MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Rhodococcus erythropolis CCM2595 plasmid pRECF1

Total Repeats: 260

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022125	CACC	2	8	268	275	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
2	NC_022125	GCTG	2	8	470	477	0 %	25 %	50 %	25 %	532437243
3	NC_022125	CCGG	2	8	1566	1573	0 %	0 %	50 %	50 %	532437244
4	NC_022125	GCGA	2	8	2201	2208	25 %	0 %	50 %	25 %	532437244
5	NC_022125	TCTG	2	8	2355	2362	0 %	50 %	25 %	25 %	532437245
6	NC_022125	CCCG	2	8	3743	3750	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7	NC_022125	CCCG	2	8	3815	3822	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8	NC_022125	CGTT	2	8	3841	3848	0 %	50 %	25 %	25 %	532437246
9	NC_022125	CTTG	2	8	4030	4037	0 %	50 %	25 %	25 %	532437246
10	NC_022125	AAGA	2	8	4775	4782	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022125	CAGG	2	8	4974	4981	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_022125	CACC	2	8	5428	5435	25 %	0 %	0 %	75 %	532437248
13	NC_022125	GGGT	2	8	5458	5465	0 %	25 %	75 %	0 %	532437248
14	NC_022125	CGGC	2	8	5714	5721	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_022125	TCGT	2	8	6017	6024	0 %	50 %	25 %	25 %	532437249
16	NC_022125	CCGA	2	8	6180	6187	25 %	0 %	25 %	50 %	532437249
17	NC_022125	CCGA	2	8	7103	7110	25 %	0 %	25 %	50 %	532437250
18	NC_022125	ACCC	2	8	7303	7310	25 %	0 %	0 %	75 %	532437250
19	NC_022125	GCTG	2	8	7615	7622	0 %	25 %	50 %	25 %	532437250
20	NC_022125	CCTC	2	8	7683	7690	0 %	25 %	0 %	75 %	532437250
21	NC_022125	CGTG	2	8	8086	8093	0 %	25 %	50 %	25 %	532437250
22	NC_022125	CTGG	2	8	8157	8164	0 %	25 %	50 %	25 %	532437251
23	NC_022125	TCAC	2	8	8568	8575	25 %	25 %	0 %	50 %	532437251
24	NC_022125	GTCG	2	8	8661	8668	0 %	25 %	50 %	25 %	532437251
25	NC_022125	GTCC	2	8	8791	8798	0 %	25 %	25 %	50 %	532437251
26	NC_022125	AACA	2	8	8997	9004	75 %	0 %	0 %	25 %	532437251
27	NC_022125	ACCA	2	8	9171	9178	50 %	0 %	0 %	50 %	532437252
28	NC_022125	GCCG	2	8	9702	9709	0 %	0 %	50 %	50 %	532437252
29	NC_022125	TGGG	2	8	9856	9863	0 %	25 %	75 %	0 %	532437252
30	NC_022125	GTCG	2	8	10421	10428	0 %	25 %	50 %	25 %	532437252
31	NC_022125	CCGC	2	8	10623	10630	0 %	0 %	25 %	75 %	532437252
32	NC_022125	TCGG	2	8	10638	10645	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_022125	CGGT	2	8	11437	11444	0 %	25 %	50 %	25 %	532437253
34	NC_022125	CATC	2	8	11875	11882	25 %	25 %	0 %	50 %	532437253
35	NC_022125	CCGA	2	8	12318	12325	25 %	0 %	25 %	50 %	532437253
36	NC_022125	CTGA	2	8	12434	12441	25 %	25 %	25 %	25 %	532437254
37	NC_022125	GATG	2	8	12535	12542	25 %	25 %	50 %	0 %	532437254
38	NC_022125	CCCA	2	8	12551	12558	25 %	0 %	0 %	75 %	532437254
39	NC_022125	ACCA	2	8	12683	12690	50 %	0 %	0 %	50 %	532437254
40	NC_022125	GGAA	2	8	13374	13381	50 %	0 %	50 %	0 %	532437255
41	NC_022125	GGCC	2	8	13482	13489	0 %	0 %	50 %	50 %	532437255
42	NC_022125	GCCG	2	8	13572	13579	0 %	0 %	50 %	50 %	532437255
43	NC_022125	GAGT	2	8	14035	14042	25 %	25 %	50 %	0 %	532437256
44	NC_022125	TGGC	2	8	14820	14827	0 %	25 %	50 %	25 %	532437258
45	NC_022125	CTCG	2	8	14963	14970	0 %	25 %	25 %	50 %	532437258
46	NC_022125	AAGG	2	8	15379	15386	50 %	0 %	50 %	0 %	532437259
47	NC_022125	TCGC	2	8	15500	15507	0 %	25 %	25 %	50 %	532437259
48	NC_022125	GTCT	2	8	15889	15896	0 %	50 %	25 %	25 %	532437260
49	NC_022125	CGGC	2	8	16120	16127	0 %	0 %	50 %	50 %	532437260
50	NC_022125	TCGG	2	8	16332	16339	0 %	25 %	50 %	25 %	532437260
51	NC_022125	ACCG	2	8	17087	17094	25 %	0 %	25 %	50 %	532437260
