MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Rhodococcus erythropolis CCM2595 plasmid pRECF1

Total Repeats: 78

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022125	GCATG	2	10	1511	1520	20 %	20 %	40 %	20 %	532437244
2	NC_022125	GGGGT	2	10	2902	2911	0 %	20 %	80 %	0 %	532437245
3	NC_022125	GCTGC	2	10	4294	4303	0 %	20 %	40 %	40 %	532437247
4	NC_022125	GTCAG	2	10	7072	7081	20 %	20 %	40 %	20 %	532437250
5	NC_022125	GACCG	2	10	7351	7360	20 %	0 %	40 %	40 %	532437250
6	NC_022125	CCGAT	2	10	7365	7374	20 %	20 %	20 %	40 %	532437250
7	NC_022125	CACCG	2	10	8223	8232	20 %	0 %	20 %	60 %	532437251
8	NC_022125	CGCTC	2	10	8640	8649	0 %	20 %	20 %	60 %	532437251
9	NC_022125	CCTCG	2	10	11541	11550	0 %	20 %	20 %	60 %	532437253
10	NC_022125	CGGCC	2	10	13148	13157	0 %	0 %	40 %	60 %	532437255
11	NC_022125	CAGCG	2	10	14474	14483	20 %	0 %	40 %	40 %	532437258
12	NC_022125	CGCTG	2	10	14843	14852	0 %	20 %	40 %	40 %	532437258
13	NC_022125	GCGCT	2	10	15518	15527	0 %	20 %	40 %	40 %	532437259
14	NC_022125	CACCG	3	15	17429	17443	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
15	NC_022125	CGAAC	2	10	19191	19200	40 %	0 %	20 %	40 %	532437262
16	NC_022125	GCGCC	2	10	19208	19217	0 %	0 %	40 %	60 %	532437262
17	NC_022125	CGAAA	2	10	21133	21142	60 %	0 %	20 %	20 %	532437264
18	NC_022125	CGAAG	2	10	22146	22155	40 %	0 %	40 %	20 %	532437265
19	NC_022125	CGAAG	2	10	23411	23420	40 %	0 %	40 %	20 %	532437266
20	NC_022125	GCAGA	2	10	24047	24056	40 %	0 %	40 %	20 %	532437267
21	NC_022125	CACAG	2	10	24828	24837	40 %	0 %	20 %	40 %	532437268
22	NC_022125	CTGAT	2	10	26586	26595	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_022125	TCCTC	2	10	31061	31070	0 %	40 %	0 %	60 %	532437273
24	NC_022125	TTCGC	2	10	31974	31983	0 %	40 %	20 %	40 %	532437274
25	NC_022125	GATCG	2	10	32723	32732	20 %	20 %	40 %	20 %	532437274
26	NC_022125	CAGCG	2	10	33432	33441	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
27	NC_022125	TGCTC	2	10	33532	33541	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
28	NC_022125	AGCGG	2	10	33686	33695	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
29	NC_022125	GAAGA	2	10	34065	34074	60 %	0 %	40 %	0 %	532437276
30	NC_022125	CGCAG	2	10	36865	36874	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
31	NC_022125	CTGCG	2	10	37035	37044	0 %	20 %	40 %	40 %	532437280
32	NC_022125	TCGCG	2	10	38513	38522	0 %	20 %	40 %	40 %	532437282
33	NC_022125	GCTCT	2	10	38995	39004	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
34	NC_022125	CCCTT	2	10	40668	40677	0 %	40 %	0 %	60 %	532437284
35	NC_022125	TGCGG	2	10	41632	41641	0 %	20 %	60 %	20 %	532437287
36	NC_022125	TGCGT	2	10	42600	42609	0 %	40 %	40 %	20 %	532437288
37	NC_022125	GGTGA	2	10	43718	43727	20 %	20 %	60 %	0 %	532437291
38	NC_022125	GCATT	2	10	44245	44254	20 %	40 %	20 %	20 %	532437292
