0 %	0 %	50 %	532530535
107	NC_022130	AG	3	6	70492	70497	50 %	0 %	50 %	0 %	532530538
108	NC_022130	GA	3	6	70569	70574	50 %	0 %	50 %	0 %	532530538
109	NC_022130	TA	3	6	70715	70720	50 %	50 %	0 %	0 %	532530538
110	NC_022130	GT	3	6	71423	71428	0 %	50 %	50 %	0 %	532530538
111	NC_022130	AG	3	6	71830	71835	50 %	0 %	50 %	0 %	532530538
112	NC_022130	AT	3	6	73106	73111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022130	CT	3	6	74416	74421	0 %	50 %	0 %	50 %	532530540
114	NC_022130	AG	3	6	75147	75152	50 %	0 %	50 %	0 %	532530541
115	NC_022130	GA	4	8	75721	75728	50 %	0 %	50 %	0 %	532530542
116	NC_022130	AC	3	6	77422	77427	50 %	0 %	0 %	50 %	532530545
117	NC_022130	TG	3	6	77638	77643	0 %	50 %	50 %	0 %	532530545
118	NC_022130	TG	4	8	77976	77983	0 %	50 %	50 %	0 %	532530545
119	NC_022130	CT	3	6	80182	80187	0 %	50 %	0 %	50 %	532530548
120	NC_022130	CG	3	6	80547	80552	0 %	0 %	50 %	50 %	532530548
121	NC_022130	CT	3	6	81798	81803	0 %	50 %	0 %	50 %	532530550
122	NC_022130	GC	3	6	82554	82559	0 %	0 %	50 %	50 %	532530550
123	NC_022130	TA	3	6	82705	82710	50 %	50 %	0 %	0 %	532530550
124	NC_022130	AT	3	6	83112	83117	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022130	TA	4	8	83139	83146	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_022130	AT	3	6	83180	83185	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_022130	GT	3	6	83411	83416	0 %	50 %	50 %	0 %	532530552
128	NC_022130	AC	3	6	84499	84504	50 %	0 %	0 %	50 %	532530553
129	NC_022130	GA	3	6	84814	84819	50 %	0 %	50 %	0 %	532530553
130	NC_022130	TC	3	6	85101	85106	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_022130	TG	3	6	85142	85147	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_022130	AG	3	6	85460	85465	50 %	0 %	50 %	0 %	532530554
133	NC_022130	GA	3	6	87749	87754	50 %	0 %	50 %	0 %	532530555
134	NC_022130	AG	3	6	89097	89102	50 %	0 %	50 %	0 %	532530555
135	NC_022130	AG	3	6	89468	89473	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_022130	CT	4	8	90519	90526	0 %	50 %	0 %	50 %	532530558
137	NC_022130	CT	3	6	90858	90863	0 %	50 %	0 %	50 %	532530560
138	NC_022130	AG	3	6	91119	91124	50 %	0 %	50 %	0 %	532530560
139	NC_022130	GA	3	6	93195	93200	50 %	0 %	50 %	0 %	532530561
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142	NC_022130	TA	3	6	95888	95893	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_022130	CA	3	6	96249	96254	50 %	0 %	0 %	50 %	532530564
144	NC_022130	TC	3	6	96800	96805	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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