52	NC_022125	GTCC	2	8	17164	17171	0 %	25 %	25 %	50 %	532437260
53	NC_022125	GCCC	2	8	17497	17504	0 %	0 %	25 %	75 %	532437261
54	NC_022125	CGCT	2	8	17675	17682	0 %	25 %	25 %	50 %	532437261
55	NC_022125	AGCA	2	8	17737	17744	50 %	0 %	25 %	25 %	532437261
56	NC_022125	CCCG	2	8	18359	18366	0 %	0 %	25 %	75 %	532437261
57	NC_022125	AACG	2	8	18529	18536	50 %	0 %	25 %	25 %	532437261
58	NC_022125	GGTC	2	8	18689	18696	0 %	25 %	50 %	25 %	532437261
59	NC_022125	ACCG	2	8	19227	19234	25 %	0 %	25 %	50 %	532437262
60	NC_022125	CGAC	2	8	20064	20071	25 %	0 %	25 %	50 %	532437262
61	NC_022125	GGAA	2	8	22176	22183	50 %	0 %	50 %	0 %	532437265
62	NC_022125	ACAA	2	8	22352	22359	75 %	0 %	0 %	25 %	532437265
63	NC_022125	CGCT	2	8	22396	22403	0 %	25 %	25 %	50 %	532437265
64	NC_022125	TTCG	2	8	22480	22487	0 %	50 %	25 %	25 %	532437265
65	NC_022125	CGGC	2	8	22532	22539	0 %	0 %	50 %	50 %	532437265
66	NC_022125	GGTC	2	8	22892	22899	0 %	25 %	50 %	25 %	532437265
67	NC_022125	ACGG	2	8	23031	23038	25 %	0 %	50 %	25 %	532437265
68	NC_022125	GGCC	2	8	23049	23056	0 %	0 %	50 %	50 %	532437265
69	NC_022125	GAAG	2	8	23390	23397	50 %	0 %	50 %	0 %	532437266
70	NC_022125	AAGG	2	8	23946	23953	50 %	0 %	50 %	0 %	532437266
71	NC_022125	TCAA	2	8	23991	23998	50 %	25 %	0 %	25 %	532437267
72	NC_022125	GCCG	2	8	24502	24509	0 %	0 %	50 %	50 %	532437267
73	NC_022125	CCGC	2	8	24707	24714	0 %	0 %	25 %	75 %	532437267
74	NC_022125	CGAG	2	8	25106	25113	25 %	0 %	50 %	25 %	532437268
75	NC_022125	CGAA	2	8	25379	25386	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_022125	CGCC	2	8	25796	25803	0 %	0 %	25 %	75 %	532437269
77	NC_022125	GGGA	2	8	26825	26832	25 %	0 %	75 %	0 %	532437270
78	NC_022125	CTTT	2	8	28257	28264	0 %	75 %	0 %	25 %	532437271
79	NC_022125	CTAC	2	8	28281	28288	25 %	25 %	0 %	50 %	532437271
80	NC_022125	CGGC	2	8	28826	28833	0 %	0 %	50 %	50 %	532437272
81	NC_022125	GCGA	2	8	29034	29041	25 %	0 %	50 %	25 %	532437272
82	NC_022125	TCGG	2	8	29190	29197	0 %	25 %	50 %	25 %	532437272
83	NC_022125	CAAA	2	8	29595	29602	75 %	0 %	0 %	25 %	532437272
84	NC_022125	ATCA	2	8	29887	29894	50 %	25 %	0 %	25 %	532437272
85	NC_022125	GACG	2	8	29913	29920	25 %	0 %	50 %	25 %	532437272
86	NC_022125	TCAT	2	8	29956	29963	25 %	50 %	0 %	25 %	532437272
87	NC_022125	TTTC	2	8	30227	30234	0 %	75 %	0 %	25 %	532437272
88	NC_022125	TCTG	2	8	30475	30482	0 %	50 %	25 %	25 %	532437273
89	NC_022125	ACCT	2	8	30502	30509	25 %	25 %	0 %	50 %	532437273
90	NC_022125	GCGG	2	8	30591	30598	0 %	0 %	75 %	25 %	532437273
91	NC_022125	GGCA	2	8	30711	30718	25 %	0 %	50 %	25 %	532437273
92	NC_022125	CCGA	2	8	30856	30863	25 %	0 %	25 %	50 %	532437273
93	NC_022125	GAAG	2	8	31006	31013	50 %	0 %	50 %	0 %	532437273
94	NC_022125	GCCG	2	8	31455	31462	0 %	0 %	50 %	50 %	532437274
95	NC_022125	GTGC	2	8	31744	31751	0 %	25 %	50 %	25 %	532437274
96	NC_022125	CGAG	2	8	31776	31783	25 %	0 %	50 %	25 %	532437274
97	NC_022125	CCGT	2	8	31855	31862	0 %	25 %	25 %	50 %	532437274
98	NC_022125	TCGG	2	8	31886	31893	0 %	25 %	50 %	25 %	532437274
99	NC_022125	CGGC	2	8	31938	31945	0 %	0 %	50 %	50 %	532437274
100	NC_022125	GCGG	2	8	32438	32445	0 %	0 %	75 %	25 %	532437274
101	NC_022125	CGTC	2	8	32650	32657	0 %	25 %	25 %	50 %	532437274
102	NC_022125	GTAG	2	8	32782	32789	25 %	25 %	50 %	0 %	532437274
103	NC_022125	ACCC	2	8	33906	33913	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
104	NC_022125	ACGG	2	8	33968	33975	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
105	NC_022125	GCCG	2	8	34307	34314	0 %	0 %	50 %	50 %	532437276
