MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus 55/2053 plasmid

Total Repeats: 182

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022126	TAT	2	6	233	238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532438801
2	NC_022126	CAG	2	6	337	342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532438801
3	NC_022126	ATT	2	6	362	367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532438801
4	NC_022126	AAT	2	6	414	419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532438801
5	NC_022126	TAA	2	6	440	445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532438801
6	NC_022126	TTA	2	6	519	524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532438801
7	NC_022126	TAA	2	6	545	550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532438801
8	NC_022126	ATA	2	6	715	720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532438801
9	NC_022126	TAA	2	6	784	789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532438801
10	NC_022126	ATA	2	6	790	795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532438801
11	NC_022126	ATC	2	6	796	801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532438801
12	NC_022126	ATC	2	6	817	822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532438801
13	NC_022126	TAA	2	6	836	841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532438801
14	NC_022126	GAA	2	6	867	872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532438801
15	NC_022126	CAA	2	6	879	884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532438801
16	NC_022126	ATT	2	6	927	932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532438801
17	NC_022126	TTA	2	6	983	988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532438801
18	NC_022126	AGA	2	6	995	1000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532438801
19	NC_022126	GAA	2	6	1116	1121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532438801
20	NC_022126	AAT	2	6	1177	1182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532438801
21	NC_022126	AAT	2	6	1558	1563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532438802
22	NC_022126	TTA	2	6	1565	1570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532438802
23	NC_022126	ATT	2	6	1636	1641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532438802
24	NC_022126	AAT	2	6	1646	1651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532438802
25	NC_022126	GTT	2	6	2384	2389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532438803
26	NC_022126	AAT	2	6	2411	2416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532438803
27	NC_022126	CTA	2	6	2986	2991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532438804
28	NC_022126	GTG	2	6	3042	3047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532438804
29	NC_022126	TCA	2	6	3055	3060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532438804
30	NC_022126	GAA	2	6	3115	3120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532438804
31	NC_022126	TTA	2	6	3136	3141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532438804
32	NC_022126	TGA	2	6	3154	3159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532438804
33	NC_022126	CAT	2	6	3586	3591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532438804
34	NC_022126	AGG	2	6	3710	3715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532438805
35	NC_022126	ACC	2	6	3764	3769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532438805
36	NC_022126	CAA	2	6	3820	3825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532438805
37	NC_022126	ATG	2	6	3964	3969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532438805
38	NC_022126	ATA	2	6	4201	4206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532438805
39	NC_022126	ACA	2	6	4442	4447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532438806
40	NC_022126	TAG	2	6	4456	4461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532438806
41	NC_022126	CTC	2	6	4469	4474	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532438806
42	NC_022126	CGT	2	6	4591	4596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532438806
43	NC_022126	CGA	2	6	4858	4863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532438806
44	NC_022126	TCA	2	6	4875	4880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532438806
45	NC_022126	CCG	2	6	4942	4947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532438806
46	NC_022126	TTC	2	6	6963	6968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532438807
47	NC_022126	AAC	2	6	6969	6974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532438807
48	NC_022126	TGC	2	6	7010	7015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532438807
49	NC_022126	ACC	2	6	7030	7035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532438807
50	NC_022126	CAA	2	6	7087	7092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532438807
51	NC_022126	CAA	2	6	7110	7115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532438807
52	NC_022126	AAT	2	6	7140	7145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532438807
53	NC_022126	CAC	2	6	7208	7213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532438807
54	NC_022126	CCA	2	6	7356	7361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532438808
55	NC_022126	TAA	2	6	7377	7382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532438808
56	NC_022126	GCT	2	6	7416	7421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532438808
57	NC_022126	CAC	2	6	7505	7510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532438808
58	NC_022126	GAT	2	6	7532	7537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532438808
59	NC_022126	TGA	2	6	7543	7548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532438808
60	NC_022126	ACC	2	6	7587	7592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532438808
61	NC_022126	TCC	2	6	7802	7807	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532438808
62	NC_022126	CCA	2	6	7860	7865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532438808
63	NC_022126	AAG	2	6	7939	7944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532438808
64	NC_022126	CTT	2	6	8046	8051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532438809
65	NC_022126	ATC	2	6	8056	8061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532438809
66	NC_022126	AAC	2	6	8459	8464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532438809
67	NC_022126	AAT	2	6	8549	8554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532438810
68	NC_022126	TAA	2	6	8606	8611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532438810
69	NC_022126	ACA	2	6	8722	8727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532438810
70	NC_022126	TAA	2	6	8770	8775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532438810
71	NC_022126	CTG	2	6	8788	8793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532438810
72	NC_022126	ACA	2	6	9228	9233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532438811
73	NC_022126	CAA	2	6	9369	9374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532438811
74	NC_022126	GCA	2	6	9410	9415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532438811
75	NC_022126	TCC	2	6	9500	9505	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532438811
76	NC_022126	CAG	2	6	9546	9551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532438811
77	NC_022126	TGC	2	6	9658	9663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532438811
78	NC_022126	CTA	2	6	10081	10086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532438812
79	NC_022126	GTG	2	6	10137	10142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532438812
