MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Rhodococcus erythropolis CCM2595 plasmid pRECF1

Total Repeats: 51

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022125	CGTCGA	2	12	6350	6361	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	532437249
2	NC_022125	CGGTGC	2	12	6557	6568	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	532437249
3	NC_022125	TTCTTT	2	12	7038	7049	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_022125	ACCGAC	2	12	7489	7500	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	532437250
5	NC_022125	CGGACG	2	12	9997	10008	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	532437252
6	NC_022125	TCGCCG	2	12	11899	11910	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	532437253
7	NC_022125	CAACCG	2	12	12402	12413	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	532437253
8	NC_022125	GACCAC	2	12	12521	12532	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	532437254
9	NC_022125	GGCCAC	2	12	12820	12831	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	532437254
10	NC_022125	ACCGGC	2	12	14448	14459	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	532437258
11	NC_022125	TCGCAC	2	12	14635	14646	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	532437258
12	NC_022125	GCCGGC	2	12	15205	15216	0 %	0 %	50 %	50 %	532437259
13	NC_022125	GCGGCC	2	12	17253	17264	0 %	0 %	50 %	50 %	532437260
14	NC_022125	GCCGTC	2	12	17283	17294	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	532437260
15	NC_022125	TCAAGG	2	12	18707	18718	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	532437261
16	NC_022125	GAAATC	2	12	19575	19586	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	532437262
17	NC_022125	GACAAG	2	12	19938	19949	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	532437262
18	NC_022125	CGATGG	2	12	21515	21526	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	532437265
19	NC_022125	CCGGAG	3	18	23520	23537	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	532437266
20	NC_022125	AGACGC	2	12	24526	24537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532437267
21	NC_022125	CCGTCC	2	12	25227	25238	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	532437268
22	NC_022125	ATGTGG	2	12	32520	32531	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	532437274
23	NC_022125	GTTGAT	2	12	33133	33144	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	532437275
24	NC_022125	TTCGCT	2	12	35042	35053	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	532437277
25	NC_022125	GTCGAC	2	12	35598	35609	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	532437279
26	NC_022125	TGCGGT	2	12	36069	36080	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	532437279
27	NC_022125	TCGGCG	2	12	37679	37690	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	532437282
28	NC_022125	GTCGGT	2	12	38452	38463	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	532437282
29	NC_022125	GCAAAG	2	12	40095	40106	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_022125	TTTGGG	2	12	42751	42762	0 %	50 %	50 %	0 %	532437289
31	NC_022125	TCCTTG	2	12	44670	44681	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_022125	CGGCCT	2	12	45269	45280	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	532437293
33	NC_022125	CGCAGT	2	12	47188	47199	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	532437296
34	NC_022125	GTAGTC	2	12	47373	47384	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	532437297
35	NC_022125	CGGCGT	2	12	50965	50976	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	532437301
36	NC_022125	TCGCGC	2	12	51448	51459	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	532437301
37	NC_022125	TGCGGT	2	12	59312	59323	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	532437314
38	NC_022125	CGCCGA	2	12	64856	64867	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	532437319
39	NC_022125	AGCGCC	2	12	65305	65316	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	532437319
40	NC_022125	GTCGGT	2	12	65708	65719	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	532437320
41	NC_022125	TCGAGT	2	12	70469	70480	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	532437325
42	NC_022125	ATTTCG	2	12	71604	71615	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	532437327
43	NC_022125	CGGGAA	2	12	75667	75678	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	532437330
44	NC_022125	ATCGTC	2	12	79393	79404	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	532437333
45	NC_022125	CCGTCG	2	12	80964	80975	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	532437334
46	NC_022125	GCGGCC	2	12	83412	83423	0 %	0 %	50 %	50 %	532437340
47	NC_022125	CGATGG	2	12	88343	88354	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	532437345
48	NC_022125	CGAGTG	2	12	88499	88510	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	532437345
49	NC_022125	TCTGCC	2	12	88734	88745	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	532437346
50	NC_022125	TGGGCT	2	12	88864	88875	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	532437346
51	NC_022125	AGGTCG	2	12	89357	89368	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	532437347

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.