MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus 55/2053 plasmid

Total Repeats: 28

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022126	TTTA	2	8	2031	2038	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022126	TAGA	2	8	2109	2116	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022126	TATT	2	8	4333	4340	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022126	TAGA	2	8	4366	4373	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022126	TCAC	2	8	5334	5341	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_022126	CGAT	2	8	5509	5516	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_022126	CGCT	2	8	5958	5965	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_022126	TCAT	2	8	6108	6115	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_022126	TGAC	2	8	6289	6296	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_022126	GGCT	2	8	6591	6598	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_022126	TTAT	2	8	9036	9043	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022126	TTCA	2	8	13493	13500	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_022126	ATTT	2	8	13504	13511	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022126	GCAA	2	8	13543	13550	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_022126	TGAA	2	8	13556	13563	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022126	AAGT	2	8	13572	13579	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022126	AACG	2	8	13604	13611	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_022126	GAAG	2	8	18089	18096	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022126	AAAG	2	8	18259	18266	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022126	GATA	2	8	18562	18569	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022126	AGAA	2	8	18622	18629	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022126	CCTT	2	8	18858	18865	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_022126	TTAA	2	8	18915	18922	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022126	TTTC	2	8	19023	19030	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_022126	ATTC	2	8	19057	19064	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_022126	TGAT	2	8	19071	19078	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022126	GTCA	2	8	19102	19109	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_022126	TAAT	2	8	19460	19467	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.