80	NC_022126	TCA	2	6	10150	10155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532438812
81	NC_022126	GAA	2	6	10210	10215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532438812
82	NC_022126	TTA	2	6	10231	10236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532438812
83	NC_022126	TGA	2	6	10249	10254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532438812
84	NC_022126	CAT	2	6	10681	10686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532438812
85	NC_022126	TCA	2	6	10951	10956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532438813
86	NC_022126	TAG	2	6	10984	10989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532438813
87	NC_022126	ATT	2	6	11055	11060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532438813
88	NC_022126	ATC	2	6	11147	11152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532438813
89	NC_022126	GCA	2	6	11229	11234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532438813
90	NC_022126	CAT	2	6	11245	11250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532438813
91	NC_022126	TGA	2	6	11430	11435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532438813
92	NC_022126	AAT	2	6	11516	11521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532438813
93	NC_022126	TTC	2	6	11681	11686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532438813
94	NC_022126	ATT	2	6	11733	11738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532438813
95	NC_022126	TGT	2	6	11754	11759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532438813
96	NC_022126	TTC	2	6	11801	11806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532438813
97	NC_022126	ACC	2	6	11918	11923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532438813
98	NC_022126	CCA	2	6	12057	12062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532438813
99	NC_022126	GTA	2	6	12119	12124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532438813
100	NC_022126	CTT	2	6	12175	12180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532438813
101	NC_022126	CAA	2	6	12181	12186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532438813
102	NC_022126	AAT	2	6	12191	12196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532438813
103	NC_022126	TCT	2	6	12213	12218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532438813
104	NC_022126	ATT	3	9	12432	12440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532438813
105	NC_022126	CTT	2	6	12466	12471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532438813
106	NC_022126	AAC	2	6	12560	12565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532438813
107	NC_022126	AAT	2	6	12590	12595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532438813
108	NC_022126	TCA	2	6	12619	12624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532438813
109	NC_022126	AAT	2	6	12675	12680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532438813
110	NC_022126	TCT	2	6	12735	12740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532438813
111	NC_022126	TAG	2	6	12776	12781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532438813
112	NC_022126	TCT	2	6	12828	12833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532438813
113	NC_022126	TTC	2	6	12932	12937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532438813
114	NC_022126	TCT	2	6	13083	13088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532438813
115	NC_022126	CTT	2	6	13127	13132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532438814
116	NC_022126	ATC	2	6	13150	13155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532438814
117	NC_022126	TCA	2	6	13174	13179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532438814
118	NC_022126	CTT	2	6	13205	13210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532438814
119	NC_022126	ACC	2	6	13222	13227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532438814
120	NC_022126	ATG	2	6	13251	13256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532438814
121	NC_022126	TTC	2	6	13434	13439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532438814
122	NC_022126	TTG	2	6	14020	14025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532438815
123	NC_022126	TAA	2	6	14087	14092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532438815
124	NC_022126	AGA	2	6	14117	14122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532438815
125	NC_022126	GCA	2	6	14178	14183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532438815
126	NC_022126	TTC	2	6	14219	14224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532438815
127	NC_022126	ACA	2	6	14370	14375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532438815
128	NC_022126	ATT	2	6	14560	14565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532438816
129	NC_022126	ATC	2	6	14580	14585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532438816
130	NC_022126	ATT	2	6	14792	14797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532438816
131	NC_022126	AAG	2	6	14807	14812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532438816
132	NC_022126	TGA	2	6	14819	14824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532438816
133	NC_022126	ATG	2	6	14839	14844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532438816
134	NC_022126	GAC	2	6	14996	15001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532438816
135	NC_022126	AGA	2	6	15072	15077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532438816
136	NC_022126	CTG	2	6	15430	15435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532438817
137	NC_022126	ATC	2	6	15437	15442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532438817
138	NC_022126	TGG	2	6	15470	15475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532438817
139	NC_022126	ATT	2	6	15488	15493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532438817
140	NC_022126	CTT	2	6	15589	15594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532438817
141	NC_022126	CAG	2	6	15640	15645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532438817
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144	NC_022126	CTT	2	6	15978	15983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532438818
145	NC_022126	TGT	2	6	16044	16049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532438818
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147	NC_022126	ATG	2	6	16091	16096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532438818
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149	NC_022126	AAT	2	6	16291	16296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532438818
150	NC_022126	AAT	2	6	16303	16308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532438818
151	NC_022126	AGT	2	6	16352	16357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532438818
152	NC_022126	GTA	2	6	16607	16612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532438818
153	NC_022126	AAT	2	6	16633	16638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532438818
154	NC_022126	CAT	2	6	16719	16724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532438818
155	NC_022126	TGC	2	6	16735	16740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532438818
156	NC_022126	ATA	2	6	16760	16765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532438818
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161	NC_022126	CTA	2	6	17210	17215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532438819
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163	NC_022126	TAA	2	6	17265	17270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532438819
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.