MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus 55/2053 plasmid

Total Repeats: 81

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022126	TATG	2	8	353	360	25 %	50 %	25 %	0 %	532438801
2	NC_022126	ATCC	2	8	386	393	25 %	25 %	0 %	50 %	532438801
3	NC_022126	TAGA	2	8	406	413	50 %	25 %	25 %	0 %	532438801
4	NC_022126	TATT	2	8	564	571	25 %	75 %	0 %	0 %	532438801
5	NC_022126	TTTA	2	8	2031	2038	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022126	TAGA	2	8	2109	2116	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022126	TATT	2	8	2374	2381	25 %	75 %	0 %	0 %	532438803
8	NC_022126	ACAT	2	8	3220	3227	50 %	25 %	0 %	25 %	532438804
9	NC_022126	AAGA	2	8	3454	3461	75 %	0 %	25 %	0 %	532438804
10	NC_022126	AGTA	2	8	3795	3802	50 %	25 %	25 %	0 %	532438805
11	NC_022126	TATT	2	8	4333	4340	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022126	TAGA	2	8	4366	4373	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022126	CCGA	2	8	4606	4613	25 %	0 %	25 %	50 %	532438806
14	NC_022126	CGGA	2	8	4701	4708	25 %	0 %	50 %	25 %	532438806
15	NC_022126	ACGG	2	8	4996	5003	25 %	0 %	50 %	25 %	532438806
16	NC_022126	TCAC	2	8	5334	5341	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_022126	CGAT	2	8	5509	5516	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_022126	CGCT	2	8	5958	5965	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_022126	TCAT	2	8	6108	6115	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_022126	TGAC	2	8	6289	6296	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_022126	GGCT	2	8	6591	6598	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_022126	CATC	2	8	7195	7202	25 %	25 %	0 %	50 %	532438807
23	NC_022126	TACA	2	8	7248	7255	50 %	25 %	0 %	25 %	532438807
24	NC_022126	ATAG	2	8	7652	7659	50 %	25 %	25 %	0 %	532438808
25	NC_022126	CTTT	2	8	8219	8226	0 %	75 %	0 %	25 %	532438809
26	NC_022126	AACT	2	8	8247	8254	50 %	25 %	0 %	25 %	532438809
27	NC_022126	TAGG	2	8	8370	8377	25 %	25 %	50 %	0 %	532438809
28	NC_022126	ATTC	2	8	8412	8419	25 %	50 %	0 %	25 %	532438809
29	NC_022126	ATTT	2	8	8517	8524	25 %	75 %	0 %	0 %	532438810
30	NC_022126	TTAT	2	8	9036	9043	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022126	TACC	2	8	9513	9520	25 %	25 %	0 %	50 %	532438811
32	NC_022126	TTAC	2	8	9692	9699	25 %	50 %	0 %	25 %	532438811
33	NC_022126	ACAT	2	8	10315	10322	50 %	25 %	0 %	25 %	532438812
34	NC_022126	AAGA	2	8	10549	10556	75 %	0 %	25 %	0 %	532438812
35	NC_022126	CTTA	2	8	11138	11145	25 %	50 %	0 %	25 %	532438813
36	NC_022126	AGTA	2	8	11626	11633	50 %	25 %	25 %	0 %	532438813
37	NC_022126	TCCA	2	8	12362	12369	25 %	25 %	0 %	50 %	532438813
38	NC_022126	CGTA	2	8	13242	13249	25 %	25 %	25 %	25 %	532438814
39	NC_022126	GTAA	2	8	13332	13339	50 %	25 %	25 %	0 %	532438814
40	NC_022126	TCTT	2	8	13465	13472	0 %	75 %	0 %	25 %	532438814
41	NC_022126	TTCA	2	8	13493	13500	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_022126	ATTT	2	8	13504	13511	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022126	GCAA	2	8	13543	13550	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_022126	TGAA	2	8	13556	13563	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022126	AAGT	2	8	13572	13579	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022126	AACG	2	8	13604	13611	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_022126	TAGA	2	8	13981	13988	50 %	25 %	25 %	0 %	532438815
48	NC_022126	TAGA	2	8	14035	14042	50 %	25 %	25 %	0 %	532438815
49	NC_022126	TAAA	2	8	14281	14288	75 %	25 %	0 %	0 %	532438815
50	NC_022126	ATAA	2	8	14419	14426	75 %	25 %	0 %	0 %	532438815
51	NC_022126	ATCG	2	8	14746	14753	25 %	25 %	25 %	25 %	532438816
52	NC_022126	GAAA	2	8	14973	14980	75 %	0 %	25 %	0 %	532438816
53	NC_022126	TATC	2	8	15045	15052	25 %	50 %	0 %	25 %	532438816
54	NC_022126	GCAA	2	8	15081	15088	50 %	0 %	25 %	25 %	532438816
55	NC_022126	AGAC	2	8	15121	15128	50 %	0 %	25 %	25 %	532438816
56	NC_022126	ATCA	2	8	15548	15555	50 %	25 %	0 %	25 %	532438817
57	NC_022126	TGTT	2	8	16122	16129	0 %	75 %	25 %	0 %	532438818
58	NC_022126	ATAC	2	8	16186	16193	50 %	25 %	0 %	25 %	532438818
59	NC_022126	TTAC	2	8	16583	16590	25 %	50 %	0 %	25 %	532438818
60	NC_022126	AAAC	2	8	16767	16774	75 %	0 %	0 %	25 %	532438818
61	NC_022126	TACA	2	8	17084	17091	50 %	25 %	0 %	25 %	532438819
62	NC_022126	TTTC	2	8	17656	17663	0 %	75 %	0 %	25 %	532438820
63	NC_022126	TTCA	2	8	17739	17746	25 %	50 %	0 %	25 %	532438820
64	NC_022126	GAAG	2	8	18089	18096	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022126	AAAG	2	8	18259	18266	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022126	GATA	2	8	18562	18569	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022126	AGAA	2	8	18622	18629	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022126	CCTT	2	8	18858	18865	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_022126	TTAA	2	8	18915	18922	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022126	TTTC	2	8	19023	19030	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_022126	ATTC	2	8	19057	19064	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_022126	TGAT	2	8	19071	19078	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022126	GTCA	2	8	19102	19109	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_022126	TAAT	2	8	19460	19467	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022126	CAAA	2	8	19480	19487	75 %	0 %	0 %	25 %	532438821
76	NC_022126	TCTT	2	8	19763	19770	0 %	75 %	0 %	25 %	532438821
77	NC_022126	TTTA	2	8	19844	19851	25 %	75 %	0 %	0 %	532438821
78	NC_022126	TCTT	2	8	20042	20049	0 %	75 %	0 %	25 %	532438821
79	NC_022126	CTTT	2	8	20079	20086	0 %	75 %	0 %	25 %	532438821
80	NC_022126	TAAT	2	8	20133	20140	50 %	50 %	0 %	0 %	532438821
81	NC_022126	GTTT	2	8	20193	20200	0 %	75 %	25 %	0 %	532438821

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.