106	NC_022125	TCGC	2	8	34402	34409	0 %	25 %	25 %	50 %	532437277
107	NC_022125	TGGT	2	8	34574	34581	0 %	50 %	50 %	0 %	532437277
108	NC_022125	GACT	2	8	35363	35370	25 %	25 %	25 %	25 %	532437278
109	NC_022125	GGCG	2	8	35855	35862	0 %	0 %	75 %	25 %	532437279
110	NC_022125	CGAA	2	8	36031	36038	50 %	0 %	25 %	25 %	532437279
111	NC_022125	CGGC	2	8	36770	36777	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_022125	GGCC	2	8	36904	36911	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_022125	CAGC	2	8	37002	37009	25 %	0 %	25 %	50 %	532437280
114	NC_022125	CGGG	2	8	37609	37616	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
115	NC_022125	GCGG	2	8	37741	37748	0 %	0 %	75 %	25 %	532437282
116	NC_022125	CGTT	2	8	38022	38029	0 %	50 %	25 %	25 %	532437282
117	NC_022125	ACAA	2	8	38800	38807	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_022125	GGCC	2	8	38868	38875	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_022125	GGCC	2	8	38969	38976	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_022125	CTCG	2	8	39042	39049	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
121	NC_022125	AGAA	2	8	39273	39280	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_022125	CTGG	2	8	39562	39569	0 %	25 %	50 %	25 %	532437283
123	NC_022125	TGGT	2	8	39707	39714	0 %	50 %	50 %	0 %	532437283
124	NC_022125	GGTG	2	8	39717	39724	0 %	25 %	75 %	0 %	532437283
125	NC_022125	TCTG	2	8	39805	39812	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_022125	AACT	2	8	40016	40023	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_022125	ACCA	2	8	40141	40148	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_022125	AGCG	2	8	40161	40168	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
129	NC_022125	TGTT	2	8	40182	40189	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_022125	GGAT	2	8	41116	41123	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_022125	GGCC	2	8	41599	41606	0 %	0 %	50 %	50 %	532437287
132	NC_022125	GTCG	2	8	42048	42055	0 %	25 %	50 %	25 %	532437287
133	NC_022125	GCGT	2	8	43873	43880	0 %	25 %	50 %	25 %	532437291
134	NC_022125	TAAC	2	8	44429	44436	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_022125	GGTA	2	8	45445	45452	25 %	25 %	50 %	0 %	532437293
136	NC_022125	GATG	2	8	46011	46018	25 %	25 %	50 %	0 %	532437293
137	NC_022125	GGAT	2	8	46283	46290	25 %	25 %	50 %	0 %	532437293
138	NC_022125	TCGG	2	8	46768	46775	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
139	NC_022125	GGTC	2	8	46784	46791	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
140	NC_022125	TGGG	2	8	46819	46826	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
141	NC_022125	TTCG	2	8	47403	47410	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_022125	GTGG	2	8	47724	47731	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
143	NC_022125	CCGA	2	8	47733	47740	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
144	NC_022125	GTTG	2	8	47955	47962	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_022125	GGTT	2	8	48510	48517	0 %	50 %	50 %	0 %	532437299
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249	NC_022125	TGGA	2	8	86472	86479	25 %	25 %	50 %	0 %	532437343
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256	NC_022125	TTCC	2	8	88577	88584	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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259	NC_022125	CTCG	2	8	89202	89209	0 %	25 %	25 %	50 %	532437347
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.