39	NC_022125	GCCCC	2	10	44488	44497	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
40	NC_022125	TAGCG	2	10	44557	44566	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
41	NC_022125	GACAC	2	10	46440	46449	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
42	NC_022125	GTGTT	2	10	46471	46480	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022125	GCAGG	2	10	47169	47178	20 %	0 %	60 %	20 %	532437296
44	NC_022125	GGCCG	2	10	47697	47706	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
45	NC_022125	GCTGC	2	10	48022	48031	0 %	20 %	40 %	40 %	532437298
46	NC_022125	GTTCG	2	10	48121	48130	0 %	40 %	40 %	20 %	532437298
47	NC_022125	TGTTT	2	10	51973	51982	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022125	GTGCG	2	10	52046	52055	0 %	20 %	60 %	20 %	532437303
49	NC_022125	CTTCG	2	10	53276	53285	0 %	40 %	20 %	40 %	532437304
50	NC_022125	CCGCG	2	10	55512	55521	0 %	0 %	40 %	60 %	532437307
51	NC_022125	GCAGC	2	10	56902	56911	20 %	0 %	40 %	40 %	532437309
52	NC_022125	AGCAA	2	10	58260	58269	60 %	0 %	20 %	20 %	532437312
53	NC_022125	CGGGA	2	10	58499	58508	20 %	0 %	60 %	20 %	532437312
54	NC_022125	CGTCC	2	10	59515	59524	0 %	20 %	20 %	60 %	532437314
55	NC_022125	CGTTG	2	10	60301	60310	0 %	40 %	40 %	20 %	532437314
56	NC_022125	GCCGC	2	10	61793	61802	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
57	NC_022125	CGTGG	2	10	68756	68765	0 %	20 %	60 %	20 %	532437323
58	NC_022125	ACGAG	2	10	68804	68813	40 %	0 %	40 %	20 %	532437323
59	NC_022125	CCTGT	2	10	71011	71020	0 %	40 %	20 %	40 %	532437326
60	NC_022125	GACCT	2	10	71688	71697	20 %	20 %	20 %	40 %	532437327
61	NC_022125	GGTTC	2	10	74234	74243	0 %	40 %	40 %	20 %	532437329
62	NC_022125	GGGAC	2	10	74388	74397	20 %	0 %	60 %	20 %	532437329
63	NC_022125	TGGAC	2	10	76454	76463	20 %	20 %	40 %	20 %	532437331
64	NC_022125	GAAAG	2	10	76951	76960	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022125	CCGCA	2	10	77780	77789	20 %	0 %	20 %	60 %	532437332
66	NC_022125	GCGGG	2	10	78921	78930	0 %	0 %	80 %	20 %	532437333
67	NC_022125	CCCGA	2	10	78934	78943	20 %	0 %	20 %	60 %	532437333
68	NC_022125	CCATC	2	10	79520	79529	20 %	20 %	0 %	60 %	532437333
69	NC_022125	CGATG	2	10	81782	81791	20 %	20 %	40 %	20 %	532437337
70	NC_022125	GGGCA	2	10	82845	82854	20 %	0 %	60 %	20 %	532437338
71	NC_022125	GGTCA	2	10	83081	83090	20 %	20 %	40 %	20 %	532437338
72	NC_022125	GATCT	2	10	83241	83250	20 %	40 %	20 %	20 %	532437339
73	NC_022125	CGGGT	2	10	83613	83622	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
74	NC_022125	TCAGG	2	10	83894	83903	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
75	NC_022125	GCTGT	2	10	86067	86076	0 %	40 %	40 %	20 %	532437343
76	NC_022125	TCAGA	2	10	88001	88010	40 %	20 %	20 %	20 %	532437345
77	NC_022125	CAGGT	2	10	88396	88405	20 %	20 %	40 %	20 %	532437345
78	NC_022125	GCAAT	2	10	89990	89999	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.