MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhodococcus erythropolis CCM2595 plasmid pRECF1

Total Repeats: 18

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022125	CACCG	3	15	17429	17443	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
2	NC_022125	CTGAT	2	10	26586	26595	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_022125	CAGCG	2	10	33432	33441	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4	NC_022125	TGCTC	2	10	33532	33541	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
5	NC_022125	AGCGG	2	10	33686	33695	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
6	NC_022125	CGCAG	2	10	36865	36874	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
7	NC_022125	GCTCT	2	10	38995	39004	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
8	NC_022125	GCCCC	2	10	44488	44497	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
9	NC_022125	TAGCG	2	10	44557	44566	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
10	NC_022125	GACAC	2	10	46440	46449	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
11	NC_022125	GTGTT	2	10	46471	46480	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022125	GGCCG	2	10	47697	47706	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
13	NC_022125	TGTTT	2	10	51973	51982	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022125	GCCGC	2	10	61793	61802	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
15	NC_022125	GAAAG	2	10	76951	76960	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022125	CGGGT	2	10	83613	83622	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
17	NC_022125	TCAGG	2	10	83894	83903	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_022125	GCAAT	2	10	89990	89999	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.